Result of FASTA (omim) for pF1KB6171
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6171, 649 aa
  1>>>pF1KB6171 649 - 649 aa - 649 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3870+/-0.000372; mu= 14.5780+/- 0.023
 mean_var=95.0701+/-19.386, 0's: 0 Z-trim(115.7): 45  B-trim: 809 in 1/50
 Lambda= 0.131538
 statistics sampled from 26228 (26273) to 26228 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.308), width:  16
 Scan time: 10.880

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001030 (OMIM: 177200,264350,600761,613071) amil ( 649) 4462 857.4       0
NP_000327 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) amil ( 640) 1306 258.4 5.7e-68
XP_011544216 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 646) 1306 258.4 5.7e-68
XP_011544215 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 651) 1306 258.4 5.7e-68
XP_016879014 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 659) 1306 258.4 5.8e-68
NP_001029 (OMIM: 264350,600228,613021) amiloride-s ( 669) 1163 231.3 8.7e-60
NP_001153047 (OMIM: 264350,600228,613021) amilorid ( 692) 1163 231.3 8.9e-60
NP_001153048 (OMIM: 264350,600228,613021) amilorid ( 728) 1163 231.3 9.3e-60
XP_011540235 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 638)  928 186.7 2.2e-46
XP_011540234 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 638)  928 186.7 2.2e-46
XP_011540231 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 696)  928 186.7 2.4e-46
XP_011540227 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 704)  928 186.7 2.4e-46
XP_016857533 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 732)  928 186.7 2.5e-46
XP_011540222 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 736)  928 186.7 2.5e-46
XP_016857532 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 749)  928 186.7 2.5e-46
XP_016857531 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 757)  928 186.7 2.6e-46
XP_016857530 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 760)  928 186.7 2.6e-46
XP_016857529 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 764)  928 186.7 2.6e-46
XP_011540210 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 795)  928 186.8 2.7e-46
NP_001123885 (OMIM: 601328) amiloride-sensitive so ( 802)  928 186.8 2.7e-46
XP_016857528 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 810)  928 186.8 2.7e-46
XP_011540208 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 816)  928 186.8 2.7e-46
XP_011540207 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 827)  928 186.8 2.8e-46
XP_016857527 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 846)  928 186.8 2.8e-46
XP_011540204 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 851)  928 186.8 2.8e-46
XP_011540203 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 859)  928 186.8 2.8e-46
XP_016857526 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 895)  928 186.8 2.9e-46
XP_011540201 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 895)  928 186.8 2.9e-46
XP_016879015 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 623)  591 122.7 3.9e-27
NP_064717 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel  ( 549)  315 70.3   2e-11
NP_004760 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel  ( 531)  312 69.8 2.9e-11
NP_064718 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel  ( 543)  312 69.8   3e-11
XP_016863780 (OMIM: 616693) PREDICTED: acid-sensin ( 463)  287 65.0   7e-10
NP_059115 (OMIM: 616693) acid-sensing ion channel  ( 505)  287 65.0 7.5e-10
XP_011536654 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 529)  280 63.7   2e-09
NP_001086 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel  ( 528)  275 62.7 3.8e-09
NP_001243759 (OMIM: 602866) acid-sensing ion chann ( 562)  273 62.4 5.2e-09
XP_011536652 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 560)  234 55.0 8.8e-07
NP_061144 (OMIM: 606715) acid-sensing ion channel  ( 666)  233 54.8 1.2e-06
XP_011536653 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 559)  229 54.0 1.7e-06
NP_001085 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel  ( 512)  168 42.4  0.0048
NP_899233 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel  ( 563)  168 42.4  0.0052


>>NP_001030 (OMIM: 177200,264350,600761,613071) amilorid  (649 aa)
 initn: 4462 init1: 4462 opt: 4462  Z-score: 4578.0  bits: 857.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4462; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSRGRLRRLLWIGFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSRGRLRRLLWIGFT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 LTAVALILWQCALLVFSFYTVSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYSTVRHLLADLEQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTAVALILWQCALLVFSFYTVSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYSTVRHLLADLEQE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TREALKSLYGFPESRKRREAESWNSVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQDEKGKARDFFTGRKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TREALKSLYGFPESRKRREAESWNSVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQDEKGKARDFFTGRKR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 KVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGINAIQEWYKLHYMNIMAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGINAIQEWYKLHYMNIMAQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNCYTFNNRENETILSTSMG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNCYTFNNRENETILSTSMG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 GSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDVGTEIETAMVTSIGMHLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDVGTEIETAMVTSIGMHLT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 ESFKLSEPYSQCTEDGSDVPIRNIYNAAYSLQICLHSCFQTKMVEKCGCAQYSQPLPPAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESFKLSEPYSQCTEDGSDVPIRNIYNAAYSLQICLHSCFQTKMVEKCGCAQYSQPLPPAA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 NYCNYQQHPNWMYCYYQLHRAFVQEELGCQSVCKEACSFKEWTLTTSLAQWPSVVSEKWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NYCNYQQHPNWMYCYYQLHRAFVQEELGCQSVCKEACSFKEWTLTTSLAQWPSVVSEKWL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 LPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANSIEMLLSNFGGQLGLWMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANSIEMLLSNFGGQLGLWMS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 CSVVCVIEIIEVFFIDFFSIIARRQWQKAKEWWAWKQAPPCPEAPRSPQGQDNPALDIDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CSVVCVIEIIEVFFIDFFSIIARRQWQKAKEWWAWKQAPPCPEAPRSPQGQDNPALDIDD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640         
pF1KB6 DLPTFNSALHLPPALGTQVPGTPPPKYNTLRLERAFSNQLTDTQMLDEL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLPTFNSALHLPPALGTQVPGTPPPKYNTLRLERAFSNQLTDTQMLDEL
              610       620       630       640         

>>NP_000327 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) amilorid  (640 aa)
 initn: 1422 init1: 546 opt: 1306  Z-score: 1341.3  bits: 258.4 E(85289): 5.7e-68
Smith-Waterman score: 1472; 36.7% identity (69.2% similar) in 627 aa overlap (19-633:17-626)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSRGRLRRLLWIGFT
                         :: . : :::. ::: :::::: .::.  .:  .. .:. .:
NP_000   MHVKKYLLKGLHRLQKGP-GYTYKELLVWYCDNTNTHGPKRIIC-EGPKKKAMWFLLT
                 10         20        30        40         50      

               70        80          90       100       110        
pF1KB6 LTAVALILWQCALLVFSFYT--VSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYSTVRHLLADLE
       :  .::. :: .... .. .  ::::..: :. .::::::::: .:.::: ..::: ::.
NP_000 LLFAALVCWQWGIFIRTYLSWEVSVSLSVGFKTMDFPAVTICNASPFKYSKIKHLLKDLD
         60        70        80        90       100       110      

      120       130       140        150       160       170       
pF1KB6 QETREALKSLYGFPESRKRREAESWN-SVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQDEKGKAR--DFF
       .  . .:. . . ::  .   ... : :.       ..:  ::...:. .  .    :.:
NP_000 ELMEAVLERILA-PELSHANATRNLNFSI-------WNHT-PLVLIDERNPHHPMVLDLF
        120        130       140               150       160       

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB6 TGRKRKVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGINAIQEWYKLHYM
          .  . .:   .::. .       ....::: . ..:.  .:.:. .:. ::: :.  
NP_000 GDNHNGLTSS---SASEKICNAHGCKMAMRLCSLNRTQCTFRNFTSATQALTEWYILQAT
       170          180       190       200       210       220    

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB6 NIMAQVPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNCYTFNNRENETIL
       ::.:::: .. ..::: .:.....:.: .  :. :::: . .: .:::: ::   .:  :
NP_000 NIFAQVPQQELVEMSYPGEQMILACLFGAEPCNYRNFTSIFYPHYGNCYIFNWGMTEKAL
          230       240       250       260       270       280    

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB6 STSMGGSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDVGTEIETAMVTSI
        ..  :.:.::..:: :..:.: :::.:..:.....:.:  :::..: :    ..  :::
NP_000 PSANPGTEFGLKLILDIGQEDYVPFLASTAGVRLMLHEQRSYPFIRDEGIYAMSGTETSI
          290       300       310       320       330       340    

         360       370       380          390       400       410  
pF1KB6 GMHLTESFKLSEPYSQCTEDGSDVPIRNIY---NAAYSLQICLHSCFQTKMVEKCGCAQY
       :. . .  ...:::: :: .::.::..:.:   :..::.: ::.:::: .:...:.:..:
NP_000 GVLVDKLQRMGEPYSPCTVNGSEVPVQNFYSDYNTTYSIQACLRSCFQDHMIRNCNCGHY
          350       360       370       380       390       400    

            420       430       440       450       460       470  
pF1KB6 SQPLPPAANYCNYQQHPNWMYCYYQLHRAFVQEELGCQSVCKEACSFKEWTLTTSLAQWP
         ::: . .::: .. :.: .:: .:. . .:.:  : ..:::.:.  .. .: :.:.::
NP_000 LYPLPRGEKYCNNRDFPDWAHCYSDLQMSVAQRET-CIGMCKESCNDTQYKMTISMADWP
          410       420       430        440       450       460   

            480       490       500       510       520       530  
pF1KB6 SVVSEKWLLPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANSIEMLLSNFG
       : .:: :.. ::. .. ...:  :..  ..:: :.....: :.: :: ::.:  ::::.:
NP_000 SEASEDWIFHVLSQERDQSTNITLSRKGIVKLNIYFQEFNYRTIEESAANNIVWLLSNLG
           470       480       490       500       510       520   

            540           550       560       570       580        
pF1KB6 GQLGLWMSCSVVCVIE----IIEVFFIDFFSIIARRQWQKAKEWWAWKQAPPCPEAPRSP
       ::.:.::. ::.:.::    ::.  .: .....:  .  . ..  :   .:: : . .  
NP_000 GQFGFWMGGSVLCLIEFGEIIIDFVWITIIKLVALAKSLRQRRAQASYAGPP-PTVAELV
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       ... : ...  :  :   ..   :   .  .::::::.:..:::.               
NP_000 EAHTNFGFQ-PDTAPRSPNTGPYPSEQALPIPGTPPPNYDSLRLQPLDVIESDSEGDAI 
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pF1KB6 L

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XP_011 EKALPSANPGTEFGLKLILDIGQEDYVPFLASTAGVRLMLHEQRSYPFIRDEGIYAMSGT
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XP_011 ETSIGVLVDKLQRMGEPYSPCTVNGSEVPVQNFYSDYNTTYSIQACLRSCFQDHMIRNCN
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pF1KB6 CAQYSQPLPPAANYCNYQQHPNWMYCYYQLHRAFVQEELGCQSVCKEACSFKEWTLTTSL
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pF1KB6 AQWPSVVSEKWLLPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANSIEMLL
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XP_011 ADWPSEASEDWIFHVLSQERDQSTNITLSRKGIVKLNIYFQEFNYRTIEESAANNIVWLL
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XP_011 SNLGGQFGFWMGGSVLCLIEFGEIIIDFVWITIIKLVALAKSLRQRRAQASYAGPP-PTV
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pF1KB6 PRSPQGQDNPALDIDDDLPTFNSALHLPPALGTQVPGTPPPKYNTLRLERAFSNQLTDTQ
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XP_011 AELVEAHTNFGFQ-PDTAPRSPNTGPYPSEQALPIPGTPPPNYDSLRLQPLDVIESDSEG
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pF1KB6 MLDEL
            
XP_011 DAI  
            

>>XP_011544215 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) PREDI  (651 aa)
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pF1KB6 RRLLWIGFTLTAVALILWQCALLVFSFYT--VSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYST
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XP_011 KKAMWFLLTLLFAALVCWQWGIFIRTYLSWEVSVSLSVGFKTMDFPAVTICNASPFKYSK
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pF1KB6 VRHLLADLEQETREALKSLYGFPESRKRREAESWN-SVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQDEK
       ..::: ::..  . .:. . . ::  .   ... : :.       ..:  ::...:. . 
XP_011 IKHLLKDLDELMEAVLERILA-PELSHANATRNLNFSI-------WNHT-PLVLIDERNP
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XP_011 NWGMTEKALPSANPGTEFGLKLILDIGQEDYVPFLASTAGVRLMLHEQRSYPFIRDEGIY
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pF1KB6 IETAMVTSIGMHLTESFKLSEPYSQCTEDGSDVPIRNIY---NAAYSLQICLHSCFQTKM
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pF1KB6 LTTSLAQWPSVVSEKWLLPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANS
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pF1KB6 IEMLLSNFGGQLGLWMSCSVVCVIE----IIEVFFIDFFSIIARRQWQKAKEWWAWKQAP
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XP_011 IVWLLSNLGGQFGFWMGGSVLCLIEFGEIIIDFVWITIIKLVALAKSLRQRRAQASYAGP
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pF1KB6 PCPEAPRSPQGQDNPALDIDDDLPTFNSALHLPPALGTQVPGTPPPKYNTLRLERAFSNQ
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pF1KB6 LTDTQMLDEL
                 
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pF1KB6             MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSR
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pF1KB6 GRLRRLLWIGFTLTAVALILWQCALLVFSFYT--VSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYK
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pF1KB6 YSTVRHLLADLEQETREALKSLYGFPESRKRREAESWN-SVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQ
       :: ..::: ::..  . .:. . . ::  .   ... : :.       ..:  ::...:.
XP_016 YSKIKHLLKDLDELMEAVLERILA-PELSHANATRNLNFSI-------WNHT-PLVLIDE
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pF1KB6 DEKGKAR--DFFTGRKRKVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGI
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pF1KB6 NAIQEWYKLHYMNIMAQVPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNC
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XP_016 QALTEWYILQATNIFAQVPQQELVEMSYPGEQMILACLFGAEPCNYRNFTSIFYPHYGNC
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pF1KB6 YTFNNRENETILSTSMGGSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDV
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