Result of FASTA (ccds) for pF1KB9767
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9767, 947 aa
  1>>>pF1KB9767 947 - 947 aa - 947 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2177+/-0.00118; mu= -0.9728+/- 0.071
 mean_var=243.8208+/-49.035, 0's: 0 Z-trim(110.0): 78  B-trim: 112 in 1/51
 Lambda= 0.082137
 statistics sampled from 11260 (11321) to 11260 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.348), width:  16
 Scan time:  3.330

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS735.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1              ( 947) 6145 742.1 1.2e-213
CCDS72820.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1            ( 951) 6127 740.0 5.1e-213
CCDS55616.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1            ( 874) 5647 683.1 6.3e-196
CCDS55615.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1            ( 901) 5400 653.8 4.2e-187
CCDS82307.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19         ( 794)  945 125.9 3.1e-28
CCDS12328.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19         (1362)  950 126.6 3.2e-28
CCDS46004.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19         ( 722)  942 125.5 3.7e-28
CCDS6980.1 BRD3 gene_id:8019|Hs108|chr9            ( 726)  722 99.4 2.6e-20
CCDS56421.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6           ( 754)  701 97.0 1.5e-19
CCDS4762.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6            ( 801)  701 97.0 1.6e-19
CCDS56420.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6           ( 836)  701 97.0 1.6e-19


>>CCDS735.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1                   (947 aa)
 initn: 6145 init1: 6145 opt: 6145  Z-score: 3949.4  bits: 742.1 E(32554): 1.2e-213
Smith-Waterman score: 6145; 99.8% identity (99.9% similar) in 947 aa overlap (1-947:1-947)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQ
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LQLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 ALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGTQQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGTQQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 FPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAVKASSEFSPTFTEKSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAVKASSEFSPTFTEKSV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 ALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 VNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 MARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSEDERV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSEDERV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 KRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNENPRKMCEQMRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNENPRKMCEQMRL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 KEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 EPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 ELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSSSSSSSESESSSSDLSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSSSSSSSESESSSSDLSSS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 DSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPEGRTGVTQIGYCVQDTTSANTTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECIPPEGRTGVTQIGYCVQDTTSANTTL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 VHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSGDSEQLSNGITVMHPSGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSGDSEQLSNGITVMHPSGD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB9 SDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSDELFNQFRKAAIEKEVKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSDELFNQFRKAAIEKEVKA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB9 RTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNKCSGEEQKEHQQSSEAQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNKCSGEEQKEHQQSSEAQD
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       
pF1KB9 KSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFENNFD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFENNFD
              910       920       930       940       

>>CCDS72820.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1                 (951 aa)
 initn: 5156 init1: 5156 opt: 6127  Z-score: 3937.8  bits: 740.0 E(32554): 5.1e-213
Smith-Waterman score: 6127; 99.4% identity (99.5% similar) in 951 aa overlap (1-947:1-951)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQ
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LQLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140           150       160       170      
pF1KB9 ALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKG----TQQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQE
       :::::::::::::::::::::::::::::    :::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGKAGGTQQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQE
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB9 IPSVFPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAVKASSEFSPTFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IPSVFPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAVKASSEFSPTFT
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB9 EKSVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EKSVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFY
              250       260       270       280       290       300

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB9 NPVDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NPVDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDH
              310       320       330       340       350       360

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB9 EVVTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EVVTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSE
              370       380       390       400       410       420

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB9 DERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNENPRKMCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNENPRKMCE
              430       440       450       460       470       480

        480       490       500       510       520       530      
pF1KB9 QMRLKEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QMRLKEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHI
              490       500       510       520       530       540

        540       550       560       570       580       590      
pF1KB9 IQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPAKKIMMSKEELHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPAKKIMMSKEELHS
              550       560       570       580       590       600

        600       610       620       630       640       650      
pF1KB9 QKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSSSSSSSESESSSSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSSSSSSSESESSSSD
              610       620       630       640       650       660

        660       670       680       690       700       710      
pF1KB9 LSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPEGRTGVTQIGYCVQDTTSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS72 LSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECIPPEGRTGVTQIGYCVQDTTSA
              670       680       690       700       710       720

        720       730       740       750       760       770      
pF1KB9 NTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSGDSEQLSNGITVMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSGDSEQLSNGITVMH
              730       740       750       760       770       780

        780       790       800       810       820       830      
pF1KB9 PSGDSDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSDELFNQFRKAAIEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PSGDSDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSDELFNQFRKAAIEK
              790       800       810       820       830       840

        840       850       860       870       880       890      
pF1KB9 EVKARTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNKCSGEEQKEHQQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EVKARTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNKCSGEEQKEHQQSS
              850       860       870       880       890       900

        900       910       920       930       940       
pF1KB9 EAQDKSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFENNFD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EAQDKSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFENNFD
              910       920       930       940       950 

>>CCDS55616.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1                 (874 aa)
 initn: 5647 init1: 5647 opt: 5647  Z-score: 3631.0  bits: 683.1 E(32554): 6.3e-196
Smith-Waterman score: 5647; 99.9% identity (99.9% similar) in 874 aa overlap (74-947:1-874)

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB9 WKHSFSWPFQRPVDAVKLKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55                               MDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFS
                                             10        20        30

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB9 NCYLYNKPGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGTQQNIAVSSAKEKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCYLYNKPGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGTQQNIAVSSAKEKS
               40        50        60        70        80        90

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB9 SPSATEKVFKQQEIPSVFPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SPSATEKVFKQQEIPSVFPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATS
              100       110       120       130       140       150

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB9 AVKASSEFSPTFTEKSVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AVKASSEFSPTFTEKSVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEM
              160       170       180       190       200       210

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB9 LAKKHFSYAWPFYNPVDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LAKKHFSYAWPFYNPVDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRL
              220       230       240       250       260       270

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB9 MFMNCYKYNPPDHEVVTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MFMNCYKYNPPDHEVVTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTN
              280       290       300       310       320       330

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB9 EASSEGNSSDDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EASSEGNSSDDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEK
              340       350       360       370       380       390

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB9 VNNSNENPRKMCEQMRLKEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VNNSNENPRKMCEQMRLKEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNIN
              400       410       420       430       440       450

           530       540       550       560       570       580   
pF1KB9 KLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPP
              460       470       480       490       500       510

           590       600       610       620       630       640   
pF1KB9 AKKIMMSKEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AKKIMMSKEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSS
              520       530       540       550       560       570

           650       660       670       680       690       700   
pF1KB9 SSSSSESESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPEGRTGV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS55 SSSSSESESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECIPPEGRTGV
              580       590       600       610       620       630

           710       720       730       740       750       760   
pF1KB9 TQIGYCVQDTTSANTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TQIGYCVQDTTSANTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSG
              640       650       660       670       680       690

           770       780       790       800       810       820   
pF1KB9 DSEQLSNGITVMHPSGDSDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DSEQLSNGITVMHPSGDSDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSD
              700       710       720       730       740       750

           830       840       850       860       870       880   
pF1KB9 ELFNQFRKAAIEKEVKARTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELFNQFRKAAIEKEVKARTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNK
              760       770       780       790       800       810

           890       900       910       920       930       940   
pF1KB9 CSGEEQKEHQQSSEAQDKSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CSGEEQKEHQQSSEAQDKSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFE
              820       830       840       850       860       870

           
pF1KB9 NNFD
       ::::
CCDS55 NNFD
           

>>CCDS55615.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1                 (901 aa)
 initn: 5398 init1: 5398 opt: 5400  Z-score: 3472.6  bits: 653.8 E(32554): 4.2e-187
Smith-Waterman score: 5732; 94.9% identity (95.0% similar) in 947 aa overlap (1-947:1-901)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQ
       :.::                                              ::::::::::
CCDS55 LQLP----------------------------------------------PGDDIVLMAQ
                                                             70    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 ALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGTQQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGTQQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSV
           80        90       100       110       120       130    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 FPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAVKASSEFSPTFTEKSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAVKASSEFSPTFTEKSV
          140       150       160       170       180       190    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 ALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVD
          200       210       220       230       240       250    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 VNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVT
          260       270       280       290       300       310    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 MARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSEDERV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSEDERV
          320       330       340       350       360       370    

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 KRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNENPRKMCEQMRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNENPRKMCEQMRL
          380       390       400       410       420       430    

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 KEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSR
          440       450       460       470       480       490    

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 EPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQ
          500       510       520       530       540       550    

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 ELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSSSSSSSESESSSSDLSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSSSSSSSESESSSSDLSSS
          560       570       580       590       600       610    

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 DSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPEGRTGVTQIGYCVQDTTSANTTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECIPPEGRTGVTQIGYCVQDTTSANTTL
          620       630       640       650       660       670    

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 VHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSGDSEQLSNGITVMHPSGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSGDSEQLSNGITVMHPSGD
          680       690       700       710       720       730    

              790       800       810       820       830       840
pF1KB9 SDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSDELFNQFRKAAIEKEVKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSDELFNQFRKAAIEKEVKA
          740       750       760       770       780       790    

              850       860       870       880       890       900
pF1KB9 RTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNKCSGEEQKEHQQSSEAQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNKCSGEEQKEHQQSSEAQD
          800       810       820       830       840       850    

              910       920       930       940       
pF1KB9 KSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFENNFD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFENNFD
          860       870       880       890       900 

>>CCDS82307.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19              (794 aa)
 initn: 1525 init1: 704 opt: 945  Z-score: 620.4  bits: 125.9 E(32554): 3.1e-28
Smith-Waterman score: 1889; 47.6% identity (67.0% similar) in 740 aa overlap (21-688:52-740)

                         10        20        30        40        50
pF1KB9           MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSW
                                     : .:  : ::::::: .:::: ::::.:.:
CCDS82 ETSQMSTTQAQAQPQPANAASTNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAW
              30        40        50        60        70        80 

               60        70        80        90       100       110
pF1KB9 PFQRPVDAVKLKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNK
       :::.:::::::.::::: :::.:::..::::::::.:: .:.:::.::::::.:::.:::
CCDS82 PFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNK
              90       100       110       120       130       140 

              120       130          140                150        
pF1KB9 PGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEE---QVVGVKER---------IKKGT--------
       :::::::::.::::::.::....: ::   ..: .: :          : :.        
CCDS82 PGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGRGRGRKETGTAKPGVSTVPNTTQ
             150       160       170       180       190       200 

                        160       170       180                    
pF1KB9 ----------QQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSVFPKTSI--------------
                 : :    .:  .  :..:  .. :  . .: :   .              
CCDS82 ASTPPQTQTPQPNPPPVQATPHPFPAVTPDLIVQTPVMTVVPPQPLQTPPPVPPQPQPPP
             210       220       230       240       250       260 

          190       200       210       220        230             
pF1KB9 --SPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPAT-SAVKASSEFSPT-----FTEK
         .:  : .   . ...   ... ::::::::::::.: . ..    . :      . ..
CCDS82 APAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQR
             270       280       290       300       310       320 

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB9 SVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNP
         .  :.:   ::. .:::::.    :. ::.:::. :: :::::.:::: .::::::.:
CCDS82 RESSRPVKP--PKKDVPDSQQHPAPEKSSKVSEQLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKP
             330         340       350       360       370         

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB9 VDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEV
       :::.:::::.: :..:.:::..::: :.. .::.:: .:.::::::: ::::::::::::
CCDS82 VDVEALGLHDYCDIIKHPMDMSTIKSKLEAREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEV
     380       390       400       410       420       430         

      360       370       380            390        400       410  
pF1KB9 VTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVE-----SMPLCYIKTDITET-TGRENTNEASSEGNSS
       :.::: :::::: .:.:.: :: :     : :     : ..   .. ......::...::
CCDS82 VAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPEEPVVAVSSPAVPPPTKVVAPPSSSDSSSDSSSDSDSS
     440       450       460       470       480       490         

             420       430       440       450       460           
pF1KB9 -DDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNE--
        ::::.::..:::.:::::::::.:: .::: : ..  :::::.:::::::: . ..:  
CCDS82 TDDSEEERAQRLAELQEQLKAVHEQLAALSQ-PQQNKPKKKEKDKKEKKKEKHKRKEEVE
     500       510       520       530        540       550        

     470       480       490          500               510        
pF1KB9 NPRKMCEQMRLKEKSKRNQPKKR---KQQFIGLKS--------EDEDNAKPMNYDEKRQL
       . .:   .    .:.:.:. ..    :..   .::        :.::. :::.:.:::::
CCDS82 ENKKSKAKEPPPKKTKKNNSSNSNVSKKEPAPMKSKPPPTYESEEEDKCKPMSYEEKRQL
      560       570       580       590       600       610        

      520       530       540       550       560       570        
pF1KB9 SLNINKLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKR
       ::.::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::.::..::::.
CCDS82 SLDINKLPGEKLGRVVHIIQSREPSLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKK
      620       630       640       650       660       670        

      580       590       600       610       620       630        
pF1KB9 PLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLS
         :: :.:.                    ::                     . . :...
CCDS82 R-KPQAEKV--------------------DV---------------------IAGSSKMK
       680                                                690      

      640       650       660       670       680       690        
pF1KB9 ESSSSSSSSSESESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPE
            . ::::::::: . ::::: :::. .  .   :.:. :: . .:.          
CCDS82 -----GFSSSESESSSES-SSSDSEDSETAFCTSGDFVSPGPSPYHSHVQCGRFREMLRW
             700        710       720       730       740       750

      700       710       720       730       740       750        
pF1KB9 GRTGVTQIGYCVQDTTSANTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQI
                                                                   
CCDS82 FLVDVEQTAAGQPHRQSAAGPAITWAPAIAYPSPECARCCVGCS                
              760       770       780       790                    

>>CCDS12328.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19              (1362 aa)
 initn: 2120 init1: 704 opt: 950  Z-score: 620.0  bits: 126.6 E(32554): 3.2e-28
Smith-Waterman score: 1900; 48.0% identity (67.0% similar) in 740 aa overlap (21-688:52-737)

                         10        20        30        40        50
pF1KB9           MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSW
                                     : .:  : ::::::: .:::: ::::.:.:
CCDS12 ETSQMSTTQAQAQPQPANAASTNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAW
              30        40        50        60        70        80 

               60        70        80        90       100       110
pF1KB9 PFQRPVDAVKLKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNK
       :::.:::::::.::::: :::.:::..::::::::.:: .:.:::.::::::.:::.:::
CCDS12 PFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNK
              90       100       110       120       130       140 

              120       130          140                150        
pF1KB9 PGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEE---QVVGVKER---------IKKGT--------
       :::::::::.::::::.::....: ::   ..: .: :          : :.        
CCDS12 PGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGRGRGRKETGTAKPGVSTVPNTTQ
             150       160       170       180       190       200 

                        160       170       180                    
pF1KB9 ----------QQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSVFPKTSI--------------
                 : :    .:  .  :..:  .. :  . .: :   .              
CCDS12 ASTPPQTQTPQPNPPPVQATPHPFPAVTPDLIVQTPVMTVVPPQPLQTPPPVPPQPQPPP
             210       220       230       240       250       260 

          190       200       210       220        230             
pF1KB9 --SPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPAT-SAVKASSEFSPT-----FTEK
         .:  : .   . ...   ... ::::::::::::.: . ..    . :      . ..
CCDS12 APAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQR
             270       280       290       300       310       320 

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB9 SVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNP
         .  :.:   ::. .:::::.    :. ::.:::. :: :::::.:::: .::::::.:
CCDS12 RESSRPVKP--PKKDVPDSQQHPAPEKSSKVSEQLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKP
             330         340       350       360       370         

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB9 VDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEV
       :::.:::::.: :..:.:::..::: :.. .::.:: .:.::::::: ::::::::::::
CCDS12 VDVEALGLHDYCDIIKHPMDMSTIKSKLEAREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEV
     380       390       400       410       420       430         

      360       370       380            390        400       410  
pF1KB9 VTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVE-----SMPLCYIKTDITET-TGRENTNEASSEGNSS
       :.::: :::::: .:.:.: :: :     : :     : ..   .. ......::...::
CCDS12 VAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPEEPVVAVSSPAVPPPTKVVAPPSSSDSSSDSSSDSDSS
     440       450       460       470       480       490         

             420       430       440       450       460           
pF1KB9 -DDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNE--
        ::::.::..:::.:::::::::.:: .::: : ..  :::::.:::::::: . ..:  
CCDS12 TDDSEEERAQRLAELQEQLKAVHEQLAALSQ-PQQNKPKKKEKDKKEKKKEKHKRKEEVE
     500       510       520       530        540       550        

     470       480       490          500               510        
pF1KB9 NPRKMCEQMRLKEKSKRNQPKKR---KQQFIGLKS--------EDEDNAKPMNYDEKRQL
       . .:   .    .:.:.:. ..    :..   .::        :.::. :::.:.:::::
CCDS12 ENKKSKAKEPPPKKTKKNNSSNSNVSKKEPAPMKSKPPPTYESEEEDKCKPMSYEEKRQL
      560       570       580       590       600       610        

      520       530       540       550       560       570        
pF1KB9 SLNINKLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKR
       ::.::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::.::..::::.
CCDS12 SLDINKLPGEKLGRVVHIIQSREPSLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKK
      620       630       640       650       660       670        

      580       590       600       610       620       630        
pF1KB9 PLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLS
         :: :.:.                    ::                     . . :...
CCDS12 R-KPQAEKV--------------------DV---------------------IAGSSKMK
       680                                                690      

      640       650       660       670       680       690        
pF1KB9 ESSSSSSSSSESESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPE
            . ::::::::: . ::::: :::.:: ::    : .  :..:. :          
CCDS12 -----GFSSSESESSSES-SSSDSEDSETEMAPK---SKKKGHPGREQKKHHHHHHQQMQ
             700        710       720          730       740       

      700       710       720       730       740       750        
pF1KB9 GRTGVTQIGYCVQDTTSANTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQI
                                                                   
CCDS12 QAPAPVPQQPPPPPQQPPPPPPPQQQQQPPPPPPPPSMPQQAAPAMKSSPPPFIATQVPV
       750       760       770       780       790       800       

>>CCDS46004.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19              (722 aa)
 initn: 1958 init1: 704 opt: 942  Z-score: 619.1  bits: 125.5 E(32554): 3.7e-28
Smith-Waterman score: 1885; 51.2% identity (71.4% similar) in 639 aa overlap (21-587:52-686)

                         10        20        30        40        50
pF1KB9           MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSW
                                     : .:  : ::::::: .:::: ::::.:.:
CCDS46 ETSQMSTTQAQAQPQPANAASTNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAW
              30        40        50        60        70        80 

               60        70        80        90       100       110
pF1KB9 PFQRPVDAVKLKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNK
       :::.:::::::.::::: :::.:::..::::::::.:: .:.:::.::::::.:::.:::
CCDS46 PFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNK
              90       100       110       120       130       140 

              120       130          140                150        
pF1KB9 PGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEE---QVVGVKER---------IKKGT--------
       :::::::::.::::::.::....: ::   ..: .: :          : :.        
CCDS46 PGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGRGRGRKETGTAKPGVSTVPNTTQ
             150       160       170       180       190       200 

                        160       170       180                    
pF1KB9 ----------QQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSVFPKTSI--------------
                 : :    .:  .  :..:  .. :  . .: :   .              
CCDS46 ASTPPQTQTPQPNPPPVQATPHPFPAVTPDLIVQTPVMTVVPPQPLQTPPPVPPQPQPPP
             210       220       230       240       250       260 

          190       200       210       220        230             
pF1KB9 --SPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPAT-SAVKASSEFSPT-----FTEK
         .:  : .   . ...   ... ::::::::::::.: . ..    . :      . ..
CCDS46 APAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQR
             270       280       290       300       310       320 

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB9 SVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNP
         .  :.:   ::. .:::::.    :. ::.:::. :: :::::.:::: .::::::.:
CCDS46 RESSRPVKP--PKKDVPDSQQHPAPEKSSKVSEQLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKP
             330         340       350       360       370         

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB9 VDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEV
       :::.:::::.: :..:.:::..::: :.. .::.:: .:.::::::: ::::::::::::
CCDS46 VDVEALGLHDYCDIIKHPMDMSTIKSKLEAREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEV
     380       390       400       410       420       430         

      360       370       380            390        400       410  
pF1KB9 VTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVE-----SMPLCYIKTDITET-TGRENTNEASSEGNSS
       :.::: :::::: .:.:.: :: :     : :     : ..   .. ......::...::
CCDS46 VAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPEEPVVAVSSPAVPPPTKVVAPPSSSDSSSDSSSDSDSS
     440       450       460       470       480       490         

             420       430       440       450       460           
pF1KB9 -DDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNE--
        ::::.::..:::.:::::::::.:: .::: : ..  :::::.:::::::: . ..:  
CCDS46 TDDSEEERAQRLAELQEQLKAVHEQLAALSQ-PQQNKPKKKEKDKKEKKKEKHKRKEEVE
     500       510       520       530        540       550        

     470       480       490          500               510        
pF1KB9 NPRKMCEQMRLKEKSKRNQPKKR---KQQFIGLKS--------EDEDNAKPMNYDEKRQL
       . .:   .    .:.:.:. ..    :..   .::        :.::. :::.:.:::::
CCDS46 ENKKSKAKEPPPKKTKKNNSSNSNVSKKEPAPMKSKPPPTYESEEEDKCKPMSYEEKRQL
      560       570       580       590       600       610        

      520       530       540       550       560       570        
pF1KB9 SLNINKLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKR
       ::.::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::.::..::::.
CCDS46 SLDINKLPGEKLGRVVHIIQSREPSLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKK
      620       630       640       650       660       670        

      580       590       600       610       620       630        
pF1KB9 PLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLS
         :: :.:.                                                   
CCDS46 R-KPQAEKVDVIAGSSKMKGFSSSESESSSESSSSDSEDSETGPA               
       680       690       700       710       720                 

>>CCDS6980.1 BRD3 gene_id:8019|Hs108|chr9                 (726 aa)
 initn: 2072 init1: 685 opt: 722  Z-score: 478.1  bits: 99.4 E(32554): 2.6e-20
Smith-Waterman score: 2150; 53.1% identity (72.7% similar) in 719 aa overlap (12-666:19-726)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB9        MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQ
                         :::::::  : .: :: ::::::.:.::.: ::::.:.::: 
CCDS69 MSTATTVAPAGIPATPGPVNPPPPEVSNPSKPGRKTNQLQYMQNVVVKTLWKHQFAWPFY
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB9 RPVDAVKLKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGD
       .::::.::.::::. :::::::..::::::::.:: .::::..::::::.:::.:::: :
CCDS69 QPVDAIKLNLPDYHKIIKNPMDMGTIKKRLENNYYWSASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTD
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140                  150       160  
pF1KB9 DIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEEQVV---GVKERIKK--------GTQQNIAVSSAKEK
       :::::::::::.:.::..::::::  .   . : . .:        ::::  ::::..  
CCDS69 DIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQEEVELLPPAPKGKGRKPAAGAQSAGTQQVAAVSSVSPA
              130       140       150       160       170       180

                 170        180               190       200        
pF1KB9 SS-----PSATEK-VFKQQEIPSV--------FPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVT
       .      :....  :.    .:..         : ..  :  ..  . :   .  ...  
CCDS69 TPFQSVPPTVSQTPVIAATPVPTITANVTSVPVPPAAAPPPPATPIVPVVPPTPPVVK-K
              190       200       210       220       230          

      210       220        230           240            250        
pF1KB9 KGVKRKADTTTPATSAVKAS-SEFSPTFTE----KSVALP-----PIKENMPKNVLPDSQ
       ::::::::::::.:::. :: ::  : ...    : ::       :::   ::. : :..
CCDS69 KGVKRKADTTTPTTSAITASRSESPPPLSDPKQAKVVARRESGGRPIKP--PKKDLEDGE
     240       250       260       270       280         290       

      260       270       280       290       300       310        
pF1KB9 QQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVDVNALGLHNYYDVVKNPMD
          .. :  :..:.::.:. ::.:::.::: .::::::.:::..:: ::.:.:..:.:::
CCDS69 VPQHAGKKGKLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMD
       300       310       320       330       340       350       

      320       330       340       350       360       370        
pF1KB9 LGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVTMARMLQDVFETHFSKIPI
       :.:.:.:::..:: ::  ::::::::: :::::::::::::.::: :::::: .:.:.: 
CCDS69 LSTVKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPD
       360       370       380       390       400       410       

      380       390       400         410       420       430      
pF1KB9 EPVESMPLCYIKTDITETTGRENT--NEASSEGNSSDDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQ
       ::::. :     .    . : :..  .: ::  ..:.:::.::. :::.:::::::::.:
CCDS69 EPVEA-PALPAPAAPMVSKGAESSRSSEESSSDSGSSDSEEERATRLAELQEQLKAVHEQ
       420        430       440       450       460       470      

        440       450       460                470             480 
pF1KB9 LQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKE---------KVNNSNEN------PRKMCEQMRLK
       : .:::.:  : .:::::..:::::.         ::.  .:.      : :. .: .  
CCDS69 LAALSQAPVNKPKKKKEKKEKEKKKKDKEKEKEKHKVKAEEEKKAKVAPPAKQAQQKKAP
        480       490       500       510       520       530      

                    490       500       510       520       530    
pF1KB9 EKSK-------RNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVV
        :.        :.  :  ::   .  ::.:... ::.:::::::::.::.:::.::::::
CCDS69 AKKANSTTTAGRQLKKGGKQASASYDSEEEEEGLPMSYDEKRQLSLDINRLPGEKLGRVV
        540       550       560       570       580       590      

          540       550       560       570       580           590
pF1KB9 HIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPA----KKIMMS
       :::::::::: .:::::::::::::: .::::::.::..::.:.  :: .    :.   :
CCDS69 HIIQSREPSLRDSNPDEIEIDFETLKPTTLRELERYVKSCLQKKQRKPFSASGKKQAAKS
        600       610       620       630       640       650      

              600       610       620       630        640         
pF1KB9 KEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVEN-VSRLSESSSSSSSSSE
       :::: ..::.:::::: ::..::.: :. ....:  :..:  .  ::::     ::::::
CCDS69 KEELAQEKKKELEKRLQDVSGQLSSSKKPARKEK--PGSAPSGGPSRLS-----SSSSSE
        660       670       680       690         700              

     650       660       670       680       690       700         
pF1KB9 SESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPEGRTGVTQIGYC
       : ::::. :::::::::                                           
CCDS69 SGSSSSSGSSSDSSDSE                                           
     710       720                                                 

>>CCDS56421.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6                (754 aa)
 initn: 2304 init1: 678 opt: 701  Z-score: 464.4  bits: 97.0 E(32554): 1.5e-19
Smith-Waterman score: 2188; 52.1% identity (73.3% similar) in 753 aa overlap (2-662:3-753)

                10        20        30        40        50         
pF1KB9  MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAV
         :.:. : .  .::::::  : :: ::.:::::::.:::.: ::::.:.:::..:::::
CCDS56 MASVPALQLTP-ANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAV
               10         20        30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB9 KLKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMA
       :: ::::. :::.:::..:::.::::.::  ::::..::::::.:::.:::: :::::::
CCDS56 KLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMA
      60        70        80        90       100       110         

     120       130         140        150          160          170
pF1KB9 QALEKLFMQKLSQMPQEEQ--VVGV-KERIKKGTQQNI---AVSSAKEK---SSPSATEK
       :.:::.:.::...::::::  :: . :.  :::..      .:.::..    :: : :  
CCDS56 QTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKNSHKKGAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSHTAL
     120       130       140       150       160       170         

              180             190       200             210        
pF1KB9 VFKQQEIPSV---FPKTSI--SPL-NVVQGASVNSSSQTAAQVT------KGVKRKADTT
            :::..   .:. :.  ::: . ...:.    . :::  .      ::::::::::
CCDS56 YTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTT
     180       190       200       210       220       230         

      220        230         240             250       260         
pF1KB9 TPATSAVKA-SSEFSP--TFTEKSVALPPIKENM------PKNVLPDSQQQYNVVKTVKV
       ::. .:. : .:  ::  ..  :.. :::....       :.. :::::::..  :  :.
CCDS56 TPTPTAILAPGSPASPPGSLEPKAARLPPMRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKL
     240       250       260       270       280       290         

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB9 TEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQ
       .:::.::. ::::.:.::: .::::::.:::..:::::.:.:..:.::::.:.:.::.:.
CCDS56 SEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENR
     300       310       320       330       340       350         

     330       340       350       360       370       380         
pF1KB9 EYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVE-------
       .:.:: .::::::::: ::::::::::.::.::: :::::: ...:.: ::.:       
CCDS56 DYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVS
     360       370       380       390       400       410         

             390       400                    410       420        
pF1KB9 -SMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEG-------------NSSDDSEDERVKRLAKLQE
        .::    :.. .:....:...:.:::              . :.:::.::..:::.:::
CCDS56 TAMPPGLAKSS-SESSSEESSSESSSEEEEEEDEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQE
     420       430        440       450       460       470        

      430       440       450       460               470       480
pF1KB9 QLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKK--EK------VNNSNENPRKMCEQMRL
       ::.:::.:: .::: :. : ..:.::..:.::.  ::      .......::     .  
CCDS56 QLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRKAEKHRGRAGADEDDKGPRAPRPPQPK
      480       490       500       510       520       530        

                                    490            500       510   
pF1KB9 KEK----------------------SKRNQPKKRKQQF-----IGLKSEDEDNAKPMNYD
       : :                      :  . :::  .        :  ::.:....::.::
CCDS56 KSKKASGSGGGSAALGPSGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPTGYDSEEEEESRPMSYD
      540       550       560       570       580       590        

           520       530       540       550       560       570   
pF1KB9 EKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSA
       :::::::.::::::.::::::::::.::::: .:::.:::::::::: :::::::.:: .
CCDS56 EKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLS
      600       610       620       630       640       650        

           580         590       600       610       620           
pF1KB9 CLRKRPLKPPA--KKIMMSKEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTK--SDKTQPSK
       ::::.: :: .  : .  .::::  .::.:::::: ::..:::: :.  :  ..::. :.
CCDS56 CLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKANEKTESSS
      660       670       680       690       700       710        

     630        640        650       660       670       680       
pF1KB9 AVE-NVSRLSESSSSS-SSSSESESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENV
       : .  ::::: ::::: :::: : ::::: :.:::                         
CCDS56 AQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG                        
      720       730       740       750                            

       690       700       710       720       730       740       
pF1KB9 KKMKNECILPEGRTGVTQIGYCVQDTTSANTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHL

>>CCDS4762.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6                 (801 aa)
 initn: 2304 init1: 678 opt: 701  Z-score: 464.0  bits: 97.0 E(32554): 1.6e-19
Smith-Waterman score: 2188; 52.1% identity (73.3% similar) in 753 aa overlap (2-662:50-800)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQ
                                     :.:. : .  .::::::  : :: ::.:::
CCDS47 LGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTP-ANPPPPEVSNPKKPGRVTNQ
      20        30        40        50         60        70        

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB9 LQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVKLKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKA
       ::::.:::.: ::::.:.:::..::::::: ::::. :::.:::..:::.::::.::  :
CCDS47 LQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAA
       80        90       100       110       120       130        

             100       110       120       130         140         
pF1KB9 SECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEEQ--VVGV-KERIKK
       :::..::::::.:::.:::: ::::::::.:::.:.::...::::::  :: . :.  ::
CCDS47 SECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKNSHKK
      140       150       160       170       180       190        

      150          160          170       180             190      
pF1KB9 GTQQNI---AVSSAKEK---SSPSATEKVFKQQEIPSV---FPKTSI--SPL-NVVQGAS
       :..      .:.::..    :: : :       :::..   .:. :.  ::: . ...:.
CCDS47 GAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAG
      200       210       220       230       240       250        

        200             210       220        230         240       
pF1KB9 VNSSSQTAAQVT------KGVKRKADTTTPATSAVKA-SSEFSP--TFTEKSVALPPIKE
           . :::  .      ::::::::::::. .:. : .:  ::  ..  :.. :::...
CCDS47 PPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPASPPGSLEPKAARLPPMRR
      260       270       280       290       300       310        

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB9 NM------PKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVDV
       .       :.. :::::::..  :  :..:::.::. ::::.:.::: .::::::.:::.
CCDS47 ESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDA
      320       330       340       350       360       370        

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB9 NALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVTM
       .:::::.:.:..:.::::.:.:.::.:..:.:: .::::::::: ::::::::::.::.:
CCDS47 SALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAM
      380       390       400       410       420       430        

             370       380               390       400             
pF1KB9 ARMLQDVFETHFSKIPIEPVE--------SMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEG----
       :: :::::: ...:.: ::.:        .::    :.. .:....:...:.:::     
CCDS47 ARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTAMPPGLAKSS-SESSSEESSSESSSEEEEEE
      440       450       460       470        480       490       

              410       420       430       440       450       460
pF1KB9 ---------NSSDDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKK
                . :.:::.::..:::.:::::.:::.:: .::: :. : ..:.::..:.::
CCDS47 DEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKK
       500       510       520       530       540       550       

                      470       480                             490
pF1KB9 K--EK------VNNSNENPRKMCEQMRLKEK----------------------SKRNQPK
       .  ::      .......::     .  : :                      :  . ::
CCDS47 RKAEKHRGRAGADEDDKGPRAPRPPQPKKSKKASGSGGGSAALGPSGFGPSGGSGTKLPK
       560       570       580       590       600       610       

                   500       510       520       530       540     
pF1KB9 KRKQQF-----IGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSREPSLS
       :  .        :  ::.:....::.:::::::::.::::::.::::::::::.::::: 
CCDS47 KATKTAPPALPTGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLR
       620       630       640       650       660       670       

         550       560       570       580         590       600   
pF1KB9 NSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPA--KKIMMSKEELHSQKKQELE
       .:::.:::::::::: :::::::.:: .::::.: :: .  : .  .::::  .::.:::
CCDS47 DSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELE
       680       690       700       710       720       730       

           610       620         630        640        650         
pF1KB9 KRLLDVNNQLNSRKRQTK--SDKTQPSKAVE-NVSRLSESSSSS-SSSSESESSSSDLSS
       ::: ::..:::: :.  :  ..::. :.: .  ::::: ::::: :::: : ::::: :.
CCDS47 KRLQDVSGQLNSTKKPPKKANEKTESSSAQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSD
       740       750       760       770       780       790       

     660       670       680       690       700       710         
pF1KB9 SDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPEGRTGVTQIGYCVQDTTSANTT
       :::                                                         
CCDS47 SDSG                                                        
       800                                                         




947 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 18:45:56 2016 done: Fri Nov  4 18:45:57 2016
 Total Scan time:  3.330 Total Display time:  0.230

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com