Result of FASTA (omim) for pF1KB5407
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5407, 494 aa
  1>>>pF1KB5407 494 - 494 aa - 494 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5019+/-0.000367; mu= 17.3000+/- 0.023
 mean_var=92.4142+/-18.208, 0's: 0 Z-trim(115.4): 295  B-trim: 271 in 1/48
 Lambda= 0.133415
 statistics sampled from 25454 (25851) to 25454 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.303), width:  16
 Scan time:  9.910

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002227 (OMIM: 603787) potassium voltage-gated c ( 494) 3301 645.9 7.5e-185
XP_006723847 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858) 1243 250.0   2e-65
NP_004966 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage- ( 858) 1243 250.0   2e-65
XP_011527101 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858) 1243 250.0   2e-65
NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated c ( 911) 1223 246.2   3e-64
NP_055194 (OMIM: 608164) potassium voltage-gated c ( 500)  918 187.3   9e-47
XP_016881193 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 509)  880 179.9 1.5e-44
NP_036415 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated c ( 466)  874 178.8   3e-44
XP_016881194 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466)  874 178.8   3e-44
XP_011524220 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466)  874 178.8   3e-44
XP_011524222 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466)  874 178.8   3e-44
NP_758847 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated c ( 425)  837 171.6 3.9e-42
XP_006710694 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 510)  769 158.6 3.9e-38
XP_006710693 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 636)  769 158.7 4.6e-38
NP_751948 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 636)  769 158.7 4.6e-38
XP_006710692 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655)  769 158.7 4.7e-38
XP_016856733 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655)  769 158.7 4.7e-38
NP_004971 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 655)  769 158.7 4.7e-38
XP_005270908 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655)  769 158.7 4.7e-38
XP_016859548 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491)  766 158.0 5.7e-38
NP_001269357 (OMIM: 603888) potassium voltage-gate ( 491)  766 158.0 5.7e-38
XP_011531127 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491)  766 158.0 5.7e-38
NP_002243 (OMIM: 603888) potassium voltage-gated c ( 491)  766 158.0 5.7e-38
NP_036413 (OMIM: 605410) potassium voltage-gated c ( 630)  764 157.7 8.9e-38
NP_065748 (OMIM: 602906) potassium voltage-gated c ( 477)  756 156.1 2.1e-37
NP_004970 (OMIM: 300281) potassium voltage-gated c ( 647)  755 156.0   3e-37
XP_011542212 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 647)  755 156.0   3e-37
XP_016869470 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium v ( 666)  705 146.4 2.4e-34
XP_016869471 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium v ( 666)  705 146.4 2.4e-34
XP_016884998 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 558)  682 141.9 4.6e-33
XP_016884997 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 558)  682 141.9 4.6e-33
NP_002223 (OMIM: 176263) potassium voltage-gated c ( 575)  649 135.5 3.9e-31
XP_011539699 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499)  642 134.1 8.8e-31
XP_011539701 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499)  642 134.1 8.8e-31
XP_016856702 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499)  642 134.1 8.8e-31
XP_011539698 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499)  642 134.1 8.8e-31
XP_011539700 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499)  642 134.1 8.8e-31
XP_011539702 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499)  642 134.1 8.8e-31
NP_004965 (OMIM: 176262,616366) potassium voltage- ( 499)  642 134.1 8.8e-31
NP_598004 (OMIM: 607604,610356) potassium voltage- ( 545)  633 132.4 3.1e-30
XP_006710695 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 375)  620 129.8 1.3e-29
XP_011539728 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 387)  615 128.8 2.7e-29
XP_011539729 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 369)  614 128.6   3e-29
XP_011539730 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 369)  614 128.6   3e-29
XP_011539727 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 407)  614 128.7 3.2e-29
XP_016856734 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 407)  614 128.7 3.2e-29
NP_001309728 (OMIM: 602905) potassium voltage-gate ( 526)  613 128.6 4.4e-29
NP_002242 (OMIM: 602905) potassium voltage-gated c ( 526)  613 128.6 4.4e-29
XP_016883335 (OMIM: 602905) PREDICTED: potassium v ( 527)  613 128.6 4.4e-29
NP_000208 (OMIM: 160120,176260) potassium voltage- ( 495)  612 128.4 4.8e-29


>>NP_002227 (OMIM: 603787) potassium voltage-gated chann  (494 aa)
 initn: 3301 init1: 3301 opt: 3301  Z-score: 3439.6  bits: 645.9 E(85289): 7.5e-185
Smith-Waterman score: 3301; 100.0% identity (100.0% similar) in 494 aa overlap (1-494:1-494)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGGY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVDL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 KFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVWKFLEKPESSCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVWKFLEKPESSCP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 ARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVETACIGWFTLEYLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVETACIGWFTLEYLLR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 LFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQAVQALRIMRIARI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQAVQALRIMRIARI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 FKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQSHPETLFKSIPQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQSHPETLFKSIPQS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 FWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNFVRYYNKQRVLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNFVRYYNKQRVLE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 TAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLSHSDTFIPLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLSHSDTFIPLL
              430       440       450       460       470       480

              490    
pF1KB5 TEEKHHRTRLQSCK
       ::::::::::::::
NP_002 TEEKHHRTRLQSCK
              490    

>>XP_006723847 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: potassiu  (858 aa)
 initn: 1193 init1: 895 opt: 1243  Z-score: 1295.7  bits: 250.0 E(85289): 2e-65
Smith-Waterman score: 1243; 41.9% identity (74.7% similar) in 442 aa overlap (1-437:5-443)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB5     MDGSGERSL----PEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAEL
           :   : ::     :::     . . . .. .::::. . .    :.. :.:::..:
XP_006 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB5 INCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNE
        .:  . .:... .::::.    :..::: : ::  ... :  :..:: . .: . :..:
XP_006 RDC--NTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQE
                 70        80        90       100       110        

            120       130        140       150       160       170 
pF1KB5 MDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVWKF
       .:.: .:  .:..::...  .:.:.. ::. :... . .  : .  .    . .: .: .
XP_006 LDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDL
      120       130       140       150       160       170        

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB5 LEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVETACIG
       ::::.::  :...:..:...:..:.... ..:.:::: ::  :. ...: : .::..::.
XP_006 LEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIA
      180       190       200       210       220       230        

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB5 WFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQAVQA
       :::.:::::..:::.: .:  . .: .:.:::::.::.. ::. .  .... ::...:: 
XP_006 WFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQI
      240       250       260       270       280       290        

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB5 LRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQSHPE
       .::::: ::.::::::.:::.: ..:.::..:::::...::.::..::.: .  :... .
XP_006 FRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDD
      300       310       320       330       340       350        

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB5 TLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNFVR
       : ::::: ::::: ::::::::::::::: :::. ...  . ::..:::::  :.::: .
XP_006 TKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSE
      360       370       380       390       400       410        

             420       430       440       450       460       470 
pF1KB5 YYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLS
       .:..:.  : : :.. : .:  . .:                                  
XP_006 FYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDK
      420       430        440       450       460       470       

>>NP_004966 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage-gate  (858 aa)
 initn: 1193 init1: 895 opt: 1243  Z-score: 1295.7  bits: 250.0 E(85289): 2e-65
Smith-Waterman score: 1243; 41.9% identity (74.7% similar) in 442 aa overlap (1-437:5-443)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB5     MDGSGERSL----PEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAEL
           :   : ::     :::     . . . .. .::::. . .    :.. :.:::..:
NP_004 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB5 INCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNE
        .:  . .:... .::::.    :..::: : ::  ... :  :..:: . .: . :..:
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pF1KB5 MDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVWKF
       .:.: .:  .:..::...  .:.:.. ::. :... . .  : .  .    . .: .: .
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pF1KB5 LEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVETACIG
       ::::.::  :...:..:...:..:.... ..:.:::: ::  :. ...: : .::..::.
NP_004 LEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIA
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       :::.:::::..:::.: .:  . .: .:.:::::.::.. ::. .  .... ::...:: 
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       .::::: ::.::::::.:::.: ..:.::..:::::...::.::..::.: .  :... .
NP_004 FRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDD
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       : ::::: ::::: ::::::::::::::: :::. ...  . ::..:::::  :.::: .
NP_004 TKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSE
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pF1KB5 YYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLS
       .:..:.  : : :.. : .:  . .:                                  
NP_004 FYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDK
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>>XP_011527101 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: potassiu  (858 aa)
 initn: 1193 init1: 895 opt: 1243  Z-score: 1295.7  bits: 250.0 E(85289): 2e-65
Smith-Waterman score: 1243; 41.9% identity (74.7% similar) in 442 aa overlap (1-437:5-443)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB5     MDGSGERSL----PEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAEL
           :   : ::     :::     . . . .. .::::. . .    :.. :.:::..:
XP_011 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
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pF1KB5 INCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNE
        .:  . .:... .::::.    :..::: : ::  ... :  :..:: . .: . :..:
XP_011 RDC--NTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQE
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pF1KB5 MDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVWKF
       .:.: .:  .:..::...  .:.:.. ::. :... . .  : .  .    . .: .: .
XP_011 LDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDL
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pF1KB5 LEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVETACIG
       ::::.::  :...:..:...:..:.... ..:.:::: ::  :. ...: : .::..::.
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pF1KB5 WFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQAVQA
       :::.:::::..:::.: .:  . .: .:.:::::.::.. ::. .  .... ::...:: 
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XP_011 FRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDD
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pF1KB5 TLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNFVR
       : ::::: ::::: ::::::::::::::: :::. ...  . ::..:::::  :.::: .
XP_011 TKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSE
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pF1KB5 YYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLS
       .:..:.  : : :.. : .:  . .:                                  
XP_011 FYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDK
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>>NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated chann  (911 aa)
 initn: 1196 init1: 873 opt: 1223  Z-score: 1274.5  bits: 246.2 E(85289): 3e-64
Smith-Waterman score: 1223; 40.6% identity (73.9% similar) in 463 aa overlap (10-466:22-481)

                           10        20        30        40        
pF1KB5             MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETR
                            ::: .   . . . .. .::::. . .    :.. :.::
NP_004 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
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pF1KB5 LAELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPIC
       :..: .:  . ..... .::::. .. :..::: : ::  ... :  :..:: . .: . 
NP_004 LGKLRDC--NTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALS
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pF1KB5 FKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKC
       : .:.:.: .:  .:..::...  .:.:.. ::. :... . .  : .  .      .: 
NP_004 FGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKK
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pF1KB5 VWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVET
       .: .::::.::  :...:..:.:.:..:.... ..:.::::  :  :.  ..  : .::.
NP_004 LWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEA
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pF1KB5 ACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQ
       .::.:::.:::::..::::: .:  . .:..:.:::::.::.. ::. .  .... ::..
NP_004 VCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRR
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pF1KB5 AVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQ
       .:: .::::: ::.::::::.:::.: ..:.::..:::::...::.::..::.: .  :.
NP_004 VVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEK
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pF1KB5 SHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIIN
       ..  : : ::: ::::: ::::::::::::::: :::. ...  . ::..:::::  :.:
NP_004 DEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVN
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pF1KB5 NFVRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGG----EGKTGGSRS-DLDNLPPEPAGKEAP
       :: ..:..:.  : : :.. : .:  . .:.    . : . .:: .: ..  : ::. : 
NP_004 NFSEFYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESAN
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pF1KB5 SCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK                            
       . .:                                                        
NP_004 TKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSA
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>>NP_055194 (OMIM: 608164) potassium voltage-gated chann  (500 aa)
 initn: 914 init1: 428 opt: 918  Z-score: 960.7  bits: 187.3 E(85289): 9e-47
Smith-Waterman score: 918; 37.5% identity (67.2% similar) in 424 aa overlap (27-435:43-457)

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pF1KB5     MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCL
                                     ::::: : ::  . :: .:.:::..:   .
NP_055 LDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
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pF1KB5 A-----GGYDTIFS---LCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPIC
       :     :.  .. :   :::: .:   :..:::. .::. :.. :  :..:. . .: . 
NP_055 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
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pF1KB5 FKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRR--C--
       : .:...: .:   .:.::...   .:.:: :     .   :. .   .:  . .  :  
NP_055 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYF-RRKELSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
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pF1KB5 -QKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLE
        .. .:..:::: ::  ::. .:.:.....:: . : . .  ::. :: .        ::
NP_055 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMSA-ELSWLDLQ-------LLE
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pF1KB5 NVETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARM--ME
        .: .::.::: :..::..   .. .:  .  ::.:.:::::::..: .  :.. .  .:
NP_055 ILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQTTQE
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pF1KB5 LTNVQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSAL
       : :: . ::.::..:  :..::.:::.::..: ... . ..:.::::..:.::: .::..
NP_055 LENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFSTV
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pF1KB5 GYTMEQSHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALP
        :  ::: :.: : :.: ..:::  .::::::::: : :: ::. : . .: :....:::
NP_055 EYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALP
           370       380       390       400       410       420   

             410       420       430       440       450       460 
pF1KB5 IHPIINNFVRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEA
       :  : . :   :   .. :.:....  : .:...                          
NP_055 IAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLK
           430       440       450       460       470       480   

             470       480       490    
pF1KB5 PSCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
                                        
NP_055 GRERASTRSSGGDDFWF                
           490       500                

>>XP_016881193 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium volta  (509 aa)
 initn: 709 init1: 250 opt: 880  Z-score: 921.0  bits: 179.9 E(85289): 1.5e-44
Smith-Waterman score: 881; 32.5% identity (65.6% similar) in 459 aa overlap (3-447:39-492)

                                           10        20         30 
pF1KB5                             MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIE-IVVNVGG
                                     : . :  : : : .....   . ...::::
XP_016 AGLSCVFTGSLKENTLYLHRARSRAGAPRSGPALRMEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGG
       10        20        30        40        50        60        

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB5 VRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIE
        :  :    :.. : .:: .:  :   :.: .. .::::: .. ::.:::.: ::. .. 
XP_016 CRVRLAWAALARCPLARLERLRAC--RGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVA
       70        80        90         100       110       120      

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB5 VYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDD
       .   :.... .: : . :..:. .: .:   :. ::  .: ...::  : ::        
XP_016 LLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAE-ARAGPTERGA
        130       140       150       160       170        180     

                 160       170       180       190       200       
pF1KB5 LGVDA----AEGRWRRCQKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPEL
        :  :     .:: .: .. .   ...:.:.  ... : .:  .. :..: .:..:.:..
XP_016 QGSPARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDI
         190       200       210       220       230       240     

       210        220       230       240       250       260      
pF1KB5 QVLDAEGN-RVEHPTLENVETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPF
       .. . .:.   .  .:  .::.:..::..:.::: ... .:  :  . .::.:.::.:::
XP_016 RAEEERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPF
         250       260       270       280       290       300     

        270           280       290       300       310       320  
pF1KB5 YVSLTLTHL----GARMMELTNVQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFK
       :::: :       :....: ...  ... :: .:.  ...::::: ::..:  ...:  .
XP_016 YVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGL--VLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAR
         310       320         330       340       350       360   

            330       340        350       360       370       380 
pF1KB5 ELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQS-HPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTT
       :.::::..: :.. .:. : .  :.    .  :.:.: :.:::.:.::::::::. :.. 
XP_016 EFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSL
           370       380       390       400       410       420   

             390       400       410        420       430          
pF1KB5 LGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNFVRYYNK-QRVLETAAKHELELME--LNSSSGG
        :.. :  :.: :.. .:.:.  :...: : :.. ..  . ::. :  :.:   .:... 
XP_016 PGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATAT
           430       440       450       460       470       480   

      440       450       460       470       480       490    
pF1KB5 EGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
       : .. :  :                                               
XP_016 EDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAGR                              
           490       500                                       

>>NP_036415 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated chann  (466 aa)
 initn: 709 init1: 250 opt: 874  Z-score: 915.3  bits: 178.8 E(85289): 3e-44
Smith-Waterman score: 875; 32.5% identity (65.9% similar) in 452 aa overlap (10-447:3-449)

               10        20         30        40        50         
pF1KB5 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIE-IVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGG
                : : : .....   . ...:::: :  :    :.. : .:: .:  :   :
NP_036        MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACR--G
                      10        20        30        40        50   

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB5 YDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVD
       .: .. .::::: .. ::.:::.: ::. .. .   :.... .: : . :..:. .: .:
NP_036 HDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGID
              60        70        80        90       100       110 

     120       130       140       150           160       170     
pF1KB5 LKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDA----AEGRWRRCQKCVWKFLEKP
          :. ::  .: ...::  : ::         :  :     .:: .: .. .   ...:
NP_036 EARLERCCLRRLRRREEEAAE-ARAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNP
             120       130        140       150       160       170

         180       190       200       210        220       230    
pF1KB5 ESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGN-RVEHPTLENVETACIGWFT
       .:.  ... : .:  .. :..: .:..:.:.... . .:.   .  .:  .::.:..::.
NP_036 HSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFS
              180       190       200       210       220       230

          240       250       260       270           280       290
pF1KB5 LEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHL----GARMMELTNVQQAVQ
       .:.::: ... .:  :  . .::.:.::.::::::: :       :....: ...  ...
NP_036 FEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGL--VLR
              240       250       260       270       280          

              300       310       320       330       340          
pF1KB5 ALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQS-H
        :: .:.  ...::::: ::..:  ...:  .:.::::..: :.. .:. : .  :.   
NP_036 LLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELG
      290       300       310       320       330       340        

     350       360       370       380       390       400         
pF1KB5 PETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNF
        .  :.:.: :.:::.:.::::::::. :..  :.. :  :.: :.. .:.:.  :...:
NP_036 ARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTF
      350       360       370       380       390       400        

     410        420       430         440       450       460      
pF1KB5 VRYYNK-QRVLETAAKHELELME--LNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSS
        : :.. ..  . ::. :  :.:   .:... : .. :  :                   
NP_036 SRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAGR  
      410       420       430       440       450       460        

        470       480       490    
pF1KB5 RLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK

>>XP_016881194 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium volta  (466 aa)
 initn: 709 init1: 250 opt: 874  Z-score: 915.3  bits: 178.8 E(85289): 3e-44
Smith-Waterman score: 875; 32.5% identity (65.9% similar) in 452 aa overlap (10-447:3-449)

               10        20         30        40        50         
pF1KB5 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIE-IVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGG
                : : : .....   . ...:::: :  :    :.. : .:: .:  :   :
XP_016        MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACR--G
                      10        20        30        40        50   

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB5 YDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVD
       .: .. .::::: .. ::.:::.: ::. .. .   :.... .: : . :..:. .: .:
XP_016 HDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGID
              60        70        80        90       100       110 

     120       130       140       150           160       170     
pF1KB5 LKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDA----AEGRWRRCQKCVWKFLEKP
          :. ::  .: ...::  : ::         :  :     .:: .: .. .   ...:
XP_016 EARLERCCLRRLRRREEEAAE-ARAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNP
             120       130        140       150       160       170

         180       190       200       210        220       230    
pF1KB5 ESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGN-RVEHPTLENVETACIGWFT
       .:.  ... : .:  .. :..: .:..:.:.... . .:.   .  .:  .::.:..::.
XP_016 HSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFS
              180       190       200       210       220       230

          240       250       260       270           280       290
pF1KB5 LEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHL----GARMMELTNVQQAVQ
       .:.::: ... .:  :  . .::.:.::.::::::: :       :....: ...  ...
XP_016 FEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGL--VLR
              240       250       260       270       280          

              300       310       320       330       340          
pF1KB5 ALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQS-H
        :: .:.  ...::::: ::..:  ...:  .:.::::..: :.. .:. : .  :.   
XP_016 LLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELG
      290       300       310       320       330       340        

     350       360       370       380       390       400         
pF1KB5 PETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNF
        .  :.:.: :.:::.:.::::::::. :..  :.. :  :.: :.. .:.:.  :...:
XP_016 ARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTF
      350       360       370       380       390       400        

     410        420       430         440       450       460      
pF1KB5 VRYYNK-QRVLETAAKHELELME--LNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSS
        : :.. ..  . ::. :  :.:   .:... : .. :  :                   
XP_016 SRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAGR  
      410       420       430       440       450       460        

        470       480       490    
pF1KB5 RLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK

>>XP_011524220 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium volta  (466 aa)
 initn: 709 init1: 250 opt: 874  Z-score: 915.3  bits: 178.8 E(85289): 3e-44
Smith-Waterman score: 875; 32.5% identity (65.9% similar) in 452 aa overlap (10-447:3-449)

               10        20         30        40        50         
pF1KB5 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIE-IVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGG
                : : : .....   . ...:::: :  :    :.. : .:: .:  :   :
XP_011        MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACR--G
                      10        20        30        40        50   

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB5 YDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVD
       .: .. .::::: .. ::.:::.: ::. .. .   :.... .: : . :..:. .: .:
XP_011 HDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGID
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