Result of FASTA (ccds) for pF1KB5419
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5419, 318 aa
  1>>>pF1KB5419 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5464+/-0.00147; mu= 14.7346+/- 0.086
 mean_var=112.6101+/-34.735, 0's: 0 Z-trim(100.0): 452  B-trim: 1008 in 3/43
 Lambda= 0.120861
 statistics sampled from 5379 (5962) to 5379 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.487), E-opt: 0.2 (0.183), width:  16
 Scan time:  2.310

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1            ( 318) 2063 371.5 4.9e-103
CCDS1434.1 ADORA1 gene_id:134|Hs108|chr1           ( 326)  859 161.6 7.8e-40
CCDS838.1 TMIGD3 gene_id:57413|Hs108|chr1          ( 347)  728 138.7 6.2e-33
CCDS81358.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1          ( 123)  714 135.8 1.7e-32
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22        ( 412)  582 113.4 3.2e-25
CCDS11173.1 ADORA2B gene_id:136|Hs108|chr17        ( 332)  462 92.3 5.5e-19
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5            ( 359)  404 82.3 6.4e-16
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5           ( 397)  404 82.3 6.8e-16
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10          ( 478)  369 76.3 5.3e-14
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18         ( 349)  348 72.5 5.5e-13
CCDS31072.1 OPN3 gene_id:23596|Hs108|chr1          ( 402)  345 72.0 8.6e-13
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5          ( 422)  341 71.4 1.4e-12
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6           ( 337)  332 69.7 3.7e-12
CCDS3687.1 RRH gene_id:10692|Hs108|chr4            ( 337)  328 69.0   6e-12
CCDS31237.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10         ( 489)  330 69.5   6e-12
CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1            ( 382)  322 68.0 1.3e-11
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20        ( 333)  318 67.2   2e-11
CCDS8290.1 MTNR1B gene_id:4544|Hs108|chr11         ( 362)  318 67.3 2.1e-11
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8            ( 408)  316 67.0 2.9e-11
CCDS3848.1 MTNR1A gene_id:4543|Hs108|chr4          ( 350)  315 66.7 2.9e-11
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  313 66.4 3.9e-11
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6         ( 345)  310 65.9 5.3e-11
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11          ( 460)  311 66.2 5.7e-11


>>CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1                 (318 aa)
 initn: 2063 init1: 2063 opt: 2063  Z-score: 1963.3  bits: 371.5 E(32554): 4.9e-103
Smith-Waterman score: 2063; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYHRNVTFLSCQFVSVMRMDYMVYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYHRNVTFLSCQFVSVMRMDYMVYF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLNLSNSKETGAFYGREFKTAKSLFLVLFLFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLNLSNSKETGAFYGREFKTAKSLFLVLFLFA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 LSWLPLSIINCIIYFNGEVPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAYKIKKFKETYLLILKAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LSWLPLSIINCIIYFNGEVPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAYKIKKFKETYLLILKAC
              250       260       270       280       290       300

              310        
pF1KB5 VVCHPSDSLDTSIEKNSE
       ::::::::::::::::::
CCDS83 VVCHPSDSLDTSIEKNSE
              310        

>>CCDS1434.1 ADORA1 gene_id:134|Hs108|chr1                (326 aa)
 initn: 954 init1: 533 opt: 859  Z-score: 828.6  bits: 161.6 E(32554): 7.8e-40
Smith-Waterman score: 1010; 48.8% identity (78.9% similar) in 322 aa overlap (1-313:1-319)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
       :: . .:.. :   :: .:..:.: .. :::::: .::.: .:. .:: ::::::.::.:
CCDS14 MPPSISAFQAA---YIGIEVLIALVSVPGNVLVIWAVKVNQALRDATFCFIVSLAVADVA
               10           20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
       ::.::.::::....:   .:..::...: .::.:..::..:::::::::::::. .::: 
CCDS14 VGALVIPLAILINIGPQTYFHTCLMVACPVLILTQSSILALLAIAVDRYLRVKIPLRYKM
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150         160           170    
pF1KB5 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSE--YHRNVTF----LSCQFVSVMRM
       :.: ::  .:.. ::..::.::::::::::   . :  .  : ..    ..:.: .:. :
CCDS14 VVTPRRAAVAIAGCWILSFVVGLTPMFGWNNLSAVERAWAANGSMGEPVIKCEFEKVISM
       120       130       140       150       160       170       

          180       190       200       210        220       230   
pF1KB5 DYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLNLSNSK-ETGAFYGREFKTAKSLF
       .:::::.:..:.. ::..:  :::..::.::..:. ..: :. .   .::.:.: :::: 
CCDS14 EYMVYFNFFVWVLPPLLLMVLIYLEVFYLIRKQLNKKVSASSGDPQKYYGKELKIAKSLA
       180       190       200       210       220       230       

           240       250         260       270       280       290 
pF1KB5 LVLFLFALSWLPLSIINCIIYF--NGEVPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAYKIKKFKE
       :.::::::::::: :.:::  :  . . :... :..:.:.:.:: :::::::..:.::. 
CCDS14 LILFLFALSWLPLHILNCITLFCPSCHKPSILTYIAIFLTHGNSAMNPIVYAFRIQKFRV
       240       250       260       270       280       290       

             300       310          
pF1KB5 TYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE  
       :.: : .    :.:.  .: ..       
CCDS14 TFLKIWNDHFRCQPAPPIDEDLPEERPDD
       300       310       320      

>>CCDS838.1 TMIGD3 gene_id:57413|Hs108|chr1               (347 aa)
 initn: 728 init1: 728 opt: 728  Z-score: 704.8  bits: 138.7 E(32554): 6.2e-33
Smith-Waterman score: 728; 98.3% identity (100.0% similar) in 119 aa overlap (1-119:1-119)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. 
CCDS83 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRFRI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYHRNVTFLSCQFVSVMRMDYMVYF
                                                                   
CCDS83 PGLPGCILSFQLKVCFLPVMWLFILLSLALISDAMVMDEKVKRSFVLDTASAICNYNAHY
              130       140       150       160       170       180

>>CCDS81358.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1               (123 aa)
 initn: 714 init1: 714 opt: 714  Z-score: 697.0  bits: 135.8 E(32554): 1.7e-32
Smith-Waterman score: 714; 100.0% identity (100.0% similar) in 116 aa overlap (1-116:1-116)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::    
CCDS81 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVSSIS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYHRNVTFLSCQFVSVMRMDYMVYF
                                                                   
CCDS81 PTL                                                         
                                                                   

>>CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22             (412 aa)
 initn: 770 init1: 474 opt: 582  Z-score: 566.3  bits: 113.4 E(32554): 3.2e-25
Smith-Waterman score: 811; 41.6% identity (75.4% similar) in 305 aa overlap (10-302:4-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
                ... .:::.:. :.. ::.:::::  .: :: .::..: ::.:::: ::::
CCDS13       MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIA
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
       ::::..:.::..: :.    ..:::..:..:..:..::.::::::.:::. ... .::. 
CCDS13 VGVLAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNG
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160             170    
pF1KB5 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYHRNVTF------LSCQFVSVMRM
       ..:  :    ...::..:: .:::::.:::     .  .: .       ..: : .:. :
CCDS13 LVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPM
          120       130       140       150       160       170    

          180       190       200       210          220       230 
pF1KB5 DYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLNLSN---SKETGAFYGREFKTAKS
       .:::::.:.. ...::..: ..:: ::   : .:.   :.   .... .   .: ..:::
CCDS13 NYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAAKS
          180       190       200       210       220       230    

             240       250          260       270       280        
pF1KB5 LFLVLFLFALSWLPLSIINCIIYFNGE---VPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAYKIKK
       : ... :::: :::: ::::. .:  .   .:  ..:..:.:::.::..::..:::.:..
CCDS13 LAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIRE
          240       250       260       270       280       290    

      290       300       310                                      
pF1KB5 FKETYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE                              
       :..:.  :... :.                                              
CCDS13 FRQTFRKIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHP
          300       310       320       330       340       350    

>>CCDS11173.1 ADORA2B gene_id:136|Hs108|chr17             (332 aa)
 initn: 740 init1: 452 opt: 462  Z-score: 454.4  bits: 92.3 E(32554): 5.5e-19
Smith-Waterman score: 766; 39.3% identity (71.9% similar) in 313 aa overlap (8-304:3-312)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
              :   .. :...:. :.  ...:::::  .:    .::: : ::.:::: ::.:
CCDS11      MLLETQDALYVALELVIAALSVAGNVLVCAAVGTANTLQTPTNYFLVSLAAADVA
                    10        20        30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
       ::....:.::..:::.   ::.:::..:..:..:..::.::::.:::::: . . .::: 
CCDS11 VGLFAIPFAITISLGFCTDFYGCLFLACFVLVLTQSSIFSLLAVAVDRYLAICVPLRYKS
          60        70        80        90       100       110     

              130       140       150                 160       170
pF1KB5 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYH----------RNVTFLSCQFVS
       ..:  :   .... :...: .::::..::: : ..  .          ..  ...: : .
CCDS11 LVTGTRARGVIAVLWVLAFGIGLTPFLGWNSKDSATNNCTEPWDGTTNESCCLVKCLFEN
         120       130       140       150       160       170     

              180       190       200       210         220        
pF1KB5 VMRMDYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLN--LSNSKETGAFYGREFKT
       :. :.:::::.:.  .. ::..: .::. :: .   .:. .  ...:. :     ::...
CCDS11 VVPMSYMVYFNFFGCVLPPLLIMLVIYIKIFLVACRQLQRTELMDHSRTT---LQREIHA
         180       190       200       210       220          230  

      230       240       250           260       270       280    
pF1KB5 AKSLFLVLFLFALSWLPLSIINCIIYFN---GEV-PQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAY
       :::: ... .::: :::.  .::.  :.   :.  :. .. :.::::::::..:::::::
CCDS11 AKSLAMIVGIFALCWLPVHAVNCVTLFQPAQGKNKPKWAMNMAILLSHANSVVNPIVYAY
            240       250       260       270       280       290  

          290       300       310              
pF1KB5 KIKKFKETYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE      
       . . :. :.  :..  ..:.                    
CCDS11 RNRDFRYTFHKIISRYLLCQADVKSGNGQAGVQPALGVGL
            300       310       320       330  

>>CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5                 (359 aa)
 initn: 275 init1: 121 opt: 404  Z-score: 399.3  bits: 82.3 E(32554): 6.4e-16
Smith-Waterman score: 404; 29.7% identity (63.8% similar) in 323 aa overlap (4-317:13-321)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB5          MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFI
                   .::: ... .: ... ..: : ...:::.:  .: ::  :.. :  ::
CCDS43 MAPNGTASSFCLDSTACKIT-IT-VVLAVLI-LITVAGNVVVCLAVGLNRRLRNLTNCFI
               10        20           30        40        50       

              60        70        80          90       100         
pF1KB5 VSLALADIAVGVLVMPLAIVVSLGITIHFYS--CLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRY
       ::::..:. .:.::.:.. . .:.    : .  : ..: : ...  :::..:. :..:::
CCDS43 VSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRY
        60        70        80        90       100       110       

     110       120       130       140        150        160       
pF1KB5 LRVKLTVRYKRVTTHRRIWLALGLCWLVSFLVG-LTPMFGWNMKLTSEYHR-NVTFLSCQ
         :   .::  ..:  :. ..: : :..:. .. :.  .::: .  .:  . : :  .:.
CCDS43 CAVMDPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSR--NETSKGNHTTSKCK
       120       130       140       150       160         170     

       170       180       190       200        210       220      
pF1KB5 FVSVMRMDYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLS-LNLSNSKETGAFYGREF
        :.: ..  .:  . :. ...::..::  :  :: . :.. . .:  .: .....  :: 
CCDS43 -VQVNEVYGLV--DGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHISSWKAATI--REH
          180         190       200       210       220         230

        230       240       250           260       270       280  
pF1KB5 KTAKSLFLVLFLFALSWLPLSIINCIIY--FNGE--VPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVY
       :.. .:  :.  : . :.:   .. ..:  . :.  . ...  . . :..::: .:::.:
CCDS43 KATVTLAAVMGAFIICWFP--YFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSALNPILY
              240         250       260       270       280        

            290       300       310                                
pF1KB5 AYKIKKFKETYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE                        
       :   . :.  :  ..  :      .:  ::...:.                         
CCDS43 AALNRDFRTGYQQLF--CCRLANRNSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQVWS
      290       300         310       320       330       340      

CCDS43 GTEVTAPQGATDR
        350         

>>CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5                (397 aa)
 initn: 275 init1: 121 opt: 404  Z-score: 398.8  bits: 82.3 E(32554): 6.8e-16
Smith-Waterman score: 404; 29.7% identity (63.8% similar) in 323 aa overlap (4-317:13-321)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB5          MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFI
                   .::: ... .: ... ..: : ...:::.:  .: ::  :.. :  ::
CCDS47 MAPNGTASSFCLDSTACKIT-IT-VVLAVLI-LITVAGNVVVCLAVGLNRRLRNLTNCFI
               10        20           30        40        50       

              60        70        80          90       100         
pF1KB5 VSLALADIAVGVLVMPLAIVVSLGITIHFYS--CLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRY
       ::::..:. .:.::.:.. . .:.    : .  : ..: : ...  :::..:. :..:::
CCDS47 VSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRY
        60        70        80        90       100       110       

     110       120       130       140        150        160       
pF1KB5 LRVKLTVRYKRVTTHRRIWLALGLCWLVSFLVG-LTPMFGWNMKLTSEYHR-NVTFLSCQ
         :   .::  ..:  :. ..: : :..:. .. :.  .::: .  .:  . : :  .:.
CCDS47 CAVMDPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSR--NETSKGNHTTSKCK
       120       130       140       150       160         170     

       170       180       190       200        210       220      
pF1KB5 FVSVMRMDYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLS-LNLSNSKETGAFYGREF
        :.: ..  .:  . :. ...::..::  :  :: . :.. . .:  .: .....  :: 
CCDS47 -VQVNEVYGLV--DGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHISSWKAATI--REH
          180         190       200       210       220         230

        230       240       250           260       270       280  
pF1KB5 KTAKSLFLVLFLFALSWLPLSIINCIIY--FNGE--VPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVY
       :.. .:  :.  : . :.:   .. ..:  . :.  . ...  . . :..::: .:::.:
CCDS47 KATVTLAAVMGAFIICWFP--YFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSALNPILY
              240         250       260       270       280        

            290       300       310                                
pF1KB5 AYKIKKFKETYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE                        
       :   . :.  :  ..  :      .:  ::...:.                         
CCDS47 AALNRDFRTGYQQLF--CCRLANRNSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQVWS
      290       300         310       320       330       340      

CCDS47 GTEVTAPQGATDRPWLCLPECWSVELTHSFIHLFIHSFANIHPIPTTCQEL
        350       360       370       380       390       

>>CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10               (478 aa)
 initn: 292 init1: 106 opt: 369  Z-score: 364.8  bits: 76.3 E(32554): 5.3e-14
Smith-Waterman score: 369; 28.7% identity (59.7% similar) in 293 aa overlap (11-290:69-358)

                                   10        20        30        40
pF1KB5                     MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLN
                                     :. :  :. ...:: ...::. :: .   .
CCDS73 LGRLPSISPTAPGTWAAAWVPLPTVDVPDHAHYTLGTVILLVGLTGMLGNLTVIYTFCRS
       40        50        60        70        80        90        

               50        60        70        80          90        
pF1KB5 PSLQTTTFYFIVSLALADIAVGVLVMPLAIVVSLGITIHF--YSCLFMTCLLLIFTHASI
        ::.: . .::..::..:. ..    :. .. ::     :   .: :..    .:  .:.
CCDS73 RSLRTPANMFIINLAVSDFLMSFTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFGISSM
      100       110       120       130       140       150        

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB5 MSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKRVTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYH
       ..: :::.:::: .   .    :...::  ..:   :: ..  .: :.:::.  .     
CCDS73 ITLTAIALDRYLVITRPLATFGVASKRRAAFVLLGVWLYALAWSLPPFFGWSAYVPEGLL
      160       170       180       190       200       210        

      160       170       180       190       200         210      
pF1KB5 RNVTFLSCQFVSVMRMDYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRN--KLSLNLSNSK
        . ..   .:. ..:   :.   :.  .:.::...   :. ::  ::.  .   ...  :
CCDS73 TSCSWDYMSFTPAVRAYTMLLCCFV--FFLPLLIIIYCYIFIFRAIRETGRALQTFGACK
      220       230       240         250       260       270      

         220            230       240       250       260          
pF1KB5 ETG-AFYGR-----EFKTAKSLFLVLFLFALSWLPLSIINCIIYFNGEVPQLVLYMG---
        .: ... :     : : :: ..::..::.::: : : .  .. : : .  :. ::.   
CCDS73 GNGESLWQRQRLQSECKMAKIMLLVILLFVLSWAPYSAVA-LVAFAGYAHVLTPYMSSVP
        280       290       300       310        320       330     

       270       280       290       300       310                 
pF1KB5 ILLSHANSMMNPIVYAYKIKKFKETYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE         
        ....:... :::.::    :..                                     
CCDS73 AVIAKASAIHNPIIYAITHPKYRVAIAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPSYRSTHRSTLTS
         340       350       360       370       380       390     

>>CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18              (349 aa)
 initn: 163 init1:  85 opt: 348  Z-score: 346.7  bits: 72.5 E(32554): 5.5e-13
Smith-Waterman score: 348; 26.4% identity (61.3% similar) in 326 aa overlap (2-316:21-336)

                                  10        20           30        
pF1KB5                    MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLC---AIVGNVLVICVV-
                           :. .  ....  ...:. .: ::    ...:: ::: :. 
CCDS12 MELAVGNLSEGNASWPEPPAPEPGPLFGIGVENFVTLVVF-GLIFALGVLGNSLVITVLA
               10        20        30        40         50         

        40         50        60         70         80        90    
pF1KB5 KLNPSL-QTTTFYFIVSLALADIAVGVLVMPL-AIVVSLGI-TIHFYSCLFMTCLLLIFT
       . .:.  ..::  ::..:..::.:  .. .:. : : .:   ..  . : :.  .. .  
CCDS12 RSKPGKPRSTTNLFILNLSIADLAYLLFCIPFQATVYALPTWVLGAFICKFIHYFFTVSM
      60        70        80        90       100       110         

          100       110       120       130       140       150    
pF1KB5 HASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKRVTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLT
        .::..: :..::::. .  . : . . . :   :..:  : .:  ....   .... : 
CCDS12 LVSIFTLAAMSVDRYVAIVHSRRSSSLRVSRNALLGVGCIWALS--IAMASPVAYHQGLF
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