Result of FASTA (omim) for pF1KB9704
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9704, 332 aa
  1>>>pF1KB9704 332 - 332 aa - 332 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2531+/-0.000446; mu= 11.0846+/- 0.028
 mean_var=308.8802+/-63.958, 0's: 0 Z-trim(120.5): 117  B-trim: 917 in 2/53
 Lambda= 0.072976
 statistics sampled from 35757 (35893) to 35757 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.755), E-opt: 0.2 (0.421), width:  16
 Scan time:  8.380

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005404 (OMIM: 157170,269160,603714) homeobox pr ( 332) 2259 251.1 2.5e-66
NP_031400 (OMIM: 206900,212550,606326) homeobox pr ( 246) 1354 155.6   1e-37
NP_058628 (OMIM: 604994) homeobox protein SIX2 [Ho ( 291)  965 114.7 2.4e-25
XP_005264157 (OMIM: 604994) PREDICTED: homeobox pr ( 293)  955 113.7 4.9e-25
NP_005973 (OMIM: 113650,601205,605192,608389) home ( 284)  934 111.5 2.3e-24
XP_016877091 (OMIM: 113650,601205,605192,608389) P ( 173)  804 97.4 2.3e-20
XP_005267816 (OMIM: 606342) PREDICTED: homeobox pr ( 773)  740 91.7 5.4e-18
NP_059116 (OMIM: 606342) homeobox protein SIX4 [Ho ( 781)  740 91.7 5.4e-18
NP_787071 (OMIM: 600963,610896) homeobox protein S ( 739)  729 90.5 1.2e-17


>>NP_005404 (OMIM: 157170,269160,603714) homeobox protei  (332 aa)
 initn: 2259 init1: 2259 opt: 2259  Z-score: 1311.8  bits: 251.1 E(85289): 2.5e-66
Smith-Waterman score: 2259; 99.7% identity (99.7% similar) in 332 aa overlap (1-332:1-332)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MVFRSPLDLYSSHFLLPNFADSHHRSILLASSGGGNGAGGGGGAGGGSGGGNGAGGGGAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MVFRSPLDLYSSHFLLPNFADSHHRSILLASSGGGNGAGGGGGAGGGSGGGNGAGGGGAG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 GAGGGGGGGSRAPPEELSMFQLPTLNFSPEQVASVCETLEETGDIERLGRFLWSLPVAPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GAGGGGGGGSRAPPEELSMFQLPTLNFSPEQVASVCETLEETGDIERLGRFLWSLPVAPG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 ACEAINKHESILRARAVVAFHTGNFRDLYHILENHKFTKESHGKLQAMWLEAHYQEAEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ACEAINKHESILRARAVVAFHTGNFRDLYHILENHKFTKESHGKLQAMWLEAHYQEAEKL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 RGRPLGPVDKYRVRKKFPLPRTIWDGEQKTHCFKERTRSLLREWYLQDPYPNPSKKCELA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
NP_005 RGRPLGPVDKYRVRKKFPLPRTIWDGEQKTHCFKERTRSLLREWYLQDPYPNPSKKRELA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 QATGLTPTQVGNWFKNRRQRDRAAAAKNRLQHQAIGPSGMRSLAEPGCPTHGSAESPSTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QATGLTPTQVGNWFKNRRQRDRAAAAKNRLQHQAIGPSGMRSLAEPGCPTHGSAESPSTA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330  
pF1KB9 ASPTTSVSSLTERADTGTSILSVTSSDSECDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ASPTTSVSSLTERADTGTSILSVTSSDSECDV
              310       320       330  

>>NP_031400 (OMIM: 206900,212550,606326) homeobox protei  (246 aa)
 initn: 1375 init1: 1268 opt: 1354  Z-score: 798.1  bits: 155.6 E(85289): 1e-37
Smith-Waterman score: 1354; 78.3% identity (90.9% similar) in 254 aa overlap (79-332:1-246)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB9 GGGNGAGGGGAGGAGGGGGGGSRAPPEELSMFQLPTLNFSPEQVASVCETLEETGDIERL
                                     ::::: :::::.:::.:::::::.::.:::
NP_031                               MFQLPILNFSPQQVAGVCETLEESGDVERL
                                             10        20        30

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB9 GRFLWSLPVAPGACEAINKHESILRARAVVAFHTGNFRDLYHILENHKFTKESHGKLQAM
       :::::::::::.::::.::.::.:::::.:::: ::.:.:::::::::::::::.::::.
NP_031 GRFLWSLPVAPAACEALNKNESVLRARAIVAFHGGNYRELYHILENHKFTKESHAKLQAL
               40        50        60        70        80        90

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB9 WLEAHYQEAEKLRGRPLGPVDKYRVRKKFPLPRTIWDGEQKTHCFKERTRSLLREWYLQD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
NP_031 WLEAHYQEAEKLRGRPLGPVDKYRVRKKFPLPRTIWDGEQKTHCFKERTRHLLREWYLQD
              100       110       120       130       140       150

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB9 PYPNPSKKCELAQATGLTPTQVGNWFKNRRQRDRAAAAKNRLQHQAIGPSGMRSLAEPGC
       :::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:... .. :.:   : 
NP_031 PYPNPSKKRELAQATGLTPTQVGNWFKNRRQRDRAAAAKNRLQQQVLSQGSGRALRAEG-
              160       170       180       190       200          

      290       300       310       320       330  
pF1KB9 PTHGSAESPSTAASPTTSVSSLTERADTGTSILSVTSSDSECDV
          :. :  ..:.::..:.::      ..:: .:.::::::::.
NP_031 --DGTPEVLGVATSPAASLSS-----KAATSAISITSSDSECDI
       210       220            230       240      

>>NP_058628 (OMIM: 604994) homeobox protein SIX2 [Homo s  (291 aa)
 initn: 962 init1: 793 opt: 965  Z-score: 576.1  bits: 114.7 E(85289): 2.4e-25
Smith-Waterman score: 965; 60.8% identity (83.2% similar) in 232 aa overlap (79-309:1-228)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB9 GGGNGAGGGGAGGAGGGGGGGSRAPPEELSMFQLPTLNFSPEQVASVCETLEETGDIERL
                                     : .:::..:. :::: :::.:.. :.::::
NP_058                               MSMLPTFGFTQEQVACVCEVLQQGGNIERL
                                             10        20        30

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB9 GRFLWSLPVAPGACEAINKHESILRARAVVAFHTGNFRDLYHILENHKFTKESHGKLQAM
       ::::::::    ::: ..:.::.:.:.:::::: ::::.::.:::.:.:. ..:.::: .
NP_058 GRFLWSLP----ACEHLHKNESVLKAKAVVAFHRGNFRELYKILESHQFSPHNHAKLQQL
                   40        50        60        70        80      

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB9 WLEAHYQEAEKLRGRPLGPVDKYRVRKKFPLPRTIWDGEQKTHCFKERTRSLLREWYLQD
       ::.::: ::::::::::: : :::::.::::::.:::::. ..::::..::.::::: ..
NP_058 WLKAHYIEAEKLRGRPLGAVGKYRVRRKFPLPRSIWDGEETSYCFKEKSRSVLREWYAHN
         90       100       110       120       130       140      

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB9 PYPNPSKKCELAQATGLTPTQVGNWFKNRRQRDRAAAAKNRLQHQAIGPSGMRSLAEPGC
       :::.: .: :::.::::: :::.::::::::::::: ::.: ...  . ..   :   : 
NP_058 PYPSPREKRELAEATGLTTTQVSNWFKNRRQRDRAAEAKERENNENSNSNSHNPLNGSGK
        150       160       170       180       190       200      

      290        300       310       320       330                 
pF1KB9 PTHGSAESPST-AASPTTSVSSLTERADTGTSILSVTSSDSECDV               
        . ::.:. .: ...:  : ::                                      
NP_058 SVLGSSEDEKTPSGTPDHSSSSPALLLSPPPPGLPSLHSLGHPPGPSAVPVPVPGGGGAD
        210       220       230       240       250       260      

>>XP_005264157 (OMIM: 604994) PREDICTED: homeobox protei  (293 aa)
 initn: 941 init1: 772 opt: 955  Z-score: 570.4  bits: 113.7 E(85289): 4.9e-25
Smith-Waterman score: 955; 60.3% identity (82.5% similar) in 234 aa overlap (79-309:1-230)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB9 GGGNGAGGGGAGGAGGGGGGGSRAPPEELSMFQLPTLNFSPEQVASVCETLEETGDIERL
                                     : .:::..:. :::: :::.:.. :.::::
XP_005                               MSMLPTFGFTQEQVACVCEVLQQGGNIERL
                                             10        20        30

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB9 GRFLWSLPVAPGACEAINKHESILRARAVVAFHTGNFRDLYHILENHKFTKESHGKLQAM
       ::::::::    ::: ..:.::.:.:.:::::: ::::.::.:::.:.:. ..:.::: .
XP_005 GRFLWSLP----ACEHLHKNESVLKAKAVVAFHRGNFRELYKILESHQFSPHNHAKLQQL
                   40        50        60        70        80      

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB9 WLEAHYQEAEKLRGRPLGPVDKYRVRKKFPLPRTIWDGEQKTHCFKERTRSLLREWYLQD
       ::.::: ::::::::::: : :::::.::::::.:::::. ..::::..::.::::: ..
XP_005 WLKAHYIEAEKLRGRPLGAVGKYRVRRKFPLPRSIWDGEETSYCFKEKSRSVLREWYAHN
         90       100       110       120       130       140      

      230       240       250       260       270         280      
pF1KB9 PYPNPSKKCELAQATGLTPTQVGNWFKNRRQRDRAAAAKNRLQ--HQAIGPSGMRSLAEP
       :::.: .: :::.::::: :::.::::::::::::: ::.: .  ..  . ..   :   
XP_005 PYPSPREKRELAEATGLTTTQVSNWFKNRRQRDRAAEAKERYEENNENSNSNSHNPLNGS
        150       160       170       180       190       200      

        290        300       310       320       330               
pF1KB9 GCPTHGSAESPST-AASPTTSVSSLTERADTGTSILSVTSSDSECDV             
       :  . ::.:. .: ...:  : ::                                    
XP_005 GKSVLGSSEDEKTPSGTPDHSSSSPALLLSPPPPGLPSLHSLGHPPGPSAVPVPVPGGGG
        210       220       230       240       250       260      

>>NP_005973 (OMIM: 113650,601205,605192,608389) homeobox  (284 aa)
 initn: 926 init1: 763 opt: 934  Z-score: 558.6  bits: 111.5 E(85289): 2.3e-24
Smith-Waterman score: 934; 57.8% identity (79.1% similar) in 244 aa overlap (79-317:1-239)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB9 GGGNGAGGGGAGGAGGGGGGGSRAPPEELSMFQLPTLNFSPEQVASVCETLEETGDIERL
                                     : .::...:. :::: :::.:.. :..:::
NP_005                               MSMLPSFGFTQEQVACVCEVLQQGGNLERL
                                             10        20        30

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB9 GRFLWSLPVAPGACEAINKHESILRARAVVAFHTGNFRDLYHILENHKFTKESHGKLQAM
       ::::::::    ::. ..:.::.:.:.:::::: ::::.::.:::.:.:. ..: ::: .
NP_005 GRFLWSLP----ACDHLHKNESVLKAKAVVAFHRGNFRELYKILESHQFSPHNHPKLQQL
                   40        50        60        70        80      

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB9 WLEAHYQEAEKLRGRPLGPVDKYRVRKKFPLPRTIWDGEQKTHCFKERTRSLLREWYLQD
       ::.::: ::::::::::: : :::::.::::::::::::. ..::::..:..::::: ..
NP_005 WLKAHYVEAEKLRGRPLGAVGKYRVRRKFPLPRTIWDGEETSYCFKEKSRGVLREWYAHN
         90       100       110       120       130       140      

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB9 PYPNPSKKCELAQATGLTPTQVGNWFKNRRQRDRAAAAKNRLQHQAIGPSGMR----SLA
       :::.: .: :::.::::: :::.::::::::::::: ::.: . .  . :. .    :  
NP_005 PYPSPREKRELAEATGLTTTQVSNWFKNRRQRDRAAEAKERENTENNNSSSNKQNQLSPL
        150       160       170       180       190       200      

          290        300       310       320       330             
pF1KB9 EPGCPTHGSAESP-STAASPTTSVSSLTERADTGTSILSVTSSDSECDV           
       : : :  .:.:   :   ::  . : :  ... :                          
NP_005 EGGKPLMSSSEEEFSPPQSPDQN-SVLLLQGNMGHARSSNYSLPGLTASQPSHGLQTHQH
        210       220        230       240       250       260     

NP_005 QLQDSLLGPLTSSLVDLGS
         270       280    

>>XP_016877091 (OMIM: 113650,601205,605192,608389) PREDI  (173 aa)
 initn: 808 init1: 645 opt: 804  Z-score: 486.6  bits: 97.4 E(85289): 2.3e-20
Smith-Waterman score: 804; 64.9% identity (87.7% similar) in 171 aa overlap (79-249:1-167)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB9 GGGNGAGGGGAGGAGGGGGGGSRAPPEELSMFQLPTLNFSPEQVASVCETLEETGDIERL
                                     : .::...:. :::: :::.:.. :..:::
XP_016                               MSMLPSFGFTQEQVACVCEVLQQGGNLERL
                                             10        20        30

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB9 GRFLWSLPVAPGACEAINKHESILRARAVVAFHTGNFRDLYHILENHKFTKESHGKLQAM
       ::::::::    ::. ..:.::.:.:.:::::: ::::.::.:::.:.:. ..: ::: .
XP_016 GRFLWSLP----ACDHLHKNESVLKAKAVVAFHRGNFRELYKILESHQFSPHNHPKLQQL
                   40        50        60        70        80      

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB9 WLEAHYQEAEKLRGRPLGPVDKYRVRKKFPLPRTIWDGEQKTHCFKERTRSLLREWYLQD
       ::.::: ::::::::::: : :::::.::::::::::::. ..::::..:..::::: ..
XP_016 WLKAHYVEAEKLRGRPLGAVGKYRVRRKFPLPRTIWDGEETSYCFKEKSRGVLREWYAHN
         90       100       110       120       130       140      

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB9 PYPNPSKKCELAQATGLTPTQVGNWFKNRRQRDRAAAAKNRLQHQAIGPSGMRSLAEPGC
       :::.: .: :::.::::: ::                                       
XP_016 PYPSPREKRELAEATGLTTTQGEHRKQ                                 
        150       160       170                                    

>>XP_005267816 (OMIM: 606342) PREDICTED: homeobox protei  (773 aa)
 initn: 782 init1: 602 opt: 740  Z-score: 444.0  bits: 91.7 E(85289): 5.4e-18
Smith-Waterman score: 745; 44.4% identity (67.6% similar) in 293 aa overlap (42-325:48-318)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB9 SHFLLPNFADSHHRSILLASSGGGNGAGGGGGAGGGSGGGNGAGGGGAGGAGGGGGGGSR
                                     : :. ...  .:  :. :..:.:...   .
XP_005 SEGQEAHREVAGGAAVGLSPPAPAPFPLEPGDAATAAARVSGEEGAVAAAAAGAAADQVQ
        20        30        40        50        60        70       

              80                90       100       110       120   
pF1KB9 APPEELSMF--------QLPTLNFSPEQVASVCETLEETGDIERLGRFLWSLPVAPGACE
          : :.          : : : :::..:: :::.:.. :...::.:::::::      .
XP_005 LHSELLGRHHHAAAAAAQTP-LAFSPDHVACVCEALQQGGNLDRLARFLWSLP----QSD
        80        90        100       110       120           130  

           130       140       150       160       170       180   
pF1KB9 AINKHESILRARAVVAFHTGNFRDLYHILENHKFTKESHGKLQAMWLEAHYQEAEKLRGR
        .  .::.:.:::.:::: : . .:: :::.:.: . .:  :: .: .:.: :::. :::
XP_005 LLRGNESLLKARALVAFHQGIYPELYSILESHSFESANHPLLQQLWYKARYTEAERARGR
            140       150       160       170       180       190  

           190       200       210       220       230       240   
pF1KB9 PLGPVDKYRVRKKFPLPRTIWDGEQKTHCFKERTRSLLREWYLQDPYPNPSKKCELAQAT
       ::: :::::.:.::::::::::::. ..::::..:. :.: : :. ::.:..: .::. :
XP_005 PLGAVDKYRLRRKFPLPRTIWDGEETVYCFKEKSRNALKELYKQNRYPSPAEKRHLAKIT
            200       210       220       230       240       250  

           250       260       270       280        290       300  
pF1KB9 GLTPTQVGNWFKNRRQRDRAAAAKNRLQHQAIGPSGMRSLAEP-GCPTHGSAESPSTAAS
       ::. :::.:::::::::::             .::  .: .:  : :   :.:. :. . 
XP_005 GLSLTQVSNWFKNRRQRDR-------------NPSETQSKSESDGNP---STEDESSKGH
            260       270                    280          290      

            310       320       330                                
pF1KB9 PTTSVSSLTERADTGTSILSVTSSDSECDV                              
          :   :.  .: : . ::..:                                     
XP_005 EDLSPHPLSSSSD-GITNLSLSSHMEPVYMQQIGNAKISLSSSGVLLNGSLVPASTSPVF
        300        310       320       330       340       350     

>>NP_059116 (OMIM: 606342) homeobox protein SIX4 [Homo s  (781 aa)
 initn: 782 init1: 602 opt: 740  Z-score: 444.0  bits: 91.7 E(85289): 5.4e-18
Smith-Waterman score: 745; 44.4% identity (67.6% similar) in 293 aa overlap (42-325:56-326)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB9 SHFLLPNFADSHHRSILLASSGGGNGAGGGGGAGGGSGGGNGAGGGGAGGAGGGGGGGSR
                                     : :. ...  .:  :. :..:.:...   .
NP_059 SEGQEAHREVAGGAAVGLSPPAPAPFPLEPGDAATAAARVSGEEGAVAAAAAGAAADQVQ
          30        40        50        60        70        80     

              80                90       100       110       120   
pF1KB9 APPEELSMF--------QLPTLNFSPEQVASVCETLEETGDIERLGRFLWSLPVAPGACE
          : :.          : : : :::..:: :::.:.. :...::.:::::::      .
NP_059 LHSELLGRHHHAAAAAAQTP-LAFSPDHVACVCEALQQGGNLDRLARFLWSLP----QSD
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           130       140       150       160       170       180   
pF1KB9 AINKHESILRARAVVAFHTGNFRDLYHILENHKFTKESHGKLQAMWLEAHYQEAEKLRGR
        .  .::.:.:::.:::: : . .:: :::.:.: . .:  :: .: .:.: :::. :::
NP_059 LLRGNESLLKARALVAFHQGIYPELYSILESHSFESANHPLLQQLWYKARYTEAERARGR
              150       160       170       180       190       200

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pF1KB9 PLGPVDKYRVRKKFPLPRTIWDGEQKTHCFKERTRSLLREWYLQDPYPNPSKKCELAQAT
       ::: :::::.:.::::::::::::. ..::::..:. :.: : :. ::.:..: .::. :
NP_059 PLGAVDKYRLRRKFPLPRTIWDGEETVYCFKEKSRNALKELYKQNRYPSPAEKRHLAKIT
              210       220       230       240       250       260

           250       260       270       280        290       300  
pF1KB9 GLTPTQVGNWFKNRRQRDRAAAAKNRLQHQAIGPSGMRSLAEP-GCPTHGSAESPSTAAS
       ::. :::.:::::::::::             .::  .: .:  : :   :.:. :. . 
NP_059 GLSLTQVSNWFKNRRQRDR-------------NPSETQSKSESDGNP---STEDESSKGH
              270                    280       290          300    

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pF1KB9 PTTSVSSLTERADTGTSILSVTSSDSECDV                              
          :   :.  .: : . ::..:                                     
NP_059 EDLSPHPLSSSSD-GITNLSLSSHMEPVYMQQIGNAKISLSSSGVLLNGSLVPASTSPVF
          310        320       330       340       350       360   

>>NP_787071 (OMIM: 600963,610896) homeobox protein SIX5   (739 aa)
 initn: 761 init1: 535 opt: 729  Z-score: 438.0  bits: 90.5 E(85289): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 743; 46.2% identity (68.8% similar) in 292 aa overlap (42-330:44-315)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB9 SHFLLPNFADSHHRSILLASSGGGNGAGGGGGAGGGSGGGNGAGGGGAGGAGGGGGGGSR
                                     : :....:.: ::...:: : :. :  :: 
NP_787 AGGEAVAAAAATEEEEEEARQLLQTLQAAEGEAAAAAGAGAGAAAAGAEGPGSPGVPGS-
            20        30        40        50        60        70   

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pF1KB9 APPEELSMFQLPT-LNFSPEQVASVCETLEETGDIERLGRFLWSLPVAPGACEAINKHES
        :::  :  . :: : ::::::: :::.: ..:   ::.::: .:: :    : .   . 
NP_787 -PPEAAS--EPPTGLRFSPEQVACVCEALLQAGHAGRLSRFLGALPPA----ERLRGSDP
                80        90       100       110           120     

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pF1KB9 ILRARAVVAFHTGNFRDLYHILENHKFTKESHGKLQAMWLEAHYQEAEKLRGRPLGPVDK
       .:::::.:::. :.. .::..::.. :    :. :: ..:.:.:.:::. ::: :: :::
NP_787 VLRARALVAFQRGEYAELYRLLESRPFPAAHHAFLQDLYLRARYHEAERARGRALGAVDK
         130       140       150       160       170       180     

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pF1KB9 YRVRKKFPLPRTIWDGEQKTHCFKERTRSLLREWYLQDPYPNPSKKCELAQATGLTPTQV
       ::.:::::::.::::::. ..:::::.:. :.  :  . ::.:..: .::  :::. :::
NP_787 YRLRKKFPLPKTIWDGEETVYCFKERSRAALKACYRGNRYPTPDEKRRLATLTGLSLTQV
         190       200       210       220       230       240     

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pF1KB9 GNWFKNRRQRDRAAAAKNRLQHQAIGPSGMRSLAEPGCPT--HGSAESPSTAASPTTSVS
       .:::::::::::..:.         : .  .: .. : ::    :..::      .. ::
NP_787 SNWFKNRRQRDRTGAG---------GGAPCKSESD-GNPTTEDESSRSPEDLERGAAPVS
         250       260                270        280       290     

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pF1KB9 SLTERADTGTSILSVTSSDSECDV                                    
       .  : :  :. .:. :.  . :                                      
NP_787 A--EAAAQGSIFLAGTGPPAPCPASSSILVNGSFLAASGSPAVLLNGGPVIINGLALGEA
           300       310       320       330       340       350   




332 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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