Result of FASTA (ccds) for pF1KB9826
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9826, 321 aa
  1>>>pF1KB9826 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4701+/-0.000947; mu= -5.2389+/- 0.058
 mean_var=293.3796+/-58.939, 0's: 0 Z-trim(115.7): 46  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.074879
 statistics sampled from 16235 (16281) to 16235 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.792), E-opt: 0.2 (0.5), width:  16
 Scan time:  2.860

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15           ( 321) 2164 246.3 2.4e-65
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX        ( 606)  650 82.9 6.8e-16
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15       ( 304)  631 80.7 1.6e-15
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3         ( 307)  615 78.9 5.5e-15
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX            ( 309)  615 78.9 5.5e-15
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX            ( 706)  615 79.2 1.1e-14
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX            (1034)  615 79.3 1.4e-14
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX            (1431)  615 79.4 1.8e-14
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX         ( 778)  602 77.8   3e-14
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX         ( 834)  602 77.9 3.2e-14
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX       ( 739)  541 71.2 2.8e-12
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX       ( 739)  541 71.2 2.8e-12
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX       ( 741)  541 71.2 2.8e-12
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15       (1249)  546 71.9 2.9e-12
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX         ( 346)  532 70.0   3e-12
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX            ( 962)  523 69.4 1.3e-11
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX        ( 957)  518 68.8 1.9e-11
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX         ( 347)  505 67.1 2.3e-11
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX         ( 319)  491 65.6 6.1e-11
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX      ( 336)  489 65.4 7.4e-11
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX      ( 343)  489 65.4 7.5e-11


>>CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15                (321 aa)
 initn: 2164 init1: 2164 opt: 2164  Z-score: 1286.6  bits: 246.3 E(32554): 2.4e-65
Smith-Waterman score: 2164; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSEQSKDLSDPNFAAEAPNSEVHSSPGVSEGVPPSATLAEPQSPPLGPTAAPQAAPPPQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSEQSKDLSDPNFAAEAPNSEVHSSPGVSEGVPPSATLAEPQSPPLGPTAAPQAAPPPQA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 PNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPAQLVQKAHELMWYVLVKDQKKMIIW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPAQLVQKAHELMWYVLVKDQKKMIIW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 FPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDRVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDRVA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 LSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEEFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEEFV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 QMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREALEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREALEE
              250       260       270       280       290       300

              310       320 
pF1KB9 ARALREANPTAHYPRSSVSED
       :::::::::::::::::::::
CCDS10 ARALREANPTAHYPRSSVSED
              310       320 

>>CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX             (606 aa)
 initn: 722 init1: 630 opt: 650  Z-score: 398.8  bits: 82.9 E(32554): 6.8e-16
Smith-Waterman score: 650; 42.1% identity (69.6% similar) in 247 aa overlap (67-311:248-493)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB9 TLAEPQSPPLGPTAAPQAAPPPQAPNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPA
                                     ::: .  :.. :: .  :. .:   ::  .
CCDS14 SRGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARR-RAAKLQSSQEPEAPPPRDV
       220       230       240       250        260       270      

        100        110       120       130       140       150     
pF1KB9 QLVQ-KAHELMWYVLVKDQKKMIIWFPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHL
        :.: .:..:. :.:.::: :. :   ::.::.:  :      :..:..  : .:::..:
CCDS14 ALLQGRANDLVKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYSLEKVFGIQL
        280       290       300       310       320       330      

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB9 RLTSLHTMEFALVKALEPEELDRVALSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLR
       .  . .   . :...::: .   .. ..  :  :::...::.:...:  . :...:.:::
CCDS14 KEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSSEAVIWEVLR
        340       350       360       370       380       390      

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB9 ILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEEFVQMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQI
        :::::  .:: ::::.::::.:::...:: : :::  .::::::::: :.  : .::..
CCDS14 KLGLRPGIHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRSYYETSKMKV
        400       410       420       430       440       450      

         280       290        300       310       320              
pF1KB9 MEFLARVFKKDPQAWPSRYREALE-EARALREANPTAHYPRSSVSED             
       ..:  .: ::::. : ..::::.: . .:  ::   :                       
CCDS14 LKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGLGSENAAGPC
        460       470       480       490       500       510      

CCDS14 NWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQESGSASTGASTSTNNSASASASTSGGFSAGASLT
        520       530       540       550       560       570      

>>CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15            (304 aa)
 initn: 633 init1: 430 opt: 631  Z-score: 391.9  bits: 80.7 E(32554): 1.6e-15
Smith-Waterman score: 631; 39.9% identity (68.1% similar) in 263 aa overlap (59-316:46-304)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KB9 SEGVPPSATLAEPQSPPLGPTAAPQAAPPPQAPNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQP
                                     .::.    : . :  . .: . :.   :: 
CCDS10 ERDRDWSHSGNPGASRAGEDARVLRDGFAEEAPSTSRGPGGSQ--GSQGPSPQGARRAQA
          20        30        40        50          60        70   

       90         100       110       120       130       140      
pF1KB9 GPA--PPAPAQLVQKAHELMWYVLVKDQKKMIIWFPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLI
       .::  : .  ::  :. ::. ..:.:::::. :   :..: :::.::    ....:..  
CCDS10 APAVGPRSQKQLELKVSELVQFLLIKDQKKIPIKRADILKHVIGDYKDIFPDLFKRAAER
            80        90       100       110       120       130   

        150       160       170       180        190       200     
pF1KB9 LARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDRVALSNR-MPMTGLLLMILSLIYVKGRGA
       :  ::: .:     ..  . :...::: : :    ...  : ::::...:.::..::   
CCDS10 LQYVFGYKLVELEPKSNTYILINTLEPVEEDAEMRGDQGTPTTGLLMIVLGLIFMKGNTI
           140       150       160       170       180       190   

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB9 RESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEEFVQMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSR
       .:. .:. :: ::. : :::  ::: .:::::.::.. ::.:.:.:...: .::: :: :
CCDS10 KETEAWDFLRRLGVYPTKKHLIFGDPKKLITEDFVRQRYLEYRRIPHTDPVDYEFQWGPR
           200       210       220       230       240       250   

         270       280       290         300       310       320 
pF1KB9 ASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREAL--EEARALREANPTAHYPRSSVSED
       .. : .::....:.:.: ..::. ::..: :::  :: ::  . .:..  : :     
CCDS10 TNLETSKMKVLKFVAKVHNQDPKDWPAQYCEALADEENRA--RPQPSGPAPSS     
           260       270       280       290         300         

>>CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3              (307 aa)
 initn: 584 init1: 463 opt: 615  Z-score: 382.5  bits: 78.9 E(32554): 5.5e-15
Smith-Waterman score: 615; 40.3% identity (66.3% similar) in 288 aa overlap (29-311:7-292)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSEQSKDLSDPNFAAEAPNSEVHSSPGVSEGVPPSATLAEPQSPPLGPTAAPQAAPPPQA
                                   :.:.:   . .: ..   : : :: :.   . 
CCDS32                       MLQTPESRGLPVPQAEGEKDGGHDGETRAPTASQ--ER
                                     10        20        30        

               70        80          90       100       110        
pF1KB9 PNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSA--AQPGPAPPAPAQLVQKAHELMWYVLVKDQKKMI
       :..:      . ::: . ....  :  :.      :  .: . . ::. ..::::.::  
CCDS32 PKEELGAGREEGAAEPALTRKGARALAAKALARRRAYRRLNRTVAELVQFLLVKDKKKSP
         40        50        60        70        80        90      

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB9 IWFPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEP-EELD
       :   .::: :::. :    .:. :..  :  :::..:.  . .   . :.. :.: :: .
CCDS32 ITRSEMVKYVIGDLKILFPDIIARAAEHLRYVFGFELKQFDRKHHTYILINKLKPLEEEE
        100       110       120       130       140       150      

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB9 RVALSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITE
       .  :..  :  :::.:::.:::..: .:::. ::..:: ::..: : :  ::  ..:: :
CCDS32 EEDLGGDGPRLGLLMMILGLIYMRGNSAREAQVWEMLRRLGVQPSKYHFLFGYPKRLIME
        160       170       180       190       200       210      

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB9 EFVQMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREA
       .:::. ::.:.:::...:::::: :: :.. ::.::... :.:.. ::.:: :: .::::
CCDS32 DFVQQRYLSYRRVPHTNPPEYEFSWGPRSNLEISKMEVLGFVAKLHKKEPQHWPVQYREA
        220       230       240       250       260       270      

        300        310       320      
pF1KB9 L-EEA-RALREANPTAHYPRSSVSED     
       : .:: ::  .:   :               
CCDS32 LADEADRARAKARAEASMRARASARAGIHLW
        280       290       300       

>>CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX                 (309 aa)
 initn: 570 init1: 460 opt: 615  Z-score: 382.5  bits: 78.9 E(32554): 5.5e-15
Smith-Waterman score: 615; 44.5% identity (73.5% similar) in 211 aa overlap (90-299:38-247)

      60        70        80        90       100        110        
pF1KB9 APNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPAQLVQ-KAHELMWYVLVKDQKKMI
                                     ::::  . ..: .:..:. :.::::: :. 
CCDS59 GYRVPLFQSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIP
        10        20        30        40        50        60       

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       :   ::..:::  : ..   :..:.:  : ..: ..:.  . ..  . :... :      
CCDS59 IKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSA-GI
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>>CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX                 (706 aa)
 initn: 577 init1: 460 opt: 615  Z-score: 377.4  bits: 79.2 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 615; 44.5% identity (73.5% similar) in 211 aa overlap (90-299:435-644)

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       .. ..  :  :::..:::.:...:  : :...:.::: :::::  .:: ::.::::::.:
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>>CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX                 (1034 aa)
 initn: 551 init1: 460 opt: 615  Z-score: 375.1  bits: 79.3 E(32554): 1.4e-14
Smith-Waterman score: 615; 44.5% identity (73.5% similar) in 211 aa overlap (90-299:38-247)

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CCDS59 GYRVPLFQSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIP
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pF1KB9 IWFPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDR
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CCDS59 IKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSA-GI
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pF1KB9 VALSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEE
       .. ..  :  :::..:::.:...:  : :...:.::: :::::  .:: ::.::::::.:
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       ::...::.:.:::  .::::::::: :. .: .::....:  :: ::::. :  .::::.
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pF1KB9 EEARALREANPTAHYPRSSVSED                                     
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>>CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX                 (1431 aa)
 initn: 577 init1: 460 opt: 615  Z-score: 373.1  bits: 79.4 E(32554): 1.8e-14
Smith-Waterman score: 615; 44.5% identity (73.5% similar) in 211 aa overlap (90-299:435-644)

      60        70        80        90       100        110        
pF1KB9 APNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPAQLVQ-KAHELMWYVLVKDQKKMI
                                     ::::  . ..: .:..:. :.::::: :. 
CCDS43 TRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIP
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pF1KB9 IWFPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDR
       :   ::..:::  : ..   :..:.:  : ..: ..:.  . ..  . :... :      
CCDS43 IKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSA-GI
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pF1KB9 VALSNRMPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEE
       .. ..  :  :::..:::.:...:  : :...:.::: :::::  .:: ::.::::::.:
CCDS43 LGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDE
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pF1KB9 FVQMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREAL
       ::...::.:.:::  .::::::::: :. .: .::....:  :: ::::. :  .::::.
CCDS43 FVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAV
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pF1KB9 EEARALREANPTAHYPRSSVSED                                     
       :                                                           
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>>CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX              (778 aa)
 initn: 485 init1: 417 opt: 602  Z-score: 369.2  bits: 77.8 E(32554): 3e-14
Smith-Waterman score: 602; 37.1% identity (67.3% similar) in 272 aa overlap (32-301:412-673)

              10        20        30        40        50         60
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CCDS14 TPPGWQTPPGWQGPPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPL--PTDWPLPPDWIPADWPIPPDW
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pF1KB9 PNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPAQLVQKAHELMWYVLVKDQKKMIIW
        : . .:.   . . ..:: : :.::::  .    : : ..:..:. :...::  :. : 
CCDS14 QNLRPSPN--LRPSPNSRASQNPGAAQPRDV----ALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIK
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pF1KB9 FPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDRVA
         .:..:.:  :      :..:. ..: . ::..:.  . .   . :...  :: :  . 
CCDS14 RSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILIST--PESLAGIL
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pF1KB9 LSNR-MPMTGLLLMILSLIYVKGRGARESAVWNVLRILGLRPWKKHSTFGDVRKLITEEF
        ...  :  ::::.::..:...:  : :...:..:: .::::  .:  .::.:::.: ::
CCDS14 GTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEF
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pF1KB9 VQMNYLKYQRVPYVEPPEYEFFWGSRASREITKMQIMEFLARVFKKDPQAWPSRYREALE
       :...:: :.:::  .::::::.:: :. .: .::....:.:.: :.::. : ... :: .
CCDS14 VKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAAD
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pF1KB9 EARALREANPTAHYPRSSVSED                                      
       ::                                                          
CCDS14 EALDALDAAAAEAEARAEARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIP
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>>CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX              (834 aa)
 initn: 493 init1: 417 opt: 602  Z-score: 368.8  bits: 77.9 E(32554): 3.2e-14
Smith-Waterman score: 602; 37.1% identity (67.3% similar) in 272 aa overlap (32-301:468-729)

              10        20        30        40        50         60
pF1KB9 SEQSKDLSDPNFAAEAPNSEVHSSPGVSEGVPPSATLAEPQSPPLGPTAAPQAAP-PPQA
                                     .::.  :  : . :: :   :   : ::. 
CCDS35 TPPGWQTPPGWQGPPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPL--PTDWPLPPDWIPADWPIPPDW
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pF1KB9 PNDEGDPKALQQAAEEGRAHQAPSAAQPGPAPPAPAQLVQKAHELMWYVLVKDQKKMIIW
        : . .:.   . . ..:: : :.::::  .    : : ..:..:. :...::  :. : 
CCDS35 QNLRPSPN--LRPSPNSRASQNPGAAQPRDV----ALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIK
         500         510       520           530       540         

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pF1KB9 FPDMVKDVIGSYKKWCRSILRRTSLILARVFGLHLRLTSLHTMEFALVKALEPEELDRVA
         .:..:.:  :      :..:. ..: . ::..:.  . .   . :...  :: :  . 
CCDS35 RSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILIST--PESLAGIL
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        ...  :  ::::.::..:...:  : :...:..:: .::::  .:  .::.:::.: ::
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