Result of FASTA (omim) for pF1KB5892
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5892, 524 aa
  1>>>pF1KB5892 524 - 524 aa - 524 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3366+/-0.000453; mu= 13.6956+/- 0.028
 mean_var=110.0369+/-23.316, 0's: 0 Z-trim(113.0): 415  B-trim: 965 in 1/49
 Lambda= 0.122266
 statistics sampled from 21662 (22159) to 21662 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.26), width:  16
 Scan time:  8.990

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_011513028 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 524) 3406 612.2 1.2e-174
NP_060684 (OMIM: 608195) leucine-rich repeat-conta ( 524) 3406 612.2 1.2e-174
XP_011513029 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 465) 2786 502.8  9e-142
XP_016866486 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 331) 2129 386.8 5.3e-107
NP_056171 (OMIM: 607733) protein scribble homolog  (1630) 2107 383.5 2.7e-105
NP_874365 (OMIM: 607733) protein scribble homolog  (1655) 2107 383.5 2.7e-105
XP_016857384 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1255) 1269 235.6 6.9e-61
XP_016857383 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1438) 1269 235.6 7.7e-61
XP_016857382 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1472) 1269 235.6 7.8e-61
XP_016857381 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1490) 1269 235.6 7.9e-61
NP_001317564 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-co (1495) 1269 235.6 7.9e-61
XP_016857379 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1528) 1269 235.6 8.1e-61
XP_016857378 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1537) 1269 235.6 8.1e-61
NP_065845 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-conta (1537) 1269 235.6 8.1e-61
XP_016857377 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1541) 1269 235.6 8.1e-61
XP_016857376 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1547) 1269 235.6 8.1e-61
XP_016857375 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1594) 1269 235.6 8.3e-61
XP_016857374 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1594) 1269 235.6 8.3e-61
XP_016865126 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1298) 1258 233.6 2.7e-60
NP_001240630 (OMIM: 606944) erbin isoform 9 [Homo  (1367) 1258 233.6 2.8e-60
XP_016865125 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1415) 1258 233.7 2.9e-60
XP_005248612 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1456) 1258 233.7   3e-60
XP_006714723 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1246) 1255 233.1 3.8e-60
NP_001006600 (OMIM: 606944) erbin isoform 7 [Homo  (1302) 1255 233.1 3.9e-60
NP_001240627 (OMIM: 606944) erbin isoform 4 [Homo  (1346) 1255 233.1   4e-60
NP_061165 (OMIM: 606944) erbin isoform 2 [Homo sap (1371) 1255 233.1 4.1e-60
NP_001240626 (OMIM: 606944) erbin isoform 1 [Homo  (1412) 1255 233.1 4.2e-60
NP_001240628 (OMIM: 606944) erbin isoform 8 [Homo  (1419) 1255 233.1 4.2e-60
XP_005248611 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1460) 1255 233.1 4.3e-60
XP_016865124 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1460) 1255 233.1 4.3e-60
NP_001255968 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 536)  615 119.9 1.9e-26
XP_016872191 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582)  521 103.4   2e-21
XP_016872192 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582)  521 103.4   2e-21
NP_001311266 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582)  521 103.4   2e-21
XP_016872193 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582)  521 103.4   2e-21
NP_001311265 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582)  521 103.4   2e-21
NP_031399 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repea ( 582)  521 103.4   2e-21
XP_011542154 (OMIM: 605352) PREDICTED: malignant f (1003)  478 96.0 5.8e-19
NP_004216 (OMIM: 605352) malignant fibrous histioc (1052)  478 96.0 6.1e-19
NP_001243193 (OMIM: 600362) protein flightless-1 h (1258)  438 89.0 9.2e-17
XP_005256615 (OMIM: 600362) PREDICTED: protein fli (1268)  438 89.0 9.3e-17
NP_002009 (OMIM: 600362) protein flightless-1 homo (1269)  438 89.0 9.3e-17
XP_005256613 (OMIM: 600362) PREDICTED: protein fli (1295)  438 89.0 9.5e-17
XP_005256612 (OMIM: 600362) PREDICTED: protein fli (1296)  438 89.0 9.5e-17
NP_001243194 (OMIM: 600362) protein flightless-1 h (1214)  429 87.4 2.7e-16
XP_011539446 (OMIM: 612888) PREDICTED: volume-regu ( 803)  406 83.2 3.3e-15
XP_016856372 (OMIM: 612888) PREDICTED: volume-regu ( 803)  406 83.2 3.3e-15
XP_005270760 (OMIM: 612888) PREDICTED: volume-regu ( 803)  406 83.2 3.3e-15
XP_005270758 (OMIM: 612888) PREDICTED: volume-regu ( 803)  406 83.2 3.3e-15
XP_011539445 (OMIM: 612888) PREDICTED: volume-regu ( 803)  406 83.2 3.3e-15


>>XP_011513028 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-rich re  (524 aa)
 initn: 3406 init1: 3406 opt: 3406  Z-score: 3256.6  bits: 612.2 E(85289): 1.2e-174
Smith-Waterman score: 3406; 99.8% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRAT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520    
pF1KB5 PHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
              490       500       510       520    

>>NP_060684 (OMIM: 608195) leucine-rich repeat-containin  (524 aa)
 initn: 3406 init1: 3406 opt: 3406  Z-score: 3256.6  bits: 612.2 E(85289): 1.2e-174
Smith-Waterman score: 3406; 99.8% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRAT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520    
pF1KB5 PHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
              490       500       510       520    

>>XP_011513029 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-rich re  (465 aa)
 initn: 2784 init1: 2784 opt: 2786  Z-score: 2666.3  bits: 502.8 E(85289): 9e-142
Smith-Waterman score: 2786; 97.1% identity (98.7% similar) in 447 aa overlap (78-524:24-465)

        50        60        70        80        90       100       
pF1KB5 LRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKAL
                                     ..::..: .     .:::::::::::::::
XP_011        MSHLYSTSGHKVFMGGEEKGELHLGNFYELCQ-----QEIPEIPESISFCKAL
                      10        20        30             40        

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB5 QVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLP
       50        60        70        80        90       100        

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB5 DSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDV
       :::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDV
      110       120       130       140       150       160        

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB5 SENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGE
      170       180       190       200       210       220        

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB5 CESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRL
      230       240       250       260       270       280        

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB5 TRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTG
      290       300       310       320       330       340        

       410       420       430       440       450       460       
pF1KB5 EKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDE
      350       360       370       380       390       400        

       470       480       490       500       510       520    
pF1KB5 EDNETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDNETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
      410       420       430       440       450       460     

>>XP_016866486 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-rich re  (331 aa)
 initn: 2129 init1: 2129 opt: 2129  Z-score: 2042.0  bits: 386.8 E(85289): 5.3e-107
Smith-Waterman score: 2129; 99.7% identity (100.0% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::                              
XP_016 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEQ                             
              310       320       330                              

>>NP_056171 (OMIM: 607733) protein scribble homolog isof  (1630 aa)
 initn: 2902 init1: 1992 opt: 2107  Z-score: 2011.4  bits: 383.5 E(85289): 2.7e-105
Smith-Waterman score: 2144; 64.5% identity (85.3% similar) in 504 aa overlap (1-499:1-494)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
       :..:::::::::::::.:::::::  ::::::::.:::::::::::::::::. ::.:..
NP_056 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
       :::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::.:::::..::::::::.::
NP_056 LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
       :..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..::::::::  :: ::. : .::.::
NP_056 PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
       ::.:..  ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::::::::.:: :..
NP_056 LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
       ::. ::::..:::::. .:::::.::.::::::::::: .. ::.:.::.:.::.:::: 
NP_056 GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
       :..::.:.::: ::.:::.:::.: .:: ::::: .:.:. .:::::. .: :....:::
NP_056 LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
       ::::::::::  ::..:: :.::::::..::.::.: :::. :  ::::.::: :::: :
NP_056 HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460           470      
pF1KB5 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVE----DEKDEEDN-ETRTL
         :   :.  . :.:        .:.:..   .:::.:.:.:    ::  ::   : : :
NP_056 --PPSLEDAGQQGSL--------SETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGL
                430               440       450       460       470

         480       490       500       510       520               
pF1KB5 LRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV           
        :::::::.::: ::...:. :..                                    
NP_056 QRRATPHPSELKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSAST
              480       490       500       510       520       530

>>NP_874365 (OMIM: 607733) protein scribble homolog isof  (1655 aa)
 initn: 2902 init1: 1992 opt: 2107  Z-score: 2011.3  bits: 383.5 E(85289): 2.7e-105
Smith-Waterman score: 2144; 64.5% identity (85.3% similar) in 504 aa overlap (1-499:1-494)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
       :..:::::::::::::.:::::::  ::::::::.:::::::::::::::::. ::.:..
NP_874 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
       :::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::.:::::..::::::::.::
NP_874 LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
       :..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..::::::::  :: ::. : .::.::
NP_874 PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
       ::.:..  ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::::::::.:: :..
NP_874 LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
       ::. ::::..:::::. .:::::.::.::::::::::: .. ::.:.::.:.::.:::: 
NP_874 GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
       :..::.:.::: ::.:::.:::.: .:: ::::: .:.:. .:::::. .: :....:::
NP_874 LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
       ::::::::::  ::..:: :.::::::..::.::.: :::. :  ::::.::: :::: :
NP_874 HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460           470      
pF1KB5 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVE----DEKDEEDN-ETRTL
         :   :.  . :.:        .:.:..   .:::.:.:.:    ::  ::   : : :
NP_874 --PPSLEDAGQQGSL--------SETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGL
                430               440       450       460       470

         480       490       500       510       520               
pF1KB5 LRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV           
        :::::::.::: ::...:. :..                                    
NP_874 QRRATPHPSELKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSAST
              480       490       500       510       520       530

>>XP_016857384 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-rich re  (1255 aa)
 initn: 1122 init1: 1122 opt: 1269  Z-score: 1214.1  bits: 235.6 E(85289): 6.9e-61
Smith-Waterman score: 1269; 44.3% identity (73.0% similar) in 467 aa overlap (9-470:72-529)

                                     10            20        30    
pF1KB5                       MFHCIPLWRCNRHVESI----DKRHCSLVYVPEEIYRY
                                     :: :  : :    :  ::::  ::.:.. .
XP_016 RAALRKRPEEELQCLEMTTKRKIIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNF
              50        60        70        80        90       100 

           40        50        60        70        80        90    
pF1KB5 ARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEI
        :.:::: :::::..:::.:.:.   ::::.. ::... ::  ::....: :::.:.: .
XP_016 ERTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLSNLPTTIASLVNLKELDISKNGV
             110       120       130       140       150       160 

          100       110       120       130       140       150    
pF1KB5 PEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLA
        :.::.:. :: : . . : ::...::..: .: ::: : .::  :. :: :.: : .: 
XP_016 QEFPENIKCCKCLTIIEASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLR
             170       180       190       200       210       220 

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pF1KB5 SLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQ
        :::::: :  :: :. .: .::.:::::::. .::: .  . .:..::.:.: :. :: 
XP_016 ILELRENHLKTLPKSMHKLAQLERLDLGNNEFGELPEVLDQIQNLRELWMDNNALQVLPG
             230       240       250       260       270       280 

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB5 EIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVD
        ::.:: :. ::.:.::.: .  .:::  .: ::..:.:.:. .::.:: ::::. ::::
XP_016 SIGKLKMLVYLDMSKNRIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKVD
             290       300       310       320       330       340 

          280       290       300       310       320       330    
pF1KB5 QNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGC
       .:.::.::...:.   : :.  . :.: .::..:: :..: .: .:.: :  ::.:::.:
XP_016 DNQLTMLPNTIGNLSLLEEFDCSCNELESLPSTIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREIGSC
             350       360       370       380       390       400 

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pF1KB5 CSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALK-LKALWLSDNQSQ
        ..::. .:.:.:  .: :..:  .:.::... ::: .::.:.: :: : :::::::::.
XP_016 KNVTVMSLRSNKLEFLPEEIGQMQKLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAALWLSDNQSK
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pF1KB5 PLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVN
        :. .::..   : ...::  ..::   .:  .:..      ..  .. .   :.:.  .
XP_016 ALIPLQTEAHPETKQRVLTNYMFPQ---QPRGDEDF------QSDSDSFNPTLWEEQRQQ
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pF1KB5 RVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEV
       :...    ::.:....:                                           
XP_016 RMTVAFEFEDKKEDDENAGKVKDLSCQAPWERGQRGITLQPARLSGDCCTPWARCDQQIQ
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>>XP_016857383 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-rich re  (1438 aa)
 initn: 1122 init1: 1122 opt: 1269  Z-score: 1213.3  bits: 235.6 E(85289): 7.7e-61
Smith-Waterman score: 1269; 44.3% identity (73.0% similar) in 467 aa overlap (9-470:20-477)

                          10            20        30        40     
pF1KB5            MFHCIPLWRCNRHVESI----DKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDA
                          :: :  : :    :  ::::  ::.:.. . :.:::: :::
XP_016 MQCLEMTTKRKIIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNFERTLEELYLDA
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pF1KB5 NQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCK
       ::..:::.:.:.   ::::.. ::... ::  ::....: :::.:.: . :.::.:. ::
XP_016 NQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLSNLPTTIASLVNLKELDISKNGVQEFPENIKCCK
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pF1KB5 ALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTY
        : . . : ::...::..: .: ::: : .::  :. :: :.: : .:  :::::: :  
XP_016 CLTIIEASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLRILELRENHLKT
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pF1KB5 LPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCL
       :: :. .: .::.:::::::. .::: .  . .:..::.:.: :. ::  ::.:: :. :
XP_016 LPKSMHKLAQLERLDLGNNEFGELPEVLDQIQNLRELWMDNNALQVLPGSIGKLKMLVYL
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pF1KB5 DVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAV
       :.:.::.: .  .:::  .: ::..:.:.:. .::.:: ::::. ::::.:.::.::...
XP_016 DMSKNRIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKVDDNQLTMLPNTI
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pF1KB5 GECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDN
       :.   : :.  . :.: .::..:: :..: .: .:.: :  ::.:::.: ..::. .:.:
XP_016 GNLSLLEEFDCSCNELESLPSTIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREIGSCKNVTVMSLRSN
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pF1KB5 RLTRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALK-LKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDY
       .:  .: :..:  .:.::... ::: .::.:.: :: : :::::::::. :. .::..  
XP_016 KLEFLPEEIGQMQKLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAALWLSDNQSKALIPLQTEAHP
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pF1KB5 TTGEKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDE
        : ...::  ..::   .:  .:..      ..  .. .   :.:.  .:...    ::.
XP_016 ETKQRVLTNYMFPQ---QPRGDEDF------QSDSDSFNPTLWEEQRQQRMTVAFEFEDK
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pF1KB5 KDEEDNETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
       :....:                                                      
XP_016 KEDDENAGKVKDLSCQAPWERGQRGITLQPARLSGDCCTPWARCDQQIQDMPVPQNDPQL
             480       490       500       510       520       530 

>>XP_016857382 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-rich re  (1472 aa)
 initn: 1122 init1: 1122 opt: 1269  Z-score: 1213.1  bits: 235.6 E(85289): 7.8e-61
Smith-Waterman score: 1269; 44.3% identity (73.0% similar) in 467 aa overlap (9-470:54-511)

                                     10            20        30    
pF1KB5                       MFHCIPLWRCNRHVESI----DKRHCSLVYVPEEIYRY
                                     :: :  : :    :  ::::  ::.:.. .
XP_016 RAALRKRPEEELQCLEMTTKRKIIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNF
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pF1KB5 ARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEI
        :.:::: :::::..:::.:.:.   ::::.. ::... ::  ::....: :::.:.: .
XP_016 ERTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLSNLPTTIASLVNLKELDISKNGV
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pF1KB5 PEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLA
        :.::.:. :: : . . : ::...::..: .: ::: : .::  :. :: :.: : .: 
XP_016 QEFPENIKCCKCLTIIEASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLR
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pF1KB5 SLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQ
        :::::: :  :: :. .: .::.:::::::. .::: .  . .:..::.:.: :. :: 
XP_016 ILELRENHLKTLPKSMHKLAQLERLDLGNNEFGELPEVLDQIQNLRELWMDNNALQVLPG
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pF1KB5 EIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVD
        ::.:: :. ::.:.::.: .  .:::  .: ::..:.:.:. .::.:: ::::. ::::
XP_016 SIGKLKMLVYLDMSKNRIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKVD
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pF1KB5 QNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGC
       .:.::.::...:.   : :.  . :.: .::..:: :..: .: .:.: :  ::.:::.:
XP_016 DNQLTMLPNTIGNLSLLEEFDCSCNELESLPSTIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREIGSC
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pF1KB5 CSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALK-LKALWLSDNQSQ
        ..::. .:.:.:  .: :..:  .:.::... ::: .::.:.: :: : :::::::::.
XP_016 KNVTVMSLRSNKLEFLPEEIGQMQKLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAALWLSDNQSK
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pF1KB5 PLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVN
        :. .::..   : ...::  ..::   .:  .:..      ..  .. .   :.:.  .
XP_016 ALIPLQTEAHPETKQRVLTNYMFPQ---QPRGDEDF------QSDSDSFNPTLWEEQRQQ
           450       460          470             480       490    

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pF1KB5 RVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEV
       :...    ::.:....:                                           
XP_016 RMTVAFEFEDKKEDDENAGKVKDLSCQAPWERGQRGITLQPARLSGDCCTPWARCDQQIQ
          500       510       520       530       540       550    

>>XP_016857381 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-rich re  (1490 aa)
 initn: 1122 init1: 1122 opt: 1269  Z-score: 1213.1  bits: 235.6 E(85289): 7.9e-61
Smith-Waterman score: 1269; 44.3% identity (73.0% similar) in 467 aa overlap (9-470:72-529)

                                     10            20        30    
pF1KB5                       MFHCIPLWRCNRHVESI----DKRHCSLVYVPEEIYRY
                                     :: :  : :    :  ::::  ::.:.. .
XP_016 RAALRKRPEEELQCLEMTTKRKIIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNF
              50        60        70        80        90       100 

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pF1KB5 ARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEI
        :.:::: :::::..:::.:.:.   ::::.. ::... ::  ::....: :::.:.: .
XP_016 ERTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLSNLPTTIASLVNLKELDISKNGV
             110       120       130       140       150       160 

          100       110       120       130       140       150    
pF1KB5 PEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLA
        :.::.:. :: : . . : ::...::..: .: ::: : .::  :. :: :.: : .: 
XP_016 QEFPENIKCCKCLTIIEASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLR
             170       180       190       200       210       220 

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB5 SLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQ
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