Result of FASTA (ccds) for pF1KB9850
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9850, 377 aa
  1>>>pF1KB9850 377 - 377 aa - 377 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6488+/-0.00107; mu= 14.2368+/- 0.064
 mean_var=137.2202+/-53.499, 0's: 0 Z-trim(103.8): 282  B-trim: 983 in 2/45
 Lambda= 0.109488
 statistics sampled from 7067 (7589) to 7067 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.233), width:  16
 Scan time:  2.330

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1            ( 377) 2468 402.3 3.5e-112
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6           ( 390) 1561 259.1 4.8e-69
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3           ( 366) 1086 184.0 1.8e-46
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6           ( 365) 1074 182.1 6.6e-46
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3           ( 367)  666 117.7 1.7e-26
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5          ( 422)  659 116.7 3.9e-26
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10           ( 477)  639 113.6 3.8e-25
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX          ( 458)  623 111.0 2.1e-24
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2           ( 481)  566 102.0 1.1e-21
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4            ( 477)  553 100.0 4.7e-21
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10          ( 465)  539 97.8 2.1e-20
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4          ( 462)  535 97.1 3.3e-20
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 432)  523 95.2 1.2e-19
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 445)  523 95.2 1.2e-19
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 479)  523 95.3 1.2e-19
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7           ( 357)  502 91.8   1e-18
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2          ( 450)  497 91.1 2.1e-18
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 342)  489 89.7 4.2e-18
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 429)  489 89.8 4.8e-18
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 455)  489 89.9   5e-18
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 466)  489 89.9 5.1e-18
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 475)  489 89.9 5.1e-18
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5           ( 520)  485 89.3 8.4e-18
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20         ( 572)  479 88.4 1.7e-17
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8            ( 408)  471 86.9 3.4e-17
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5            ( 413)  460 85.2 1.1e-16
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11           ( 443)  437 81.6 1.5e-15
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11           ( 414)  433 81.0 2.2e-15
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5            ( 359)  432 80.7 2.2e-15
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5           ( 397)  432 80.8 2.4e-15
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1           ( 590)  427 80.2 5.2e-15
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7           ( 466)  424 79.6 6.2e-15
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11         ( 479)  420 79.0 9.8e-15
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15         ( 532)  418 78.7 1.3e-14
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11          ( 460)  405 76.6   5e-14
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5            ( 446)  400 75.8 8.4e-14
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3            ( 487)  398 75.5 1.1e-13
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6         ( 345)  395 74.9 1.2e-13
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6         ( 339)  379 72.3 7.1e-13
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6          ( 342)  370 70.9 1.9e-12
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13          ( 471)  369 70.9 2.6e-12
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6        ( 348)  360 69.3 5.8e-12
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6           ( 337)  344 66.8 3.3e-11
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1             ( 440)  342 66.6 4.8e-11


>>CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1                 (377 aa)
 initn: 2468 init1: 2468 opt: 2468  Z-score: 2127.5  bits: 402.3 E(32554): 3.5e-112
Smith-Waterman score: 2468; 100.0% identity (100.0% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-377)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 TTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 TTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDIT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 CCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 CCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 AQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 AQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRFT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 TAHLITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSALERKRISAARERKAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 TAHLITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSALERKRISAARERKAT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 KILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 KILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFN
              310       320       330       340       350       360

              370       
pF1KB9 EEFRQAFQKIVPFRKAS
       :::::::::::::::::
CCDS23 EEFRQAFQKIVPFRKAS
              370       

>>CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6                (390 aa)
 initn: 1535 init1: 931 opt: 1561  Z-score: 1353.0  bits: 259.1 E(32554): 4.8e-69
Smith-Waterman score: 1561; 62.4% identity (83.4% similar) in 380 aa overlap (3-377:12-390)

                        10          20        30        40         
pF1KB9          MSPLNQSAEGLPQE--ASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVIT
                  :   :   .::   .:  : : .  .  ..       :. :...:..::
CCDS49 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB9 LATVLSNAFVLTTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQI
       :::.::::::..:.  ::::::::::::.:::.:::::::::::::  ::.:  :..::.
CCDS49 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB9 LCDIWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICI
       .::.::::::::::::::::::::::::::::::.::: .::  .::.:::.::..:: :
CCDS49 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB9 SIPPLFWRQAKAQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRIL
       :.::.:::::::.::.:.:.:::..: ::.::: ::::.:..::: ::::::  ::.:::
CCDS49 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
              190       200       210       220       230       240

     230        240       250         260       270       280      
pF1KB9 NP-PSLYGKRFTTAHLITGSAGS--SLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSAL
       .  :.  :::.: :.::: : ::  :. :.:: . .  :.: :::.. :.::....:. :
CCDS49 KQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSES-GSPVYVNQVKVRVSDALL
              250       260       270       280        290         

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB9 ERKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGY
       :.:.. ::::::::: :::::::::.::::::..:::.:::.:.::.: :.:::::::::
CCDS49 EKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGY
     300       310       320       330       340       350         

        350       360       370       
pF1KB9 LNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
       :::::::::::. ::.:.:::.:.. :. .:
CCDS49 LNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
     360       370       380       390

>>CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3                (366 aa)
 initn: 1050 init1: 591 opt: 1086  Z-score: 947.8  bits: 184.0 E(32554): 1.8e-46
Smith-Waterman score: 1086; 50.4% identity (77.4% similar) in 345 aa overlap (38-374:23-365)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB9 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
                                     :: ....:: ..: :.  :..:...:..::
CCDS29         MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
                       10        20        30        40        50  

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB9 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
       ::: :::::: :::.::.::..::::.::.: . ..: .::..:::::: :::::: :::
CCDS29 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
             60        70        80        90       100       110  

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB9 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAKAQEEMSD
       :: .:::::: :::::.::...::  ::. ::.::: ::. ::.::::::.  .... ..
CCDS29 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRD-DE
            120       130       140       150       160        170 

       190       200       210       220       230        240      
pF1KB9 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILN-PPSLYGKRFTTAHLIT
       :... ..:  ::::: :::::: .:..::: .:::::..   .   :  .:. ...... 
CCDS29 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
             180       190       200       210       220       230 

        250       260       270        280             290         
pF1KB9 GSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFN-HVKIKLADSALE------RKRISAARERKA
        :. .:  :...:    .: :  :  : . :  ..   : ..      :..::..:::::
CCDS29 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
             240       250       260       270       280       290 

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB9 TKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVF
       .  ::.:::::.::::::::  ::. .: :.: :   . .:..:::::::::::.:::.:
CCDS29 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIF
             300       310        320       330       340       350

     360       370       
pF1KB9 NEEFRQAFQKIVPFRKAS
       ::.:..::::.:  :   
CCDS29 NEDFKKAFQKLVRCRC  
              360        

>>CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6                (365 aa)
 initn: 1056 init1: 591 opt: 1074  Z-score: 937.6  bits: 182.1 E(32554): 6.6e-46
Smith-Waterman score: 1074; 49.0% identity (72.8% similar) in 367 aa overlap (23-375:8-363)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVL
                             ::.: :  :.:.   :. . ..: :::  :.: :  :.
CCDS50                MNITNCTTEASMAIRPKTITE-KMLICMTLVVITTLTTLLNLAVI
                              10        20         30        40    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 TTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDIT
        .:  :.::: :::::: :::.:::::..::::.:: : .   :..: .::..::: :.:
CCDS50 MAIGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMT
           50        60        70        80        90       100    

              130       140       150       160       170          
pF1KB9 CCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWR-QA
       ::: :::::::::::::::::.:.::...::: .:: ::  ::.::: ::.:::::: . 
CCDS50 CCTCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHR
          110       120       130       140       150       160    

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB9 KAQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRF
       . .   :.: .. ... :::::: :::::: .:..::: :::.::.       ::: :: 
CCDS50 RLSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAK-------SLYQKRG
          170       180       190       200       210              

     240       250           260       270            280          
pF1KB9 TTAHLITGSAGS----SLCSLNSSLHEGHSHSAGSPL-----FFNHVKIKLADSAL----
       .. :: . :. :    . :.:....  . . :...:      :   ..:   :. :    
CCDS50 SSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQTFCVS-DFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG
       220       230       240        250       260       270      

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB9 ERKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGY
       ::..::..:::::..:::.::::::. :::::.  :.. .   .  .   . ::.:::::
CCDS50 ERQQISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYT--VSSEVADFLTWLGY
        280       290       300       310       320         330    

        350       360       370       
pF1KB9 LNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
       .::::::..:: :::.:. ::.:..  :.  
CCDS50 VNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
          340       350       360     

>>CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3                (367 aa)
 initn: 629 init1: 178 opt: 666  Z-score: 589.3  bits: 117.7 E(32554): 1.7e-26
Smith-Waterman score: 666; 35.7% identity (65.8% similar) in 339 aa overlap (42-371:33-365)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB9 PQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTRKLHT
                                     :.   .. :: :..:..:  ..:  : :.:
CCDS33 SLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERALQT
             10        20        30        40        50        60  

              80        90       100        110       120       130
pF1KB9 PANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITH-TWNFGQILCDIWLSSDITCCTASILHLC
        .:::. :::..::::. ::::  .   .:  .:::..: ::.... :.  ::::::.::
CCDS33 TTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILNLC
             70        80        90       100       110       120  

              140          150       160       170       180       
pF1KB9 VIALDRYWAITDALEYSK---RRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAKAQEEMSD
       .:..::: :..  ..:..   . .  ..: ::. ::.... .: : ::  .. ..  .  
CCDS33 AISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTV--
            130       140       150       160       170       180  

       190       200       210       220           230       240   
pF1KB9 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIY----RAARNRILNPPSLYGKRFTTAH
       : .  :. ...:::.  .::.:  . ...:.:::    .  :.:::.  .   .    . 
CCDS33 CSI--SNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVRPGF
                190       200       210       220       230        

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB9 -LITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSALERKRISAARERKATKI
          : :   .   :.      .. . :.: : ..   .:      :. .   ::.:::..
CCDS33 PQQTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGF-QERGGELKREEKTRNSLMPLREKKATQM
      240       250       260        270       280       290       

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB9 LGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFNEE
       ..:.:::::.::::::.. ..   :. .: . : :..  :::::.:: .::.:::.:: :
CCDS33 VAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQ-TCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIE
       300       310       320        330       340       350      

            370       
pF1KB9 FRQAFQKIVPFRKAS
       ::.:: ::.      
CCDS33 FRKAFLKILSC    
        360           

>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5               (422 aa)
 initn: 968 init1: 637 opt: 659  Z-score: 582.6  bits: 116.7 E(32554): 3.9e-26
Smith-Waterman score: 919; 40.6% identity (70.1% similar) in 374 aa overlap (38-363:36-407)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB9 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
                                     ..  ...:... . .::.:: :...: : :
CCDS34 PGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALER
          10        20        30        40        50        60     

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB9 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
       .:.. :::::::::.:::.::.::.:..  : . . :..::. ::.... :. :::.:::
CCDS34 SLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSIL
          70        80        90       100       110       120     

       130       140       150       160       170        180      
pF1KB9 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLF-WRQAKAQEEMS
       :::.::::::::::: ..: ..::  .::..:...: :.. :::::.. ::  . . . .
CCDS34 HLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPEDRSDPD
         130       140       150       160       170       180     

        190       200       210       220       230                
pF1KB9 DCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNP---------------
        : .. .. .:::::: :::::: .:...:::::.:::: :: .                
CCDS34 ACTISKDH-GYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADTRHGA
         190        200       210       220       230       240    

              240               250       260                270   
pF1KB9 -PSLYGKRFTTAHL--------ITGSAGSSLCSLNSSLHEGHS---------HSAGS---
        :.   :. ....         . ..::..::. :.....: .         : .:.   
CCDS34 SPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCA-NGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGNSKE
          250       260       270        280       290       300   

                280                290       300       310         
pF1KB9 --PLFFNHVKIKLADSALERK---------RISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFV
         ::  .      : ...:::         ... :::::..: ::::.:.::.::::::.
CCDS34 HLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPFFI
           310       320       330       340       350       360   

     320       330       340       350       360       370        
pF1KB9 VSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS 
       :.::::.:..:: .   :  ...:::: :::.::.::. ::..:               
CCDS34 VALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
           370       380       390       400       410       420  

>>CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10                (477 aa)
 initn: 528 init1: 313 opt: 639  Z-score: 565.0  bits: 113.6 E(32554): 3.8e-25
Smith-Waterman score: 639; 34.6% identity (65.7% similar) in 356 aa overlap (26-371:47-391)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB9      MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLS
                                     ::. .: . :    ........:.:  : .
CCDS75 SSAAPLPDGAATAARLLVPASPPASLLPPASESPEPLS-QQWTAGMGLLMALIVLLIVAG
         20        30        40        50         60        70     

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB9 NAFVLTTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWL
       :..:...:  : .:.: .: .: :::..::....::.:.. . ..   :..:...:..: 
CCDS75 NVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIVVWGRWEYGSFFCELWT
          80        90       100       110       120       130     

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB9 SSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLF
       : :. : ::::  ::::::::: :::. ..:..  : ..:  ..  :::::  .:. :..
CCDS75 SVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLVCTVWAISALVSFLPIL
         140       150       160       170       180       190     

           180            190       200       210       220        
pF1KB9 --WRQAKAQEE---MSD--CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRI
         : .:...:    ..:  :   ... .:.: :.  .::.:  .. ..: :..: :....
CCDS75 MHWWRAESDEARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCIMAFVYLRVFREAQKQV
         200       210       220       230       240       250     

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB9 LNPPSLYGKRFTTAHLITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADS-ALE
        .  :   .::  .     : . :     .    :  . :..      .   ::.. : .
CCDS75 KKIDSCE-RRFLGGPARPPSPSPSPVPAPAP-PPGPPRPAAAA-----ATAPLANGRAGK
         260        270       280        290            300        

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB9 RK--RISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLG
       :.  :. : ::.:: : ::::.:.: .::::::....:  . :.   .   :: ::.:::
CCDS75 RRPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRE--LVPDRLFVFFNWLG
      310       320       330       340       350         360      

         350       360       370                                   
pF1KB9 YLNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS                            
       : :: .:::::   . .::.::: ..                                  
CCDS75 YANSAFNPIIYCR-SPDFRKAFQGLLCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGPPPSPG
        370        380       390       400       410       420     

>>CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX               (458 aa)
 initn: 562 init1: 228 opt: 623  Z-score: 551.5  bits: 111.0 E(32554): 2.1e-24
Smith-Waterman score: 623; 33.0% identity (64.3% similar) in 333 aa overlap (42-367:57-379)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB9 PQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTRKLHT
                                     :. . .: . :. .: .:. .. . .:::.
CCDS14 VSPVAAIVTDIFNTSDGGRFKFPDGVQNWPALSIVIIIIMTIGGNILVIMAVSMEKKLHN
         30        40        50        60        70        80      

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pF1KB9 PANYLIGSLATTDLLVSILVMPISI-AYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASILHLC
        .::.. ::: .:.::..::::.:. :    ..: . . :: .:.: :.   ::::.:::
CCDS14 ATNYFLMSLAIADMLVGLLVMPLSLLAILYDYVWPLPRYLCPVWISLDVLFSTASIMHLC
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CCDS14 AISLDRYVAIRNPIEHSRFNSRTKAIMKIAIVWAISIGVSVPIPVIGLRDEEKVFVNNTT
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pF1KB9 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRFTTAHLITG
       :..:    .... ..  ::.:: ....: :     . : . :    :.:.      :   
CCDS14 CVLNDP--NFVLIGSFVAFFIPLTIMVITYCLTIYVLRRQALM--LLHGHTEEPPGLSLD
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           . :. :.. .:    ....:   .... .       :  ..:   ::::.:.:::.
CCDS14 FL--KCCKRNTAEEE----NSANPNQDQNARRRKKKERRPRGTMQAINNERKASKVLGIV
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pF1KB9 LGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSC--WIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFNEEFR
       . .:.: : :::.....  .:. ::   .   :.. :.:.::. : :::..::.::. .:
CCDS14 FFVFLIMWCPFFITNILSVLCEKSCNQKLMEKLLNVFVWIGYVCSGINPLVYTLFNKIYR
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pF1KB9 QAFQKIVPFRKAS                                               
       .::                                                         
CCDS14 RAFSNYLRCNYKVEKKPPVRQIPRVAATALSGRELNVNIYRHTNEPVIEKASDNEPGIEM
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>>CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2                (481 aa)
 initn: 437 init1: 187 opt: 566  Z-score: 502.6  bits: 102.0 E(32554): 1.1e-21
Smith-Waterman score: 566; 27.7% identity (65.5% similar) in 339 aa overlap (42-371:58-395)

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                                     :... .. . :. .:..:. .. : .::. 
CCDS24 SSNWSGLQTESIPEEMKQIVEEQGNKLHWAALLILMVIIPTIGGNTLVILAVSLEKKLQY
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pF1KB9 PANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHT-WNFGQILCDIWLSSDITCCTASILHLC
        .::.. :::..::::...::::..   . .. : .  .::  ::  :.   ::::.:::
CCDS24 ATNYFLMSLAVADLLVGLFVMPIALLTIMFEAMWPLPLVLCPAWLFLDVLFSTASIMHLC
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pF1KB9 VIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIP-PLFWRQAKAQEEMS-DC
       .:..::: ::   .. ..  . . :   :..:: ::: :.:: :.   .. ...  .  :
CCDS24 AISVDRYIAIKKPIQANQYNSRATAFIKITVVWLISIGIAIPVPIKGIETDVDNPNNITC
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pF1KB9 LVNTSQIS-YTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNR---ILNPPSLYGKRFTTAHL
       ...  ... . .... .::. : ...:. :    .: ...   . : :      .:.. .
CCDS24 VLTKERFGDFMLFGSLAAFFTPLAIMIVTYFLTIHALQKKAYLVKNKPPQRLTWLTVSTV
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pF1KB9 ITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSALERKRISAARERKATKILG
       .  .        . .. .:  .. . :   ... .. ...  ...  . . :..:.:.::
CCDS24 FQRDETPCSSPEKVAMLDGSRKDKALPNSGDETLMRRTSTIGKKSVQTISNEQRASKVLG
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pF1KB9 IILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSC--WIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFNEE
       :..  :.. : :::.....: .: :::       :...:.:.::..: .::..::.::. 
CCDS24 IVFFLFLLMWCPFFITNITLVLC-DSCNQTTLQMLLEIFVWIGYVSSGVNPLVYTLFNKT
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pF1KB9 FRQAFQKIVPFRKAS                                             
       ::.:: . .                                                   
CCDS24 FRDAFGRYITCNYRATKSVKTLRKRSSKIYFRNPMAENSKFFKKHGIRNGINPAMYQSPM
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>>CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4                 (477 aa)
 initn: 608 init1: 239 opt: 553  Z-score: 491.5  bits: 100.0 E(32554): 4.7e-21
Smith-Waterman score: 597; 31.7% identity (59.8% similar) in 410 aa overlap (1-371:1-373)

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pF1KB9 MSPLNQSAEGLP-QEASNRSL---NATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSN
       : : .... . : : :  ..:   ::.  : .  :  :   ..  : .:... . :.:.:
CCDS34 MLPPGSNGTAYPGQFALYQQLAQGNAVGGSAGAPP--LGPSQVVTACLLTLLIIWTLLGN
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pF1KB9 AFVLTTILLTRKLHTP-ANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWL
       ..: ..:. .:.:..  .: .: :::..::.:..:::: . .  ..  : ::  .::.:.
CCDS34 VLVCAAIVRSRHLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGYWPFGA-FCDVWV
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pF1KB9 SSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPP--
       . :: : :::::.::::..::::::.  ..:... :   : .:....:..:: ::. :  
CCDS34 AFDIMCSTASILNLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMVGLAWTLSILISFIPVQ
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pF1KB9 LFWRQAKAQE----EMSDCLVN------------------TSQI--SYTIYSTCGAFYIP
       : :.. .:      .. . :.:                   :..  .:.: :.  .::::
CCDS34 LNWHRDQAASWGGLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNRTYAISSSLISFYIP
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pF1KB9 SVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRFTTAHLITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAG
        ...:. : :::: :. .:        .:... .  .  : :  :         .: .: 
CCDS34 VAIMIVTYTRIYRIAQVQI--------RRISSLERAAEHAQS--C---------RSSAAC
       240       250               260       270                   

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       .:           :..:   : :  .: :. : :..:.:.:. ::::::... ..:.:  
CCDS34 AP-----------DTSL---RASIKKETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCMVPFCSG
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pF1KB9 SCWIHPA--------LFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS    
            ::         :: :.:.:. :: .::.::. :: .:...: ...          
CCDS34 HPEGPPAGFPCVSETTFDVFVWFGWANSSLNPVIYA-FNADFQKVFAQLLGCSHFCSRTP
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CCDS34 VETVNISNELISYNQDIVFHKEIAAAYIHMMPNAVTPGNREVDNDEEEGPFDRMFQIYQT
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377 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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