seq1 = pF1KB9777.tfa, 2364 bp
seq2 = pF1KB9777/gi568815583r_77898258.tfa (gi568815583r:77898258_78154169), 255912 bp

>pF1KB9777 2364
>gi568815583r:77898258_78154169 (Chr15)

(complement)

1-136  (100001-100136)   100% ->
137-305  (109102-109270)   100% ->
306-469  (124000-124163)   100% ->
470-708  (128673-128911)   100% ->
709-1092  (129631-130014)   100% ->
1093-1203  (136213-136323)   100% ->
1204-1397  (137431-137624)   100% ->
1398-1892  (140853-141347)   100% ->
1893-2010  (145056-145173)   100% ->
2011-2196  (150680-150865)   100% ->
2197-2318  (152430-152551)   100% ->
2319-2364  (155867-155912)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTTACTGGTTACAGGAGCTTCAGCAGAAGAGATGGGAATATTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTTACTGGTTACAGGAGCTTCAGCAGAAGAGATGGGAATATTGTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGTCTTGACATGGTCAAGTGGGACAGCAGGACCTCTCCAACTCCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGTCTTGACATGGTCAAGTGGGACAGCAGGACCTCTCCAACTCCCGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATTTTCCTAAGGGTCTTGTAGCCAGAGATAACACTG         ATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100101 ATTTTCCTAAGGGTCTTGTAGCCAGAGATAACACTGGTA...CAGATTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTTACCCACACCCAAATGCTTCTGCAGAAAAAGCCAGAAATGTCCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109107 ATTTACCCACACCCAAATGCTTCTGCAGAAAAAGCCAGAAATGTCCTAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTGGAGACTGTGCCTGGAGAGCTGGTGGGAGAACAAGCTGCAAATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109157 TGTGGAGACTGTGCCTGGAGAGCTGGTGGGAGAACAAGCTGCAAATCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCGCCCCAGGGCATCCAAATTCCATTAATTTTTACTCTTTGAAACAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109207 CCGCCCCAGGGCATCCAAATTCCATTAATTTTTACTCTTTGAAACAGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCAATGAGCTCAA         GAATTCGATGTCTTCTTTCCGTCCTGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 109257 GGCAATGAGCTCAAGTG...CAGGAATTCGATGTCTTCTTTCCGTCCTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAGAGGACATAATGATAGTCGGAGGACTGTGTTTTATACCAATGAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124027 GAGAGGACATAATGATAGTCGGAGGACTGTGTTTTATACCAATGAAGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGGAACTTTTAGACCCAACCCCTAAGGACCTAGAGGAGTCCATAGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124077 GGGAACTTTTAGACCCAACCCCTAAGGACCTAGAGGAGTCCATAGTACAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGAAAAGAAGAAGCTGACCCCTGAAGGAAACAAAG         GAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 124127 GAAGAAAAGAAGAAGCTGACCCCTGAAGGAAACAAAGGTA...TAGGAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AACTGGCTCAGGATTCCCCTTTGATTTTGGACGTAACCCCTACAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128677 AACTGGCTCAGGATTCCCCTTTGATTTTGGACGTAACCCCTACAAAGGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGCGCCCTTTGAAAGACATAATTGGGTCGTACAAAAATCGTCACAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128727 AGCGCCCTTTGAAAGACATAATTGGGTCGTACAAAAATCGTCACAGCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGTGACCCTTCAAGTGAAGGCACATCAGGCAGTGGCAGCGTCAGCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128777 GGTGACCCTTCAAGTGAAGGCACATCAGGCAGTGGCAGCGTCAGCATCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAAGCCGGCCTCCGAAATGCAACTGCAGGTCCAGAGCCAGCAGGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128827 GAAGCCGGCCTCCGAAATGCAACTGCAGGTCCAGAGCCAGCAGGAAGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGGAACAGTTAAAGAAAGACCTGTCCAGTCAGAAG         GAGCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 128877 TGGAACAGTTAAAGAAAGACCTGTCCAGTCAGAAGGTA...CAGGAGCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTTCGACTGCTCCAGCAGACAGTCCGGTCATCCCAGTATGACAAGTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129637 GTTCGACTGCTCCAGCAGACAGTCCGGTCATCCCAGTATGACAAGTATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CACAAGCAGCCGGCTCTGTGAGGGGGTCCCAAAGGACACGCTCGAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129687 CACAAGCAGCCGGCTCTGTGAGGGGGTCCCAAAGGACACGCTCGAGCTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGCACCAAAAGGATGATCAGATTCTGGGCCTTACCAGCCAGCTGGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129737 TGCACCAAAAGGATGATCAGATTCTGGGCCTTACCAGCCAGCTGGAGAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TTCAGCTTGGAGAAGGAGAGTCTTCAGCAGGAAGTAAGGACGCTGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129787 TTCAGCTTGGAGAAGGAGAGTCTTCAGCAGGAAGTAAGGACGCTGAAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CAAAGTGGGCGAGCTCAACGAGCAGCTGGGAATGCTCATGGAGACCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129837 CAAAGTGGGCGAGCTCAACGAGCAGCTGGGAATGCTCATGGAGACCATCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AAGCCAAGGACGAGGTCATCATCAAGCTCAGCGAGGGCGAGGGCAACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129887 AAGCCAAGGACGAGGTCATCATCAAGCTCAGCGAGGGCGAGGGCAACGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CCTCCTCCCACCGTGGCGCCCAGCTCCCCTTCGGTTGTGCCTGTTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129937 CCTCCTCCCACCGTGGCGCCCAGCTCCCCTTCGGTTGTGCCTGTTGCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GGACCAGCTGGAACTGGACAGGCTGAAA         GATAATCTACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 129987 GGACCAGCTGGAACTGGACAGGCTGAAAGTA...CAGGATAATCTACAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GGTACAAAACCCAAAACAAATTTCTAAATAAGGAGATTTTGGAACTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136226 GGTACAAAACCCAAAACAAATTTCTAAATAAGGAGATTTTGGAACTCTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GCTCTACGAAGAAATGCAGAAAGGAGAGAGAGGGATCTGATGGCAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 136276 GCTCTACGAAGAAATGCAGAAAGGAGAGAGAGGGATCTGATGGCAAAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1204        TATTCTAGCCTGGAAGCCAAGCTCTGCCAGATAGAAAGTAAAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136326 G...CAGTATTCTAGCCTGGAAGCCAAGCTCTGCCAGATAGAAAGTAAAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 ACCTGATATTGCTCCAAGAAATGAAGACACCAGTGTGCTCAGAAGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137474 ACCTGATATTGCTCCAAGAAATGAAGACACCAGTGTGCTCAGAAGACCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GGGCCCACCCGGGAGGTCATAGCCCAGTTGCTGGAGGATGCTCTGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137524 GGGCCCACCCGGGAGGTCATAGCCCAGTTGCTGGAGGATGCTCTGCAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 TGAGAGCCAAGAGCAGCCGGAGCAAGCATTTGTTAAACCTCATCTTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137574 TGAGAGCCAAGAGCAGCCGGAGCAAGCATTTGTTAAACCTCATCTTGTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 G         TGAATATGATATTTATGGGTTCAGGACTGTACCTGAGGAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137624 GGTA...CAGTGAATATGATATTTATGGGTTCAGGACTGTACCTGAGGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GATGAGGAAGAGAAATTGGTTGCCAAGGTCCGCGCGTTGGATCTGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140893 GATGAGGAAGAGAAATTGGTTGCCAAGGTCCGCGCGTTGGATCTGAAGAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 TCTCTACCTCACAGAAAACCAGGAAGTCTCCACTGGGGTCAAGTGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140943 TCTCTACCTCACAGAAAACCAGGAAGTCTCCACTGGGGTCAAGTGGGAAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 ACTATTTTGCAAGTACAGTGAACAGGGAGATGATGTGCTCTCCAGAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140993 ACTATTTTGCAAGTACAGTGAACAGGGAGATGATGTGCTCTCCAGAGTTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 AAAAACCTCATCCGTGCGGGCATTCCCCACGAGCACCGTTCCAAGGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141043 AAAAACCTCATCCGTGCGGGCATTCCCCACGAGCACCGTTCCAAGGTGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 GAAGTGGTGTGTGGACCGTCACACCAGGAAGTTCAAGGACAACACTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141093 GAAGTGGTGTGTGGACCGTCACACCAGGAAGTTCAAGGACAACACTGAGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CTGGCCACTTCCAGACCTTGCTGCAGAAGGCGCTGGAGAAACAGAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141143 CTGGCCACTTCCAGACCTTGCTGCAGAAGGCGCTGGAGAAACAGAACCCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GCCTCCAAGCAGATTGAGCTGGACTTGCTGCGAACTCTGCCCAACAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141193 GCCTCCAAGCAGATTGAGCTGGACTTGCTGCGAACTCTGCCCAACAACAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 ACATTACTCCTGCCCCACCTCAGAAGGCATACAGAAGTTACGCAATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141243 ACATTACTCCTGCCCCACCTCAGAAGGCATACAGAAGTTACGCAATGTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 TCCTCGCCTTCTCCTGGCGGAATCCAGATATCGGCTACTGTCAAGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141293 TCCTCGCCTTCTCCTGGCGGAATCCAGATATCGGCTACTGTCAAGGCCTA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 AACAG         GTTGGTGGCAGTGGCCCTCCTGTACCTGGAACAAGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141343 AACAGGTG...TAGGTTGGTGGCAGTGGCCCTCCTGTACCTGGAACAAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 AGATGCTTTCTGGTGTCTCGTTACCATAGTGGAAGTTTTCATGCCTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145092 AGATGCTTTCTGGTGTCTCGTTACCATAGTGGAAGTTTTCATGCCTCGAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 ACTATTATACAAAGACTCTTTTAGGATCCCAG         GTGGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 145142 ACTATTATACAAAGACTCTTTTAGGATCCCAGGTA...CAGGTGGACCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 CGGGTGTTCAGAGACCTTATGAGTGAGAAGCTGCCTCGGTTGCATGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150689 CGGGTGTTCAGAGACCTTATGAGTGAGAAGCTGCCTCGGTTGCATGGCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 CTTTGAACAGTACAAAGTCGACTACACTCTCATCACTTTCAACTGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150739 CTTTGAACAGTACAAAGTCGACTACACTCTCATCACTTTCAACTGGTTTC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 TGGTGGTATTTGTGGATAGTGTCGTTAGTGACATCCTCTTTAAAATATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150789 TGGTGGTATTTGTGGATAGTGTCGTTAGTGACATCCTCTTTAAAATATGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 GACTCTTTCCTTTATGAAGGACCAAAG         GTTATTTTCCGTTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 150839 GACTCTTTCCTTTATGAAGGACCAAAGGTG...CAGGTTATTTTCCGTTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 TGCTCTGGCACTTTTTAAGTACAAGGAAGAGGAGATTTTGAAATTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152444 TGCTCTGGCACTTTTTAAGTACAAGGAAGAGGAGATTTTGAAATTGCAAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 ATTCGATGTCTATATTTAAGTATCTCCGCTACTTCACTCGCACTATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152494 ATTCGATGTCTATATTTAAGTATCTCCGCTACTTCACTCGCACTATCCTT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2311 GATGCTAG         ATCCGGAACCGACGCGCCTACCACTTGGAGAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 152544 GATGCTAGGTG...CAGATCCGGAACCGACGCGCCTACCACTTGGAGAAA

   2450     .    :
   2352 GTCCGGCTGGAGC
        |||||||||||||
 155900 GTCCGGCTGGAGC