seq1 = pF1KB5278.tfa, 1125 bp seq2 = pF1KB5278/gi568815597f_43636263.tfa (gi568815597f:43636263_44030218), 393956 bp >pF1KB5278 1125 >gi568815597f:43636263_44030218 (Chr1) 1-118 (100001-100118) 100% == 292-397 (258112-258215) 96% -> 398-461 (261973-262036) 100% -> 462-557 (262906-263001) 100% -> 558-744 (263279-263465) 100% -> 745-891 (284142-284288) 100% -> 892-1038 (284520-284666) 100% -> 1039-1125 (293870-293956) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTT 50 . : . : . : . : . : 51 TCTGGTACTGGGATTTTTGTATTATTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 TCTGGTACTGGGATTTTTGTATTATTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCC 100 . : . 101 AGTGGGAGGAGGACTCCA |||||||||||||||||| 100101 AGTGGGAGGAGGACTCCA 0 . : . : . : . : . : 292 ATCTTCCCCCGGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGTTCCTGGATGACTCCTT || |||| --|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 258112 ATATTCCA GGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGTTCCTGGATGACTCCTT 50 . : . : . : . : . : 342 TCGCAAGTGGGCTAGAATCCGGGAGTTCGTGCCGCCTTTTGGGATCAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 258160 TCGCAAGTGGGCTAGAATCCGGGAGTTCGTGCCGCCTTTTGGGATCAAAG 100 . : . : . : . : . : 392 GTCAAG ACAATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCAAA ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 258210 GTCAAGGTA...CAGACAATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCAAA 150 . : . : . : . : . : 433 GAGTACCGCCTGACCCCTGCCTTGGACAG CCTCCGCTGCCG |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 262008 GAGTACCGCCTGACCCCTGCCTTGGACAGGTG...CAGCCTCCGCTGCCG 200 . : . : . : . : . : 474 CCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTTCTTGCCAACAAGTCTCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 262918 CCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTTCTTGCCAACAAGTCTCTGG 250 . : . : . : . : . : 524 GGTCACGAATTGACGACTATGACATTGTGGTGAG ACTGAAT ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 262968 GGTCACGAATTGACGACTATGACATTGTGGTGAGGTG...TAGACTGAAT 300 . : . : . : . : . : 565 TCAGCACCAGTGAAAGGCTTTGAGAAGGACGTGGGCAGCAAAACGACACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 263286 TCAGCACCAGTGAAAGGCTTTGAGAAGGACGTGGGCAGCAAAACGACACT 350 . : . : . : . : . : 615 GCGCATCACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTGAGCAGTACGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 263336 GCGCATCACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTGAGCAGTACGAGC 400 . : . : . : . : . : 665 GCGATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAAGTGGCAGGACTTTAAGTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 263386 GCGATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAAGTGGCAGGACTTTAAGTGG 450 . : . : . : . : . : 715 TTGAAATACATCGTCTACAAGGAGAGAGTG AGTGCATCGGA ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 263436 TTGAAATACATCGTCTACAAGGAGAGAGTGGTA...CAGAGTGCATCGGA 500 . : . : . : . : . : 756 TGGCTTCTGGAAATCTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCCTGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 284153 TGGCTTCTGGAAATCTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCCTGAGA 550 . : . : . : . : . : 806 TTCGAATCCTCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCCTTCACCCTCATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 284203 TTCGAATCCTCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCCTTCACCCTCATT 600 . : . : . : . : . : 856 GGCCTGCCCTTCAACAATGGCCTCATGGGCCGGGGG AACAT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 284253 GGCCTGCCCTTCAACAATGGCCTCATGGGCCGGGGGGTG...TAGAACAT 650 . : . : . : . : . : 897 CCCTACCCTTGGCAGTGTGGCAGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 284525 CCCTACCCTTGGCAGTGTGGCAGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACG 700 . : . : . : . : . : 947 AGGTGGCAGTCGCAGGATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACGCACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 284575 AGGTGGCAGTCGCAGGATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACGCACCC 750 . : . : . : . : . : 997 CTGCACTACTATGAGACCGTTCGCATGGCAGCCATCAAAGAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 284625 CTGCACTACTATGAGACCGTTCGCATGGCAGCCATCAAAGAGGTT...CA 800 . : . : . : . : . : 1039 TCCTGGACGCACAATATCCAGCGAGAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGG >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 293869 GTCCTGGACGCACAATATCCAGCGAGAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGG 850 . : . : . : . 1088 TGAAAGCTCGCGTCATCACTGATCTAAGCAGTGGCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 293919 TGAAAGCTCGCGTCATCACTGATCTAAGCAGTGGCATC