Result of FASTA (ccds) for pF1KB5892
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5892, 524 aa
  1>>>pF1KB5892 524 - 524 aa - 524 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8446+/-0.00104; mu= 10.7235+/- 0.062
 mean_var=108.6397+/-22.508, 0's: 0 Z-trim(106.0): 185  B-trim: 18 in 1/50
 Lambda= 0.123050
 statistics sampled from 8519 (8729) to 8519 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.268), width:  16
 Scan time:  2.980

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6          ( 524) 3406 615.9 3.5e-176
CCDS6411.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8          (1630) 2107 385.6 2.4e-106
CCDS6412.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8          (1655) 2107 385.6 2.4e-106
CCDS81341.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1         (1495) 1269 236.8 1.3e-61
CCDS645.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1           (1537) 1269 236.8 1.4e-61
CCDS58951.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5         (1367) 1258 234.8 4.8e-61
CCDS34172.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5         (1302) 1255 234.3 6.6e-61
CCDS58954.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5         (1346) 1255 234.3 6.8e-61
CCDS3990.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5          (1371) 1255 234.3 6.9e-61
CCDS58953.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5         (1412) 1255 234.3 7.1e-61
CCDS58952.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5         (1419) 1255 234.3 7.1e-61
CCDS55124.1 LRRD1 gene_id:401387|Hs108|chr7        ( 860)  643 125.5 2.4e-28
CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10         ( 536)  615 120.5   5e-27
CCDS46951.1 LRRIQ4 gene_id:344657|Hs108|chr3       ( 560)  570 112.5 1.3e-24
CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10          ( 582)  521 103.8 5.6e-22
CCDS646.1 LRRC40 gene_id:55631|Hs108|chr1          ( 602)  479 96.4   1e-19
CCDS34844.1 MFHAS1 gene_id:9258|Hs108|chr8         (1052)  478 96.3 1.8e-19
CCDS58521.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17          (1258)  438 89.2 2.9e-17
CCDS11192.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17          (1269)  438 89.2   3e-17
CCDS58522.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17          (1214)  429 87.6 8.6e-17
CCDS724.1 LRRC8B gene_id:23507|Hs108|chr1          ( 803)  406 83.5   1e-15
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3        ( 581)  392 80.9 4.4e-15
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3       ( 587)  392 80.9 4.4e-15
CCDS726.1 LRRC8D gene_id:55144|Hs108|chr1          ( 858)  389 80.5 8.8e-15
CCDS35155.1 LRRC8A gene_id:56262|Hs108|chr9        ( 810)  386 79.9 1.2e-14
CCDS766.1 LRRC39 gene_id:127495|Hs108|chr1         ( 335)  371 77.0 3.7e-14
CCDS58014.1 LRRC39 gene_id:127495|Hs108|chr1       ( 339)  371 77.0 3.7e-14
CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1           ( 915)  362 75.7 2.6e-13
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1          ( 967)  362 75.7 2.7e-13
CCDS44508.1 PIDD1 gene_id:55367|Hs108|chr11        ( 893)  360 75.3 3.2e-13
CCDS7716.1 PIDD1 gene_id:55367|Hs108|chr11         ( 910)  360 75.3 3.3e-13
CCDS44621.1 LRRC10B gene_id:390205|Hs108|chr11     ( 292)  349 73.1 4.9e-13
CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12           ( 907)  350 73.5 1.1e-12
CCDS66873.1 LRRC28 gene_id:123355|Hs108|chr15      ( 312)  340 71.5 1.6e-12
CCDS2741.1 LRRC2 gene_id:79442|Hs108|chr3          ( 371)  338 71.2 2.3e-12
CCDS12189.1 LRRC8E gene_id:80131|Hs108|chr19       ( 796)  341 71.9   3e-12
CCDS73910.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16       (1256)  342 72.2   4e-12
CCDS32479.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16       (1323)  342 72.2 4.1e-12
CCDS7112.1 RSU1 gene_id:6251|Hs108|chr10           ( 277)  331 69.9 4.3e-12
CCDS10380.1 LRRC28 gene_id:123355|Hs108|chr15      ( 367)  327 69.3 8.9e-12
CCDS31856.1 LRRC10 gene_id:376132|Hs108|chr12      ( 277)  317 67.4 2.4e-11
CCDS10089.1 LRRC57 gene_id:255252|Hs108|chr15      ( 239)  312 66.5 3.9e-11
CCDS725.1 LRRC8C gene_id:84230|Hs108|chr1          ( 803)  319 68.0 4.6e-11
CCDS42409.1 LRRC30 gene_id:339291|Hs108|chr18      ( 301)  312 66.5 4.8e-11


>>CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6               (524 aa)
 initn: 3406 init1: 3406 opt: 3406  Z-score: 3276.6  bits: 615.9 E(32554): 3.5e-176
Smith-Waterman score: 3406; 99.8% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRAT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520    
pF1KB5 PHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 PHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
              490       500       510       520    

>>CCDS6411.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8               (1630 aa)
 initn: 2902 init1: 1992 opt: 2107  Z-score: 2022.9  bits: 385.6 E(32554): 2.4e-106
Smith-Waterman score: 2144; 64.5% identity (85.3% similar) in 504 aa overlap (1-499:1-494)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
       :..:::::::::::::.:::::::  ::::::::.:::::::::::::::::. ::.:..
CCDS64 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
       :::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::.:::::..::::::::.::
CCDS64 LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
       :..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..::::::::  :: ::. : .::.::
CCDS64 PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
       ::.:..  ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::::::::.:: :..
CCDS64 LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
       ::. ::::..:::::. .:::::.::.::::::::::: .. ::.:.::.:.::.:::: 
CCDS64 GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
       :..::.:.::: ::.:::.:::.: .:: ::::: .:.:. .:::::. .: :....:::
CCDS64 LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
       ::::::::::  ::..:: :.::::::..::.::.: :::. :  ::::.::: :::: :
CCDS64 HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460           470      
pF1KB5 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVE----DEKDEEDN-ETRTL
         :   :.  . :.:        .:.:..   .:::.:.:.:    ::  ::   : : :
CCDS64 --PPSLEDAGQQGSL--------SETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGL
                430               440       450       460       470

         480       490       500       510       520               
pF1KB5 LRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV           
        :::::::.::: ::...:. :..                                    
CCDS64 QRRATPHPSELKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSAST
              480       490       500       510       520       530

>>CCDS6412.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8               (1655 aa)
 initn: 2902 init1: 1992 opt: 2107  Z-score: 2022.8  bits: 385.6 E(32554): 2.4e-106
Smith-Waterman score: 2144; 64.5% identity (85.3% similar) in 504 aa overlap (1-499:1-494)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
       :..:::::::::::::.:::::::  ::::::::.:::::::::::::::::. ::.:..
CCDS64 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
       :::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::.:::::..::::::::.::
CCDS64 LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
       :..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..::::::::  :: ::. : .::.::
CCDS64 PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
       ::.:..  ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::::::::.:: :..
CCDS64 LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
       ::. ::::..:::::. .:::::.::.::::::::::: .. ::.:.::.:.::.:::: 
CCDS64 GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
       :..::.:.::: ::.:::.:::.: .:: ::::: .:.:. .:::::. .: :....:::
CCDS64 LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
       ::::::::::  ::..:: :.::::::..::.::.: :::. :  ::::.::: :::: :
CCDS64 HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460           470      
pF1KB5 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVE----DEKDEEDN-ETRTL
         :   :.  . :.:        .:.:..   .:::.:.:.:    ::  ::   : : :
CCDS64 --PPSLEDAGQQGSL--------SETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGL
                430               440       450       460       470

         480       490       500       510       520               
pF1KB5 LRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV           
        :::::::.::: ::...:. :..                                    
CCDS64 QRRATPHPSELKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSAST
              480       490       500       510       520       530

>>CCDS81341.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1              (1495 aa)
 initn: 1122 init1: 1122 opt: 1269  Z-score: 1219.5  bits: 236.8 E(32554): 1.3e-61
Smith-Waterman score: 1269; 44.3% identity (73.0% similar) in 467 aa overlap (9-470:20-477)

                          10            20        30        40     
pF1KB5            MFHCIPLWRCNRHVESI----DKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDA
                          :: :  : :    :  ::::  ::.:.. . :.:::: :::
CCDS81 MQCLEMTTKRKIIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNFERTLEELYLDA
               10        20        30        40        50        60

          50        60        70        80        90       100     
pF1KB5 NQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCK
       ::..:::.:.:.   ::::.. ::... ::  ::....: :::.:.: . :.::.:. ::
CCDS81 NQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLSNLPTTIASLVNLKELDISKNGVQEFPENIKCCK
               70        80        90       100       110       120

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB5 ALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTY
        : . . : ::...::..: .: ::: : .::  :. :: :.: : .:  :::::: :  
CCDS81 CLTIIEASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLRILELRENHLKT
              130       140       150       160       170       180

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB5 LPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCL
       :: :. .: .::.:::::::. .::: .  . .:..::.:.: :. ::  ::.:: :. :
CCDS81 LPKSMHKLAQLERLDLGNNEFGELPEVLDQIQNLRELWMDNNALQVLPGSIGKLKMLVYL
              190       200       210       220       230       240

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB5 DVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAV
       :.:.::.: .  .:::  .: ::..:.:.:. .::.:: ::::. ::::.:.::.::...
CCDS81 DMSKNRIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKVDDNQLTMLPNTI
              250       260       270       280       290       300

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB5 GECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDN
       :.   : :.  . :.: .::..:: :..: .: .:.: :  ::.:::.: ..::. .:.:
CCDS81 GNLSLLEEFDCSCNELESLPSTIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREIGSCKNVTVMSLRSN
              310       320       330       340       350       360

         350       360       370       380        390       400    
pF1KB5 RLTRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALK-LKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDY
       .:  .: :..:  .:.::... ::: .::.:.: :: : :::::::::. :. .::..  
CCDS81 KLEFLPEEIGQMQKLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAALWLSDNQSKALIPLQTEAHP
              370       380       390       400       410       420

          410       420       430       440       450       460    
pF1KB5 TTGEKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDE
        : ...::  ..::   .:  .:..      ..  .. .   :.:.  .:...    ::.
CCDS81 ETKQRVLTNYMFPQ---QPRGDEDF------QSDSDSFNPTLWEEQRQQRMTVAFEFEDK
              430          440             450       460       470 

          470       480       490       500       510       520    
pF1KB5 KDEEDNETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
       :....:                                                      
CCDS81 KEDDENAGKVKDLSCQAPWERGQRGITLQPARLSGDCCTPWARCDQQIQDMPVPQNDPQL
             480       490       500       510       520       530 

>>CCDS645.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1                (1537 aa)
 initn: 1122 init1: 1122 opt: 1269  Z-score: 1219.3  bits: 236.8 E(32554): 1.4e-61
Smith-Waterman score: 1269; 44.3% identity (73.0% similar) in 467 aa overlap (9-470:15-472)

                     10            20        30        40        50
pF1KB5       MFHCIPLWRCNRHVESI----DKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRE
                     :: :  : :    :  ::::  ::.:.. . :.:::: :::::..:
CCDS64 MTTKRKIIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNFERTLEELYLDANQIEE
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KB5 LPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVA
       ::.:.:.   ::::.. ::... ::  ::....: :::.:.: . :.::.:. :: : . 
CCDS64 LPKQLFNCQALRKLSIPDNDLSNLPTTIASLVNLKELDISKNGVQEFPENIKCCKCLTII
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KB5 DFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSL
       . : ::...::..: .: ::: : .::  :. :: :.: : .:  :::::: :  :: :.
CCDS64 EASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLRILELRENHLKTLPKSM
              130       140       150       160       170       180

              180       190       200       210       220       230
pF1KB5 TQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSEN
        .: .::.:::::::. .::: .  . .:..::.:.: :. ::  ::.:: :. ::.:.:
CCDS64 HKLAQLERLDLGNNEFGELPEVLDQIQNLRELWMDNNALQVLPGSIGKLKMLVYLDMSKN
              190       200       210       220       230       240

              240       250       260       270       280       290
pF1KB5 RLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECES
       :.: .  .:::  .: ::..:.:.:. .::.:: ::::. ::::.:.::.::...:.   
CCDS64 RIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKVDDNQLTMLPNTIGNLSL
              250       260       270       280       290       300

              300       310       320       330       340       350
pF1KB5 LTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRI
       : :.  . :.: .::..:: :..: .: .:.: :  ::.:::.: ..::. .:.:.:  .
CCDS64 LEEFDCSCNELESLPSTIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREIGSCKNVTVMSLRSNKLEFL
              310       320       330       340       350       360

              360       370       380        390       400         
pF1KB5 PAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALK-LKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEK
       : :..:  .:.::... ::: .::.:.: :: : :::::::::. :. .::..   : ..
CCDS64 PEEIGQMQKLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAALWLSDNQSKALIPLQTEAHPETKQR
              370       380       390       400       410       420

     410       420       430       440       450       460         
pF1KB5 ILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDEED
       .::  ..::   .:  .:..      ..  .. .   :.:.  .:...    ::.:....
CCDS64 VLTNYMFPQ---QPRGDEDF------QSDSDSFNPTLWEEQRQQRMTVAFEFEDKKEDDE
                 430             440       450       460       470 

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB5 NETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV     
       :                                                           
CCDS64 NAGKVKDLSCQAPWERGQRGITLQPARLSGDCCTPWARCDQQIQDMPVPQNDPQLAWGCI
             480       490       500       510       520       530 

>>CCDS58951.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5              (1367 aa)
 initn: 1566 init1: 1033 opt: 1258  Z-score: 1209.5  bits: 234.8 E(32554): 4.8e-61
Smith-Waterman score: 1258; 41.3% identity (70.7% similar) in 526 aa overlap (9-522:15-532)

                     10            20        30        40        50
pF1KB5       MFHCIPLWRCNRH----VESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRE
                     :: :     : ..:  ::::  ::.::. . ..:::: :::::..:
CCDS58 MTTKRSLFVRLVPCRCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIEE
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KB5 LPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVA
       ::.:.:.  .:.::.: ::..  ::  :::...: :::::.: : :.::.:. ::.: ..
CCDS58 LPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTIV
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KB5 DFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSL
       . : ::...::..: .: ::: : .::  :. :: :.: : .:  :::::: : .:: ..
CCDS58 EASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKTM
              130       140       150       160       170       180

              180       190       200       210       220       230
pF1KB5 TQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSEN
       ..: .::.::::.::. ..:: .  :  ::..:.:.:.:. .:  ::.::.:  ::::.:
CCDS58 NRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVSKN
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>>CCDS3990.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5               (1371 aa)
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        .: . : ::   .: ::..:.: :. .:. ::.::... ::.:.:.:  ::...:   :
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       . ::  . :.. .::.:::.: .: .. ::.: : .:: :::.  ..::. ...:.:  .
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       : :...  .:.:.... ::: .::.:.: :. : :.:::::::.::. .: .::  : . 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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