Result of FASTA (ccds) for pF1KB5811
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5811, 474 aa
  1>>>pF1KB5811 474 - 474 aa - 474 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2014+/-0.000889; mu= 14.2492+/- 0.053
 mean_var=101.1490+/-19.411, 0's: 0 Z-trim(109.0): 99  B-trim: 6 in 1/49
 Lambda= 0.127524
 statistics sampled from 10508 (10613) to 10508 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.326), width:  16
 Scan time:  3.340

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10575.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16        ( 474) 3190 597.5  1e-170
CCDS76835.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16        ( 470) 3158 591.6  6e-169
CCDS81952.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16        ( 413) 2730 512.8 2.7e-145
CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12          ( 419)  771 152.4 8.7e-37
CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12           ( 422)  768 151.8 1.3e-36
CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1          ( 419)  755 149.4 6.7e-36
CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11          ( 478)  733 145.4 1.2e-34
CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11          ( 403)  727 144.3 2.3e-34
CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11          ( 447)  727 144.3 2.5e-34
CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19          ( 382)  708 140.8 2.5e-33
CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19          ( 386)  701 139.5 6.1e-33
CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1           ( 425)  646 129.4 7.3e-30
CCDS12798.1 SYT3 gene_id:84258|Hs108|chr19         ( 590)  629 126.4 8.3e-29
CCDS7778.1 SYT9 gene_id:143425|Hs108|chr11         ( 491)  627 125.9 9.3e-29
CCDS8732.1 SYT10 gene_id:341359|Hs108|chr12        ( 523)  625 125.6 1.3e-28
CCDS1122.1 SYT11 gene_id:23208|Hs108|chr1          ( 431)  619 124.4 2.3e-28
CCDS11922.1 SYT4 gene_id:6860|Hs108|chr18          ( 425)  589 118.9 1.1e-26
CCDS73103.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10        ( 421)  496 101.8 1.5e-21
CCDS8154.1 SYT12 gene_id:91683|Hs108|chr11         ( 421)  477 98.3 1.7e-20
CCDS7726.2 SYT8 gene_id:90019|Hs108|chr11          ( 401)  466 96.3 6.5e-20
CCDS31470.1 SYT13 gene_id:57586|Hs108|chr11        ( 426)  419 87.6 2.7e-17
CCDS73104.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10        ( 390)  406 85.2 1.3e-16
CCDS73934.1 DOC2B gene_id:8447|Hs108|chr17         ( 412)  392 82.7 8.4e-16


>>CCDS10575.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16             (474 aa)
 initn: 3190 init1: 3190 opt: 3190  Z-score: 3178.4  bits: 597.5 E(32554): 1e-170
Smith-Waterman score: 3190; 100.0% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (1-474:1-474)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAYIQLEPLNEGFLSRISGLLLCRWTCRHCCQKCYESSCCQSSEDEVEILGPFPAQTPPW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAYIQLEPLNEGFLSRISGLLLCRWTCRHCCQKCYESSCCQSSEDEVEILGPFPAQTPPW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LMASRSSDKDGDSVHTASEVPLTPRTNSPDGRRSSSDTSKSTYSLTRRISSLESRRPSSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LMASRSSDKDGDSVHTASEVPLTPRTNSPDGRRSSSDTSKSTYSLTRRISSLESRRPSSP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 LIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 NSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 VKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSND
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470    
pF1KB5 FIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
              430       440       450       460       470    

>>CCDS76835.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16             (470 aa)
 initn: 3158 init1: 3158 opt: 3158  Z-score: 3146.6  bits: 591.6 E(32554): 6e-169
Smith-Waterman score: 3158; 100.0% identity (100.0% similar) in 469 aa overlap (6-474:2-470)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAYIQLEPLNEGFLSRISGLLLCRWTCRHCCQKCYESSCCQSSEDEVEILGPFPAQTPPW
            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76     MLEPLNEGFLSRISGLLLCRWTCRHCCQKCYESSCCQSSEDEVEILGPFPAQTPPW
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LMASRSSDKDGDSVHTASEVPLTPRTNSPDGRRSSSDTSKSTYSLTRRISSLESRRPSSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LMASRSSDKDGDSVHTASEVPLTPRTNSPDGRRSSSDTSKSTYSLTRRISSLESRRPSSP
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 LIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEIL
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQK
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 NSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEV
        240       250       260       270       280       290      

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPF
        300       310       320       330       340       350      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 VKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSND
        360       370       380       390       400       410      

              430       440       450       460       470    
pF1KB5 FIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 FIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
        420       430       440       450       460       470

>>CCDS81952.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16             (413 aa)
 initn: 2730 init1: 2730 opt: 2730  Z-score: 2721.9  bits: 512.8 E(32554): 2.7e-145
Smith-Waterman score: 2730; 100.0% identity (100.0% similar) in 413 aa overlap (62-474:1-413)

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB5 QKCYESSCCQSSEDEVEILGPFPAQTPPWLMASRSSDKDGDSVHTASEVPLTPRTNSPDG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81                               MASRSSDKDGDSVHTASEVPLTPRTNSPDG
                                             10        20        30

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB5 RRSSSDTSKSTYSLTRRISSLESRRPSSPLIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RRSSSDTSKSTYSLTRRISSLESRRPSSPLIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPD
               40        50        60        70        80        90

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB5 DYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEILSKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEILSKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDL
              100       110       120       130       140       150

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB5 PPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPFLEAQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPFLEAQR
              160       170       180       190       200       210

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB5 RTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNY
              220       230       240       250       260       270

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB5 LPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNES
              280       290       300       310       320       330

             400       410       420       430       440       450 
pF1KB5 FSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAV
              340       350       360       370       380       390

             460       470    
pF1KB5 EQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
       :::::::::::::::::::::::
CCDS81 EQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
              400       410   

>>CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12               (419 aa)
 initn: 708 init1: 333 opt: 771  Z-score: 773.9  bits: 152.4 E(32554): 8.7e-37
Smith-Waterman score: 771; 40.7% identity (72.8% similar) in 305 aa overlap (165-464:116-412)

          140       150       160       170           180       190
pF1KB5 KKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTD----EEILSKYQLGMLHF
                                     :...:   .:::    ::   . .:: :..
CCDS76 KKKNKKKGKEKGGKNAINMKDVKDLGKTMKDQDDDAETGLTDGEEKEEPKEEEKLGKLQY
          90       100       110       120       130       140     

              200       210       220       230       240       250
pF1KB5 STQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRK
       : .::. .:.: : .:.: .::  ..  :.      :.::::. ::::.:.. .: :.::
CCDS76 SLDYDFQNNQLLVGIIQAAELPA-LDMGGT------SDPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRK
         150       160        170             180       190        

              260       270       280       290       300       310
pF1KB5 TQKPVFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWK
       : .:::.:..::..:. :   .::...: :::.::.: .::. .::.  ::. .  . :.
CCDS76 TLNPVFNEQFTFKVPYSELGGKTLVMAVYDFDRFSKHDIIGEFKVPMNTVDFGHVTEEWR
      200       210       220       230       240       250        

              320        330       340       350       360         
pF1KB5 ALIPSSQNEVE-LGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGL
        :  . ..: : ::.. .:: :.:.::.:.: ...::.: . ::.  :::.:::.:... 
CCDS76 DLQSAEKEEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVVILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNG
      260       270       280       290       300       310        

     370       380       390       400       410       420         
pF1KB5 KLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQ
       : .: :::.. ..:..:.:::::::.:: :.......: ::. ..  ..:: ::.. .: 
CCDS76 KRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPFEQIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGY
      320       330       340       350       360       370        

     430       440       450       460       470    
pF1KB5 YSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
        :.: .:  ::  :: . :  . :::.:. . : :          
CCDS76 NSTG-AELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQVEEEVDAMLAVKK   
      380        390       400       410            

>>CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12                (422 aa)
 initn: 708 init1: 333 opt: 768  Z-score: 770.9  bits: 151.8 E(32554): 1.3e-36
Smith-Waterman score: 768; 40.2% identity (73.1% similar) in 301 aa overlap (165-464:123-415)

          140       150       160       170       180       190    
pF1KB5 KKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEILSKYQLGMLHFSTQY
                                     :...  .:.   ::   . .:: :..: .:
CCDS90 GKEKGGKNAINMKDVKDLGKTMKDQALKDDDAETGLTDGEEKEEPKEEEKLGKLQYSLDY
            100       110       120       130       140       150  

          200       210       220       230       240       250    
pF1KB5 DLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRKTQKP
       :. .:.: : .:.: .::  ..  :.      :.::::. ::::.:.. .: :.::: .:
CCDS90 DFQNNQLLVGIIQAAELPA-LDMGGT------SDPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRKTLNP
            160       170              180       190       200     

          260       270       280       290       300       310    
pF1KB5 VFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWKALIP
       ::.:..::..:. :   .::...: :::.::.: .::. .::.  ::. .  . :. :  
CCDS90 VFNEQFTFKVPYSELGGKTLVMAVYDFDRFSKHDIIGEFKVPMNTVDFGHVTEEWRDLQS
         210       220       230       240       250       260     

          320        330       340       350       360       370   
pF1KB5 SSQNEVE-LGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGLKLVK
       . ..: : ::.. .:: :.:.::.:.: ...::.: . ::.  :::.:::.:... : .:
CCDS90 AEKEEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVVILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLK
         270       280       290       300       310       320     

           380       390       400       410       420       430   
pF1KB5 TKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQYSSG
        :::.. ..:..:.:::::::.:: :.......: ::. ..  ..:: ::.. .:  :.:
CCDS90 KKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPFEQIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNSTG
         330       340       350       360       370       380     

           440       450       460       470    
pF1KB5 PSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
        .:  ::  :: . :  . :::.:. . : :          
CCDS90 -AELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQVEEEVDAMLAVKK   
          390       400       410       420     

>>CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1               (419 aa)
 initn: 708 init1: 315 opt: 755  Z-score: 758.0  bits: 149.4 E(32554): 6.7e-36
Smith-Waterman score: 755; 40.3% identity (72.1% similar) in 305 aa overlap (167-464:116-412)

        140       150       160       170             180       190
pF1KB5 EPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDS-LTD-----EEILSKYQLGMLHF
                                     ..::... ::.     ::     .:: :.:
CCDS14 KCCCKKKKNKKEKGKGMKNAMNMKDMKGGQDDDDAETGLTEGEGEGEEEKEPENLGKLQF
          90       100       110       120       130       140     

              200       210       220       230       240       250
pF1KB5 STQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRK
       : .::.  :.::: :..: .::  ..  :.      :.::::. ::::.:.. .: :.::
CCDS14 SLDYDFQANQLTVGVLQAAELPA-LDMGGT------SDPYVKVFLLPDKKKKYETKVHRK
         150       160        170             180       190        

              260       270       280       290       300       310
pF1KB5 TQKPVFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWK
       : .:.:.: .::..:. :   .::.... :::.::.: .::.:.::.  ::: .  . :.
CCDS14 TLNPAFNETFTFKVPYQELGGKTLVMAIYDFDRFSKHDIIGEVKVPMNTVDLGQPIEEWR
      200       210       220       230       240       250        

              320        330       340       350       360         
pF1KB5 ALIPSSQNEVE-LGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGL
        :  . ..: : ::..  :: :.:.::.:.: ...::.: . ::.  :::.:::.:... 
CCDS14 DLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKLTVCILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNG
      260       270       280       290       300       310        

     370       380       390       400       410       420         
pF1KB5 KLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQ
       : .: :::.  . :..:..::::::..: :.......: ::. ..  ..:. ::.: .:.
CCDS14 KRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFEQIQKVQVVVTVLDYDKLGKNEAIGKIFVGS
      320       330       340       350       360       370        

     430       440       450       460       470    
pF1KB5 YSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
        ..: .:  ::  :: . :  . :::::. . : :          
CCDS14 NATG-TELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEEEVDALLGKNK   
      380        390       400       410            

>>CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11               (478 aa)
 initn: 674 init1: 390 opt: 733  Z-score: 735.4  bits: 145.4 E(32554): 1.2e-34
Smith-Waterman score: 733; 32.7% identity (63.2% similar) in 456 aa overlap (22-459:37-478)

                        10        20        30        40         50
pF1KB5          MAYIQLEPLNEGFLSRISGLLLCRWTCRHCCQKCYESSCCQ-SSEDEVEIL
                                     ::.: :..   : :..:    .. :  .  
CCDS58 AASPGAPSRDVLLVSAIITVSLSVTVVLCGLCHW-CQRKLGKRYKNSLETVGTPDSGRGR
         10        20        30        40         50        60     

               60        70        80        90         100        
pF1KB5 GPFPAQTPPWLMASRSSDKDGDSVHTASEVPLTPRTNSPDGRRS--SSDTSKSTYSLTRR
       .   : .   : ... .   : .:.  ...   :    : :. .  :. .. :  .   .
CCDS58 SEKKAINGTLLSGAKVAAAAGLAVEREGRLGEKPAPVPPPGEDALRSGGAAPSEPGSGGK
          70        80        90       100       110       120     

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB5 ISSLESRRPSSPLIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNS
        .  . :  .: :   : .... : :  . .. . .      :.  :. ::.    .: :
CCDS58 AGRGRWRTVQSHLAAGK-LNLSKLPAGGKAVNTAPVPGQTPHDESDRRTEPR----SSVS
         130       140        150       160       170           180

      170       180                     190       200       210    
pF1KB5 DDVDSLTDEEIL--------------SKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPP
       : :.:::.: ..              :. .:: ..::. :.. .. :::....:..::  
CCDS58 DLVNSLTSEMLMLSPGSEEDEAHEGCSRENLGRIQFSVGYNFQESTLTVKIMKAQELP--
              190       200       210       220       230          

          220       230       240       250       260        270   
pF1KB5 ISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFE-IPFLEAQRRT
        ..: :    . :.:.::: ::::.:.. .: ::::. .: ..: . :: .:. .. .: 
CCDS58 -AKDFS----GTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRKNLNPHWNETFLFEGFPYEKVVQRI
       240           250       260       270       280       290   

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB5 LLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNYLP
       : : :.:.:.:::.  ::.::.:: .:::..   .:: : : :..    ::::::: : :
CCDS58 LYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDLTQMQTFWKDLKPCSDGSGSRGELLLSLCYNP
           300       310       320       330       340       350   

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB5 SAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFS
       ::. . :..:.:..:   :..  :::.::. :..  : :. :::  .. ...:..::::.
CCDS58 SANSIIVNIIKARNLKAMDIGGTSDPYVKVWLMYKDKRVEKKKTVTMKRNLNPIFNESFA
           360       370       380       390       400       410   

           400       410       420       430       440       450   
pF1KB5 FKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQ
       : .: :.:.......::. ..  : :: ::.: .. ..:::.:..::. :.   :  : :
CCDS58 FDIPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRNDVIGKIYLS-WKSGPGEVKHWKDMIARPRQPVAQ
           420       430       440        450       460       470  

           460       470    
pF1KB5 WHSLRSRAECDRVSPASLEVT
       ::.:..               
CCDS58 WHQLKA               
                            

>>CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11               (403 aa)
 initn: 646 init1: 390 opt: 727  Z-score: 730.4  bits: 144.3 E(32554): 2.3e-34
Smith-Waterman score: 727; 38.9% identity (70.1% similar) in 324 aa overlap (151-459:92-403)

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 LIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEIL
                                     :.  :. ::.    .: :: :.:::.: ..
CCDS31 GRGRSEKKAIKLPAGGKAVNTAPVPGQTPHDESDRRTEPR----SSVSDLVNSLTSEMLM
              70        80        90       100           110       

                            190       200       210       220      
pF1KB5 --------------SKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAH
                     :. .:: ..::. :.. .. :::....:..::   ..: :    . 
CCDS31 LSPGSEEDEAHEGCSRENLGRIQFSVGYNFQESTLTVKIMKAQELP---AKDFS----GT
       120       130       140       150       160              170

        230       240       250       260        270       280     
pF1KB5 SNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFE-IPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFS
       :.:.::: ::::.:.. .: ::::. .: ..: . :: .:. .. .: : : :.:.:.::
CCDS31 SDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRKNLNPHWNETFLFEGFPYEKVVQRILYLQVLDYDRFS
              180       190       200       210       220       230

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB5 RHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRA
       :.  ::.::.:: .:::..   .:: : : :..    ::::::: : :::. . :..:.:
CCDS31 RNDPIGEVSIPLNKVDLTQMQTFWKDLKPCSDGSGSRGELLLSLCYNPSANSIIVNIIKA
              240       250       260       270       280       290

         350       360       370       380       390       400     
pF1KB5 KQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENAS
       ..:   :..  :::.::. :..  : :. :::  .. ...:..::::.: .: :.:....
CCDS31 RNLKAMDIGGTSDPYVKVWLMYKDKRVEKKKTVTMKRNLNPIFNESFAFDIPTEKLRETT
              300       310       320       330       340       350

         410       420       430       440       450       460     
pF1KB5 LVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDR
       ...::. ..  : :: ::.: .. ..:::.:..::. :.   :  : :::.:..      
CCDS31 IIITVMDKDKLSRNDVIGKIYLS-WKSGPGEVKHWKDMIARPRQPVAQWHQLKA      
              360       370        380       390       400         

         470    
pF1KB5 VSPASLEVT

>>CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11               (447 aa)
 initn: 646 init1: 390 opt: 727  Z-score: 729.8  bits: 144.3 E(32554): 2.5e-34
Smith-Waterman score: 731; 35.6% identity (66.1% similar) in 404 aa overlap (88-459:58-447)

        60        70        80        90       100            110  
pF1KB5 PPWLMASRSSDKDGDSVHTASEVPLTPRTNSPDGRRSSSDTSKSTYSLTRRI-----SSL
                                     .::. :. :. .:.  .: : .     :..
CCDS73 LSVTVVLCGLCHWCQRKLGKRYKNSLETVGTPDSGRGRSE-KKAINDLDRDFWNNNESTV
        30        40        50        60         70        80      

            120            130         140       150            160
pF1KB5 ESRRPSSP----LIDIKPIE-FG--VLSAKKEPIQPSVLRRTYNP-----DDYFRKFEPH
       ...  : :    ...:.:   .:   :: :  :   ...  .  :     :.  :. ::.
CCDS73 QQKWSSYPPKEFILNISPYAPYGDPRLSLKL-PAGGKAVNTAPVPGQTPHDESDRRTEPR
         90       100       110        120       130       140     

              170       180                     190       200      
pF1KB5 LYSLDSNSDDVDSLTDEEIL--------------SKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVI
           .: :: :.:::.: ..              :. .:: ..::. :.. .. :::...
CCDS73 ----SSVSDLVNSLTSEMLMLSPGSEEDEAHEGCSRENLGRIQFSVGYNFQESTLTVKIM
             150       160       170       180       190       200 

        210       220       230       240       250       260      
pF1KB5 EARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFE-IP
       .:..::   ..: :    . :.:.::: ::::.:.. .: ::::. .: ..: . :: .:
CCDS73 KAQELP---AKDFS----GTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRKNLNPHWNETFLFEGFP
                210           220       230       240       250    

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB5 FLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGEL
       . .. .: : : :.:.:.:::.  ::.::.:: .:::..   .:: : : :..    :::
CCDS73 YEKVVQRILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDLTQMQTFWKDLKPCSDGSGSRGEL
          260       270       280       290       300       310    

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB5 LLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTID
       :::: : :::. . :..:.:..:   :..  :::.::. :..  : :. :::  .. ...
CCDS73 LLSLCYNPSANSIIVNIIKARNLKAMDIGGTSDPYVKVWLMYKDKRVEKKKTVTMKRNLN
          320       330       340       350       360       370    

         390       400       410       420       430       440     
pF1KB5 PFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLN
       :..::::.: .: :.:.......::. ..  : :: ::.: .. ..:::.:..::. :. 
CCDS73 PIFNESFAFDIPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRNDVIGKIYLS-WKSGPGEVKHWKDMIA
          380       390       400       410        420       430   

         450       460       470    
pF1KB5 THRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
         :  : :::.:..               
CCDS73 RPRQPVAQWHQLKA               
           440                      

>>CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19               (382 aa)
 initn: 806 init1: 576 opt: 708  Z-score: 711.9  bits: 140.8 E(32554): 2.5e-33
Smith-Waterman score: 708; 37.9% identity (72.0% similar) in 293 aa overlap (177-469:98-381)

        150       160       170       180       190       200      
pF1KB5 TYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEILSKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVI
                                     ... .:..:: :..: .::.  ..: : ..
CCDS74 PTRLPTPVASATAQVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGIL
        70        80        90       100       110       120       

        210       220       230       240       250       260      
pF1KB5 EARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPF
       .:  :   ..  ::      :.:::.. ::::..   .: :.:.: .: : : ..:..:.
CCDS74 QAMGLAA-LDLGGS------SDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQTLNPHFGETFAFKVPY
       130        140             150       160       170       180

        270       280       290       300       310       320      
pF1KB5 LEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELL
       .:   :.:...: :::.:::. .::.: ::.  ::: .  . :. :  . ..: .::.. 
CCDS74 VELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPMSSVDLGRPVQAWRELQAAPREEEKLGDIC
              190       200       210       220       230       240

        330       340       350       360       370       380      
pF1KB5 LSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDP
       .:: :.:.::.:.: :..::.: . ::.  :::.::..:..: : :. :::.. ..:..:
CCDS74 FSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLSDPYVKVHLLQGGKKVRKKKTTIKKNTLNP
              250       260       270       280       290       300

        390       400       410       420       430       440      
pF1KB5 FYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNT
       .:::.:::.:: ........ .::. ..  ..:. :::...:  ..: .   ::  :: .
CCDS74 YYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRVAVGA-AAGGAGLRHWADMLAN
              310       320       330       340        350         

        450       460       470    
pF1KB5 HRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
        :  . ::::::   .  :. ::     
CCDS74 PRRPIAQWHSLRPPDRV-RLLPAP    
     360       370        380      




474 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 10:24:25 2016 done: Sat Nov  5 10:24:26 2016
 Total Scan time:  3.340 Total Display time:  0.070

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com