Result of FASTA (omim) for pF1KB9868
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9868, 450 aa
  1>>>pF1KB9868 450 - 450 aa - 450 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5012+/-0.000445; mu= 1.9842+/- 0.028
 mean_var=395.7349+/-83.764, 0's: 0 Z-trim(121.4): 367  B-trim: 1891 in 1/55
 Lambda= 0.064472
 statistics sampled from 37551 (37982) to 37551 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.445), width:  16
 Scan time: 10.720

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 3081 300.6 5.6e-81
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 1303 135.3 3.4e-31
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 1000 107.1   1e-22
XP_016872785 (OMIM: 126450,159900) PREDICTED: D(2) ( 443)  756 84.4 6.9e-16
NP_000786 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 443)  756 84.4 6.9e-16
XP_011543044 (OMIM: 118510) PREDICTED: muscarinic  ( 460)  595 69.4 2.3e-11
NP_000729 (OMIM: 118510) muscarinic acetylcholine  ( 460)  595 69.4 2.3e-11
NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamin ( 422)  550 65.2 3.9e-10
XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328)  539 64.0 6.8e-10
XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331)  539 64.0 6.9e-10
XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366)  539 64.1 7.3e-10
NP_000855 (OMIM: 182133) 5-hydroxytryptamine recep ( 377)  539 64.1 7.4e-10
XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389)  539 64.1 7.6e-10
XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402)  539 64.1 7.7e-10
NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine recep ( 390)  537 63.9 8.6e-10
NP_000670 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic recep ( 520)  539 64.3   9e-10
XP_011532737 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 556)  539 64.3 9.4e-10
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308)  520 62.2 2.2e-09
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317)  520 62.2 2.3e-09
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324)  520 62.2 2.3e-09
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342)  520 62.3 2.4e-09
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370)  520 62.3 2.5e-09
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372)  520 62.3 2.5e-09
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429)  520 62.4 2.7e-09
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429)  520 62.4 2.7e-09
NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455)  520 62.4 2.8e-09
NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 466)  520 62.4 2.9e-09
NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 475)  520 62.4 2.9e-09
XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475)  520 62.4 2.9e-09
XP_016868584 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475)  520 62.4 2.9e-09
XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475)  520 62.4 2.9e-09
NP_000856 (OMIM: 182132) 5-hydroxytryptamine recep ( 365)  514 61.7 3.6e-09
XP_011534091 (OMIM: 182132) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 365)  514 61.7 3.6e-09
NP_000669 (OMIM: 104219) alpha-1D adrenergic recep ( 572)  508 61.4 7.1e-09
NP_057658 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 414)  498 60.3 1.1e-08
NP_000675 (OMIM: 109630,607276) beta-1 adrenergic  ( 477)  492 59.8 1.8e-08
NP_000785 (OMIM: 126449) D(1A) dopamine receptor [ ( 446)  491 59.7 1.8e-08
NP_387512 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dopami ( 367)  468 57.5 7.1e-08
NP_000787 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dopami ( 400)  468 57.5 7.5e-08
XP_016861318 (OMIM: 126451,181500,190300) PREDICTE ( 400)  468 57.5 7.5e-08
NP_001277738 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dop ( 400)  468 57.5 7.5e-08
NP_001269492 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dop ( 400)  468 57.5 7.5e-08
XP_005264808 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 366)  466 57.3 8.1e-08
XP_011531966 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 366)  466 57.3 8.1e-08
NP_001309139 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366)  466 57.3 8.1e-08
NP_000857 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recep ( 366)  466 57.3 8.1e-08
NP_001309138 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366)  466 57.3 8.1e-08
NP_001309137 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366)  466 57.3 8.1e-08
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432)  460 56.8 1.3e-07
NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445)  460 56.8 1.3e-07


>>NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic receptor   (465 aa)
 initn: 3081 init1: 3081 opt: 3081  Z-score: 1574.8  bits: 300.6 E(85289): 5.6e-81
Smith-Waterman score: 3081; 100.0% identity (100.0% similar) in 450 aa overlap (1-450:16-465)

                              10        20        30        40     
pF1KB9                MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLML
                      :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MFRQEQPLAEGSFAPMGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLML
               10        20        30        40        50        60

          50        60        70        80        90       100     
pF1KB9 LTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAW
               70        80        90       100       110       120

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB9 CEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVIS
              130       140       150       160       170       180

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB9 FPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKR
              190       200       210       220       230       240

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB9 RTRVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAPAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RTRVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAPAGP
              250       260       270       280       290       300

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB9 RDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGIGTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGIGTP
              310       320       330       340       350       360

         350       360       370       380       390       400     
pF1KB9 AAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTLTAVGCSVPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTLTAVGCSVPR
              370       380       390       400       410       420

         410       420       430       440       450
pF1KB9 TLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDRKRIV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDRKRIV
              430       440       450       460     

>>NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic receptor   (462 aa)
 initn: 1463 init1: 768 opt: 1303  Z-score: 681.0  bits: 135.3 E(85289): 3.4e-31
Smith-Waterman score: 1511; 54.9% identity (73.9% similar) in 459 aa overlap (8-447:16-458)

                        10        20                 30        40  
pF1KB9         MGSLQPDAG-NASWNGTEAPGGGARAT-----P----YSLQVTLTLVCLAGL
                      :: :::  : .. :: : :.     :    ::  ..  :. ..:.
NP_000 MASPALAAALAVAAAAGPNASGAGERGSGGVANASGASWGPPRGQYSAGAVAGLAAVVGF
               10        20        30        40        50        60

             50        60        70        80        90       100  
pF1KB9 LMLLTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFG
       :...:: :::::.:::.:::::.:::::::::::::::::::::.:::::::.:.:::::
NP_000 LIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRAPQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMAYWYFG
               70        80        90       100       110       120

            110       120       130       140       150       160  
pF1KB9 KAWCEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISA
       ..:: .::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::.:: :..::.:::
NP_000 QVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSVTQAVEYNLKRTPRRVKATIVAVWLISA
              130       140       150       160       170       180

            170       180       190       200       210       220  
pF1KB9 VISFPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQI
       :::::::.:. ..  :.    : :.: .::. ::..:::::::::::::: :::.:::..
NP_000 VISFPPLVSLYRQPDGA----AYPQCGLNDETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYRV
              190           200       210       220       230      

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB9 AKRRTRVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAP
       :: :::.   .:.:   ..: :..    ::::   .:: .:  : : :....  : : . 
NP_000 AKLRTRTLSEKRAP---VGPDGASPTTENGLGAAAGAGENGHCAPP-PADVE--PDESSA
        240       250          260       270        280         290

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB9 AGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGI
       :. :      :....     .:  : .    :  :.: :  . .. :     :.::  : 
NP_000 AAERRRRRGALRRGG-----RRRAGAEGGAGGADGQG-AGPGAAESGALTASRSPGPGGR
              300            310       320        330       340    

            350           360         370       380       390      
pF1KB9 GTPAAGPGEE----RVGAAKAS--RWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTL
        . :.. . :    :   :..:  : .  : ::::::::::::.::::.:::::::.:.:
NP_000 LSRASSRSVEFFLSRRRRARSSVCRRKVAQAREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFPFFFSYSL
          350       360       370       380       390       400    

           400       410       420       430       440       450 
pF1KB9 TAV---GCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDRKRIV 
        ..   .:.::  :::::::.:::::::::::::.::.::::.::.:: :  :.    
NP_000 YGICREACQVPGPLFKFFFWIGYCNSSLNPVIYTVFNQDFRRSFKHILFRRRRRGFRQ
          410       420       430       440       450       460  

>>NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergic re  (450 aa)
 initn: 1240 init1: 739 opt: 1000  Z-score: 528.8  bits: 107.1 E(85289): 1e-22
Smith-Waterman score: 1431; 54.1% identity (71.6% similar) in 451 aa overlap (27-443:6-443)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGNVLVIIAVFT
                                 :::.:.: ...    .:.:.:.:::.:::.::.:
NP_000                      MDHQDPYSVQATAAIAAAITFLILFTIFGNALVILAVLT
                                    10        20        30         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 SRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLALDVLFCTSS
       ::.:.:::::::::::.::::::::.::::::::..::::: ..:::.::::::::::::
NP_000 SRSLRAPQNLFLVSLAAADILVATLIIPFSLANELLGYWYFRRTWCEVYLALDVLFCTSS
      40        50        60        70        80        90         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 IVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVISFPPLISIEKKGGGGG
       :::::::::::::....:.::: :::::::: ::.:::.:.::::.::::      :  :
NP_000 IVHLCAISLDRYWAVSRALEYNSKRTPRRIKCIILTVWLIAAVISLPPLIY----KGDQG
     100       110       120       130       140       150         

               190       200       210       220       230         
pF1KB9 PQP-AEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVPPSRRGPDAV
       ::: ..:.:..:.. ::...: :::::::::::::::.::: ::::      .:::: : 
NP_000 PQPRGRPQCKLNQEAWYILASSIGSFFAPCLIMILVYLRIYLIAKRS-----NRRGPRAK
         160       170       180       190       200            210

     240         250       260       270          280        290   
pF1KB9 AAPPGGTER--RPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNG---APGEPAPA-GPRDTDALDL
       ..:  :  .  ::.  :   ::   .  .     ..::   . ::   .  :.:: .  :
NP_000 GGPGQGESKQPRPDHGGALASAKLPALASVASAREVNGHSKSTGEKEEGETPEDTGTRAL
              220       230       240       250       260       270

                             300       310         320       330   
pF1KB9 EES------------------SSSDHAERPPGPRRPERG--PRGKGKARASQVKPGDSLP
         :                  :  :.::.    .. :.   :..   . ::  .:  . :
NP_000 PPSWAALPNSGQGQKEGVCGASPEDEAEEEEEEEEEEEECEPQAVPVSPASACSPPLQQP
              280       290       300       310       320       330

             340       350       360         370       380         
pF1KB9 RRGPG--ATGIGTPAAGPGEERVGAAKASRWRGRQN--REKRFTFVLAVVIGVFVVCWFP
       . :    ::  :    : :   :::  .. :: : .  :::::::::::::::::.::::
NP_000 Q-GSRVLATLRGQVLLGRG---VGAIGGQWWRRRAQLTREKRFTFVLAVVIGVFVLCWFP
               340          350       360       370       380      

     390          400       410       420       430       440      
pF1KB9 FFFTYTLTAV---GCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDR
       :::.:.: :.    :.::. ::.::::.::::::::::::::::.::::::..::::   
NP_000 FFFSYSLGAICPKHCKVPHGLFQFFFWIGYCNSSLNPVIYTIFNQDFRRAFRRILCRPWT
        390       400       410       420       430       440      

        450
pF1KB9 KRIV
           
NP_000 QTAW
        450

>>XP_016872785 (OMIM: 126450,159900) PREDICTED: D(2) dop  (443 aa)
 initn: 730 init1: 360 opt: 756  Z-score: 406.2  bits: 84.4 E(85289): 6.9e-16
Smith-Waterman score: 796; 33.6% identity (60.4% similar) in 455 aa overlap (13-442:22-443)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB9          MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGN
                            .::..   : :    :.  .::       ::. . ::::
XP_016 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSD---GKADRPHYNYYATLLT-----LLIAVIVFGN
               10        20           30        40             50  

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB9 VLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLA
       ::: .::   .::..  : ..:::: ::.::::::.:. .  ::.: : :..  :.:...
XP_016 VLVCMAVSREKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGEWKFSRIHCDIFVT
             60        70        80        90       100       110  

             120       130       140        150       160       170
pF1KB9 LDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTP-RRIKAIIITVWVISAVISFPPLI
       :::..::.::..:::::.::: .... . :: . .  ::. ..:  :::.: .:: : :.
XP_016 LDVMMCTASILNLCAISIDRYTAVAMPMLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLF
            120       130       140       150       160       170  

              180       190       200       210       220       230
pF1KB9 SIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVP
       ....          . .: : .   .:. : : ::..: .. .:::..:: . .:: .  
XP_016 GLNNAD--------QNECIIANPA-FVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRRRKRV
                    180        190       200       210       220   

                  240       250                    260       270   
pF1KB9 PSRRGPDA----VAAPPGGTERRP------------NGLGP-ERSAGPGGAEAEPLPTQL
        ..:.  :    . ::  :.  .:            ::  : .:    .. .:. :  ..
XP_016 NTKRSSRAFRAHLRAPLKGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEM
           230       240       250       260       270       280   

           280            290       300       310       320        
pF1KB9 NGAPGEP-----APAGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKP
        .. . :     .:  : .   : : . :       : .: .::.. ..: . . ...  
XP_016 LSSTSPPERTRYSPIPP-SHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIAKIFE
           290       300        310       320       330       340  

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB9 GDSLPRRGPGATGIGTPAAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWF
        ...:                :. :..    :: .  :..::. : .::.:.:::..::.
XP_016 IQTMPN---------------GKTRTSLKTMSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWL
                           350       360       370       380       

      390        400       410       420       430       440       
pF1KB9 PFFFTYTLTA-VGCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKIL-CRGDR
       :::.:. :.    :..: .:.. : :.:: ::..::.::: :: .::.:: ::: :    
XP_016 PFFITHILNIHCDCNIPPVLYSAFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC    
       390       400       410       420       430       440       

        450
pF1KB9 KRIV

>>NP_000786 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine receptor  (443 aa)
 initn: 730 init1: 360 opt: 756  Z-score: 406.2  bits: 84.4 E(85289): 6.9e-16
Smith-Waterman score: 796; 33.6% identity (60.4% similar) in 455 aa overlap (13-442:22-443)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB9          MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGN
                            .::..   : :    :.  .::       ::. . ::::
NP_000 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSD---GKADRPHYNYYATLLT-----LLIAVIVFGN
               10        20           30        40             50  

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB9 VLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLA
       ::: .::   .::..  : ..:::: ::.::::::.:. .  ::.: : :..  :.:...
NP_000 VLVCMAVSREKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGEWKFSRIHCDIFVT
             60        70        80        90       100       110  

             120       130       140        150       160       170
pF1KB9 LDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTP-RRIKAIIITVWVISAVISFPPLI
       :::..::.::..:::::.::: .... . :: . .  ::. ..:  :::.: .:: : :.
NP_000 LDVMMCTASILNLCAISIDRYTAVAMPMLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLF
            120       130       140       150       160       170  

              180       190       200       210       220       230
pF1KB9 SIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVP
       ....          . .: : .   .:. : : ::..: .. .:::..:: . .:: .  
NP_000 GLNNAD--------QNECIIANPA-FVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRRRKRV
                    180        190       200       210       220   

                  240       250                    260       270   
pF1KB9 PSRRGPDA----VAAPPGGTERRP------------NGLGP-ERSAGPGGAEAEPLPTQL
        ..:.  :    . ::  :.  .:            ::  : .:    .. .:. :  ..
NP_000 NTKRSSRAFRAHLRAPLKGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEM
           230       240       250       260       270       280   

           280            290       300       310       320        
pF1KB9 NGAPGEP-----APAGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKP
        .. . :     .:  : .   : : . :       : .: .::.. ..: . . ...  
NP_000 LSSTSPPERTRYSPIPP-SHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIAKIFE
           290       300        310       320       330       340  

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB9 GDSLPRRGPGATGIGTPAAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWF
        ...:                :. :..    :: .  :..::. : .::.:.:::..::.
NP_000 IQTMPN---------------GKTRTSLKTMSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWL
                           350       360       370       380       

      390        400       410       420       430       440       
pF1KB9 PFFFTYTLTA-VGCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKIL-CRGDR
       :::.:. :.    :..: .:.. : :.:: ::..::.::: :: .::.:: ::: :    
NP_000 PFFITHILNIHCDCNIPPVLYSAFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC    
       390       400       410       420       430       440       

        450
pF1KB9 KRIV

>>XP_011543044 (OMIM: 118510) PREDICTED: muscarinic acet  (460 aa)
 initn: 384 init1: 384 opt: 595  Z-score: 325.1  bits: 69.4 E(85289): 2.3e-11
Smith-Waterman score: 595; 29.7% identity (59.4% similar) in 441 aa overlap (18-448:17-441)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGNVLVIIAVFT
                        ::: :    :.  ::..  .  .::: : :: ::.::.:.  .
XP_011  MNTSAPPAVSPNITVLAPGKG----PW--QVAFIGIT-TGLLSLATVTGNLLVLISFKV
                10        20              30         40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 SRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLALDVLFCTSS
       .  ::. .: ::.::: ::....:. . .  .  .::.: .:   :...:::: .  ..:
XP_011 NTELKTVNNYFLLSLACADLIIGTFSMNLYTTYLLMGHWALGTLACDLWLALDYVASNAS
             60        70        80        90       100       110  

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 IVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVISFPPLISIEKKGGGGG
       ...:  ::.:::.:.:. . :  ::::::   .:  .:..: :.  : ..  .   :   
XP_011 VMNLLLISFDRYFSVTRPLSYRAKRTPRRAALMIGLAWLVSFVLWAPAILFWQYLVGERT
            120       130       140       150       160       170  

              190       200       210       220       230          
pF1KB9 PQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVPPSRRG---PD
          ..   .. .:   .... ...:. :  .:  .: :::. .. :.:   . .:   : 
XP_011 VLAGQCYIQFLSQPIITFGTAMAAFYLPVTVMCTLYWRIYRETENRARELAALQGSETPG
            180       190       200       210       220       230  

       240        250        260        270       280       290    
pF1KB9 AVAAPPGGTER-RPNGLG-PERSAGPGGA-EAEPLPTQLNGAPGEPAPAGPRDTDALDLE
         ..  ...:: .:.. : ::  . ::   .    :  :..   .      .. :  ..:
XP_011 KGGGSSSSSERSQPGAEGSPE--TPPGRCCRCCRAPRLLQAYSWKEE----EEEDEGSME
            240       250         260       270           280      

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB9 ESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGIGTPAAGPGEERV
         .::.  :  :: .   . :    .:.:   .:  : :      :  :   :: :..  
XP_011 SLTSSEGEE--PGSEVVIKMPMVDPEAQAPTKQPPRSSPNTVKRPTKKGRDRAGKGQKPR
        290         300       310       320       330       340    

           360       370       380       390       400         410 
pF1KB9 GAAK-ASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTLTAVGCS--VPRTLFKFF
       :  . :.:      .::. . .:.... .:.. : :. . ..:... :.  ::.::... 
XP_011 GKEQLAKRKTFSLVKEKKAARTLSAILLAFILTWTPYNI-MVLVSTFCKDCVPETLWELG
          350       360       370       380        390       400   

             420       430       440        450                 
pF1KB9 FWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKIL-CRGDRKRIV                 
       .:. : ::..::. :.. :. :: .:. .: :: :..:                   
XP_011 YWLCYVNSTINPMCYALCNKAFRDTFRLLLLCRWDKRRWRKIPKRPGSVHRTPSRQC
           410       420       430       440       450       460

>>NP_000729 (OMIM: 118510) muscarinic acetylcholine rece  (460 aa)
 initn: 384 init1: 384 opt: 595  Z-score: 325.1  bits: 69.4 E(85289): 2.3e-11
Smith-Waterman score: 595; 29.7% identity (59.4% similar) in 441 aa overlap (18-448:17-441)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGNVLVIIAVFT
                        ::: :    :.  ::..  .  .::: : :: ::.::.:.  .
NP_000  MNTSAPPAVSPNITVLAPGKG----PW--QVAFIGIT-TGLLSLATVTGNLLVLISFKV
                10        20              30         40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 SRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLALDVLFCTSS
       .  ::. .: ::.::: ::....:. . .  .  .::.: .:   :...:::: .  ..:
NP_000 NTELKTVNNYFLLSLACADLIIGTFSMNLYTTYLLMGHWALGTLACDLWLALDYVASNAS
             60        70        80        90       100       110  

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 IVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVISFPPLISIEKKGGGGG
       ...:  ::.:::.:.:. . :  ::::::   .:  .:..: :.  : ..  .   :   
NP_000 VMNLLLISFDRYFSVTRPLSYRAKRTPRRAALMIGLAWLVSFVLWAPAILFWQYLVGERT
            120       130       140       150       160       170  

              190       200       210       220       230          
pF1KB9 PQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVPPSRRG---PD
          ..   .. .:   .... ...:. :  .:  .: :::. .. :.:   . .:   : 
NP_000 VLAGQCYIQFLSQPIITFGTAMAAFYLPVTVMCTLYWRIYRETENRARELAALQGSETPG
            180       190       200       210       220       230  

       240        250        260        270       280       290    
pF1KB9 AVAAPPGGTER-RPNGLG-PERSAGPGGA-EAEPLPTQLNGAPGEPAPAGPRDTDALDLE
         ..  ...:: .:.. : ::  . ::   .    :  :..   .      .. :  ..:
NP_000 KGGGSSSSSERSQPGAEGSPE--TPPGRCCRCCRAPRLLQAYSWKEE----EEEDEGSME
            240       250         260       270           280      

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB9 ESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGIGTPAAGPGEERV
         .::.  :  :: .   . :    .:.:   .:  : :      :  :   :: :..  
NP_000 SLTSSEGEE--PGSEVVIKMPMVDPEAQAPTKQPPRSSPNTVKRPTKKGRDRAGKGQKPR
        290         300       310       320       330       340    

           360       370       380       390       400         410 
pF1KB9 GAAK-ASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTLTAVGCS--VPRTLFKFF
       :  . :.:      .::. . .:.... .:.. : :. . ..:... :.  ::.::... 
NP_000 GKEQLAKRKTFSLVKEKKAARTLSAILLAFILTWTPYNI-MVLVSTFCKDCVPETLWELG
          350       360       370       380        390       400   

             420       430       440        450                 
pF1KB9 FWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKIL-CRGDRKRIV                 
       .:. : ::..::. :.. :. :: .:. .: :: :..:                   
NP_000 YWLCYVNSTINPMCYALCNKAFRDTFRLLLLCRWDKRRWRKIPKRPGSVHRTPSRQC
           410       420       430       440       450       460

>>NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamine re  (422 aa)
 initn: 659 init1: 425 opt: 550  Z-score: 302.9  bits: 65.2 E(85289): 3.9e-10
Smith-Waterman score: 753; 34.1% identity (59.2% similar) in 461 aa overlap (1-447:1-422)

               10           20           30        40        50    
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAP---GG---GARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGNVLV
       :  :.:  :: . ..  ::   ::   :   .  : ::  .:  : : :.. .:.::. :
NP_000 MDVLSPGQGNNT-TSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSL--LLGTLIFCAVLGNACV
               10         20        30        40          50       

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB9 IIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLALDV
       . :.   :.:.   : .. ::: .:..:..::.:..   .:.. : .:.. :....::::
NP_000 VAAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDV
        60        70        80        90       100       110       

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB9 LFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVISFPPLISIEK
       : :::::.:::::.:::::.::. :.:  ::::::  :.:  .:.:. .::.::... . 
NP_000 LCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRT
       120       130       140       150       160       170       

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB9 KGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVPPSRR
           . :.     : :. .. :.: : .:.:. : :.:...: ::.. :. : :      
NP_000 PEDRSDPDA----CTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIR------
       180           190       200       210       220             

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB9 GPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAPAGPRDTDALDLE
                  : .. .  : .   :     : : :   ... ::   .: :.   : .:
NP_000 ----------KTVKKVEKTGADTRHG-----ASPAPQPKKSVNGE---SGSRNWR-LGVE
                 230       240            250          260         

          300       310       320       330          340       350 
pF1KB9 ESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDS---LPRRGPGATGIGTPAAGPGE
         :..  :    :  :  .:  : .       . :.:   ::   :. .:  :: :  . 
NP_000 --SKAGGALCANGAVR--QGDDGAALEVIEVHRVGNSKEHLPL--PSEAG-PTPCAPASF
        270       280         290       300         310        320 

              360       370       380       390          400       
pF1KB9 ERVGAAKA-SRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFF---FTYTLTAVGCSVPRTL
       :: .  .: .. .    ::.. . .:....:.:..::.:::   ..  .   .: .:  :
NP_000 ERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLL
             330       340       350       360       370       380 

       410       420       430       440        450
pF1KB9 FKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKIL-CRGDRKRIV
         .. :.:: :: ::::::. ::.::. :::::. :.  :.   
NP_000 GAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ   
             390       400       410       420     

>>XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B adrene  (328 aa)
 initn: 601 init1: 400 opt: 539  Z-score: 298.6  bits: 64.0 E(85289): 6.8e-10
Smith-Waterman score: 539; 36.4% identity (70.0% similar) in 220 aa overlap (10-228:22-235)

                           10        20        30        40        
pF1KB9             MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTV
                            ::...: .  ....     ..  ....  . : ..:...
XP_005 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFILFAI
               10        20        30        40        50        60

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB9 FGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEI
        ::.:::..:  .: :..: : :.:.:: ::.:..  :.::: : ::.::: .:. .:.:
XP_005 VGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFCDI
               70        80        90       100       110       120

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB9 YLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVISFPP
       . :.::: ::.::. :::::.::: ..  ...:    : :.    ...:::.:.:::. :
XP_005 WAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISIGP
              130       140       150       160       170       180

      170       180        190       200       210       220       
pF1KB9 LISIEKKGGGGGPQPAEPR-CEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRT
       :.      :   : : . . : .... .:.. : .:::. :  .....: :.: .::: :
XP_005 LL------GWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTT
                    190       200       210       220       230    

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB9 RVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAPAGPRD
       .                                                           
XP_005 KNLEAGVMKEMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAK
          240       250       260       270       280       290    

>>XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B adrene  (331 aa)
 initn: 601 init1: 400 opt: 539  Z-score: 298.5  bits: 64.0 E(85289): 6.9e-10
Smith-Waterman score: 539; 36.4% identity (70.0% similar) in 220 aa overlap (10-228:22-235)

                           10        20        30        40        
pF1KB9             MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTV
                            ::...: .  ....     ..  ....  . : ..:...
XP_006 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFILFAI
               10        20        30        40        50        60

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB9 FGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEI
        ::.:::..:  .: :..: : :.:.:: ::.:..  :.::: : ::.::: .:. .:.:
XP_006 VGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFCDI
               70        80        90       100       110       120

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB9 YLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVISFPP
       . :.::: ::.::. :::::.::: ..  ...:    : :.    ...:::.:.:::. :
XP_006 WAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISIGP
              130       140       150       160       170       180

      170       180        190       200       210       220       
pF1KB9 LISIEKKGGGGGPQPAEPR-CEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRT
       :.      :   : : . . : .... .:.. : .:::. :  .....: :.: .::: :
XP_006 LL------GWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTT
                    190       200       210       220       230    

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB9 RVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAPAGPRD
       .                                                           
XP_006 KNLEAGVMKEMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAK
          240       250       260       270       280       290    




450 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 19:52:56 2016 done: Fri Nov  4 19:52:57 2016
 Total Scan time: 10.720 Total Display time:  0.070

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com