Result of FASTA (ccds) for pF1KB6648
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6648, 445 aa
  1>>>pF1KB6648 445 - 445 aa - 445 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.5589+/-0.00137; mu= -18.2767+/- 0.080
 mean_var=374.6500+/-82.066, 0's: 0 Z-trim(107.8): 623  B-trim: 240 in 1/52
 Lambda= 0.066262
 statistics sampled from 9084 (9821) to 9084 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.302), width:  16
 Scan time:  2.880

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1500.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1            ( 445) 2883 290.2 2.9e-78
CCDS73024.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1           ( 388) 2424 246.3 4.1e-65
CCDS55682.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1           ( 384) 2420 245.9 5.3e-65
CCDS31979.1 NEK5 gene_id:341676|Hs108|chr13        ( 708)  686 80.3   7e-15
CCDS2863.1 NEK4 gene_id:6787|Hs108|chr3            ( 841)  648 76.7   1e-13
CCDS46915.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3         ( 470)  624 74.2   3e-13
CCDS82836.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3         ( 482)  624 74.3 3.1e-13
CCDS54639.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3         ( 599)  624 74.3 3.7e-13
CCDS3069.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3          ( 645)  624 74.3   4e-13
CCDS6854.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9           ( 313)  579 69.8 4.3e-12
CCDS55338.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9          ( 331)  579 69.9 4.5e-12
CCDS55339.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9          ( 338)  579 69.9 4.6e-12
CCDS48015.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9          ( 347)  579 69.9 4.7e-12
CCDS73576.1 NEK3 gene_id:4752|Hs108|chr13          ( 506)  576 69.7 7.8e-12
CCDS1394.1 NEK7 gene_id:140609|Hs108|chr1          ( 302)  566 68.6 9.8e-12
CCDS56348.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4           (1189)  549 67.3 9.5e-11
CCDS56349.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4           (1214)  549 67.3 9.6e-11
CCDS56350.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4           (1242)  549 67.3 9.8e-11
CCDS47162.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4           (1258)  549 67.3 9.9e-11


>>CCDS1500.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1                 (445 aa)
 initn: 2883 init1: 2883 opt: 2883  Z-score: 1518.7  bits: 290.2 E(32554): 2.9e-78
Smith-Waterman score: 2883; 100.0% identity (100.0% similar) in 445 aa overlap (1-445:1-445)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 ELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQNVKLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 TLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQNVKLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 YYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 SDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIADLVADEQRRNLERRGRQLGEPEKSQDSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIADLVADEQRRNLERRGRQLGEPEKSQDSS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 PVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQKEQELCVRERLAEDKLARAENLLKNYSLLKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 PVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQKEQELCVRERLAEDKLARAENLLKNYSLLKE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 RKFLSLASNPELLNLPSSVIKKKVHFSGESKENIMRSENSESQLTSKSKCKDLKKRLHAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 RKFLSLASNPELLNLPSSVIKKKVHFSGESKENIMRSENSESQLTSKSKCKDLKKRLHAA
              370       380       390       400       410       420

              430       440     
pF1KB6 QLRAQALSDIEKNYQLKSRQILGMR
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS15 QLRAQALSDIEKNYQLKSRQILGMR
              430       440     

>>CCDS73024.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1                (388 aa)
 initn: 2424 init1: 2424 opt: 2424  Z-score: 1282.4  bits: 246.3 E(32554): 4.1e-65
Smith-Waterman score: 2424; 100.0% identity (100.0% similar) in 371 aa overlap (1-371:1-371)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQNVKLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQNVKLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 YYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 SDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIADLVADEQRRNLERRGRQLGEPEKSQDSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIADLVADEQRRNLERRGRQLGEPEKSQDSS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 PVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQKEQELCVRERLAEDKLARAENLLKNYSLLKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQKEQELCVRERLAEDKLARAENLLKNYSLLKE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 RKFLSLASNPELLNLPSSVIKKKVHFSGESKENIMRSENSESQLTSKSKCKDLKKRLHAA
       :::::::::::                                                 
CCDS73 RKFLSLASNPESHFVAQAGMQWCDHSSM                                
              370       380                                        

>>CCDS55682.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1                (384 aa)
 initn: 2418 init1: 2418 opt: 2420  Z-score: 1280.4  bits: 245.9 E(32554): 5.3e-65
Smith-Waterman score: 2420; 98.9% identity (99.5% similar) in 376 aa overlap (1-375:1-376)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQNVKLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQNVKLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 YYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 SDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIADLVADEQRRNLERRGRQLGEPEKSQDSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIADLVADEQRRNLERRGRQLGEPEKSQDSS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 PVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQKEQELCVRERLAEDKLARAENLLKNYSLLKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQKEQELCVRERLAEDKLARAENLLKNYSLLKE
              310       320       330       340       350       360

              370        380       390       400       410         
pF1KB6 RKFLSLASNPEL-LNLPSSVIKKKVHFSGESKENIMRSENSESQLTSKSKCKDLKKRLHA
       :::::::::: . .::                                            
CCDS55 RKFLSLASNPGMRINLVNRSWCYK                                    
              370       380                                        

>>CCDS31979.1 NEK5 gene_id:341676|Hs108|chr13             (708 aa)
 initn: 628 init1: 378 opt: 686  Z-score: 380.6  bits: 80.3 E(32554): 7e-15
Smith-Waterman score: 686; 37.9% identity (69.4% similar) in 317 aa overlap (6-314:2-307)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLR
            . :.:. .:: :..:.    . :::.:  : ::... .:   ::.   .:: ::.
CCDS31     MDKYDVIKAIGQGAFGKAYLAKGKSDSKHCVIKEINFEKMPIQEKEASKKEVILLE
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100        110         
pF1KB6 ELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYL-DEEFVLRVMTQ
       ..:::::: ... .  . :  :.::::::.:::: . :   ...:  : .:. .:  ..:
CCDS31 KMKHPNIVAFFNSF--QENGRLFIVMEYCDGGDLMKRI---NRQRGVLFSEDQILGWFVQ
         60        70          80        90          100       110 

     120       130       140       150        160       170        
pF1KB6 LTLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQNV-KLGDFGLARILNHDTSFAKTFVG
       ..:.::. : :.     .::::.:  :.::. .  : ::::::.::.::..  .:.: .:
CCDS31 ISLGLKHIHDRK-----ILHRDIKAQNIFLSKNGMVAKLGDFGIARVLNNSMELARTCIG
             120            130       140       150       160      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB6 TPYYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPY
       ::::.:::  .   ::.:.:::::::.:::::.:  :: . . ..:. :: ...:  :  
CCDS31 TPYYLSPEICQNKPYNNKTDIWSLGCVLYELCTLKHPFEGNNLQQLVLKICQAHFAPISP
        170       180       190       200       210       220      

      240       250       260       270       280         290      
pF1KB6 RYSDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIADLVADEQRRNL--ERRGRQL----GE
        .: ::. .:.......   :::.. ::. :.. .:.      ..  :. ...:    : 
CCDS31 GFSRELHSLISQLFQVSPRDRPSINSILKRPFLENLIPKYLTPEVIQEEFSHMLICRAGA
        230       240       250       260       270       280      

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB6 PEKSQDSSPVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQKEQELCVRERLAEDKLARAENLL
       :  :. .. :... :......:                                      
CCDS31 PA-SRHAGKVVQKCKIQKVRFQGKCPPRSRISVPIKRNAILHRNEWRPPAGAQKARSIKM
         290       300       310       320       330       340     

>>CCDS2863.1 NEK4 gene_id:6787|Hs108|chr3                 (841 aa)
 initn: 675 init1: 419 opt: 648  Z-score: 359.9  bits: 76.7 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 651; 31.9% identity (60.8% similar) in 436 aa overlap (1-433:1-417)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLR
       ::  :  :  : ..: ::::.   .... :::  : :.:.  . .  :..   .:..:: 
CCDS28 MPLAA--YCYLRVVGKGSYGEVTLVKHRRDGKQYVIKKLNLRNASSRERRAAEQEAQLLS
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQL
       .::::::: : .   .  .  ::::: .::::::   . .  .. : : :. :.. ..:.
CCDS28 QLKHPNIVTYKESW-EGGDGLLYIVMGFCEGGDLYRKLKE--QKGQLLPENQVVEWFVQI
       60        70         80        90         100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQNVKLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTP
       ..::.  :..    : .::::::  ::::   . .:.::.:.::.:..  ..:.:..:::
CCDS28 AMALQYLHEK----H-ILHRDLKTQNVFLTRTNIIKVGDLGIARVLENHCDMASTLIGTP
         120            130       140       150       160       170

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 YYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRY
       :::::: ..   :: :::.:.::: .::. .:   :.: ... :. .: :::.  .:  :
CCDS28 YYMSPELFSNKPYNYKSDVWALGCCVYEMATLKHAFNAKDMNSLVYRIIEGKLPPMPRDY
              180       190       200       210       220       230

              250       260       270          280       290       
pF1KB6 SDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIADLVA---DEQRRNLERRGRQLGEPEKSQ
       : :: :.:  ::. .  .::::. ::..: :   ..   .  . .  . . . :. ... 
CCDS28 SPELAELIRTMLSKRPEERPSVRSILRQPYIKRQISFFLEATKIKTSKNNIKNGDSQSKP
              240       250       260       270       280       290

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB6 DSSPVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQKEQELCVRERLAEDKLARAENLLKNYSL
        .. : .: . ..  .. .  . .. .  .  . .  :    :...:  :: .:::. . 
CCDS28 FATVVSGEAESNHEVIHPQPLSSEGSQTYIMGEGK--C----LSQEK-PRASGLLKSPAS
              300       310       320             330        340   

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB6 LKERKFLSLASNPELLNLPSSVIKKKVHFSGESKENIMRSENSESQLTSKSKCKDLKKRL
       :: .   .  ::   :   :::    .  .:  ....  .  .:.:    .  ..:    
CCDS28 LKAHTCKQDLSNTTELATISSVNIDILPAKG--RDSVSDGFVQENQPRYLDASNELGGIC
           350       360       370         380       390       400 

       420       430       440                                     
pF1KB6 HAAQLRAQALSDIEKNYQLKSRQILGMR                                
         .:.. . :.:  :.                                            
CCDS28 SISQVEEEMLQDNTKSSAQPENLIPMWSSDIVTGEKNEPVKPLQPLIKEQKPKDQSLALS
             410       420       430       440       450       460 

>>CCDS46915.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3              (470 aa)
 initn: 535 init1: 331 opt: 624  Z-score: 351.2  bits: 74.2 E(32554): 3e-13
Smith-Waterman score: 632; 32.2% identity (62.1% similar) in 422 aa overlap (5-415:26-422)

                                    10        20             30    
pF1KB6                      MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRC-----QKIRRKSDGKIL
                                :. : .   .:.::.:       .: .:  . :.:
CCDS46 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
               10        20        30        40        50        60

           40        50        60        70        80        90    
pF1KB6 VWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLRELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDL
         ::.. : ..  :  .   :..:: .: :: ::...  .... :  . :. ::::: ::
CCDS46 --KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDN--FCIITEYCEGRDL
                 70        80        90       100         110      

          100       110       120       130       140       150    
pF1KB6 ASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQLTLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQN
        . : .  .  . . :. ... . :: :..   :.:      .::::::  ::::  :.:
CCDS46 DDKIQEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERR-----ILHRDLKSKNVFL--KNN
        120       130       140       150            160           

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB6 V-KLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTPYYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALM
       . :.::::..:.:  . ..: :..:::.::::: .....:. :::::::.:.:::.: . 
CCDS46 LLKIGDFGVSRLLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMN
     170       180       190       200       210       220         

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB6 PPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRYSDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIAD
         :.. .   .. :: ::    .: ::  ::: :.  ::: .   :::. :::. : .  
CCDS46 HAFAGSNFLSIVLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYL--
     230       240       250       260       270       280         

           280       290           300       310       320         
pF1KB6 LVADEQRRNLERRGRQLGEPEKSQD----SSPVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQ
          ::: .::  :  ..   .:. :    .. ... .. :.:.::   ::: .. ...  
CCDS46 ---DEQLQNLMCRYSEMTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQ-KRIHLQTL-RAL-SEVQKMTP
          290       300       310       320        330         340 

     330       340       350       360       370       380         
pF1KB6 KEQELCVRERLAEDKLARAENLLKNYSLLKERKFLSLASNPELLNLPSSVIKKKVHFSG-
       .:. . .:.  : :. ::  . . . .  .. : ..   . .. .:  .:...:.:..: 
CCDS46 RER-MRLRKLQAADEKARKLKKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGM
              350       360       370       380       390       400

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB6 ESKENIMRSENSESQLTSKSKCKDLKKRLHAAQLRAQALSDIEKNYQLKSRQILGMR   
       : ::     :. :..:. . . .: ..                                 
CCDS46 EEKE-----EQPEGRLSCSPQDEDEERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESI
                   410       420       430       440       450     

>>CCDS82836.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3              (482 aa)
 initn: 535 init1: 331 opt: 624  Z-score: 351.1  bits: 74.3 E(32554): 3.1e-13
Smith-Waterman score: 632; 32.2% identity (62.1% similar) in 422 aa overlap (5-415:26-422)

                                    10        20             30    
pF1KB6                      MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRC-----QKIRRKSDGKIL
                                :. : .   .:.::.:       .: .:  . :.:
CCDS82 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
               10        20        30        40        50        60

           40        50        60        70        80        90    
pF1KB6 VWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLRELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDL
         ::.. : ..  :  .   :..:: .: :: ::...  .... :  . :. ::::: ::
CCDS82 --KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDN--FCIITEYCEGRDL
                 70        80        90       100         110      

          100       110       120       130       140       150    
pF1KB6 ASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQLTLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQN
        . : .  .  . . :. ... . :: :..   :.:      .::::::  ::::  :.:
CCDS82 DDKIQEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERR-----ILHRDLKSKNVFL--KNN
        120       130       140       150            160           

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB6 V-KLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTPYYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALM
       . :.::::..:.:  . ..: :..:::.::::: .....:. :::::::.:.:::.: . 
CCDS82 LLKIGDFGVSRLLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMN
     170       180       190       200       210       220         

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB6 PPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRYSDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIAD
         :.. .   .. :: ::    .: ::  ::: :.  ::: .   :::. :::. : .  
CCDS82 HAFAGSNFLSIVLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYL--
     230       240       250       260       270       280         

           280       290           300       310       320         
pF1KB6 LVADEQRRNLERRGRQLGEPEKSQD----SSPVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQ
          ::: .::  :  ..   .:. :    .. ... .. :.:.::   ::: .. ...  
CCDS82 ---DEQLQNLMCRYSEMTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQ-KRIHLQTL-RAL-SEVQKMTP
          290       300       310       320        330         340 

     330       340       350       360       370       380         
pF1KB6 KEQELCVRERLAEDKLARAENLLKNYSLLKERKFLSLASNPELLNLPSSVIKKKVHFSG-
       .:. . .:.  : :. ::  . . . .  .. : ..   . .. .:  .:...:.:..: 
CCDS82 RER-MRLRKLQAADEKARKLKKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGM
              350       360       370       380       390       400

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB6 ESKENIMRSENSESQLTSKSKCKDLKKRLHAAQLRAQALSDIEKNYQLKSRQILGMR   
       : ::     :. :..:. . . .: ..                                 
CCDS82 EEKE-----EQPEGRLSCSPQDEDEERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESI
                   410       420       430       440       450     

>>CCDS54639.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3              (599 aa)
 initn: 535 init1: 331 opt: 624  Z-score: 349.7  bits: 74.3 E(32554): 3.7e-13
Smith-Waterman score: 632; 32.2% identity (62.1% similar) in 422 aa overlap (5-415:26-422)

                                    10        20             30    
pF1KB6                      MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRC-----QKIRRKSDGKIL
                                :. : .   .:.::.:       .: .:  . :.:
CCDS54 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
               10        20        30        40        50        60

           40        50        60        70        80        90    
pF1KB6 VWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLRELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDL
         ::.. : ..  :  .   :..:: .: :: ::...  .... :  . :. ::::: ::
CCDS54 --KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDN--FCIITEYCEGRDL
                 70        80        90       100         110      

          100       110       120       130       140       150    
pF1KB6 ASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQLTLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQN
        . : .  .  . . :. ... . :: :..   :.:      .::::::  ::::  :.:
CCDS54 DDKIQEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERR-----ILHRDLKSKNVFL--KNN
        120       130       140       150            160           

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB6 V-KLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTPYYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALM
       . :.::::..:.:  . ..: :..:::.::::: .....:. :::::::.:.:::.: . 
CCDS54 LLKIGDFGVSRLLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMN
     170       180       190       200       210       220         

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB6 PPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRYSDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIAD
         :.. .   .. :: ::    .: ::  ::: :.  ::: .   :::. :::. : .  
CCDS54 HAFAGSNFLSIVLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYL--
     230       240       250       260       270       280         

           280       290           300       310       320         
pF1KB6 LVADEQRRNLERRGRQLGEPEKSQD----SSPVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQ
          ::: .::  :  ..   .:. :    .. ... .. :.:.::   ::: .. ...  
CCDS54 ---DEQLQNLMCRYSEMTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQ-KRIHLQTL-RAL-SEVQKMTP
          290       300       310       320        330         340 

     330       340       350       360       370       380         
pF1KB6 KEQELCVRERLAEDKLARAENLLKNYSLLKERKFLSLASNPELLNLPSSVIKKKVHFSG-
       .:. . .:.  : :. ::  . . . .  .. : ..   . .. .:  .:...:.:..: 
CCDS54 RER-MRLRKLQAADEKARKLKKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGM
              350       360       370       380       390       400

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB6 ESKENIMRSENSESQLTSKSKCKDLKKRLHAAQLRAQALSDIEKNYQLKSRQILGMR   
       : ::     :. :..:. . . .: ..                                 
CCDS54 EEKE-----EQPEGRLSCSPQDEDEERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESI
                   410       420       430       440       450     

>>CCDS3069.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3               (645 aa)
 initn: 535 init1: 331 opt: 624  Z-score: 349.2  bits: 74.3 E(32554): 4e-13
Smith-Waterman score: 632; 32.2% identity (62.1% similar) in 422 aa overlap (5-415:26-422)

                                    10        20             30    
pF1KB6                      MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRC-----QKIRRKSDGKIL
                                :. : .   .:.::.:       .: .:  . :.:
CCDS30 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
               10        20        30        40        50        60

           40        50        60        70        80        90    
pF1KB6 VWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLRELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDL
         ::.. : ..  :  .   :..:: .: :: ::...  .... :  . :. ::::: ::
CCDS30 --KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDN--FCIITEYCEGRDL
                 70        80        90       100         110      

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pF1KB6 ASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQLTLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQN
        . : .  .  . . :. ... . :: :..   :.:      .::::::  ::::  :.:
CCDS30 DDKIQEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERR-----ILHRDLKSKNVFL--KNN
        120       130       140       150            160           

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB6 V-KLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTPYYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALM
       . :.::::..:.:  . ..: :..:::.::::: .....:. :::::::.:.:::.: . 
CCDS30 LLKIGDFGVSRLLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMN
     170       180       190       200       210       220         

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB6 PPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRYSDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIAD
         :.. .   .. :: ::    .: ::  ::: :.  ::: .   :::. :::. : .  
CCDS30 HAFAGSNFLSIVLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYL--
     230       240       250       260       270       280         

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pF1KB6 LVADEQRRNLERRGRQLGEPEKSQD----SSPVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQ
          ::: .::  :  ..   .:. :    .. ... .. :.:.::   ::: .. ...  
CCDS30 ---DEQLQNLMCRYSEMTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQ-KRIHLQTL-RAL-SEVQKMTP
          290       300       310       320        330         340 

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pF1KB6 KEQELCVRERLAEDKLARAENLLKNYSLLKERKFLSLASNPELLNLPSSVIKKKVHFSG-
       .:. . .:.  : :. ::  . . . .  .. : ..   . .. .:  .:...:.:..: 
CCDS30 RER-MRLRKLQAADEKARKLKKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGM
              350       360       370       380       390       400

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB6 ESKENIMRSENSESQLTSKSKCKDLKKRLHAAQLRAQALSDIEKNYQLKSRQILGMR   
       : ::     :. :..:. . . .: ..                                 
CCDS30 EEKE-----EQPEGRLSCSPQDEDEERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESI
                   410       420       430       440       450     

>>CCDS6854.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9                (313 aa)
 initn: 493 init1: 348 opt: 579  Z-score: 330.6  bits: 69.8 E(32554): 4.3e-12
Smith-Waterman score: 579; 37.7% identity (70.0% similar) in 260 aa overlap (7-262:44-296)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MPSRAEDYEVLYTIGTGSYGRCQKIRRKSDGKILVW
                                     :...   :: :....  :     : : .. 
CCDS68 SNNLCHTLGPVHPPDPQRHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVAL
            20        30        40        50        60        70   

         40         50        60        70        80        90     
pF1KB6 KELDYGSMTEAE-KQMLVSEVNLLRELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLA
       :...   : .:. .:  :.:..::..:.::::..: : .:.  .. : ::.:  ..:::.
CCDS68 KKVQIFEMMDAKARQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIE--DNELNIVLELADAGDLS
            80        90       100       110         120       130 

         100       110       120       130       140       150     
pF1KB6 SVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQLTLALKECHRRSDGGHTVLHRDLKPANVFLDGKQNV
       ..:    :... . :. : . ..::  :... : :      :.:::.::::::. .   :
CCDS68 QMIKYFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSAVEHMHSRR-----VMHRDIKPANVFITATGVV
             140       150       160            170       180      

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB6 KLGDFGLARILNHDTSFAKTFVGTPYYMSPEQMNRMSYNEKSDIWSLGCLLYELCALMPP
       ::::.::.:... .:. :...::::::::::.... .:: :::::::::::::. ::. :
CCDS68 KLGDLGLGRFFSSETTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSP
        190       200       210       220       230       240      

         220         230        240       250       260       270  
pF1KB6 FTAFSQK--ELAGKIREGKFRRIP-YRYSDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLIA
       : . ...   :  ::..  .  .:  .::..: :...  .    ..::..          
CCDS68 FYGDKMNLFSLCQKIEQCDYPPLPGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQM
        250       260       270       280       290       300      

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB6 DLVADEQRRNLERRGRQLGEPEKSQDSSPVLSELKLKEIQLQERERALKAREERLEQKEQ
                                                                   
CCDS68 HIWMSST                                                     
        310                                                        




445 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Sat Nov  5 11:15:24 2016 done: Sat Nov  5 11:15:25 2016
 Total Scan time:  2.880 Total Display time:  0.060

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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