Result of FASTA (omim) for pF1KB3524
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3524, 460 aa
  1>>>pF1KB3524 460 - 460 aa - 460 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2006+/-0.000402; mu= 10.3483+/- 0.025
 mean_var=177.0531+/-35.985, 0's: 0 Z-trim(116.5): 36  B-trim: 289 in 2/53
 Lambda= 0.096388
 statistics sampled from 27708 (27743) to 27708 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.325), width:  16
 Scan time:  9.900

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_068798 (OMIM: 300026) nucleosome assembly prote ( 460) 3078 440.6 4.2e-123
NP_001294853 (OMIM: 164060) nucleosome assembly pr ( 383)  815 125.8   2e-28
XP_011536695 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome  ( 391)  795 123.0 1.4e-27
NP_001317160 (OMIM: 164060) nucleosome assembly pr ( 391)  795 123.0 1.4e-27
NP_004528 (OMIM: 164060) nucleosome assembly prote ( 391)  795 123.0 1.4e-27
XP_016874827 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome  ( 391)  795 123.0 1.4e-27
NP_631946 (OMIM: 164060) nucleosome assembly prote ( 391)  795 123.0 1.4e-27
XP_016874828 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome  ( 328)  782 121.2 4.3e-27
NP_001317161 (OMIM: 164060) nucleosome assembly pr ( 328)  782 121.2 4.3e-27
XP_016874829 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome  ( 328)  782 121.2 4.3e-27
NP_005960 (OMIM: 601651) nucleosome assembly prote ( 375)  769 119.4 1.7e-26
NP_004529 (OMIM: 300117) nucleosome assembly prote ( 506)  607 97.0 1.2e-19
NP_715638 (OMIM: 612203) nucleosome assembly prote ( 182)  261 48.5 1.9e-05


>>NP_068798 (OMIM: 300026) nucleosome assembly protein 1  (460 aa)
 initn: 3078 init1: 3078 opt: 3078  Z-score: 2331.0  bits: 440.6 E(85289): 4.2e-123
Smith-Waterman score: 3078; 100.0% identity (100.0% similar) in 460 aa overlap (1-460:1-460)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MAESENRKELSESSQEEAGNQIMVEGLGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 MAESENRKELSESSQEEAGNQIMVEGLGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 NGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 NGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 RAANLESKFLREFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 RAANLESKFLREFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 CHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 CHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 PDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 PDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 LLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 LLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 VTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGRDGNDDFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 VTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGRDGNDDFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460
pF1KB3 VREVNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 VREVNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
              430       440       450       460

>>NP_001294853 (OMIM: 164060) nucleosome assembly protei  (383 aa)
 initn: 771 init1: 665 opt: 815  Z-score: 631.3  bits: 125.8 E(85289): 2e-28
Smith-Waterman score: 1043; 46.3% identity (66.7% similar) in 402 aa overlap (57-449:23-376)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
                                     :: :.::.:   . .   .  .. .   : 
NP_001         MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
                       10        20        30        40        50  

           90       100       110       120       130       140    
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
        .:  ::.     : ..::::  :: :: :::.::.. :..:.:: .: ::.:::.: .:
NP_001 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
             60          70        80        90       100       110

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
       :::..:: .::::::::::::::.: : ::  .::.       .:.. .           
NP_001 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
              120       130       140              150             

          210       220       230       240       250       260    
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
                   :.:..:.         :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
NP_001 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
                                 160       170       180       190 

          270       280       290       300       310       320    
pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
       ::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:.    ::  . :  
NP_001 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
             200       210       220       230       240       250 

          330       340       350       360       370       380    
pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
       :   :::.:::..:::::::::::::::.  ::.::::.   .:::::::.:  .  .: 
NP_001 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
             260       270       280       290       300       310 

                 390       400       410       420       430       
pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
         .:       :: .:: ::  :::::::.:.:.:.:....   .: ..:       :. 
NP_001 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEA-------DEG
             320       330       340       350       360           

       440       450       460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
       .  .::::.: :           
NP_001 YQLFEEVKSCSKLFQRWLQ    
          370       380       

>>XP_011536695 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome asse  (391 aa)
 initn: 1082 init1: 656 opt: 795  Z-score: 616.1  bits: 123.0 E(85289): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 1023; 47.1% identity (67.6% similar) in 380 aa overlap (57-427:23-361)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
                                     :: :.::.:   . .   .  .. .   : 
XP_011         MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
                       10        20        30        40        50  

           90       100       110       120       130       140    
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
        .:  ::.     : ..::::  :: :: :::.::.. :..:.:: .: ::.:::.: .:
XP_011 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
             60          70        80        90       100       110

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
       :::..:: .::::::::::::::.: : ::  .::.       .:.. .           
XP_011 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
              120       130       140              150             

          210       220       230       240       250       260    
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
                   :.:..:.         :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
XP_011 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
                                 160       170       180       190 

          270       280       290       300       310       320    
pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
       ::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:.    ::  . :  
XP_011 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
             200       210       220       230       240       250 

          330       340       350       360       370       380    
pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
       :   :::.:::..:::::::::::::::.  ::.::::.   .:::::::.:  .  .: 
XP_011 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
             260       270       280       290       300       310 

                 390       400       410       420       430       
pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
         .:       :: .:: ::  :::::::.:.:.:.:....   .: ..:          
XP_011 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEADEEGEEEGDE
             320       330       340       350       360       370 

       440       450       460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
                              
XP_011 ENDPDYDPKKDQNPAECKQQ   
             380       390    

>>NP_001317160 (OMIM: 164060) nucleosome assembly protei  (391 aa)
 initn: 1082 init1: 656 opt: 795  Z-score: 616.1  bits: 123.0 E(85289): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 1023; 47.1% identity (67.6% similar) in 380 aa overlap (57-427:23-361)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
                                     :: :.::.:   . .   .  .. .   : 
NP_001         MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
                       10        20        30        40        50  

           90       100       110       120       130       140    
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
        .:  ::.     : ..::::  :: :: :::.::.. :..:.:: .: ::.:::.: .:
NP_001 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
             60          70        80        90       100       110

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
       :::..:: .::::::::::::::.: : ::  .::.       .:.. .           
NP_001 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
              120       130       140              150             

          210       220       230       240       250       260    
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
                   :.:..:.         :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
NP_001 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
                                 160       170       180       190 

          270       280       290       300       310       320    
pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
       ::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:.    ::  . :  
NP_001 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
             200       210       220       230       240       250 

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pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
       :   :::.:::..:::::::::::::::.  ::.::::.   .:::::::.:  .  .: 
NP_001 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
             260       270       280       290       300       310 

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pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
         .:       :: .:: ::  :::::::.:.:.:.:....   .: ..:          
NP_001 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEADEEGEEEGDE
             320       330       340       350       360       370 

       440       450       460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
                              
NP_001 ENDPDYDPKKDQNPAECKQQ   
             380       390    

>>NP_004528 (OMIM: 164060) nucleosome assembly protein 1  (391 aa)
 initn: 1082 init1: 656 opt: 795  Z-score: 616.1  bits: 123.0 E(85289): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 1023; 47.1% identity (67.6% similar) in 380 aa overlap (57-427:23-361)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
                                     :: :.::.:   . .   .  .. .   : 
NP_004         MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
                       10        20        30        40        50  

           90       100       110       120       130       140    
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
        .:  ::.     : ..::::  :: :: :::.::.. :..:.:: .: ::.:::.: .:
NP_004 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
             60          70        80        90       100       110

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pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
       :::..:: .::::::::::::::.: : ::  .::.       .:.. .           
NP_004 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
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pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
                   :.:..:.         :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
NP_004 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
                                 160       170       180       190 

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pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
       ::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:.    ::  . :  
NP_004 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
             200       210       220       230       240       250 

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pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
       :   :::.:::..:::::::::::::::.  ::.::::.   .:::::::.:  .  .: 
NP_004 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
             260       270       280       290       300       310 

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pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
         .:       :: .:: ::  :::::::.:.:.:.:....   .: ..:          
NP_004 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEADEEGEEEGDE
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       440       450       460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
                              
NP_004 ENDPDYDPKKDQNPAECKQQ   
             380       390    

>>XP_016874827 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome asse  (391 aa)
 initn: 1082 init1: 656 opt: 795  Z-score: 616.1  bits: 123.0 E(85289): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 1023; 47.1% identity (67.6% similar) in 380 aa overlap (57-427:23-361)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
                                     :: :.::.:   . .   .  .. .   : 
XP_016         MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
                       10        20        30        40        50  

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pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
        .:  ::.     : ..::::  :: :: :::.::.. :..:.:: .: ::.:::.: .:
XP_016 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
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pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
       :::..:: .::::::::::::::.: : ::  .::.       .:.. .           
XP_016 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
              120       130       140              150             

          210       220       230       240       250       260    
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
                   :.:..:.         :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
XP_016 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
                                 160       170       180       190 

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pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
       ::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:.    ::  . :  
XP_016 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
             200       210       220       230       240       250 

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pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
       :   :::.:::..:::::::::::::::.  ::.::::.   .:::::::.:  .  .: 
XP_016 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
             260       270       280       290       300       310 

                 390       400       410       420       430       
pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
         .:       :: .:: ::  :::::::.:.:.:.:....   .: ..:          
XP_016 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEADEEGEEEGDE
             320       330       340       350       360       370 

       440       450       460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
                              
XP_016 ENDPDYDPKKDQNPAECKQQ   
             380       390    

>>NP_631946 (OMIM: 164060) nucleosome assembly protein 1  (391 aa)
 initn: 1082 init1: 656 opt: 795  Z-score: 616.1  bits: 123.0 E(85289): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 1023; 47.1% identity (67.6% similar) in 380 aa overlap (57-427:23-361)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
                                     :: :.::.:   . .   .  .. .   : 
NP_631         MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
                       10        20        30        40        50  

           90       100       110       120       130       140    
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
        .:  ::.     : ..::::  :: :: :::.::.. :..:.:: .: ::.:::.: .:
NP_631 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
             60          70        80        90       100       110

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
       :::..:: .::::::::::::::.: : ::  .::.       .:.. .           
NP_631 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
              120       130       140              150             

          210       220       230       240       250       260    
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
                   :.:..:.         :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
NP_631 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
                                 160       170       180       190 

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pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
       ::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:.    ::  . :  
NP_631 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
             200       210       220       230       240       250 

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pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
       :   :::.:::..:::::::::::::::.  ::.::::.   .:::::::.:  .  .: 
NP_631 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
             260       270       280       290       300       310 

                 390       400       410       420       430       
pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
         .:       :: .:: ::  :::::::.:.:.:.:....   .: ..:          
NP_631 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEADEEGEEEGDE
             320       330       340       350       360       370 

       440       450       460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
                              
NP_631 ENDPDYDPKKDQNPAECKQQ   
             380       390    

>>XP_016874828 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome asse  (328 aa)
 initn: 1066 init1: 656 opt: 782  Z-score: 607.3  bits: 121.2 E(85289): 4.3e-27
Smith-Waterman score: 1003; 49.4% identity (70.1% similar) in 334 aa overlap (101-427:4-298)

               80        90       100       110       120       130
pF1KB3 EDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFL
                                     ...::  :: :: :::.::.. :..:.:: 
XP_016                            MADIDNLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFY
                                          10        20        30   

              140       150       160       170       180       190
pF1KB3 REFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEE
       .: ::.:::.: .::::..:: .::::::::::::::.: : ::  .::.          
XP_016 EEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL----------
            40        50        60        70        80             

              200       210       220       230       240       250
pF1KB3 GMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKN
                               .:. . ::.     ....:.:::::::.:::::.::
XP_016 ------------------------KEKAKIEDE-----KKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKN
                                    90            100       110    

              260       270       280       290       300       310
pF1KB3 VDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKS
       :: :. .....:::::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:
XP_016 VDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRS
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pF1KB3 KLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSF
       .    ::  . :  :   :::.:::..:::::::::::::::.  ::.::::.   .:::
XP_016 EPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSF
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pF1KB3 FNFFSPHGITSNGRDGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVRE
       ::::.:  .  .:   .:       :: .:: ::  :::::::.:.:.:.:....   .:
XP_016 FNFFAPPEVPESGDLDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEE
          240       250       260       270       280       290    

           430       440       450       460
pF1KB3 VNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
        ..:                                 
XP_016 GEEADEEGEEEGDEENDPDYDPKKDQNPAECKQQ   
          300       310       320           

>>NP_001317161 (OMIM: 164060) nucleosome assembly protei  (328 aa)
 initn: 1066 init1: 656 opt: 782  Z-score: 607.3  bits: 121.2 E(85289): 4.3e-27
Smith-Waterman score: 1003; 49.4% identity (70.1% similar) in 334 aa overlap (101-427:4-298)

               80        90       100       110       120       130
pF1KB3 EDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFL
                                     ...::  :: :: :::.::.. :..:.:: 
NP_001                            MADIDNLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFY
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pF1KB3 REFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEE
       .: ::.:::.: .::::..:: .::::::::::::::.: : ::  .::.          
NP_001 EEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL----------
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                               .:. . ::.     ....:.:::::::.:::::.::
NP_001 ------------------------KEKAKIEDE-----KKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKN
                                    90            100       110    

              260       270       280       290       300       310
pF1KB3 VDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKS
       :: :. .....:::::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:
NP_001 VDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRS
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pF1KB3 KLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSF
       .    ::  . :  :   :::.:::..:::::::::::::::.  ::.::::.   .:::
NP_001 EPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSF
          180       190       200       210       220       230    

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pF1KB3 FNFFSPHGITSNGRDGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVRE
       ::::.:  .  .:   .:       :: .:: ::  :::::::.:.:.:.:....   .:
NP_001 FNFFAPPEVPESGDLDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEE
          240       250       260       270       280       290    

           430       440       450       460
pF1KB3 VNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
        ..:                                 
NP_001 GEEADEEGEEEGDEENDPDYDPKKDQNPAECKQQ   
          300       310       320           

>>XP_016874829 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome asse  (328 aa)
 initn: 1066 init1: 656 opt: 782  Z-score: 607.3  bits: 121.2 E(85289): 4.3e-27
Smith-Waterman score: 1003; 49.4% identity (70.1% similar) in 334 aa overlap (101-427:4-298)

               80        90       100       110       120       130
pF1KB3 EDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFL
                                     ...::  :: :: :::.::.. :..:.:: 
XP_016                            MADIDNLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFY
                                          10        20        30   

              140       150       160       170       180       190
pF1KB3 REFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEE
       .: ::.:::.: .::::..:: .::::::::::::::.: : ::  .::.          
XP_016 EEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL----------
            40        50        60        70        80             

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pF1KB3 GMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKN
                               .:. . ::.     ....:.:::::::.:::::.::
XP_016 ------------------------KEKAKIEDE-----KKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKN
                                    90            100       110    

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pF1KB3 VDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKS
       :: :. .....:::::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:
XP_016 VDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRS
          120       130       140       150       160       170    

              320       330       340       350       360       370
pF1KB3 KLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSF
       .    ::  . :  :   :::.:::..:::::::::::::::.  ::.::::.   .:::
XP_016 EPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSF
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              380              390       400       410       420   
pF1KB3 FNFFSPHGITSNGRDGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVRE
       ::::.:  .  .:   .:       :: .:: ::  :::::::.:.:.:.:....   .:
XP_016 FNFFAPPEVPESGDLDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEE
          240       250       260       270       280       290    

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pF1KB3 VNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
        ..:                                 
XP_016 GEEADEEGEEEGDEENDPDYDPKKDQNPAECKQQ   
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460 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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