Result of FASTA (ccds) for pF1KB6171
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6171, 649 aa
  1>>>pF1KB6171 649 - 649 aa - 649 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1877+/-0.000892; mu= 15.8841+/- 0.054
 mean_var=95.3388+/-18.927, 0's: 0 Z-trim(108.6): 17  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.131353
 statistics sampled from 10303 (10319) to 10303 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.317), width:  16
 Scan time:  3.040

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10608.1 SCNN1G gene_id:6340|Hs108|chr16        ( 649) 4462 856.1       0
CCDS10609.1 SCNN1B gene_id:6338|Hs108|chr16        ( 640) 1306 258.1 2.8e-68
CCDS8543.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12         ( 669) 1163 231.0 4.2e-60
CCDS53739.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12        ( 692) 1163 231.0 4.3e-60
CCDS53738.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12        ( 728) 1163 231.0 4.5e-60
CCDS44037.2 SCNN1D gene_id:6339|Hs108|chr1         ( 802)  928 186.5 1.2e-46
CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7           ( 549)  315 70.2 8.4e-12
CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7           ( 531)  312 69.6 1.2e-11
CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7           ( 543)  312 69.6 1.2e-11


>>CCDS10608.1 SCNN1G gene_id:6340|Hs108|chr16             (649 aa)
 initn: 4462 init1: 4462 opt: 4462  Z-score: 4571.4  bits: 856.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4462; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSRGRLRRLLWIGFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSRGRLRRLLWIGFT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 LTAVALILWQCALLVFSFYTVSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYSTVRHLLADLEQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LTAVALILWQCALLVFSFYTVSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYSTVRHLLADLEQE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TREALKSLYGFPESRKRREAESWNSVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQDEKGKARDFFTGRKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TREALKSLYGFPESRKRREAESWNSVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQDEKGKARDFFTGRKR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 KVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGINAIQEWYKLHYMNIMAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGINAIQEWYKLHYMNIMAQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNCYTFNNRENETILSTSMG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNCYTFNNRENETILSTSMG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 GSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDVGTEIETAMVTSIGMHLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDVGTEIETAMVTSIGMHLT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 ESFKLSEPYSQCTEDGSDVPIRNIYNAAYSLQICLHSCFQTKMVEKCGCAQYSQPLPPAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESFKLSEPYSQCTEDGSDVPIRNIYNAAYSLQICLHSCFQTKMVEKCGCAQYSQPLPPAA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 NYCNYQQHPNWMYCYYQLHRAFVQEELGCQSVCKEACSFKEWTLTTSLAQWPSVVSEKWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NYCNYQQHPNWMYCYYQLHRAFVQEELGCQSVCKEACSFKEWTLTTSLAQWPSVVSEKWL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 LPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANSIEMLLSNFGGQLGLWMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANSIEMLLSNFGGQLGLWMS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 CSVVCVIEIIEVFFIDFFSIIARRQWQKAKEWWAWKQAPPCPEAPRSPQGQDNPALDIDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CSVVCVIEIIEVFFIDFFSIIARRQWQKAKEWWAWKQAPPCPEAPRSPQGQDNPALDIDD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640         
pF1KB6 DLPTFNSALHLPPALGTQVPGTPPPKYNTLRLERAFSNQLTDTQMLDEL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DLPTFNSALHLPPALGTQVPGTPPPKYNTLRLERAFSNQLTDTQMLDEL
              610       620       630       640         

>>CCDS10609.1 SCNN1B gene_id:6338|Hs108|chr16             (640 aa)
 initn: 1422 init1: 546 opt: 1306  Z-score: 1339.3  bits: 258.1 E(32554): 2.8e-68
Smith-Waterman score: 1472; 36.7% identity (69.2% similar) in 627 aa overlap (19-633:17-626)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSRGRLRRLLWIGFT
                         :: . : :::. ::: :::::: .::.  .:  .. .:. .:
CCDS10   MHVKKYLLKGLHRLQKGP-GYTYKELLVWYCDNTNTHGPKRIIC-EGPKKKAMWFLLT
                 10         20        30        40         50      

               70        80          90       100       110        
pF1KB6 LTAVALILWQCALLVFSFYT--VSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYSTVRHLLADLE
       :  .::. :: .... .. .  ::::..: :. .::::::::: .:.::: ..::: ::.
CCDS10 LLFAALVCWQWGIFIRTYLSWEVSVSLSVGFKTMDFPAVTICNASPFKYSKIKHLLKDLD
         60        70        80        90       100       110      

      120       130       140        150       160       170       
pF1KB6 QETREALKSLYGFPESRKRREAESWN-SVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQDEKGKAR--DFF
       .  . .:. . . ::  .   ... : :.       ..:  ::...:. .  .    :.:
CCDS10 ELMEAVLERILA-PELSHANATRNLNFSI-------WNHT-PLVLIDERNPHHPMVLDLF
        120        130       140               150       160       

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB6 TGRKRKVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGINAIQEWYKLHYM
          .  . .:   .::. .       ....::: . ..:.  .:.:. .:. ::: :.  
CCDS10 GDNHNGLTSS---SASEKICNAHGCKMAMRLCSLNRTQCTFRNFTSATQALTEWYILQAT
       170          180       190       200       210       220    

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB6 NIMAQVPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNCYTFNNRENETIL
       ::.:::: .. ..::: .:.....:.: .  :. :::: . .: .:::: ::   .:  :
CCDS10 NIFAQVPQQELVEMSYPGEQMILACLFGAEPCNYRNFTSIFYPHYGNCYIFNWGMTEKAL
          230       240       250       260       270       280    

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB6 STSMGGSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDVGTEIETAMVTSI
        ..  :.:.::..:: :..:.: :::.:..:.....:.:  :::..: :    ..  :::
CCDS10 PSANPGTEFGLKLILDIGQEDYVPFLASTAGVRLMLHEQRSYPFIRDEGIYAMSGTETSI
          290       300       310       320       330       340    

         360       370       380          390       400       410  
pF1KB6 GMHLTESFKLSEPYSQCTEDGSDVPIRNIY---NAAYSLQICLHSCFQTKMVEKCGCAQY
       :. . .  ...:::: :: .::.::..:.:   :..::.: ::.:::: .:...:.:..:
CCDS10 GVLVDKLQRMGEPYSPCTVNGSEVPVQNFYSDYNTTYSIQACLRSCFQDHMIRNCNCGHY
          350       360       370       380       390       400    

            420       430       440       450       460       470  
pF1KB6 SQPLPPAANYCNYQQHPNWMYCYYQLHRAFVQEELGCQSVCKEACSFKEWTLTTSLAQWP
         ::: . .::: .. :.: .:: .:. . .:.:  : ..:::.:.  .. .: :.:.::
CCDS10 LYPLPRGEKYCNNRDFPDWAHCYSDLQMSVAQRET-CIGMCKESCNDTQYKMTISMADWP
          410       420       430        440       450       460   

            480       490       500       510       520       530  
pF1KB6 SVVSEKWLLPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANSIEMLLSNFG
       : .:: :.. ::. .. ...:  :..  ..:: :.....: :.: :: ::.:  ::::.:
CCDS10 SEASEDWIFHVLSQERDQSTNITLSRKGIVKLNIYFQEFNYRTIEESAANNIVWLLSNLG
           470       480       490       500       510       520   

            540           550       560       570       580        
pF1KB6 GQLGLWMSCSVVCVIE----IIEVFFIDFFSIIARRQWQKAKEWWAWKQAPPCPEAPRSP
       ::.:.::. ::.:.::    ::.  .: .....:  .  . ..  :   .:: : . .  
CCDS10 GQFGFWMGGSVLCLIEFGEIIIDFVWITIIKLVALAKSLRQRRAQASYAGPP-PTVAELV
           530       540       550       560       570        580  

      590       600       610       620       630       640        
pF1KB6 QGQDNPALDIDDDLPTFNSALHLPPALGTQVPGTPPPKYNTLRLERAFSNQLTDTQMLDE
       ... : ...  :  :   ..   :   .  .::::::.:..:::.               
CCDS10 EAHTNFGFQ-PDTAPRSPNTGPYPSEQALPIPGTPPPNYDSLRLQPLDVIESDSEGDAI 
            590        600       610       620       630       640 

        
pF1KB6 L

>>CCDS8543.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12              (669 aa)
 initn: 1301 init1: 943 opt: 1163  Z-score: 1192.6  bits: 231.0 E(32554): 4.2e-60
Smith-Waterman score: 1332; 34.1% identity (65.9% similar) in 613 aa overlap (24-625:54-653)

                      10        20        30        40         50  
pF1KB6        MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSR-GRLR
                                     . .::....: ::. ::  :.: :. .:..
CCDS85 NKREEQGLGPEPAAPQQPTAEEEALIEFHRSYRELFEFFCNNTTIHGAIRLVCSQHNRMK
            30        40        50        60        70        80   

             60        70        80        90         100       110
pF1KB6 RLLWIGFTLTAVALILWQCALLVFSFYTVSVSIKVHFR--KLDFPAVTICNINPYKYSTV
         .:  . : . ... :: .::   ...  ::.....   :: :::::::..:::.:  .
CCDS85 TAFWAVLWLCTFGMMYWQFGLLFGEYFSYPVSLNINLNSDKLVFPAVTICTLNPYRYPEI
            90       100       110       120       130       140   

              120       130       140       150       160       170
pF1KB6 RHLLADLEQETREALKSLYGFPESRKRREAESWNSVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQDEKGK
       .. : .:.. :...: .:: .          :....  :.. : . :  :    :  .  
CCDS85 KEELEELDRITEQTLFDLYKYS---------SFTTLVAGSRSRRDLRGTLPHPLQRLRVP
           150       160                170       180       190    

              180       190       200       210       220       230
pF1KB6 ARDFFTGRKRKVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGINAIQEWY
            . : :.:..:.  .  .:   . :  .:::::... :::   :.:::..:..:::
CCDS85 PPPHGARRARSVASSLRDNNPQVDWKDWK--IGFQLCNQNKSDCFYQTYSSGVDAVREWY
          200       210       220         230       240       250  

              240       250       260       270       280       290
pF1KB6 KLHYMNIMAQVPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNCYTFNNRE
       ..::.::....:         .  ... .: :. :::.  :.. :::::.:::::::...
CCDS85 RFHYINILSRLPETLPSLEEDTLGNFIFACRFNQVSCNQANYSHFHHPMYGNCYTFNDKN
            260       270       280       290       300       310  

              300       310       320       330       340       350
pF1KB6 NETILSTSMGGSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDVGTEIETA
       : ..  .:: : . ::...:  ..... :.: . :::.:..: :::  :..: : ... .
CCDS85 NSNLWMSSMPGINNGLSLMLRAEQNDFIPLLSTVTGARVMVHGQDEPAFMDDGGFNLRPG
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CCDS44 LRHLELLDEFARENIDSLYNVNLS-KGRAALS-ATV-----PR--HEPP---FHLD----
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CCDS44 ---------REI------RLQRLSHSGSRVRVGFRLCNSTGGDCFYRGYTSGVAAVQDWY
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       ..::..:.: .:   . . . .  .....: .::..:.::.:  :::: .:.::: ..  
CCDS44 HFHYVDILALLPAAWEDSHGSQDGHFVLSCSYDGLDCQARQFRTFHHPTYGSCYTVDG--
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          . ...  :  .:. ..: .... . :.: . .: .:..: ... ::.   .  .. .
CCDS44 ---VWTAQRPGITHGVGLVLRVEQQPHLPLLSTLAGIRVMVHGRNHTPFLGHHSFSVRPG
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         ..:...  :  .:. ::..::  :  : .. ..:..:. : :: ::::  ::: :.:.
CCDS44 TEATISIREDEVHRLGSPYGHCTAGGEGVEVELLHNTSYTRQACLVSCFQQLMVETCSCG
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        : .::: .:.::.  .:: : .:.:.:.. .  ..: : : : . :  . . :.:. ..
CCDS44 YYLHPLPAGAEYCSSARHPAWGHCFYRLYQDLETHRLPCTSRCPRPCRESAFKLSTGTSR
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       :::. :  : : .:  .::   ... ....:::. : :..:: ::. :.:. :. .::: 
CCDS44 WPSAKSAGWTLATLG-EQGLPHQSHRQRSSLAKINIVYQELNYRSVEEAPVYSVPQLLSA
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       .:.  .::.. ::. ..:..:.. .:   .  ... :. ..:  :..: .: :       
CCDS44 MGSLCSLWFGASVLSLLELLELL-LDASALTLVLGGRRLRRA--WFSWPRASPASGASSI
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        ::: . :     ::   .:: :   :. ::: ..   .::                   
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CCDS44 LDT      
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       ..... .:  .: . :.  ...   :... :: .. ..:        .:..:..      
CCDS59 MLRKD-SC--ACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFL--------ARKLNRSEAYIAE
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>>CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7                (531 aa)
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Smith-Waterman score: 391; 24.8% identity (56.9% similar) in 339 aa overlap (251-568:155-475)

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pF1KB6 GNCYTFNN-RENETILSTSMGGSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSS------TGAKVIIHR
       :.:::::.  ..  .:.:. ::   ::...: ...::: :   ..      .: .: :: 
CCDS59 GKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHS
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pF1KB6 QDEYPFVEDVGTEIETAMVTSIGMHLTESFKLSEPYSQCTE---------DGSDVPIRNI
       :.: :.....:  .  .. : .. .  .   :  :...:.          . :: :. . 
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           .  :.:. :  .:    ...:::: .    .:  .  :. ::. :   : .    :
CCDS59 SPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVY--MPGDVPVCSPQQYKN---CAHPAIDA
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       ..... .:  .: . :.  ...   :... :: .. ..:        .:..:..      
CCDS59 MLRKD-SC--ACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFL--------ARKLNRSEAYIAE
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       ..  : ::.. :: ... .. :  .  ::...:::.::... :.. ..::.. .   : .
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CCDS59 KVLGYFWNRQHSQRHSSTNLLQEGLGSHRTQVPHLSLGPRPPTPPCAVTKTLSASHRTCY
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>>CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7                (543 aa)
 initn: 301 init1: 113 opt: 312  Z-score: 322.3  bits: 69.6 E(32554): 1.2e-11
Smith-Waterman score: 391; 24.8% identity (56.9% similar) in 339 aa overlap (251-568:155-475)

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pF1KB6 SGINAIQEWYKLHYMNIMAQVPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMH
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CCDS59 FLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRM-
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pF1KB6 GNCYTFNN-RENETILSTSMGGSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSS------TGAKVIIHR
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CCDS59 GKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHS
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pF1KB6 QDEYPFVEDVGTEIETAMVTSIGMHLTESFKLSEPYSQCTE---------DGSDVPIRNI
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CCDS59 SPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVY--MPGDVPVCSPQQYKN---CAHPAIDA
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pF1KB6 FVQEELGCQSVCKEACSFKEWTLTTSLAQWPSVVSEKWLLPVLTWDQGRQVNKKLN--KT
       ..... .:  .: . :.  ...   :... :: .. ..:        .:..:..      
CCDS59 MLRKD-SC--ACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFL--------ARKLNRSEAYIAE
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pF1KB6 DLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANSIEMLLSNFGGQLGLWMSCSVVCVIEIIEVFFIDFFS
       ..  : ::.. :: ... .. :  .  ::...:::.::... :.. ..::.. .   : .
CCDS59 NVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRD
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