seq1 = pF1KB6691.tfa, 1284 bp seq2 = pF1KB6691/gi568815597r_245649566.tfa (gi568815597r:245649566_246607217), 957652 bp >pF1KB6691 1284 >gi568815597r:245649566_246607217 (Chr1) (complement) 1-157 (100001-100157) 99% -> 158-228 (252110-252187) 88% -> 229-336 (271744-271851) 100% -> 337-394 (276681-276738) 100% -> 395-531 (279881-280017) 100% -> 532-599 (677281-677348) 100% -> 600-702 (679185-679287) 100% -> 703-813 (691578-691688) 100% -> 814-901 (743332-743419) 100% -> 902-1076 (748548-748722) 100% -> 1077-1193 (843069-843181) 96% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGAGCCGCTGAAGGTGGAAAAGTTCGCAACCGCCAACAGGGGAAACGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| 100001 ATGGAGCCGCTGAAGGTGGAAAAGTTCGCAACCGCCAAGAGGGGAAACGG 50 . : . : . : . : . : 51 GCTGCGCGCCGTGACCCCGCTGCGCCCCGGAGAGCTACTCTTCCGCTCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GCTGCGCGCCGTGACCCCGCTGCGCCCCGGAGAGCTACTCTTCCGCTCGG 100 . : . : . : . : . : 101 ATCCCTTGGCGTACACGGTGTGCAAGGGGAGTCGTGGCGTCGTCTGCGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 ATCCCTTGGCGTACACGGTGTGCAAGGGGAGTCGTGGCGTCGTCTGCGAC 150 . : . : . : . : . : 151 CGCTGCC TT CTCGGGAAGGAAAAGCTGATGCGAT |||||||>>>...>>>----||---| | ||||||||||||||||||||| 100151 CGCTGCCTTC...AATTTTTTTCCCCACAGGAAGGAAAAGCTGATGCGAT 200 . : . : . : . : . : 185 GCTCTCAGTGCCGCGTCGCCAAATACTGTAGTGCTAAGTGTCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 252144 GCTCTCAGTGCCGCGTCGCCAAATACTGTAGTGCTAAGTGTCAGGTA... 250 . : . : . : . : . : 229 AAAAAAGCTTGGCCAGACCACAAGCGGGAATGCAAATGCCTTAAAAG >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 271741 TAGAAAAAAGCTTGGCCAGACCACAAGCGGGAATGCAAATGCCTTAAAAG 300 . : . : . : . : . : 276 CTGCAAACCCAGATATCCTCCAGACTCCGTTCGACTTCTTGGCAGAGTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 271791 CTGCAAACCCAGATATCCTCCAGACTCCGTTCGACTTCTTGGCAGAGTTG 350 . : . : . : . : . : 326 TCTTCAAACTT ATGGATGGAGCACCTTCAGAATCAGAGAAG |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 271841 TCTTCAAACTTGTG...CAGATGGATGGAGCACCTTCAGAATCAGAGAAG 400 . : . : . : . : . : 367 CTTTACTCATTTTATGATCTGGAGTCAA ATATTAACAAACT ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 276711 CTTTACTCATTTTATGATCTGGAGTCAAGTA...AAGATATTAACAAACT 450 . : . : . : . : . : 408 GACTGAAGATAAGAAAGAGGGCCTCAGGCAACTCGTAATGACATTTCAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 279894 GACTGAAGATAAGAAAGAGGGCCTCAGGCAACTCGTAATGACATTTCAAC 500 . : . : . : . : . : 458 ATTTCATGAGAGAAGAAATACAGGATGCCTCTCAGCTGCCACCTGCCTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 279944 ATTTCATGAGAGAAGAAATACAGGATGCCTCTCAGCTGCCACCTGCCTTT 550 . : . : . : . : . : 508 GACCTTTTTGAAGCCTTTGCAAAA GTGATCTGCAACTCTTT ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 279994 GACCTTTTTGAAGCCTTTGCAAAAGTA...CAGGTGATCTGCAACTCTTT 600 . : . : . : . : . : 549 CACCATCTGTAATGCGGAGATGCAGGAAGTTGGTGTTGGCCTATATCCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 677298 CACCATCTGTAATGCGGAGATGCAGGAAGTTGGTGTTGGCCTATATCCCA 650 . : . : . : . : . : 599 G TATCTCTTTGCTCAATCACAGCTGTGACCCCAACTGTTCG |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 677348 GGTA...CAGTATCTCTTTGCTCAATCACAGCTGTGACCCCAACTGTTCG 700 . : . : . : . : . : 640 ATTGTGTTCAATGGGCCCCACCTCTTACTGCGAGCAGTCCGAGACATCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 679225 ATTGTGTTCAATGGGCCCCACCTCTTACTGCGAGCAGTCCGAGACATCGA 750 . : . : . : . : . : 690 GGTGGGAGAGGAG CTCACCATCTGCTACCTGGATATGCTGA |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 679275 GGTGGGAGAGGAGGTA...CAGCTCACCATCTGCTACCTGGATATGCTGA 800 . : . : . : . : . : 731 TGACCAGTGAGGAGCGCCGGAAGCAGCTGAGGGACCAGTACTGCTTTGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 691606 TGACCAGTGAGGAGCGCCGGAAGCAGCTGAGGGACCAGTACTGCTTTGAA 850 . : . : . : . : . : 781 TGTGACTGTTTCCGTTGCCAAACCCAGGACAAG GATGCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 691656 TGTGACTGTTTCCGTTGCCAAACCCAGGACAAGGTA...CAGGATGCTGA 900 . : . : . : . : . : 822 TATGCTAACTGGTGATGAGCAAGTATGGAAGGAAGTTCAAGAATCCCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 743340 TATGCTAACTGGTGATGAGCAAGTATGGAAGGAAGTTCAAGAATCCCTGA 950 . : . : . : . : . : 872 AAAAAATTGAAGAACTGAAGGCACACTGGA AGTGGGAGCAG ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 743390 AAAAAATTGAAGAACTGAAGGCACACTGGAGTA...CAGAGTGGGAGCAG 1000 . : . : . : . : . : 913 GTTCTGGCCATGTGCCAGGCAATCATAAGCAGCAATTCTGAACGGCTTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 748559 GTTCTGGCCATGTGCCAGGCAATCATAAGCAGCAATTCTGAACGGCTTCC 1050 . : . : . : . : . : 963 CGATATCAACATCTACCAGCTGAAGGTGCTCGACTGCGCCATGGATGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 748609 CGATATCAACATCTACCAGCTGAAGGTGCTCGACTGCGCCATGGATGCCT 1100 . : . : . : . : . : 1013 GCATCAACCTCGGCCTGTTGGAGGAAGCCTTGTTCTATGGTACTCGGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 748659 GCATCAACCTCGGCCTGTTGGAGGAAGCCTTGTTCTATGGTACTCGGACC 1150 . : . : . : . : . : 1063 ATGGAGCCATACAG GATTTTTTTCCCAGGAAGCCATCCCGT ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 748709 ATGGAGCCATACAGGCA...CAGGATTTTTTTCCCAGGAAGCCATCCCGT 1200 . : . : . : . : . : 1104 CAGAGGGGTTCAAGTGATGAAAGTTGGCAAACTGCAGCTACATCAAGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 843096 CAGAGGGGTTCAAGTGATGAAAGTTGGCAAACTGCAGCTACATCAAGGCA 1250 . : . : . : . : 1154 TGTTTCCCCAAGCAATGAAGAATCTGAGACTGGCTTTTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||-|---|| 843146 TGTTTCCCCAAGCAATGAAGAATCTGAGACTGG T GA