Result of FASTA (ccds) for pF1KB3524
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3524, 460 aa
  1>>>pF1KB3524 460 - 460 aa - 460 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9048+/-0.000995; mu= 5.9487+/- 0.060
 mean_var=151.5786+/-30.215, 0's: 0 Z-trim(109.0): 47  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.104173
 statistics sampled from 10525 (10560) to 10525 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.324), width:  16
 Scan time:  3.360

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14423.1 NAP1L2 gene_id:4674|Hs108|chrX         ( 460) 3078 474.6 9.6e-134
CCDS76581.1 NAP1L1 gene_id:4673|Hs108|chr12        ( 383)  815 134.4   2e-31
CCDS9013.1 NAP1L1 gene_id:4673|Hs108|chr12         ( 391)  795 131.4 1.6e-30
CCDS81715.1 NAP1L1 gene_id:4673|Hs108|chr12        ( 328)  782 129.4 5.4e-30
CCDS41599.1 NAP1L4 gene_id:4676|Hs108|chr11        ( 375)  769 127.5 2.3e-29
CCDS14465.1 NAP1L3 gene_id:4675|Hs108|chrX         ( 506)  607 103.2 6.4e-22


>>CCDS14423.1 NAP1L2 gene_id:4674|Hs108|chrX              (460 aa)
 initn: 3078 init1: 3078 opt: 3078  Z-score: 2514.6  bits: 474.6 E(32554): 9.6e-134
Smith-Waterman score: 3078; 100.0% identity (100.0% similar) in 460 aa overlap (1-460:1-460)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MAESENRKELSESSQEEAGNQIMVEGLGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAESENRKELSESSQEEAGNQIMVEGLGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 NGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 RAANLESKFLREFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RAANLESKFLREFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 CHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 PDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 LLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 VTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGRDGNDDFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGRDGNDDFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460
pF1KB3 VREVNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VREVNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
              430       440       450       460

>>CCDS76581.1 NAP1L1 gene_id:4673|Hs108|chr12             (383 aa)
 initn: 771 init1: 665 opt: 815  Z-score: 677.7  bits: 134.4 E(32554): 2e-31
Smith-Waterman score: 1043; 46.3% identity (66.7% similar) in 402 aa overlap (57-449:23-376)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
                                     :: :.::.:   . .   .  .. .   : 
CCDS76         MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
                       10        20        30        40        50  

           90       100       110       120       130       140    
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
        .:  ::.     : ..::::  :: :: :::.::.. :..:.:: .: ::.:::.: .:
CCDS76 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
             60          70        80        90       100       110

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
       :::..:: .::::::::::::::.: : ::  .::.       .:.. .           
CCDS76 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
              120       130       140              150             

          210       220       230       240       250       260    
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
                   :.:..:.         :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
CCDS76 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
                                 160       170       180       190 

          270       280       290       300       310       320    
pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
       ::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:.    ::  . :  
CCDS76 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
             200       210       220       230       240       250 

          330       340       350       360       370       380    
pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
       :   :::.:::..:::::::::::::::.  ::.::::.   .:::::::.:  .  .: 
CCDS76 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
             260       270       280       290       300       310 

                 390       400       410       420       430       
pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
         .:       :: .:: ::  :::::::.:.:.:.:....   .: ..:       :. 
CCDS76 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEA-------DEG
             320       330       340       350       360           

       440       450       460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
       .  .::::.: :           
CCDS76 YQLFEEVKSCSKLFQRWLQ    
          370       380       

>>CCDS9013.1 NAP1L1 gene_id:4673|Hs108|chr12              (391 aa)
 initn: 1082 init1: 656 opt: 795  Z-score: 661.4  bits: 131.4 E(32554): 1.6e-30
Smith-Waterman score: 1023; 47.1% identity (67.6% similar) in 380 aa overlap (57-427:23-361)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
                                     :: :.::.:   . .   .  .. .   : 
CCDS90         MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
                       10        20        30        40        50  

           90       100       110       120       130       140    
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
        .:  ::.     : ..::::  :: :: :::.::.. :..:.:: .: ::.:::.: .:
CCDS90 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
             60          70        80        90       100       110

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
       :::..:: .::::::::::::::.: : ::  .::.       .:.. .           
CCDS90 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
              120       130       140              150             

          210       220       230       240       250       260    
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
                   :.:..:.         :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
CCDS90 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
                                 160       170       180       190 

          270       280       290       300       310       320    
pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
       ::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:.    ::  . :  
CCDS90 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
             200       210       220       230       240       250 

          330       340       350       360       370       380    
pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
       :   :::.:::..:::::::::::::::.  ::.::::.   .:::::::.:  .  .: 
CCDS90 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
             260       270       280       290       300       310 

                 390       400       410       420       430       
pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
         .:       :: .:: ::  :::::::.:.:.:.:....   .: ..:          
CCDS90 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEADEEGEEEGDE
             320       330       340       350       360       370 

       440       450       460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
                              
CCDS90 ENDPDYDPKKDQNPAECKQQ   
             380       390    

>>CCDS81715.1 NAP1L1 gene_id:4673|Hs108|chr12             (328 aa)
 initn: 1066 init1: 656 opt: 782  Z-score: 651.9  bits: 129.4 E(32554): 5.4e-30
Smith-Waterman score: 1003; 49.4% identity (70.1% similar) in 334 aa overlap (101-427:4-298)

               80        90       100       110       120       130
pF1KB3 EDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFL
                                     ...::  :: :: :::.::.. :..:.:: 
CCDS81                            MADIDNLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFY
                                          10        20        30   

              140       150       160       170       180       190
pF1KB3 REFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEE
       .: ::.:::.: .::::..:: .::::::::::::::.: : ::  .::.          
CCDS81 EEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL----------
            40        50        60        70        80             

              200       210       220       230       240       250
pF1KB3 GMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKN
                               .:. . ::.     ....:.:::::::.:::::.::
CCDS81 ------------------------KEKAKIEDE-----KKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKN
                                    90            100       110    

              260       270       280       290       300       310
pF1KB3 VDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKS
       :: :. .....:::::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:
CCDS81 VDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRS
          120       130       140       150       160       170    

              320       330       340       350       360       370
pF1KB3 KLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSF
       .    ::  . :  :   :::.:::..:::::::::::::::.  ::.::::.   .:::
CCDS81 EPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSF
          180       190       200       210       220       230    

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pF1KB3 FNFFSPHGITSNGRDGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVRE
       ::::.:  .  .:   .:       :: .:: ::  :::::::.:.:.:.:....   .:
CCDS81 FNFFAPPEVPESGDLDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEE
          240       250       260       270       280       290    

           430       440       450       460
pF1KB3 VNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
        ..:                                 
CCDS81 GEEADEEGEEEGDEENDPDYDPKKDQNPAECKQQ   
          300       310       320           

>>CCDS41599.1 NAP1L4 gene_id:4676|Hs108|chr11             (375 aa)
 initn: 1011 init1: 659 opt: 769  Z-score: 640.5  bits: 127.5 E(32554): 2.3e-29
Smith-Waterman score: 932; 45.8% identity (71.1% similar) in 325 aa overlap (98-414:53-341)

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB3 GSGEDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLES
                                     ....:.::  :: :. :::.::.: :..:.
CCDS41 NTEKLTDQVMQNPRVLAALQERLDNVPHTPSSYIETLPKAVKRRINALKQLQVRCAHIEA
             30        40        50        60        70        80  

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB3 KFLREFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYG
       :: .: ::.:::.: .::::..:::..:..  :::. : :..:..:.       .:.. :
CCDS41 KFYEEVHDLERKYAALYQPLFDKRREFITGDVEPTDAESEWHSENEE-------EEKLAG
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pF1KB3 NEEGMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTV
       . .. :                 .: :.          ::.::     ::::::.::.:.
CCDS41 DMKSKV-----------------VVTEKAA--------ATAEE----PDPKGIPEFWFTI
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pF1KB3 LKNVDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYV
       ..::: :. :...::::::: : :::::.::::.:.::.:::::.::.:: : .::::: 
CCDS41 FRNVDMLSELVQEYDEPILKHLQDIKVKFSDPGQPMSFVLEFHFEPNDYFTNSVLTKTYK
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pF1KB3 LKSKLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPK
       .::.    ::  ..:  :    :: :::..:::::.:::::::::.  ::.::.:.. :.
CCDS41 MKSEPDKADPFSFEGPEIVDCDGCTIDWKKGKNVTVKTIKKKQKHKGRGTVRTITKQVPN
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pF1KB3 DSFFNFFSPHGITSNGRDGNDD--------FLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEG
       .::::::.:   ...:.. ..:        : .:: .:  :.::.::.:.:.:.:     
CCDS41 ESFFNFFNPLKASGDGESLDEDSEFTLASDFEIGHFFRERIVPRAVLYFTGEAIEDDDNF
        290       300       310       320       330       340      

     420       430       440       450       460
pF1KB3 VVREVNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
                                                
CCDS41 EEGEEGEEEELEGDEEGEDEDDAEINPKV            
        350       360       370                 

>>CCDS14465.1 NAP1L3 gene_id:4675|Hs108|chrX              (506 aa)
 initn: 910 init1: 503 opt: 607  Z-score: 507.0  bits: 103.2 E(32554): 6.4e-22
Smith-Waterman score: 756; 35.3% identity (58.0% similar) in 436 aa overlap (65-411:54-487)

           40        50        60        70        80        90    
pF1KB3 EDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGY
                                     ...::: .....:.:.  :.  : : .   
CCDS14 SSTSDSGEESDSSSSSSSTSDSSSSSSTSGSSSGSGSSSSSSGSTSSRSRLYRKKRVPEP
            30        40        50        60        70        80   

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pF1KB3 V-------LDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMYQPL
               : :.::. ::  :. :: ::...: .  .... ::. .::.:::.::. .::
CCDS14 SRRARRAPLGTNFVDRLPQAVRNRVQALRNIQDECDKVDTLFLKAIHDLERKYAELNKPL
            90       100       110       120       130       140   

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pF1KB3 LEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEE-------MYGNEE----------
        ..: ::::: :::::::::..:..:. ...:  ...       . :.::          
CCDS14 YDRRFQIINAEYEPTEEECEWNSEDEEFSSDEEVQDNTPSEMPPLEGEEEENPKENPEVK
           150       160       170       180       190       200   

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pF1KB3 ---GMVHEYVDE--DDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGE-------------ENK
            : . . :  :.  :       :. ::. . .: .::: :             ..:
CCDS14 AEEKEVPKEIPEVKDEEKEVPKEIPEVKAEEKADSKDCMEATPEVKEDPKEVPQVKADDK
           210       220       230       240       250       260   

                                                    240       250  
pF1KB3 EE----------------------------------------EDPKGIPDFWLTVLKNVD
       :.                                        ::::::::.:: ::::::
CCDS14 EQPKATEAKARAAVRETHKRVPEERLQDSVDLKRARKGKPKREDPKGIPDYWLIVLKNVD
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pF1KB3 TLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKL
        : :.:.::::::::.:.:...:.: ::.:.:.:.:::: :: ::.::.:.:::..:.: 
CCDS14 KLGPMIQKYDEPILKFLSDVSLKFSKPGQPVSYTFEFHFLPNPYFRNEVLVKTYIIKAKP
           330       340       350       360       370       380   

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pF1KB3 AYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFN
        . ::    :  ::   ::.::: .::.::. : ...      : :.   .  :. ::::
CCDS14 DHNDPFFSWGWEIEDCKGCKIDWRRGKDVTVTTTQSRTTAT--GEIEIQPRVVPNASFFN
           390       400       410       420         430       440 

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pF1KB3 FFSPHGITSNGR-----DG--NDDFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVN
       ::::  :   :.     :.  ..:: .:. :.  .: .:. ...:.              
CCDS14 FFSPPEIPMIGKLEPREDAILDEDFEIGQILHDNVILKSIYYYTGEVNGTYYQFGKHYGN
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         430       440       450       460
pF1KB3 DAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
                                          
CCDS14 KKYRK                              
                                          




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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