seq1 = pF1KB9797.tfa, 300 bp
seq2 = pF1KB9797/gi568815575f_103231404.tfa (gi568815575f:103231404_103431703), 200300 bp

>pF1KB9797 300
>gi568815575f:103231404_103431703 (ChrX)

1-300  (100001-100300)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAAAAACCCTGCAAAGAAAACGAAGGAAAGCCAAAGTGCAGCGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAAAAACCCTGCAAAGAAAACGAAGGAAAGCCAAAGTGCAGCGTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAAGAGGGAGGAAAAACGCCCGTATGGAGAATTTGAACGCCAGCAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAAGAGGGAGGAAAAACGCCCGTATGGAGAATTTGAACGCCAGCAAACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGGGAATTTTAGACAGAGGCTGCTTCAGTCTCTCGAAGAATTTAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGGAATTTTAGACAGAGGCTGCTTCAGTCTCTCGAAGAATTTAAAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACATAGACTATAGGCATTTTAAAGATGAAGAAATGACAAGGGAGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACATAGACTATAGGCATTTTAAAGATGAAGAAATGACAAGGGAGGGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGATGGAAAGGTGTTTGGAAGAGATAAGGGGTCTGAGAAAGAAATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAGATGGAAAGGTGTTTGGAAGAGATAAGGGGTCTGAGAAAGAAATTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGCTCTGCATTCTAACCATAGGCATTCTCGGGACCGTCCTTATCCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGCTCTGCATTCTAACCATAGGCATTCTCGGGACCGTCCTTATCCCATT