Result of FASTA (omim) for pF1KB9953
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9953, 536 aa
  1>>>pF1KB9953 536 - 536 aa - 536 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4268+/-0.000518; mu= -5.1695+/- 0.032
 mean_var=367.4399+/-78.164, 0's: 0 Z-trim(117.1): 104  B-trim: 52 in 1/57
 Lambda= 0.066908
 statistics sampled from 28651 (28754) to 28651 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.337), width:  16
 Scan time: 11.070

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_434700 (OMIM: 212050,607212) caspase recruitmen ( 536) 3496 352.2 2.4e-96
NP_434701 (OMIM: 212050,607212) caspase recruitmen ( 492) 3130 316.8 9.6e-86
XP_011513889 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) P (1153)  899 101.8 1.2e-20
NP_001311210 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) c (1154)  899 101.8 1.2e-20
XP_011513888 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) P (1154)  899 101.8 1.2e-20
NP_115791 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) casp (1154)  899 101.8 1.2e-20
NP_055365 (OMIM: 607209) caspase recruitment domai (1032)  679 80.5 2.7e-14
XP_016880547 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE ( 544)  595 72.1 4.8e-12
NP_001244899 (OMIM: 173200,602723,607211) caspase  ( 740)  595 72.3 5.9e-12
XP_016880546 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1003)  595 72.4 7.3e-12
NP_077015 (OMIM: 173200,602723,607211) caspase rec (1004)  595 72.4 7.3e-12
XP_011523519 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1004)  595 72.4 7.3e-12
XP_011523518 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1004)  595 72.4 7.3e-12
XP_011523517 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1004)  595 72.4 7.3e-12
XP_011523520 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1004)  595 72.4 7.3e-12
XP_011523515 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1004)  595 72.4 7.3e-12
XP_011523514 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1004)  595 72.4 7.3e-12


>>NP_434700 (OMIM: 212050,607212) caspase recruitment do  (536 aa)
 initn: 3496 init1: 3496 opt: 3496  Z-score: 1850.8  bits: 352.2 E(85289): 2.4e-96
Smith-Waterman score: 3496; 99.8% identity (100.0% similar) in 536 aa overlap (1-536:1-536)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSDYENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 MSDYENDDECWSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530      
pF1KB9 GLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 GLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
              490       500       510       520       530      

>>NP_434701 (OMIM: 212050,607212) caspase recruitment do  (492 aa)
 initn: 3127 init1: 3127 opt: 3130  Z-score: 1660.3  bits: 316.8 E(85289): 9.6e-86
Smith-Waterman score: 3130; 99.0% identity (99.4% similar) in 487 aa overlap (1-487:1-486)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSDYENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 MSDYENDDECWSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530      
pF1KB9 GLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
       :  .: :                                                 
NP_434 G-PAGLPGIGAVC                                           
               490                                             

>>XP_011513889 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) PREDI  (1153 aa)
 initn: 1228 init1: 414 opt: 899  Z-score: 491.8  bits: 101.8 E(85289): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 1250; 39.9% identity (69.8% similar) in 547 aa overlap (1-531:8-538)

                           10        20        30        40        
pF1KB9        MSDY-----ENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQV
              :.::     ...:  :. .:  :  :.  :.:...:::::::::.. .::..:
XP_011 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
               10        20        30        40        50        60

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB9 LSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIID
       :. : :  .  ..: :::::.  :..:::.::::::.:::.::: ::::::.: :: :. 
XP_011 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV
               70        80        90       100       110       120

      110       120       130              140       150       160 
pF1KB9 ASGESGLTQLLMTEVMKLQKKVQ-------DLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERV
         :. :::..::.::.:::....       .: : : . .:  :.. .    :   ::: 
XP_011 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVELLTFQERY
              130       140       150       160       170       180

             170       180       190       200       210       220 
pF1KB9 QRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE
        ..::: .. . :: . :..::.:::: :. ::::. :.::.:::::::::::: : : :
XP_011 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
              190       200       210       220       230       240

             230       240       250       260       270           
pF1KB9 DDCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKL---DRSSP
       ..::.::...:::.. .:.::..: . ::..:. .:... :::.. .: ::    : .. 
XP_011 EECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPDSDKA
              250       260       270       280       290       300

      280       290       300       310       320       330        
pF1KB9 YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKM
        ...::.: ..::.:.:: .: :..:... ::.:  : . .:::: .::.: .: :: .:
XP_011 ILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEM
              310       320       330       340       350       360

      340       350       360       370       380       390        
pF1KB9 YKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQ
       :: :.....::.:::  :::::. .:.: ..:... : :::  :::.::: :: ::....
XP_011 YKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIE
              370       380       390       400       410       420

      400       410       420       430       440       450        
pF1KB9 VFQCEAQLLAVEGRLRRQQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGG
       . . :: .. .:..::: . .    :..:... ::      . ::. :..   .:  :  
XP_011 MVRREACIVNLESKLRRLSKD----SNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADD
              430       440           450       460       470      

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XP_011 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
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pF1KB9 YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKM
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pF1KB9 GSPKQPFAALHQEQVLRNPHDAGLSSGEPPEKERRRLKE-SFENYRRKRALRKMQKGWRQ
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XP_011 SSTSE-----------ESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAK
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pF1KB9 GEEDRENTTGSDNTDTEGS                                         
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XP_011 GHEE-EGTDASPSSCGSLPITNSFTKMQPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHR
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>>NP_115791 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) caspase   (1154 aa)
 initn: 1228 init1: 414 opt: 899  Z-score: 491.8  bits: 101.8 E(85289): 1.2e-20
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                           10        20        30        40        
pF1KB9        MSDY-----ENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQV
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NP_115 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
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pF1KB9 LSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIID
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pF1KB9 ASGESGLTQLLMTEVMKLQKKVQ-------DLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERV
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NP_115 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVELLTFQERY
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pF1KB9 QRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE
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NP_115 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
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pF1KB9 DDCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKL---DRSSP
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NP_115 EECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPDSDKA
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pF1KB9 YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKM
        ...::.: ..::.:.:: .: :..:... ::.:  : . .:::: .::.: .: :: .:
NP_115 ILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEM
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pF1KB9 YKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQ
       :: :.....::.:::  :::::. .:.: ..:... : :::  :::.::: :: ::....
NP_115 YKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIE
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pF1KB9 VFQCEAQLLAVEGRLRRQQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGG
       . . :: .. .:..::: . .    :..:... ::      . ::. :..   .:  :  
NP_115 MVRREACIVNLESKLRRLSKD----SNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADD
              430       440           450       460       470      

      460       470       480       490        500       510       
pF1KB9 GSPKQPFAALHQEQVLRNPHDAGLSSGEPPEKERRRLKE-SFENYRRKRALRKMQKGWRQ
       .: ..           ..:.:.       : ..:  ::  ...  .   .:.. .    .
NP_115 SSTSE-----------ESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAK
        480                  490       500       510       520     

       520       530                                               
pF1KB9 GEEDRENTTGSDNTDTEGS                                         
       :.:. :.: .: ..                                              
NP_115 GHEE-EGTDASPSSCGSLPITNSFTKMQPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHR
          530       540       550       560       570       580    

>>NP_055365 (OMIM: 607209) caspase recruitment domain-co  (1032 aa)
 initn: 685 init1: 402 opt: 679  Z-score: 377.7  bits: 80.5 E(85289): 2.7e-14
Smith-Waterman score: 950; 35.0% identity (63.5% similar) in 543 aa overlap (7-518:24-565)

                                10        20        30        40   
pF1KB9                  MSDYENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPD
                              .:  :. .:: :  :. ...:...:::::::.:.. .
NP_055 MPGRAEAGEAEEEAGAGSGSEAEEDALWERIEGVRHRLARALNPAKLTPYLRQCRVIDEQ
               10        20        30        40        50        60

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB9 DEEQVLSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVF
       :::.:::   .  :  ..: :.:::.  :..:: ::::.::.:::. .  .::.:::.  
NP_055 DEEEVLSTYRFPCRVNRTGRLMDILRCRGKRGYEAFLEALEFYYPEHFTLLTGQEPAQRC
               70        80        90       100       110       120

           110       120         130        140       150          
pF1KB9 SMIIDASGESGLTQLLMTEVMKLQ--KKVQ-DLTALLSSKDDFIKELRVK-DSLLRKHQ-
       :::.:  :  ::::.::::: .:.  .: : .    :...   ..: :.  .. :: .: 
NP_055 SMILDEEGPEGLTQFLMTEVRRLREARKSQLQREQQLQARGRVLEEERAGLEQRLRDQQQ
              130       140       150       160       170       180

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB9 --ERVQRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHS
         :: :::.:. :::: :: : :.::: .:::::. ::::..:..:.::::: .:::: .
NP_055 AQERCQRLREDWEAGSLELLRLKDENYMIAMRLAQLSEEKNSAVLRSRDLQLAVDQLKLK
              190       200       210       220       230       240

        220               230       240        250       260       
pF1KB9 LMKAEDDCKVERK--------HTLKLRHAMEQRPSQ-ELLWELQQEKALLQARVQELEAS
       . . :..: . :.        .  . ..  :..:.. .:. ::. :.  : : ..::. .
NP_055 VSRLEEECALLRRARGPPPGAEEKEKEKEKEKEPDNVDLVSELRAENQRLTASLRELQEG
              250       260       270       280       290       300

       270            280       290       300       310       320  
pF1KB9 VQEGKLDRSSP-----YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEK
       .:.     ..:      ...::.:::.:  ..::  . . ... .:. .:  : . ..: 
NP_055 LQQEASRPGAPGSERILLDILEHDWREAQDSRQELCQKLHAVQGELQWAEELRDQYLQEM
              310       320       330       340       350       360

            330       340       350       360       370       380  
pF1KB9 EMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALR
       : ..:.  .:.::  .:: :. ..: :.::.  :::::: .:.... :....: :::  :
NP_055 EDLRLKHRTLQKDCDLYKHRMATVLAQLEEIEKERDQAIQSRDRIQLQYSQSLIEKDQYR
              370       380       390       400       410       420

            390       400       410           420       430        
pF1KB9 KQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQ----LETLVLSSDLEDGSPRRSQEL
       :::: :  . :::   . . :.    .: .:.: :    :.. . : .: ..     .  
NP_055 KQVRGLEAERDELLTTLTSLEGTKALLEVQLQRAQGGTCLKACASSHSLCSNLSSTWSLS
              430       440       450       460       470       480

      440       450       460       470             480       490  
pF1KB9 SLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQ------VLRNPHDAGLSSGEPPEKER
        .:. :   . . .. . ::  :..   :  .:.      .:  : .::    .  :.. 
NP_055 EFPSPLGGPEATGEAAVMGGPEPHNSEEATDSEKEINRLSILPFPPSAGSILRRQREEDP
              490       500       510       520       530       540

            500       510       520       530                      
pF1KB9 RRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS                
          :.:: ..    .   . : :  :                                  
NP_055 APPKRSFSSMSDITGSVTL-KPWSPGLSSSSSSDSVWPLGKPEGLLARGCGLDFLNRSLA
              550        560       570       580       590         

>>XP_016880547 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTED: c  (544 aa)
 initn: 600 init1: 261 opt: 595  Z-score: 337.3  bits: 72.1 E(85289): 4.8e-12
Smith-Waterman score: 608; 31.9% identity (62.0% similar) in 461 aa overlap (7-451:15-458)

                       10         20        30        40        50 
pF1KB9         MSDYENDDEC-WNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSD
                     :.:  :...:. :  ..  : :::.:::::: :::   :::.:: .
XP_016 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB9 PNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASG
       : :.    ..: :::.:.  :..: .::::::... :..:  ::: .:   :: .     
XP_016 PRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSGLME
               70        80        90       100       110       120

             120       130           140       150        160      
pF1KB9 ESGLTQLLMTEVMKLQKKVQDLTA----LLSSKDDFIKELRVKDSLLRK-HQERVQ--RL
        : ::. :   . .::.....  .    ::   ... ..: . ..  .  :: ...  :.
XP_016 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM
              130       140       150       160       170       180

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB9 KEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE--D
       :.:  :  .:. : :.:  .:... ..  .::  :  : :.:: :.  ::. :..:.  .
XP_016 KREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRANMVS
              190       200       210       220       230       240

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB9 DCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQV
       .:..: ..  .:: : .:. ..: : .:..:.     ... :  :. :          ..
XP_016 SCELELQEQ-SLRTASDQESGDEELNRLKEENE----KLRSLTFSLAEK---------DI
               250       260       270           280               

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB9 LEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDR
       ::..  .:  ..:: .. : :::.    .: .: .  ::::.  ::    .   ..:...
XP_016 LEQSLDEARGSRQELVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKMACQLYREK
        290       300       310       320       330       340      

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB9 IEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQC
       ..:.  :. :.  ::::: ..:.  . . ...: :::.::.:: :: ... ::. :. : 
XP_016 VNALQAQVCELQKERDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCELRTQLRQL
        350       360       370       380       390       400      

               410          420       430       440       450      
pF1KB9 EAQ---LLAVEGRLRR---QQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLA
       .:.   .:  :.: :.   .. . ::    ..   :: ... :: .. :.  :::     
XP_016 QAEPPGVLKQEARTREPCPREKQRLV---RMHAICPRDDSDCSLVSSTESQLLSDLSATS
        410       420       430          440       450       460   

        460       470       480       490       500       510      
pF1KB9 GGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDAGLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWR
                                                                   
XP_016 SRELVDSFRSSSPAPPSQQSLYKRVAEDFGEEPWSFSSCLEIPEGDPGALPGAKAGDPHL
           470       480       490       500       510       520   

>>NP_001244899 (OMIM: 173200,602723,607211) caspase recr  (740 aa)
 initn: 600 init1: 261 opt: 595  Z-score: 335.6  bits: 72.3 E(85289): 5.9e-12
Smith-Waterman score: 608; 31.9% identity (62.0% similar) in 461 aa overlap (7-451:15-458)

                       10         20        30        40        50 
pF1KB9         MSDYENDDEC-WNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSD
                     :.:  :...:. :  ..  : :::.:::::: :::   :::.:: .
NP_001 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB9 PNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASG
       : :.    ..: :::.:.  :..: .::::::... :..:  ::: .:   :: .     
NP_001 PRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSGLME
               70        80        90       100       110       120

             120       130           140       150        160      
pF1KB9 ESGLTQLLMTEVMKLQKKVQDLTA----LLSSKDDFIKELRVKDSLLRK-HQERVQ--RL
        : ::. :   . .::.....  .    ::   ... ..: . ..  .  :: ...  :.
NP_001 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM
              130       140       150       160       170       180

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB9 KEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE--D
       :.:  :  .:. : :.:  .:... ..  .::  :  : :.:: :.  ::. :..:.  .
NP_001 KREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRANMVS
              190       200       210       220       230       240

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB9 DCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQV
       .:..: ..  .:: : .:. ..: : .:..:.     ... :  :. :          ..
NP_001 SCELELQEQ-SLRTASDQESGDEELNRLKEENE----KLRSLTFSLAEK---------DI
               250       260       270           280               

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB9 LEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDR
       ::..  .:  ..:: .. : :::.    .: .: .  ::::.  ::    .   ..:...
NP_001 LEQSLDEARGSRQELVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKMACQLYREK
        290       300       310       320       330       340      

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB9 IEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQC
       ..:.  :. :.  ::::: ..:.  . . ...: :::.::.:: :: ... ::. :. : 
NP_001 VNALQAQVCELQKERDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCELRTQLRQL
        350       360       370       380       390       400      

               410          420       430       440       450      
pF1KB9 EAQ---LLAVEGRLRR---QQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLA
       .:.   .:  :.: :.   .. . ::    ..   :: ... :: .. :.  :::     
NP_001 QAEPPGVLKQEARTREPCPREKQRLV---RMHAICPRDDSDCSLVSSTESQLLSDLSATS
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