Result of FASTA (ccds) for pF1KB6167
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6167, 649 aa
  1>>>pF1KB6167 649 - 649 aa - 649 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1148+/-0.00113; mu= 15.5420+/- 0.068
 mean_var=81.4132+/-15.925, 0's: 0 Z-trim(103.0): 53  B-trim: 103 in 1/49
 Lambda= 0.142143
 statistics sampled from 7135 (7184) to 7135 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.221), width:  16
 Scan time:  3.140

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31756.1 RECQL gene_id:5965|Hs108|chr12         ( 649) 4277 887.5       0
CCDS73782.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15            (1286) 1156 247.6   8e-65
CCDS10363.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15            (1417) 1156 247.6 8.7e-65
CCDS45777.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17        ( 410)  882 191.2 2.4e-48
CCDS32735.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17        ( 435)  882 191.2 2.6e-48
CCDS42380.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17        ( 991)  882 191.3 5.3e-48
CCDS6082.1 WRN gene_id:7486|Hs108|chr8             (1432)  841 183.0 2.5e-45


>>CCDS31756.1 RECQL gene_id:5965|Hs108|chr12              (649 aa)
 initn: 4277 init1: 4277 opt: 4277  Z-score: 4740.8  bits: 887.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4277; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MASVSALTEELDSITSELHAVEIQIQELTERQQELIQKKKVLTKKIKQCLEDSDAGASNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MASVSALTEELDSITSELHAVEIQIQELTERQQELIQKKKVLTKKIKQCLEDSDAGASNE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 YDSSPAAWNKEDFPWSGKVKDILQNVFKLEKFRPLQLETINVTMAGKEVFLVMPTGGGKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YDSSPAAWNKEDFPWSGKVKDILQNVFKLEKFRPLQLETINVTMAGKEVFLVMPTGGGKS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 LCYQLPALCSDGFTLVICPLISLMEDQLMVLKQLGISATMLNASSSKEHVKWVHAEMVNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LCYQLPALCSDGFTLVICPLISLMEDQLMVLKQLGISATMLNASSSKEHVKWVHAEMVNK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 NSELKLIYVTPEKIAKSKMFMSRLEKAYEARRFTRIAVDEVHCCSQWGHDFRPDYKALGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NSELKLIYVTPEKIAKSKMFMSRLEKAYEARRFTRIAVDEVHCCSQWGHDFRPDYKALGI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 LKRQFPNASLIGLTATATNHVLTDAQKILCIEKCFTFTASFNRPNLYYEVRQKPSNTEDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKRQFPNASLIGLTATATNHVLTDAQKILCIEKCFTFTASFNRPNLYYEVRQKPSNTEDF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 IEDIVKLINGRYKGQSGIIYCFSQKDSEQVTVSLQNLGIHAGAYHANLEPEDKTTVHRKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IEDIVKLINGRYKGQSGIIYCFSQKDSEQVTVSLQNLGIHAGAYHANLEPEDKTTVHRKW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 SANEIQVVVATVAFGMGIDKPDVRFVIHHSMSKSMENYYQESGRAGRDDMKADCILYYGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SANEIQVVVATVAFGMGIDKPDVRFVIHHSMSKSMENYYQESGRAGRDDMKADCILYYGF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 GDIFRISSMVVMENVGQQKLYEMVSYCQNISKCRRVLMAQHFDEVWNSEACNKMCDNCCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GDIFRISSMVVMENVGQQKLYEMVSYCQNISKCRRVLMAQHFDEVWNSEACNKMCDNCCK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 DSAFERKNITEYCRDLIKILKQAEELNEKLTPLKLIDSWMGKGAAKLRVAGVVAPTLPRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DSAFERKNITEYCRDLIKILKQAEELNEKLTPLKLIDSWMGKGAAKLRVAGVVAPTLPRE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 DLEKIIAHFLIQQYLKEDYSFTAYATISYLKIGPKANLLNNEAHAITMQVTKSTQNSFRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DLEKIIAHFLIQQYLKEDYSFTAYATISYLKIGPKANLLNNEAHAITMQVTKSTQNSFRA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640         
pF1KB6 ESSQTCHSEQGDKKMEEKNSGNFQKKAANMLQQSGSKNTGAKKRKIDDA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ESSQTCHSEQGDKKMEEKNSGNFQKKAANMLQQSGSKNTGAKKRKIDDA
              610       620       630       640         

>>CCDS73782.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15                 (1286 aa)
 initn: 1215 init1: 632 opt: 1156  Z-score: 1277.2  bits: 247.6 E(32554): 8e-65
Smith-Waterman score: 1210; 42.5% identity (72.4% similar) in 445 aa overlap (73-502:649-1090)

             50        60        70        80        90       100  
pF1KB6 TKKIKQCLEDSDAGASNEYDSSPAAWNKEDFPWSGKVKDILQNVFKLEKFRPLQLETINV
                                     :: . ..  :... : :..::  :::.::.
CCDS73 FSESIQNYTDKSAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKEMMKIFHKKFGLHNFRTNQLEAINA
      620       630       640       650       660       670        

            110       120       130       140       150       160  
pF1KB6 TMAGKEVFLVMPTGGGKSLCYQLPALCSDGFTLVICPLISLMEDQLMVLKQLGISATMLN
       .. :.. :..:::::::::::::::  : : :.:: :: ::. ::.. : .: : ::.:.
CCDS73 ALLGEDCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLIVDQVQKLTSLDIPATYLT
      680       690       700       710       720       730        

            170       180       190       200       210       220  
pF1KB6 ASSSKEHVKWVHAEMVNKNSELKLIYVTPEKIAKSKMFMSRLEKAYEARRFTRIAVDEVH
       ....  ..  .. .. .:.  .::.:::::::  :. ..: ::. :: . ..:...::.:
CCDS73 GDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTLENLYERKLLARFVIDEAH
      740       750       760       770       780       790        

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB6 CCSQWGHDFRPDYKALGILKRQFPNASLIGLTATATNHVLTDAQKILCIEKCFTFTASFN
       : :::::::: ::: ...:...::.. ...:::::. .:  :    : : .  .:. :::
CCDS73 CVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKDILTQLKILRPQVFSMSFN
      800       810       820       830       840       850        

             290       300       310       320       330       340 
pF1KB6 RPNL-YYEVRQKPSNTEDFIEDIVKLINGRYKGQSGIIYCFSQKDSEQVTVSLQNLGIHA
       : :: :: . .::...  :  : .. :  ..  .::::::.:... . .. .::  :. :
CCDS73 RHNLKYYVLPKKPKKVA-F--DCLEWIRKHHPYDSGIIYCLSRRECDTMADTLQRDGLAA
      860       870          880       890       900       910     

             350       360        370       380       390       400
pF1KB6 GAYHANLEPEDKTTVHRKW-SANEIQVVVATVAFGMGIDKPDVRFVIHHSMSKSMENYYQ
        ::::.:    .  :..:: . .  ::. ::.:::::::::::::::: :. ::.:.:::
CCDS73 LAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRFVIHASLPKSVEGYYQ
         920       930       940       950       960       970     

              410       420       430               440       450  
pF1KB6 ESGRAGRDDMKADCILYYGFGDIFRISSMVVMENVGQQK--------LYEMVSYCQNISK
       ::::::::   . :.:.: . :. :.. ...::. :...        :: :: ::.::..
CCDS73 ESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLIMMEKDGNHHTRETHFNNLYSMVHYCENITE
         980       990      1000      1010      1020      1030     

            460        470           480       490       500       
pF1KB6 CRRVLMAQHFDEV-WNSEACNKM----CDNCCKDSAFERKNITEYCRDLIKILKQAEELN
       :::. .  .: :  .: . :.:     :::::: . .. ...:.  .........     
CCDS73 CRRIQLLAYFGENGFNPDFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVTDDVKSIVRFVQEHSSSQ
        1040      1050      1060      1070      1080      1090     

       510       520       530       540       550       560       
pF1KB6 EKLTPLKLIDSWMGKGAAKLRVAGVVAPTLPREDLEKIIAHFLIQQYLKEDYSFTAYATI
                                                                   
CCDS73 GMRNIKHVGPSGRFTMNMLVDIFLESLSSDPEVLLQIDGVTEDKLEKYGAEVISVLQKYS
        1100      1110      1120      1130      1140      1150     

>>CCDS10363.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15                 (1417 aa)
 initn: 1215 init1: 632 opt: 1156  Z-score: 1276.6  bits: 247.6 E(32554): 8.7e-65
Smith-Waterman score: 1265; 38.1% identity (69.5% similar) in 567 aa overlap (73-604:649-1210)

             50        60        70        80        90       100  
pF1KB6 TKKIKQCLEDSDAGASNEYDSSPAAWNKEDFPWSGKVKDILQNVFKLEKFRPLQLETINV
                                     :: . ..  :... : :..::  :::.::.
CCDS10 FSESIQNYTDKSAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKEMMKIFHKKFGLHNFRTNQLEAINA
      620       630       640       650       660       670        

            110       120       130       140       150       160  
pF1KB6 TMAGKEVFLVMPTGGGKSLCYQLPALCSDGFTLVICPLISLMEDQLMVLKQLGISATMLN
       .. :.. :..:::::::::::::::  : : :.:: :: ::. ::.. : .: : ::.:.
CCDS10 ALLGEDCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLIVDQVQKLTSLDIPATYLT
      680       690       700       710       720       730        

            170       180       190       200       210       220  
pF1KB6 ASSSKEHVKWVHAEMVNKNSELKLIYVTPEKIAKSKMFMSRLEKAYEARRFTRIAVDEVH
       ....  ..  .. .. .:.  .::.:::::::  :. ..: ::. :: . ..:...::.:
CCDS10 GDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTLENLYERKLLARFVIDEAH
      740       750       760       770       780       790        

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB6 CCSQWGHDFRPDYKALGILKRQFPNASLIGLTATATNHVLTDAQKILCIEKCFTFTASFN
       : :::::::: ::: ...:...::.. ...:::::. .:  :    : : .  .:. :::
CCDS10 CVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKDILTQLKILRPQVFSMSFN
      800       810       820       830       840       850        

             290       300       310       320       330       340 
pF1KB6 RPNL-YYEVRQKPSNTEDFIEDIVKLINGRYKGQSGIIYCFSQKDSEQVTVSLQNLGIHA
       : :: :: . .::...  :  : .. :  ..  .::::::.:... . .. .::  :. :
CCDS10 RHNLKYYVLPKKPKKVA-F--DCLEWIRKHHPYDSGIIYCLSRRECDTMADTLQRDGLAA
      860       870          880       890       900       910     

             350       360        370       380       390       400
pF1KB6 GAYHANLEPEDKTTVHRKW-SANEIQVVVATVAFGMGIDKPDVRFVIHHSMSKSMENYYQ
        ::::.:    .  :..:: . .  ::. ::.:::::::::::::::: :. ::.:.:::
CCDS10 LAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRFVIHASLPKSVEGYYQ
         920       930       940       950       960       970     

              410       420       430               440       450  
pF1KB6 ESGRAGRDDMKADCILYYGFGDIFRISSMVVMENVGQQK--------LYEMVSYCQNISK
       ::::::::   . :.:.: . :. :.. ...::. :...        :: :: ::.::..
CCDS10 ESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLIMMEKDGNHHTRETHFNNLYSMVHYCENITE
         980       990      1000      1010      1020      1030     

            460        470           480       490       500       
pF1KB6 CRRVLMAQHFDEV-WNSEACNKM----CDNCCKDSAFERKNITEYCRDLIKILKQAEELN
       :::. .  .: :  .: . :.:     :::::: . .. ...:.  ....... : .  .
CCDS10 CRRIQLLAYFGENGFNPDFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVTDDVKSIVRFV-QEHSSS
        1040      1050      1060      1070      1080       1090    

       510                   520       530         540       550   
pF1KB6 EKLTPLK------------LIDSWMGKGAAKLRVAGVVAP--TLPREDLEKIIAHFLIQQ
       . .  .:            :.: ..:. .::.. .:. .   .  :.. :... ......
CCDS10 QGMRNIKHVGPSGRFTMNMLVDIFLGSKSAKIQ-SGIFGKGSAYSRHNAERLFKKLILDK
         1100      1110      1120       1130      1140      1150   

           560        570        580       590           600       
pF1KB6 YLKEDYSFTAY-ATISYLKIGPKAN-LLNNEAHAITMQVTKST----QNSFRAESSQTCH
        : ::  ..:   .:.:. .: ::. .::.. ..  :.. .:.    :... :. ::   
CCDS10 ILDEDLYINANDQAIAYVMLGNKAQTVLNGNLKVDFMETENSSSVKKQKALVAKVSQREE
          1160      1170      1180      1190      1200      1210   

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pF1KB6 SEQGDKKMEEKNSGNFQKKAANMLQQSGSKNTGAKKRKIDDA                  
                                                                   
CCDS10 MVKKCLGELTEVCKSLGKVFGVHYFNIFNTVTLKKLAESLSSDPEVLLQIDGVTEDKLEK
          1220      1230      1240      1250      1260      1270   

>>CCDS45777.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17             (410 aa)
 initn: 806 init1: 365 opt: 882  Z-score: 981.3  bits: 191.2 E(32554): 2.4e-48
Smith-Waterman score: 885; 39.9% identity (69.3% similar) in 378 aa overlap (73-439:8-384)

             50        60        70          80        90          
pF1KB6 TKKIKQCLEDSDAGASNEYDSSPAAWNKEDFPWSG--KVKDILQNVFKLEKFR-PLQLE-
                                     ::..   .:.. :..:: ...:. :::   
CCDS45                        MSSHHTTFPFDPERRVRSTLKKVFGFDSFKTPLQESA
                                      10        20        30       

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB6 TINVTMAGKEVFLVMPTGGGKSLCYQLPALCSDGFTLVICPLISLMEDQLMVLKQLGISA
       :. :. ..:.::. ::::.::::::::::: . :.:.:. :::.:..::.  :  : . .
CCDS45 TMAVVKGNKDVFVCMPTGAGKSLCYQLPALLAKGITIVVSPLIALIQDQVDHLLTLKVRV
        40        50        60        70        80        90       

      160       170       180       190       200       210        
pF1KB6 TMLNASSSKEHVKWVHAEMVNKNSELKLIYVTPEKIAKSKMFMSRLEKAYEARRFTRIAV
       . ::.. : .. : . :..  .. . :..:.::: .: :. :.  :..    . .. ..:
CCDS45 SSLNSKLSAQERKELLADLEREKPQTKILYITPE-MAASSSFQPTLNSLVSRHLLSYLVV
       100       110       120       130        140       150      

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pF1KB6 DEVHCCSQWGHDFRPDYKALGILKRQFPNASLIGLTATATNHVLTDAQKILCIEKCFT-F
       ::.:: :::::::::::  :: :. .. .:  ..:::::: .:  :.   : ..:  . :
CCDS45 DEAHCVSQWGHDFRPDYLRLGALRSRLGHAPCVALTATATPQVQEDVFAALHLKKPVAIF
        160       170       180       190       200       210      

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pF1KB6 TASFNRPNLYYEVRQKPSNTEDF--IEDIVKLINGRY--KGQSG--IIYCFSQKDSEQVT
        .   : ::.:.:. :   .. .  ..:.     :.   :: ::  :.:: ...  ::..
CCDS45 KTPCFRANLFYDVQFKELISDPYGNLKDFCLKALGQEADKGLSGCGIVYCRTREACEQLA
        220       230       240       250       260       270      

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pF1KB6 VSLQNLGIHAGAYHANLEPEDKTTVHRKWSANEIQVVVATVAFGMGIDKPDVRFVIHHSM
       . :.  :..: ::::.:.  ..: :.  :  ... :.:::..::::.:: .:::: : ..
CCDS45 IELSCRGVNAKAYHAGLKASERTLVQNDWMEEKVPVIVATISFGMGVDKANVRFVAHWNI
        280       290       300       310       320       330      

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pF1KB6 SKSMENYYQESGRAGRDDMKADCILYYGFGDIFRISSMVVMENVGQQKLYEMVSYCQNIS
       .::: .:::::::::::   . : :::. .:  ..: ..  : .  :.            
CCDS45 AKSMAGYYQESGRAGRDGKPSWCRLYYSRNDRDQVSFLIRKEVAKLQEKRGNKASDKATI
        340       350       360       370       380       390      

             460       470       480       490       500       510 
pF1KB6 KCRRVLMAQHFDEVWNSEACNKMCDNCCKDSAFERKNITEYCRDLIKILKQAEELNEKLT
                                                                   
CCDS45 MAFDALVTFCEELG                                              
        400       410                                              

>>CCDS32735.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17             (435 aa)
 initn: 806 init1: 365 opt: 882  Z-score: 980.9  bits: 191.2 E(32554): 2.6e-48
Smith-Waterman score: 885; 39.9% identity (69.3% similar) in 378 aa overlap (73-439:8-384)

             50        60        70          80        90          
pF1KB6 TKKIKQCLEDSDAGASNEYDSSPAAWNKEDFPWSG--KVKDILQNVFKLEKFR-PLQLE-
                                     ::..   .:.. :..:: ...:. :::   
CCDS32                        MSSHHTTFPFDPERRVRSTLKKVFGFDSFKTPLQESA
                                      10        20        30       

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB6 TINVTMAGKEVFLVMPTGGGKSLCYQLPALCSDGFTLVICPLISLMEDQLMVLKQLGISA
       :. :. ..:.::. ::::.::::::::::: . :.:.:. :::.:..::.  :  : . .
CCDS32 TMAVVKGNKDVFVCMPTGAGKSLCYQLPALLAKGITIVVSPLIALIQDQVDHLLTLKVRV
        40        50        60        70        80        90       

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pF1KB6 TMLNASSSKEHVKWVHAEMVNKNSELKLIYVTPEKIAKSKMFMSRLEKAYEARRFTRIAV
       . ::.. : .. : . :..  .. . :..:.::: .: :. :.  :..    . .. ..:
CCDS32 SSLNSKLSAQERKELLADLEREKPQTKILYITPE-MAASSSFQPTLNSLVSRHLLSYLVV
       100       110       120       130        140       150      

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pF1KB6 DEVHCCSQWGHDFRPDYKALGILKRQFPNASLIGLTATATNHVLTDAQKILCIEKCFT-F
       ::.:: :::::::::::  :: :. .. .:  ..:::::: .:  :.   : ..:  . :
CCDS32 DEAHCVSQWGHDFRPDYLRLGALRSRLGHAPCVALTATATPQVQEDVFAALHLKKPVAIF
        160       170       180       190       200       210      

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pF1KB6 TASFNRPNLYYEVRQKPSNTEDF--IEDIVKLINGRY--KGQSG--IIYCFSQKDSEQVT
        .   : ::.:.:. :   .. .  ..:.     :.   :: ::  :.:: ...  ::..
CCDS32 KTPCFRANLFYDVQFKELISDPYGNLKDFCLKALGQEADKGLSGCGIVYCRTREACEQLA
        220       230       240       250       260       270      

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pF1KB6 VSLQNLGIHAGAYHANLEPEDKTTVHRKWSANEIQVVVATVAFGMGIDKPDVRFVIHHSM
       . :.  :..: ::::.:.  ..: :.  :  ... :.:::..::::.:: .:::: : ..
CCDS32 IELSCRGVNAKAYHAGLKASERTLVQNDWMEEKVPVIVATISFGMGVDKANVRFVAHWNI
        280       290       300       310       320       330      

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pF1KB6 SKSMENYYQESGRAGRDDMKADCILYYGFGDIFRISSMVVMENVGQQKLYEMVSYCQNIS
       .::: .:::::::::::   . : :::. .:  ..: ..  : .  :.            
CCDS32 AKSMAGYYQESGRAGRDGKPSWCRLYYSRNDRDQVSFLIRKEVAKLQEKRGNKASDKATI
        340       350       360       370       380       390      

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pF1KB6 KCRRVLMAQHFDEVWNSEACNKMCDNCCKDSAFERKNITEYCRDLIKILKQAEELNEKLT
                                                                   
CCDS32 MAFDALVTFCEELGRWGRGHGKSLRAAWCSQVVSRHAEL                     
        400       410       420       430                          

>>CCDS42380.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17             (991 aa)
 initn: 889 init1: 365 opt: 882  Z-score: 975.3  bits: 191.3 E(32554): 5.3e-48
Smith-Waterman score: 952; 37.5% identity (68.0% similar) in 440 aa overlap (73-487:8-443)

             50        60        70          80        90          
pF1KB6 TKKIKQCLEDSDAGASNEYDSSPAAWNKEDFPWSG--KVKDILQNVFKLEKFR-PLQLE-
                                     ::..   .:.. :..:: ...:. :::   
CCDS42                        MSSHHTTFPFDPERRVRSTLKKVFGFDSFKTPLQESA
                                      10        20        30       

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB6 TINVTMAGKEVFLVMPTGGGKSLCYQLPALCSDGFTLVICPLISLMEDQLMVLKQLGISA
       :. :. ..:.::. ::::.::::::::::: . :.:.:. :::.:..::.  :  : . .
CCDS42 TMAVVKGNKDVFVCMPTGAGKSLCYQLPALLAKGITIVVSPLIALIQDQVDHLLTLKVRV
        40        50        60        70        80        90       

      160       170       180       190       200       210        
pF1KB6 TMLNASSSKEHVKWVHAEMVNKNSELKLIYVTPEKIAKSKMFMSRLEKAYEARRFTRIAV
       . ::.. : .. : . :..  .. . :..:.::: .: :. :.  :..    . .. ..:
CCDS42 SSLNSKLSAQERKELLADLEREKPQTKILYITPE-MAASSSFQPTLNSLVSRHLLSYLVV
       100       110       120       130        140       150      

      220       230       240       250       260       270        
pF1KB6 DEVHCCSQWGHDFRPDYKALGILKRQFPNASLIGLTATATNHVLTDAQKILCIEKCFT-F
       ::.:: :::::::::::  :: :. .. .:  ..:::::: .:  :.   : ..:  . :
CCDS42 DEAHCVSQWGHDFRPDYLRLGALRSRLGHAPCVALTATATPQVQEDVFAALHLKKPVAIF
        160       170       180       190       200       210      

       280       290       300         310           320       330 
pF1KB6 TASFNRPNLYYEVRQKPSNTEDF--IEDIVKLINGRY--KGQSG--IIYCFSQKDSEQVT
        .   : ::.:.:. :   .. .  ..:.     :.   :: ::  :.:: ...  ::..
CCDS42 KTPCFRANLFYDVQFKELISDPYGNLKDFCLKALGQEADKGLSGCGIVYCRTREACEQLA
        220       230       240       250       260       270      

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB6 VSLQNLGIHAGAYHANLEPEDKTTVHRKWSANEIQVVVATVAFGMGIDKPDVRFVIHHSM
       . :.  :..: ::::.:.  ..: :.  :  ... :.:::..::::.:: .:::: : ..
CCDS42 IELSCRGVNAKAYHAGLKASERTLVQNDWMEEKVPVIVATISFGMGVDKANVRFVAHWNI
        280       290       300       310       320       330      

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pF1KB6 SKSMENYYQESGRAGRDDMKADCILYYGFGDIFRISSMV------VMENVGQQK------
       .::: .:::::::::::   . : :::. .:  ..: ..      ..:. :..       
CCDS42 AKSMAGYYQESGRAGRDGKPSWCRLYYSRNDRDQVSFLIRKEVAKLQEKRGNKASDKATI
        340       350       360       370       380       390      

       440       450       460       470       480       490       
pF1KB6 --LYEMVSYCQNISKCRRVLMAQHFDEVWNSEACNKMCDNCCKDSAFERKNITEYCRDLI
         .  .:..:.... ::.. .:..: ..    :: : ::.: . .: .:.          
CCDS42 MAFDALVTFCEELG-CRHAAIAKYFGDAL--PACAKGCDHCQNPTAVRRRLEALERSSSW
        400       410        420         430       440       450   

       500       510       520       530       540       550       
pF1KB6 KILKQAEELNEKLTPLKLIDSWMGKGAAKLRVAGVVAPTLPREDLEKIIAHFLIQQYLKE
                                                                   
CCDS42 SKTCIGPSQGNGFDPELYEGGRKGYGDFSRYDEGSGGSGDEGRDEAHKREWNLFYQKQMQ
           460       470       480       490       500       510   

>>CCDS6082.1 WRN gene_id:7486|Hs108|chr8                  (1432 aa)
 initn: 841 init1: 343 opt: 841  Z-score: 927.4  bits: 183.0 E(32554): 2.5e-45
Smith-Waterman score: 855; 34.6% identity (64.0% similar) in 483 aa overlap (51-510:509-977)

               30        40        50        60        70        80
pF1KB6 VEIQIQELTERQQELIQKKKVLTKKIKQCLEDSDAGASNEYDSSPAAWNKEDFPWSGKVK
                                     :..: . .:: . .    . .:: : .  .
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