Result of FASTA (ccds) for pF1KB6677
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6677, 427 aa
  1>>>pF1KB6677 427 - 427 aa - 427 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9343+/-0.00119; mu= 19.5117+/- 0.071
 mean_var=128.3964+/-43.326, 0's: 0 Z-trim(103.0): 246  B-trim: 926 in 2/47
 Lambda= 0.113187
 statistics sampled from 6854 (7190) to 6854 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.221), width:  16
 Scan time:  2.690

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3769.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4           ( 427) 2918 488.9 3.9e-138
CCDS9461.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13          ( 442) 1611 275.5 7.1e-74
CCDS55902.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13         ( 532) 1611 275.6 7.9e-74
CCDS45059.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13         ( 436) 1529 262.1 7.6e-70
CCDS58927.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4          ( 202) 1427 245.0 5.1e-65
CCDS54810.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4          ( 318) 1261 218.1 9.5e-57
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX           ( 384)  606 111.3 1.7e-24
CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6            ( 390)  584 107.7   2e-23
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX            ( 399)  539 100.4 3.3e-21
CCDS5792.1 GPR37 gene_id:2861|Hs108|chr7           ( 613)  491 92.8 9.7e-19
CCDS1420.1 GPR37L1 gene_id:9283|Hs108|chr1         ( 481)  465 88.4 1.6e-17
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3            ( 366)  403 78.1 1.5e-14
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11           ( 380)  403 78.2 1.6e-14
CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4          ( 431)  368 72.5 8.8e-13
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5          ( 415)  354 70.2 4.2e-12
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  347 69.0   9e-12
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  347 69.0   9e-12
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  347 69.0 9.1e-12
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 400)  347 69.0 9.1e-12
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 403)  347 69.0 9.2e-12
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 406)  347 69.1 9.2e-12
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 418)  347 69.1 9.4e-12
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 420)  347 69.1 9.4e-12
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 446)  347 69.1 9.7e-12
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 493)  347 69.2   1e-11
CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10         ( 375)  326 65.6 9.5e-11


>>CCDS3769.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4                (427 aa)
 initn: 2918 init1: 2918 opt: 2918  Z-score: 2593.4  bits: 488.9 E(32554): 3.9e-138
Smith-Waterman score: 2918; 100.0% identity (100.0% similar) in 427 aa overlap (1-427:1-427)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 METLCLRASFWLALVGCVISDNPERYSTNLSNHVDDFTTFRGTELSFLVTTHQPTNLVLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 METLCLRASFWLALVGCVISDNPERYSTNLSNHVDDFTTFRGTELSFLVTTHQPTNLVLP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 SNGSMHNYCPQQTKITSAFKYINTVISCTIFIVGMVGNATLLRIIYQNKCMRNGPNALIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SNGSMHNYCPQQTKITSAFKYINTVISCTIFIVGMVGNATLLRIIYQNKCMRNGPNALIA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 SLALGDLIYVVIDLPINVFKLLAGRWPFDHNDFGVFLCKLFPFLQKSSVGITVLNLCALS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SLALGDLIYVVIDLPINVFKLLAGRWPFDHNDFGVFLCKLFPFLQKSSVGITVLNLCALS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 VDRYRAVASWSRVQGIGIPLVTAIEIVSIWILSFILAIPEAIGFVMVPFEYRGEQHKTCM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VDRYRAVASWSRVQGIGIPLVTAIEIVSIWILSFILAIPEAIGFVMVPFEYRGEQHKTCM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 LNATSKFMEFYQDVKDWWLFGFYFCMPLVCTAIFYTLMTCEMLNRRNGSLRIALSEHLKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LNATSKFMEFYQDVKDWWLFGFYFCMPLVCTAIFYTLMTCEMLNRRNGSLRIALSEHLKQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 RREVAKTVFCLVVIFALCWFPLHLSRILKKTVYNEMDKNRCELLSFLLLMDYIGINLATM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RREVAKTVFCLVVIFALCWFPLHLSRILKKTVYNEMDKNRCELLSFLLLMDYIGINLATM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 NSCINPIALYFVSKKFKNCFQSCLCCCCYQSKSLMTSVPMNGTSIQWKNHDQNNHNTDRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NSCINPIALYFVSKKFKNCFQSCLCCCCYQSKSLMTSVPMNGTSIQWKNHDQNNHNTDRS
              370       380       390       400       410       420

              
pF1KB6 SHKDSMN
       :::::::
CCDS37 SHKDSMN
              

>>CCDS9461.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13               (442 aa)
 initn: 988 init1: 579 opt: 1611  Z-score: 1439.8  bits: 275.5 E(32554): 7.1e-74
Smith-Waterman score: 1611; 63.8% identity (85.0% similar) in 359 aa overlap (69-425:90-440)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB6 TFRGTELSFLVTTHQPTNLVLPSNGSMHNYCPQQTKITSAFKYINTVISCTIFIVGMVGN
                                     :    .:  .:::::::.:: .:..:..::
CCDS94 ASLARSLAPAEVPKGDRTAGSPPRTISPPPCQGPIEIKETFKYINTVVSCLVFVLGIIGN
      60        70        80        90       100       110         

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB6 ATLLRIIYQNKCMRNGPNALIASLALGDLIYVVIDLPINVFKLLAGRWPFDHNDFGVFLC
       .:::::::.::::::::: ::::::::::...:::.::::.::::  :::     :. .:
CCDS94 STLLRIIYKNKCMRNGPNILIASLALGDLLHIVIDIPINVYKLLAEDWPF-----GAEMC
     120       130       140       150       160            170    

      160       170       180       190       200       210        
pF1KB6 KLFPFLQKSSVGITVLNLCALSVDRYRAVASWSRVQGIGIPLVTAIEIVSIWILSFILAI
       :: ::.::.:::::::.:::::.:::::::::::..:::.:  ::.::: ::..: .::.
CCDS94 KLVPFIQKASVGITVLSLCALSIDRYRAVASWSRIKGIGVPKWTAVEIVLIWVVSVVLAV
          180       190       200       210       220       230    

      220       230       240         250       260       270      
pF1KB6 PEAIGFVMVPFEYRGEQHKTCMLNATSK--FMEFYQDVKDWWLFGFYFCMPLVCTAIFYT
       :::::: .. ..:.:   . :.:. ..:  ::.::. .::::::.::::.::. ::.:::
CCDS94 PEAIGFDIITMDYKGSYLRICLLHPVQKTAFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYT
          240       250       260       270       280       290    

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB6 LMTCEMLNRRNGSLRIALSEHLKQRREVAKTVFCLVVIFALCWFPLHLSRILKKTVYNEM
       ::::::: ...: ..:::..::::::::::::::::..:::::.::::::::: :.::. 
CCDS94 LMTCEMLRKKSG-MQIALNDHLKQRREVAKTVFCLVLVFALCWLPLHLSRILKLTLYNQN
          300        310       320       330       340       350   

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB6 DKNRCELLSFLLLMDYIGINLATMNSCINPIALYFVSKKFKNCFQSCLCCCCYQSKSLMT
       : ::::::::::..::::::.:..::::::::::.:::.:::::.::::: : ::     
CCDS94 DPNRCELLSFLLVLDYIGINMASLNSCINPIALYLVSKRFKNCFKSCLCCWC-QSFEEKQ
           360       370       380       390       400        410  

        400       410       420       
pF1KB6 SVPMNGTSIQWKNHDQNNHNTDRSSHKDSMN
       :.  . . ...: .:..  :  :::.: :  
CCDS94 SLEEKQSCLKFKANDHGYDNF-RSSNKYSSS
            420       430        440  

>>CCDS55902.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13              (532 aa)
 initn: 988 init1: 579 opt: 1611  Z-score: 1439.0  bits: 275.6 E(32554): 7.9e-74
Smith-Waterman score: 1611; 63.8% identity (85.0% similar) in 359 aa overlap (69-425:180-530)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB6 TFRGTELSFLVTTHQPTNLVLPSNGSMHNYCPQQTKITSAFKYINTVISCTIFIVGMVGN
                                     :    .:  .:::::::.:: .:..:..::
CCDS55 ASLARSLAPAEVPKGDRTAGSPPRTISPPPCQGPIEIKETFKYINTVVSCLVFVLGIIGN
     150       160       170       180       190       200         

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB6 ATLLRIIYQNKCMRNGPNALIASLALGDLIYVVIDLPINVFKLLAGRWPFDHNDFGVFLC
       .:::::::.::::::::: ::::::::::...:::.::::.::::  :::     :. .:
CCDS55 STLLRIIYKNKCMRNGPNILIASLALGDLLHIVIDIPINVYKLLAEDWPF-----GAEMC
     210       220       230       240       250            260    

      160       170       180       190       200       210        
pF1KB6 KLFPFLQKSSVGITVLNLCALSVDRYRAVASWSRVQGIGIPLVTAIEIVSIWILSFILAI
       :: ::.::.:::::::.:::::.:::::::::::..:::.:  ::.::: ::..: .::.
CCDS55 KLVPFIQKASVGITVLSLCALSIDRYRAVASWSRIKGIGVPKWTAVEIVLIWVVSVVLAV
          270       280       290       300       310       320    

      220       230       240         250       260       270      
pF1KB6 PEAIGFVMVPFEYRGEQHKTCMLNATSK--FMEFYQDVKDWWLFGFYFCMPLVCTAIFYT
       :::::: .. ..:.:   . :.:. ..:  ::.::. .::::::.::::.::. ::.:::
CCDS55 PEAIGFDIITMDYKGSYLRICLLHPVQKTAFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYT
          330       340       350       360       370       380    

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB6 LMTCEMLNRRNGSLRIALSEHLKQRREVAKTVFCLVVIFALCWFPLHLSRILKKTVYNEM
       ::::::: ...: ..:::..::::::::::::::::..:::::.::::::::: :.::. 
CCDS55 LMTCEMLRKKSG-MQIALNDHLKQRREVAKTVFCLVLVFALCWLPLHLSRILKLTLYNQN
          390        400       410       420       430       440   

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB6 DKNRCELLSFLLLMDYIGINLATMNSCINPIALYFVSKKFKNCFQSCLCCCCYQSKSLMT
       : ::::::::::..::::::.:..::::::::::.:::.:::::.::::: : ::     
CCDS55 DPNRCELLSFLLVLDYIGINMASLNSCINPIALYLVSKRFKNCFKSCLCCWC-QSFEEKQ
           450       460       470       480       490        500  

        400       410       420       
pF1KB6 SVPMNGTSIQWKNHDQNNHNTDRSSHKDSMN
       :.  . . ...: .:..  :  :::.: :  
CCDS55 SLEEKQSCLKFKANDHGYDNF-RSSNKYSSS
            510       520        530  

>>CCDS45059.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13              (436 aa)
 initn: 940 init1: 531 opt: 1529  Z-score: 1367.5  bits: 262.1 E(32554): 7.6e-70
Smith-Waterman score: 1529; 61.8% identity (83.3% similar) in 353 aa overlap (69-415:90-436)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB6 TFRGTELSFLVTTHQPTNLVLPSNGSMHNYCPQQTKITSAFKYINTVISCTIFIVGMVGN
                                     :    .:  .:::::::.:: .:..:..::
CCDS45 ASLARSLAPAEVPKGDRTAGSPPRTISPPPCQGPIEIKETFKYINTVVSCLVFVLGIIGN
      60        70        80        90       100       110         

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB6 ATLLRIIYQNKCMRNGPNALIASLALGDLIYVVIDLPINVFKLLAGRWPFDHNDFGVFLC
       .:::::::.::::::::: ::::::::::...:::.::::.::::  :::     :. .:
CCDS45 STLLRIIYKNKCMRNGPNILIASLALGDLLHIVIDIPINVYKLLAEDWPF-----GAEMC
     120       130       140       150       160            170    

      160       170       180       190       200       210        
pF1KB6 KLFPFLQKSSVGITVLNLCALSVDRYRAVASWSRVQGIGIPLVTAIEIVSIWILSFILAI
       :: ::.::.:::::::.:::::.:::::::::::..:::.:  ::.::: ::..: .::.
CCDS45 KLVPFIQKASVGITVLSLCALSIDRYRAVASWSRIKGIGVPKWTAVEIVLIWVVSVVLAV
          180       190       200       210       220       230    

      220       230       240         250       260       270      
pF1KB6 PEAIGFVMVPFEYRGEQHKTCMLNATSK--FMEFYQDVKDWWLFGFYFCMPLVCTAIFYT
       :::::: .. ..:.:   . :.:. ..:  ::.::. .::::::.::::.::. ::.:::
CCDS45 PEAIGFDIITMDYKGSYLRICLLHPVQKTAFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYT
          240       250       260       270       280       290    

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB6 LMTCEMLNRRNGSLRIALSEHLKQRREVAKTVFCLVVIFALCWFPLHLSRILKKTVYNEM
       ::::::: ...: ..:::..::::::::::::::::..:::::.::::::::: :.::. 
CCDS45 LMTCEMLRKKSG-MQIALNDHLKQRREVAKTVFCLVLVFALCWLPLHLSRILKLTLYNQN
          300        310       320       330       340       350   

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB6 DKNRCELLSFLLLMDYIGINLATMNSCINPIALYFVSKKFKNCFQSCLCCCCYQSKSLMT
       : ::::::::::..::::::.:..::::::::::.:::.:::::..           . .
CCDS45 DPNRCELLSFLLVLDYIGINMASLNSCINPIALYLVSKRFKNCFKAGPHVGNKLVMLFSV
           360       370       380       390       400       410   

        400           410       420       
pF1KB6 SVPMNGTSIQ----WKNHDQNNHNTDRSSHKDSMN
       ..  .::  :    : .. .::.            
CCDS45 NIECDGTVNQNPTMWPERKSNNN            
           420       430                  

>>CCDS58927.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4               (202 aa)
 initn: 1427 init1: 1427 opt: 1427  Z-score: 1280.8  bits: 245.0 E(32554): 5.1e-65
Smith-Waterman score: 1427; 100.0% identity (100.0% similar) in 202 aa overlap (226-427:1-202)

         200       210       220       230       240       250     
pF1KB6 IGIPLVTAIEIVSIWILSFILAIPEAIGFVMVPFEYRGEQHKTCMLNATSKFMEFYQDVK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58                               MVPFEYRGEQHKTCMLNATSKFMEFYQDVK
                                             10        20        30

         260       270       280       290       300       310     
pF1KB6 DWWLFGFYFCMPLVCTAIFYTLMTCEMLNRRNGSLRIALSEHLKQRREVAKTVFCLVVIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DWWLFGFYFCMPLVCTAIFYTLMTCEMLNRRNGSLRIALSEHLKQRREVAKTVFCLVVIF
               40        50        60        70        80        90

         320       330       340       350       360       370     
pF1KB6 ALCWFPLHLSRILKKTVYNEMDKNRCELLSFLLLMDYIGINLATMNSCINPIALYFVSKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ALCWFPLHLSRILKKTVYNEMDKNRCELLSFLLLMDYIGINLATMNSCINPIALYFVSKK
              100       110       120       130       140       150

         380       390       400       410       420       
pF1KB6 FKNCFQSCLCCCCYQSKSLMTSVPMNGTSIQWKNHDQNNHNTDRSSHKDSMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FKNCFQSCLCCCCYQSKSLMTSVPMNGTSIQWKNHDQNNHNTDRSSHKDSMN
              160       170       180       190       200  

>>CCDS54810.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4               (318 aa)
 initn: 1261 init1: 1261 opt: 1261  Z-score: 1132.3  bits: 218.1 E(32554): 9.5e-57
Smith-Waterman score: 1956; 74.5% identity (74.5% similar) in 427 aa overlap (1-427:1-318)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 METLCLRASFWLALVGCVISDNPERYSTNLSNHVDDFTTFRGTELSFLVTTHQPTNLVLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 METLCLRASFWLALVGCVISDNPERYSTNLSNHVDDFTTFRGTELSFLVTTHQPTNLVLP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 SNGSMHNYCPQQTKITSAFKYINTVISCTIFIVGMVGNATLLRIIYQNKCMRNGPNALIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SNGSMHNYCPQQTKITSAFKYINTVISCTIFIVGMVGNATLLRIIYQNKCMRNGPNALIA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 SLALGDLIYVVIDLPINVFKLLAGRWPFDHNDFGVFLCKLFPFLQKSSVGITVLNLCALS
       ::::::::::::::::::::                                        
CCDS54 SLALGDLIYVVIDLPINVFK----------------------------------------
              130       140                                        

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 VDRYRAVASWSRVQGIGIPLVTAIEIVSIWILSFILAIPEAIGFVMVPFEYRGEQHKTCM
                                                                   
CCDS54 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 LNATSKFMEFYQDVKDWWLFGFYFCMPLVCTAIFYTLMTCEMLNRRNGSLRIALSEHLKQ
                :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ---------FYQDVKDWWLFGFYFCMPLVCTAIFYTLMTCEMLNRRNGSLRIALSEHLKQ
                       150       160       170       180       190 

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 RREVAKTVFCLVVIFALCWFPLHLSRILKKTVYNEMDKNRCELLSFLLLMDYIGINLATM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RREVAKTVFCLVVIFALCWFPLHLSRILKKTVYNEMDKNRCELLSFLLLMDYIGINLATM
             200       210       220       230       240       250 

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 NSCINPIALYFVSKKFKNCFQSCLCCCCYQSKSLMTSVPMNGTSIQWKNHDQNNHNTDRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NSCINPIALYFVSKKFKNCFQSCLCCCCYQSKSLMTSVPMNGTSIQWKNHDQNNHNTDRS
             260       270       280       290       300       310 

              
pF1KB6 SHKDSMN
       :::::::
CCDS54 SHKDSMN
              

>>CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX                (384 aa)
 initn: 422 init1: 237 opt: 606  Z-score: 553.4  bits: 111.3 E(32554): 1.7e-24
Smith-Waterman score: 606; 33.5% identity (65.2% similar) in 313 aa overlap (81-387:41-340)

               60        70        80        90       100       110
pF1KB6 THQPTNLVLPSNGSMHNYCPQQTKITSAFKYINTVISCTIFIVGMVGNATLLRIIYQNKC
                                     :.  ..  .:...:..:: ::..:.   : 
CCDS14 LEVDHFMHCNISSHSADLPVNDDWSHPGILYVIPAVYGVIILIGLIGNITLIKIFCTVKS
               20        30        40        50        60        70

              120       130       140       150       160       170
pF1KB6 MRNGPNALIASLALGDLIYVVIDLPINVFKLLAGRWPFDHNDFGVFLCKLFPFLQKSSVG
       ::: :: .:.:::::::. ..   :... . :: ::      :: . :::.::.: .:::
CCDS14 MRNVPNLFISSLALGDLLLLITCAPVDASRYLADRW-----LFGRIGCKLIPFIQLTSVG
               80        90       100            110       120     

              180       190       200       210       220          
pF1KB6 ITVLNLCALSVDRYRAVASWSRVQGIGIPLVTAIEIVSIWILSFILAIPEAIGFVMVPF-
       ..:..: :::.:::.:..    .:.    .   .. . :::.:..::::::.   . :: 
CCDS14 VSVFTLTALSADRYKAIVRPMDIQASHALMKICLKAAFIWIISMLLAIPEAVFSDLHPFH
         130       140       150       160       170       180     

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB6 -EYRGEQHKTCMLNATSKFMEFYQDVKDWWLFGFYFCMPLVCTAIFYTLMTCEMLNRRNG
        :  ..   .:     :.  :..  ...   :  .. .::   ...: ... ... .   
CCDS14 EESTNQTFISCAPYPHSN--ELHPKIHSMASFLVFYVIPLSIISVYYYFIAKNLI-QSAY
         190       200         210       220       230        240  

      290       300           310       320       330       340    
pF1KB6 SLRIALSEHLKQ----RREVAKTVFCLVVIFALCWFPLHLSRILKKTVYNEMDKNRCELL
       .: .  . :.:.    :...::::. .: .::.::.: :.  . ..  :.:.: .   .:
CCDS14 NLPVEGNIHVKKQIESRKRLAKTVLVFVGLFAFCWLPNHVIYLYRSYHYSEVDTS---ML
            250       260       270       280       290            

          350       360       370       380       390       400    
pF1KB6 SFLLLMDYIGINLATMNSCINPIALYFVSKKFKNCFQSCLCCCCYQSKSLMTSVPMNGTS
        :.  .   .  ::  :::.::.:::..::.:.. :.. : ::                 
CCDS14 HFVTSI--CARLLAFTNSCVNPFALYLLSKSFRKQFNTQLLCCQPGLIIRSHSTGRSTTC
     300         310       320       330       340       350       

          410       420           
pF1KB6 IQWKNHDQNNHNTDRSSHKDSMN    
                                  
CCDS14 MTSLKSTNPSVATFSLINGNICHERYV
       360       370       380    

>>CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6                 (390 aa)
 initn: 479 init1: 235 opt: 584  Z-score: 534.0  bits: 107.7 E(32554): 2e-23
Smith-Waterman score: 584; 30.8% identity (61.0% similar) in 377 aa overlap (49-416:11-371)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KB6 ISDNPERYSTNLSNHVDDFTTFRGTELSFLVTTHQPTNLVLPSNGSMHNYCPQQTKITSA
                                     :::    .  .: .:  ... : .   :. 
CCDS51                     MPSKSLSNLSVTTGANESGSVP-EGWERDFLPASDGTTTE
                                   10        20         30         

       80        90         100       110       120       130      
pF1KB6 FKYINTVISCTIFI--VGMVGNATLLRIIYQNKCMRNGPNALIASLALGDLIYVVIDLPI
       .    .. :  ..:  ::..::  :..:.  :. ::. :: .:..:: :::. ..  .:.
CCDS51 LVIRCVIPSLYLLIITVGLLGNIMLVKIFITNSAMRSVPNIFISNLAAGDLLLLLTCVPV
      40        50        60        70        80        90         

        140       150       160       170       180       190      
pF1KB6 NVFKLLAGRWPFDHNDFGVFLCKLFPFLQKSSVGITVLNLCALSVDRYRAVASWSRVQGI
       .     :.:. ::.  ::   :::.: .: .:::..:..: :::.:::::...   .:  
CCDS51 D-----ASRYFFDEWMFGKVGCKLIPVIQLTSVGVSVFTLTALSADRYRAIVNPMDMQTS
     100            110       120       130       140       150    

        200       210       220        230       240       250     
pF1KB6 GIPLVTAIEIVSIWILSFILAIPEAI-GFVMVPFEYRGEQHKTCMLNATSKFMEFYQDVK
       :  : : .. ..::..: .::.:::. . :       . .  .:.    .   :..  ..
CCDS51 GALLRTCVKAMGIWVVSVLLAVPEAVFSEVARISSLDNSSFTACIPYPQTD--ELHPKIH
          160       170       180       190       200         210  

         260       270       280       290       300           310 
pF1KB6 DWWLFGFYFCMPLVCTAIFYTLMTCEMLNRRNGSLRIALSEHLKQ----RREVAKTVFCL
       .  .:  :: .::.  .:.:  .. . : .   .:    .:: :.    :...:: :. .
CCDS51 SVLIFLVYFLIPLAIISIYYYHIA-KTLIKSAHNLPGEYNEHTKKQMETRKRLAKIVLVF
            220       230        240       250       260       270 

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB6 VVIFALCWFPLHLSRILKKTVYNEMDKNRCELLSFLLLMDYIGINLATMNSCINPIALYF
       :  : .:::: :.  . ..  :::.: .  ...  :     ..  :.  :::.::.:::.
CCDS51 VGCFIFCWFPNHILYMYRSFNYNEIDPSLGHMIVTL-----VARVLSFGNSCVNPFALYL
             280       290       300            310       320      

             380         390       400       410       420         
pF1KB6 VSKKFKNCFQSCLCCC--CYQSKSLMTSVPMNGTSIQWKNHDQNNHNTDRSSHKDSMN  
       .:..:.  :.: :::    :: ..  ::  .......  .  .: .:             
CCDS51 LSESFRRHFNSQLCCGRKSYQERG--TSYLLSSSAVRMTSLKSNAKNMVTNSVLLNGHSM
        330       340       350         360       370       380    

CCDS51 KQEMAL
          390

>>CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX                 (399 aa)
 initn: 422 init1: 206 opt: 539  Z-score: 494.2  bits: 100.4 E(32554): 3.3e-21
Smith-Waterman score: 539; 31.6% identity (65.2% similar) in 316 aa overlap (88-387:48-348)

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       :.. :: .:.:::.:::. ..  .:... . ::  :      :: . ::.. :.. .:::
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       ..:..:  ::.:::.::..  . :  .  : : ..   .::.:.:.:.::::   .  :.
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CCDS14 DPNKNMTFESCTSYPVSK--KLLQEIHSLLCFLVFYIIPLSIISVYYSLIARTLYK---S
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       .: :   :.      ...:...:.::. ::..:::::.: ::  . .. :  . .: .  
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         . :.. .  ..  ::  :::.::.:::..::.:.. :.. : ::              
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CCDS57 MRSISNSLLANLAFWDFLIIFFCLPLVIFHELTKKWLLE--DFS---CKIVPYIEVASLG
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CCDS57 VTTFTLCALCIDRFRAATNVQMYYEMIENCSSTTAKLAVIWVGALLLALPEVVLRQLSKE
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CCDS57 DLGFSGRAPAER-CIIKISPDLPDTIYVLALTYDSARLWWYFGCYFCLPTLFT-ITCSLV
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CCDS57 TARKIRKAEKACTRGNKRQIQLESQMNCTVVALTILYGFCIIPENICNIVTAYMATGVSQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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