seq1 = pF1KB9856.tfa, 1170 bp
seq2 = pF1KB9856/gi568815592r_77362234.tfa (gi568815592r:77362234_77563403), 201170 bp

>pF1KB9856 1170
>gi568815592r:77362234_77563403 (Chr6)

(complement)

1-1170  (100001-101170)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAACCGGGTGCTCAGTGCGCTCCACCGCCGCCCGCGGGCTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAACCGGGTGCTCAGTGCGCTCCACCGCCGCCCGCGGGCTCCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCTGGGTTCCTCAAGCCAACTTATCCTCTGCTCCCTCCCAAAACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCTGGGTTCCTCAAGCCAACTTATCCTCTGCTCCCTCCCAAAACTGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGCCAAGGACTACATTTACCAGGACTCCATCTCCCTACCCTGGAAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGCCAAGGACTACATTTACCAGGACTCCATCTCCCTACCCTGGAAAGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCTGGTTATGCTATTGGCGCTCATCACCTTGGCCACCACGCTCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCTGGTTATGCTATTGGCGCTCATCACCTTGGCCACCACGCTCTCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCCTTTGTGATTGCCACAGTGTACCGGACCCGGAAACTGCACACCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCCTTTGTGATTGCCACAGTGTACCGGACCCGGAAACTGCACACCCCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTAACTACCTGATCGCCTCTCTGGCGGTCACCGACCTGCTTGTGTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTAACTACCTGATCGCCTCTCTGGCGGTCACCGACCTGCTTGTGTCCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGTGATGCCCATCAGCACCATGTACACTGTCACCGGCCGCTGGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGTGATGCCCATCAGCACCATGTACACTGTCACCGGCCGCTGGACACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGCCAGGTGGTCTGTGACTTCTGGCTGTCGTCGGACATCACTTGTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGCCAGGTGGTCTGTGACTTCTGGCTGTCGTCGGACATCACTTGTTGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTGCCTCCATCCTGCACCTCTGTGTCATCGCCCTGGACCGCTACTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTGCCTCCATCCTGCACCTCTGTGTCATCGCCCTGGACCGCTACTGGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCACGGACGCCGTGGAGTACTCAGCTAAAAGGACTCCCAAGAGGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCACGGACGCCGTGGAGTACTCAGCTAAAAGGACTCCCAAGAGGGCGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGTCATGATCGCGCTGGTGTGGGTCTTCTCCATCTCTATCTCGCTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGTCATGATCGCGCTGGTGTGGGTCTTCTCCATCTCTATCTCGCTGCCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTTCTTCTGGCGTCAGGCTAAGGCCGAAGAGGAGGTGTCGGAATGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCTTCTTCTGGCGTCAGGCTAAGGCCGAAGAGGAGGTGTCGGAATGCGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGAACACCGACCACATCCTCTACACGGTCTACTCCACGGTGGGTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGAACACCGACCACATCCTCTACACGGTCTACTCCACGGTGGGTGCTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACTTCCCCACCCTGCTCCTCATCGCCCTCTATGGCCGCATCTACGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACTTCCCCACCCTGCTCCTCATCGCCCTCTATGGCCGCATCTACGTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAGCCCGCTCCCGGATTTTGAAACAGACGCCCAACAGGACCGGCAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAGCCCGCTCCCGGATTTTGAAACAGACGCCCAACAGGACCGGCAAGCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTGACCCGAGCCCAGCTGATAACCGACTCCCCCGGGTCCACGTCCTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTGACCCGAGCCCAGCTGATAACCGACTCCCCCGGGTCCACGTCCTCGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CACCTCTATTAACTCGCGGGTTCCCGACGTGCCCAGCGAATCCGGATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CACCTCTATTAACTCGCGGGTTCCCGACGTGCCCAGCGAATCCGGATCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGTGTATGTGAACCAAGTCAAAGTGCGAGTCTCCGACGCCCTGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGTGTATGTGAACCAAGTCAAAGTGCGAGTCTCCGACGCCCTGCTGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAGAAGAAACTCATGGCCGCTAGGGAGCGCAAAGCCACCAAGACCCTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGAAGAAACTCATGGCCGCTAGGGAGCGCAAAGCCACCAAGACCCTAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GATCATTTTGGGAGCCTTTATTGTGTGTTGGCTACCCTTCTTCATCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GATCATTTTGGGAGCCTTTATTGTGTGTTGGCTACCCTTCTTCATCATCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCCTAGTGATGCCTATCTGCAAAGATGCCTGCTGGTTCCACCTAGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCCTAGTGATGCCTATCTGCAAAGATGCCTGCTGGTTCCACCTAGCCATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTTGACTTCTTCACATGGCTGGGCTATCTCAACTCCCTCATCAACCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTTGACTTCTTCACATGGCTGGGCTATCTCAACTCCCTCATCAACCCCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AATCTATACCATGTCCAATGAGGACTTTAAACAAGCATTCCATAAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AATCTATACCATGTCCAATGAGGACTTTAAACAAGCATTCCATAAACTGA

   1150     .    :    .    :
   1151 TACGTTTTAAGTGCACAAGT
        ||||||||||||||||||||
 101151 TACGTTTTAAGTGCACAAGT