Result of FASTA (ccds) for pF1KB9953
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9953, 536 aa
  1>>>pF1KB9953 536 - 536 aa - 536 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2224+/-0.00125; mu= -4.2141+/- 0.074
 mean_var=285.8806+/-62.744, 0's: 0 Z-trim(109.5): 61  B-trim: 242 in 2/50
 Lambda= 0.075855
 statistics sampled from 10874 (10916) to 10874 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.335), width:  16
 Scan time:  3.870

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6997.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9          ( 536) 3496 396.6 3.9e-110
CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9         ( 492) 3130 356.5 4.2e-98
CCDS5336.2 CARD11 gene_id:84433|Hs108|chr7         (1154)  899 112.6 2.6e-24
CCDS13948.1 CARD10 gene_id:29775|Hs108|chr22       (1032)  679 88.5 4.1e-17
CCDS58605.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17       ( 740)  595 79.2 1.9e-14
CCDS11768.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17       (1004)  595 79.3 2.4e-14


>>CCDS6997.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9               (536 aa)
 initn: 3496 init1: 3496 opt: 3496  Z-score: 2090.7  bits: 396.6 E(32554): 3.9e-110
Smith-Waterman score: 3496; 99.8% identity (100.0% similar) in 536 aa overlap (1-536:1-536)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSDYENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MSDYENDDECWSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530      
pF1KB9 GLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
              490       500       510       520       530      

>>CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9              (492 aa)
 initn: 3127 init1: 3127 opt: 3130  Z-score: 1874.7  bits: 356.5 E(32554): 4.2e-98
Smith-Waterman score: 3130; 99.0% identity (99.4% similar) in 487 aa overlap (1-487:1-486)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSDYENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MSDYENDDECWSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530      
pF1KB9 GLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
       :  .: :                                                 
CCDS48 G-PAGLPGIGAVC                                           
               490                                             

>>CCDS5336.2 CARD11 gene_id:84433|Hs108|chr7              (1154 aa)
 initn: 1228 init1: 414 opt: 899  Z-score: 550.1  bits: 112.6 E(32554): 2.6e-24
Smith-Waterman score: 1250; 39.9% identity (69.8% similar) in 547 aa overlap (1-531:8-538)

                           10        20        30        40        
pF1KB9        MSDY-----ENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQV
              :.::     ...:  :. .:  :  :.  :.:...:::::::::.. .::..:
CCDS53 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
               10        20        30        40        50        60

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB9 LSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIID
       :. : :  .  ..: :::::.  :..:::.::::::.:::.::: ::::::.: :: :. 
CCDS53 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV
               70        80        90       100       110       120

      110       120       130              140       150       160 
pF1KB9 ASGESGLTQLLMTEVMKLQKKVQ-------DLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERV
         :. :::..::.::.:::....       .: : : . .:  :.. .    :   ::: 
CCDS53 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVELLTFQERY
              130       140       150       160       170       180

             170       180       190       200       210       220 
pF1KB9 QRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE
        ..::: .. . :: . :..::.:::: :. ::::. :.::.:::::::::::: : : :
CCDS53 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
              190       200       210       220       230       240

             230       240       250       260       270           
pF1KB9 DDCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKL---DRSSP
       ..::.::...:::.. .:.::..: . ::..:. .:... :::.. .: ::    : .. 
CCDS53 EECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPDSDKA
              250       260       270       280       290       300

      280       290       300       310       320       330        
pF1KB9 YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKM
        ...::.: ..::.:.:: .: :..:... ::.:  : . .:::: .::.: .: :: .:
CCDS53 ILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEM
              310       320       330       340       350       360

      340       350       360       370       380       390        
pF1KB9 YKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQ
       :: :.....::.:::  :::::. .:.: ..:... : :::  :::.::: :: ::....
CCDS53 YKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIE
              370       380       390       400       410       420

      400       410       420       430       440       450        
pF1KB9 VFQCEAQLLAVEGRLRRQQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGG
       . . :: .. .:..::: . .    :..:... ::      . ::. :..   .:  :  
CCDS53 MVRREACIVNLESKLRRLSKD----SNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADD
              430       440           450       460       470      

      460       470       480       490        500       510       
pF1KB9 GSPKQPFAALHQEQVLRNPHDAGLSSGEPPEKERRRLKE-SFENYRRKRALRKMQKGWRQ
       .: ..           ..:.:.       : ..:  ::  ...  .   .:.. .    .
CCDS53 SSTSE-----------ESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAK
        480                  490       500       510       520     

       520       530                                               
pF1KB9 GEEDRENTTGSDNTDTEGS                                         
       :.:. :.: .: ..                                              
CCDS53 GHEE-EGTDASPSSCGSLPITNSFTKMQPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHR
          530       540       550       560       570       580    

>>CCDS13948.1 CARD10 gene_id:29775|Hs108|chr22            (1032 aa)
 initn: 685 init1: 402 opt: 679  Z-score: 420.6  bits: 88.5 E(32554): 4.1e-17
Smith-Waterman score: 950; 35.0% identity (63.5% similar) in 543 aa overlap (7-518:24-565)

                                10        20        30        40   
pF1KB9                  MSDYENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPD
                              .:  :. .:: :  :. ...:...:::::::.:.. .
CCDS13 MPGRAEAGEAEEEAGAGSGSEAEEDALWERIEGVRHRLARALNPAKLTPYLRQCRVIDEQ
               10        20        30        40        50        60

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB9 DEEQVLSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVF
       :::.:::   .  :  ..: :.:::.  :..:: ::::.::.:::. .  .::.:::.  
CCDS13 DEEEVLSTYRFPCRVNRTGRLMDILRCRGKRGYEAFLEALEFYYPEHFTLLTGQEPAQRC
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB9 SMIIDASGESGLTQLLMTEVMKLQ--KKVQ-DLTALLSSKDDFIKELRVK-DSLLRKHQ-
       :::.:  :  ::::.::::: .:.  .: : .    :...   ..: :.  .. :: .: 
CCDS13 SMILDEEGPEGLTQFLMTEVRRLREARKSQLQREQQLQARGRVLEEERAGLEQRLRDQQQ
              130       140       150       160       170       180

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB9 --ERVQRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHS
         :: :::.:. :::: :: : :.::: .:::::. ::::..:..:.::::: .:::: .
CCDS13 AQERCQRLREDWEAGSLELLRLKDENYMIAMRLAQLSEEKNSAVLRSRDLQLAVDQLKLK
              190       200       210       220       230       240

        220               230       240        250       260       
pF1KB9 LMKAEDDCKVERK--------HTLKLRHAMEQRPSQ-ELLWELQQEKALLQARVQELEAS
       . . :..: . :.        .  . ..  :..:.. .:. ::. :.  : : ..::. .
CCDS13 VSRLEEECALLRRARGPPPGAEEKEKEKEKEKEPDNVDLVSELRAENQRLTASLRELQEG
              250       260       270       280       290       300

       270            280       290       300       310       320  
pF1KB9 VQEGKLDRSSP-----YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEK
       .:.     ..:      ...::.:::.:  ..::  . . ... .:. .:  : . ..: 
CCDS13 LQQEASRPGAPGSERILLDILEHDWREAQDSRQELCQKLHAVQGELQWAEELRDQYLQEM
              310       320       330       340       350       360

            330       340       350       360       370       380  
pF1KB9 EMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALR
       : ..:.  .:.::  .:: :. ..: :.::.  :::::: .:.... :....: :::  :
CCDS13 EDLRLKHRTLQKDCDLYKHRMATVLAQLEEIEKERDQAIQSRDRIQLQYSQSLIEKDQYR
              370       380       390       400       410       420

            390       400       410           420       430        
pF1KB9 KQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQ----LETLVLSSDLEDGSPRRSQEL
       :::: :  . :::   . . :.    .: .:.: :    :.. . : .: ..     .  
CCDS13 KQVRGLEAERDELLTTLTSLEGTKALLEVQLQRAQGGTCLKACASSHSLCSNLSSTWSLS
              430       440       450       460       470       480

      440       450       460       470             480       490  
pF1KB9 SLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQ------VLRNPHDAGLSSGEPPEKER
        .:. :   . . .. . ::  :..   :  .:.      .:  : .::    .  :.. 
CCDS13 EFPSPLGGPEATGEAAVMGGPEPHNSEEATDSEKEINRLSILPFPPSAGSILRRQREEDP
              490       500       510       520       530       540

            500       510       520       530                      
pF1KB9 RRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS                
          :.:: ..    .   . : :  :                                  
CCDS13 APPKRSFSSMSDITGSVTL-KPWSPGLSSSSSSDSVWPLGKPEGLLARGCGLDFLNRSLA
              550        560       570       580       590         

>>CCDS58605.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17            (740 aa)
 initn: 600 init1: 261 opt: 595  Z-score: 373.0  bits: 79.2 E(32554): 1.9e-14
Smith-Waterman score: 608; 31.9% identity (62.0% similar) in 461 aa overlap (7-451:15-458)

                       10         20        30        40        50 
pF1KB9         MSDYENDDEC-WNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSD
                     :.:  :...:. :  ..  : :::.:::::: :::   :::.:: .
CCDS58 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB9 PNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASG
       : :.    ..: :::.:.  :..: .::::::... :..:  ::: .:   :: .     
CCDS58 PRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSGLME
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB9 ESGLTQLLMTEVMKLQKKVQDLTA----LLSSKDDFIKELRVKDSLLRK-HQERVQ--RL
        : ::. :   . .::.....  .    ::   ... ..: . ..  .  :: ...  :.
CCDS58 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB9 KEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE--D
       :.:  :  .:. : :.:  .:... ..  .::  :  : :.:: :.  ::. :..:.  .
CCDS58 KREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRANMVS
              190       200       210       220       230       240

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB9 DCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQV
       .:..: ..  .:: : .:. ..: : .:..:.     ... :  :. :          ..
CCDS58 SCELELQEQ-SLRTASDQESGDEELNRLKEENE----KLRSLTFSLAEK---------DI
               250       260       270           280               

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB9 LEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDR
       ::..  .:  ..:: .. : :::.    .: .: .  ::::.  ::    .   ..:...
CCDS58 LEQSLDEARGSRQELVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKMACQLYREK
        290       300       310       320       330       340      

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB9 IEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQC
       ..:.  :. :.  ::::: ..:.  . . ...: :::.::.:: :: ... ::. :. : 
CCDS58 VNALQAQVCELQKERDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCELRTQLRQL
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pF1KB9 EAQ---LLAVEGRLRR---QQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLA
       .:.   .:  :.: :.   .. . ::    ..   :: ... :: .. :.  :::     
CCDS58 QAEPPGVLKQEARTREPCPREKQRLV---RMHAICPRDDSDCSLVSSTESQLLSDLSATS
        410       420       430          440       450       460   

        460       470       480       490       500       510      
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CCDS58 SRELVDSFRSSSPAPPSQQSLYKRVAEDFGEEPWSFSSCLEIPEGDPGALPGAKAGDPHL
           470       480       490       500       510       520   

>>CCDS11768.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17            (1004 aa)
 initn: 600 init1: 261 opt: 595  Z-score: 371.1  bits: 79.3 E(32554): 2.4e-14
Smith-Waterman score: 608; 31.9% identity (62.0% similar) in 461 aa overlap (7-451:15-458)

                       10         20        30        40        50 
pF1KB9         MSDYENDDEC-WNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSD
                     :.:  :...:. :  ..  : :::.:::::: :::   :::.:: .
CCDS11 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB9 PNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASG
       : :.    ..: :::.:.  :..: .::::::... :..:  ::: .:   :: .     
CCDS11 PRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSGLME
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB9 ESGLTQLLMTEVMKLQKKVQDLTA----LLSSKDDFIKELRVKDSLLRK-HQERVQ--RL
        : ::. :   . .::.....  .    ::   ... ..: . ..  .  :: ...  :.
CCDS11 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM
              130       140       150       160       170       180

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB9 KEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE--D
       :.:  :  .:. : :.:  .:... ..  .::  :  : :.:: :.  ::. :..:.  .
CCDS11 KREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRANMVS
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pF1KB9 DCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQV
       .:..: ..  .:: : .:. ..: : .:..:.     ... :  :. :          ..
CCDS11 SCELELQEQ-SLRTASDQESGDEELNRLKEENE----KLRSLTFSLAEK---------DI
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pF1KB9 LEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDR
       ::..  .:  ..:: .. : :::.    .: .: .  ::::.  ::    .   ..:...
CCDS11 LEQSLDEARGSRQELVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKMACQLYREK
        290       300       310       320       330       340      

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pF1KB9 IEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQC
       ..:.  :. :.  ::::: ..:.  . . ...: :::.::.:: :: ... ::. :. : 
CCDS11 VNALQAQVCELQKERDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCELRTQLRQL
        350       360       370       380       390       400      

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pF1KB9 EAQ---LLAVEGRLRR---QQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLA
       .:.   .:  :.: :.   .. . ::    ..   :: ... :: .. :.  :::     
CCDS11 QAEPPGVLKQEARTREPCPREKQRLV---RMHAICPRDDSDCSLVSSTESQLLSDLSATS
        410       420       430          440       450       460   

        460       470       480       490       500       510      
pF1KB9 GGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDAGLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWR
                                                                   
CCDS11 SRELVDSFRSSSPAPPSQQSLYKRVAEDFGEEPWSFSSCLEIPEGDPGALPGAKAGDPHL
           470       480       490       500       510       520   




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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