Result of SIM4 for pF1KB9697

seq1 = pF1KB9697.tfa, 810 bp
seq2 = pF1KB9697/gi568815587r_47255230.tfa (gi568815587r:47255230_47478353), 223124 bp

>pF1KB9697 810
>gi568815587r:47255230_47478353 (Chr11)

(complement)

1-45  (100001-100045)   100% ->
46-142  (102625-102721)   100% ->
143-330  (118314-118501)   99% ->
331-493  (119348-119510)   100% ->
494-810  (122808-123124)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTACAGGCGTGCAAAATGGAAGGGTTTCCCCTCGTCCCCCCT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100001 ATGTTACAGGCGTGCAAAATGGAAGGGTTTCCCCTCGTCCCCCCTGTG..

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     46     CCATCAGAAGACCTGGTGCCCTATGACACGGATCTATACCAACGCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 .CAGCCATCAGAAGACCTGGTGCCCTATGACACGGATCTATACCAACGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAACGCACGAGTATTACCCCTATCTCAGCAGTGATGGGGAGAGCCATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102671 AAACGCACGAGTATTACCCCTATCTCAGCAGTGATGGGGAGAGCCATAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 G         ACCATTACTGGGACTTCCACCCCCACCACGTGCACAGCGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102721 GGTG...CAGACCATTACTGGGACTTCCACCCCCACCACGTGCACAGCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTTCGAGAGCTTCGCCGAGAACAACTTCACGGAGCTCCAGAGCGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118354 GTTCGAGAGCTTCGCCGAGAACAACTTCACGGAGCTCCAGAGCGTGCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCCCGCAGCTGCAGCAGCTCTACCGCTACATGGAGCTGGAGCAGATGCAC
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 118404 CCCCGCAGCTGCAGCAGCTCTACCGCCACATGGAGCTGGAGCAGATGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCCTCGATACCCCCATGGTGCCACCCCATCCCAGTCTTGGCCACCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 118454 GTCCTCGATACCCCCATGGTGCCACCCCATCCCAGTCTTGGCCACCAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    331        GTCTCCTACCTGCCCCGGATGTGCCTCCAGTACCCATCCCTGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118504 G...CAGGTCTCCTACCTGCCCCGGATGTGCCTCCAGTACCCATCCCTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCCAGCCCAGCCCAGCTCAGATGAGGAGGAGGGCGAGCGGCAGAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119391 CCCCAGCCCAGCCCAGCTCAGATGAGGAGGAGGGCGAGCGGCAGAGCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCACTGGAGGTGTCTGACGGCGAGGCGGATGGCCTGGAGCCCGGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119441 CCACTGGAGGTGTCTGACGGCGAGGCGGATGGCCTGGAGCCCGGGCCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTCCTGCCTGGGGAGACAG         GCAGCAAGAAGAAGATCCGCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 119491 GCTCCTGCCTGGGGAGACAGGTG...CAGGCAGCAAGAAGAAGATCCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGTACCAGTTCCTGTTGGACCTGCTCCGCAGCGGCGACATGAAGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122829 TGTACCAGTTCCTGTTGGACCTGCTCCGCAGCGGCGACATGAAGGACAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATCTGGTGGGTGGACAAGGACAAGGGCACCTTCCAGTTCTCGTCCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122879 ATCTGGTGGGTGGACAAGGACAAGGGCACCTTCCAGTTCTCGTCCAAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAAGGAGGCGCTGGCGCACCGCTGGGGCATCCAGAAGGGCAACCGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122929 CAAGGAGGCGCTGGCGCACCGCTGGGGCATCCAGAAGGGCAACCGCAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGATGACCTACCAGAAGATGGCGCGCGCGCTGCGCAACTACGGCAAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122979 AGATGACCTACCAGAAGATGGCGCGCGCGCTGCGCAACTACGGCAAGACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGCGAGGTCAAGAAGGTGAAGAAGAAGCTCACCTACCAGTTCAGCGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123029 GGCGAGGTCAAGAAGGTGAAGAAGAAGCTCACCTACCAGTTCAGCGGCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    765 AGTGCTGGGCCGCGGGGGCCTGGCCGAGCGGCGCCACCCGCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123079 AGTGCTGGGCCGCGGGGGCCTGGCCGAGCGGCGCCACCCGCCCCAC

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