Result of FASTA (ccds) for pF1KB9609
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9609, 241 aa
  1>>>pF1KB9609 241 - 241 aa - 241 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3744+/-0.00149; mu= 6.0122+/- 0.088
 mean_var=243.3473+/-50.825, 0's: 0 Z-trim(105.8): 933  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.082217
 statistics sampled from 7616 (8616) to 7616 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.265), width:  16
 Scan time:  2.000

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 364) 1108 144.7 7.8e-35
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 474) 1108 144.9 9.1e-35
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9           ( 498) 1108 144.9 9.4e-35
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19      ( 499) 1096 143.5 2.5e-34
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19      ( 475) 1088 142.5 4.7e-34
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688) 1086 142.5   7e-34
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665) 1085 142.3 7.4e-34
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667) 1085 142.3 7.4e-34
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692) 1085 142.4 7.6e-34
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616) 1083 142.1 8.3e-34
CCDS83401.1 ZNF883 gene_id:169834|Hs108|chr9       ( 379) 1079 141.3 8.6e-34
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658) 1083 142.1 8.7e-34
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670) 1083 142.1 8.8e-34
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682) 1083 142.1 8.9e-34
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19       ( 488) 1078 141.3 1.1e-33
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 568) 1079 141.5 1.1e-33
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5         ( 604) 1079 141.6 1.1e-33
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1          ( 470) 1077 141.2 1.2e-33
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 620) 1079 141.6 1.2e-33
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17      ( 511) 1074 140.9 1.6e-33
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17      ( 521) 1074 140.9 1.6e-33
CCDS33121.1 ZNF582 gene_id:147948|Hs108|chr19      ( 517) 1072 140.7 1.9e-33
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6          ( 751) 1074 141.1   2e-33
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22         ( 446) 1067 140.0 2.6e-33
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7           ( 446) 1067 140.0 2.6e-33
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17     ( 522) 1066 139.9   3e-33
CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19       ( 463) 1062 139.4 3.9e-33
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3        ( 754) 1065 140.0 4.1e-33
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 527) 1062 139.5 4.3e-33
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 686) 1062 139.6   5e-33
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1058) 1065 140.2 5.1e-33
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1090) 1065 140.2 5.2e-33
CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19       ( 609) 1060 139.3 5.5e-33
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5       ( 563) 1059 139.2 5.7e-33
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461) 1055 138.6   7e-33
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682) 1057 139.0 7.5e-33
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19        ( 706) 1057 139.1 7.7e-33
CCDS82393.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19       ( 325) 1051 137.9 7.9e-33
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19       ( 670) 1056 138.9 8.1e-33
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19      ( 645) 1055 138.8 8.6e-33
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738) 1054 138.7   1e-32
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8         ( 539) 1051 138.2 1.1e-32
CCDS12860.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19       ( 555) 1051 138.2 1.1e-32
CCDS54313.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19       ( 555) 1051 138.2 1.1e-32
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8         ( 560) 1051 138.2 1.1e-32
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 536) 1050 138.1 1.2e-32
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19      ( 717) 1052 138.5 1.2e-32
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 592) 1050 138.1 1.2e-32
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19       ( 540) 1049 137.9 1.3e-32
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19       ( 563) 1049 138.0 1.3e-32


>>CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9               (364 aa)
 initn: 3797 init1: 1107 opt: 1108  Z-score: 738.9  bits: 144.7 E(32554): 7.8e-35
Smith-Waterman score: 1108; 60.6% identity (83.1% similar) in 236 aa overlap (3-238:129-364)

                                           10        20        30  
pF1KB9                             MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSAL
                                     .::.:: ::: :: ..:::: ::::  :::
CCDS75 SSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSAL
      100       110       120       130       140       150        

             40        50        60        70        80        90  
pF1KB9 IDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHW
       ..:::::.:::::::..::.:: .::.:  ::.::.:::::.::.: :.: . ...:.: 
CCDS75 VQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQ
      160       170       180       190       200       210        

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB9 RIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHS
       :::::::::.:  : :.: .  ..: :.: :::::::.:.::::.::  ..:. :..::.
CCDS75 RIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHT
      220       230       240       250       260       270        

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB9 GEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKP
       :::::::.:::: ::  :.:. :.  :.::::: :. :::::: ::.: ::.::::: ::
CCDS75 GEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKP
      280       290       300       310       320       330        

            220       230       240 
pF1KB9 FQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
       ..::.:::.: ::: ..:: :.  :.   
CCDS75 YECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE   
      340       350       360       

>>CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9               (474 aa)
 initn: 3797 init1: 1107 opt: 1108  Z-score: 737.7  bits: 144.9 E(32554): 9.1e-35
Smith-Waterman score: 1108; 60.6% identity (83.1% similar) in 236 aa overlap (3-238:239-474)

                                           10        20        30  
pF1KB9                             MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSAL
                                     .::.:: ::: :: ..:::: ::::  :::
CCDS69 SSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSAL
      210       220       230       240       250       260        

             40        50        60        70        80        90  
pF1KB9 IDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHW
       ..:::::.:::::::..::.:: .::.:  ::.::.:::::.::.: :.: . ...:.: 
CCDS69 VQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQ
      270       280       290       300       310       320        

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB9 RIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHS
       :::::::::.:  : :.: .  ..: :.: :::::::.:.::::.::  ..:. :..::.
CCDS69 RIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHT
      330       340       350       360       370       380        

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB9 GEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKP
       :::::::.:::: ::  :.:. :.  :.::::: :. :::::: ::.: ::.::::: ::
CCDS69 GEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKP
      390       400       410       420       430       440        

            220       230       240 
pF1KB9 FQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
       ..::.:::.: ::: ..:: :.  :.   
CCDS69 YECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE   
      450       460       470       

>>CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9                (498 aa)
 initn: 3797 init1: 1107 opt: 1108  Z-score: 737.4  bits: 144.9 E(32554): 9.4e-35
Smith-Waterman score: 1108; 60.6% identity (83.1% similar) in 236 aa overlap (3-238:263-498)

                                           10        20        30  
pF1KB9                             MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSAL
                                     .::.:: ::: :: ..:::: ::::  :::
CCDS68 SSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSAL
            240       250       260       270       280       290  

             40        50        60        70        80        90  
pF1KB9 IDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHW
       ..:::::.:::::::..::.:: .::.:  ::.::.:::::.::.: :.: . ...:.: 
CCDS68 VQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQ
            300       310       320       330       340       350  

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB9 RIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHS
       :::::::::.:  : :.: .  ..: :.: :::::::.:.::::.::  ..:. :..::.
CCDS68 RIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHT
            360       370       380       390       400       410  

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB9 GEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKP
       :::::::.:::: ::  :.:. :.  :.::::: :. :::::: ::.: ::.::::: ::
CCDS68 GEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKP
            420       430       440       450       460       470  

            220       230       240 
pF1KB9 FQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
       ..::.:::.: ::: ..:: :.  :.   
CCDS68 YECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE   
            480       490           

>>CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19           (499 aa)
 initn: 5029 init1: 1090 opt: 1096  Z-score: 729.7  bits: 143.5 E(32554): 2.5e-34
Smith-Waterman score: 1096; 61.2% identity (81.9% similar) in 237 aa overlap (2-237:180-415)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSA
                                     .:: :::  :: ::   :.::::::::.: 
CCDS12 HHTSHTVRQSRETGEKLMECHECGKAFSRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASH
     150       160       170       180       190       200         

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB9 LIDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEH
       :..:::::.:::::.::.::.:: ....:: ::. :.: :::::..: :.: . :.:: :
CCDS12 LVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTSELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQLILH
     210       220       230       240       250       260         

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB9 WRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTH
        : ::::::: :::: :.: :  :.:.::::::: .:::::::::.:  ::.:..:.: :
CCDS12 QRTHTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLTVHRRIHTGARPYECKECGKAFRQHSQLTVHQRIH
     270       280       290       300       310       320         

             160       170        180       190       200       210
pF1KB9 SGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVT-HKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGE
       .:::::.::::::.:  ::: :: :.: ::::::: :. :::::   . : .:.:.:::.
CCDS12 TGEKPYECKECGKGF-IHSSEVTRHQRIHSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHTGD
     330       340        350       360       370       380        

              220       230       240                              
pF1KB9 KPFQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK                             
       .:..:..:::.:: ::.: .: :. .:                                 
CCDS12 RPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYE
      390       400       410       420       430       440        

>>CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19           (475 aa)
 initn: 1088 init1: 1088 opt: 1088  Z-score: 724.8  bits: 142.5 E(32554): 4.7e-34
Smith-Waterman score: 1088; 61.3% identity (82.6% similar) in 230 aa overlap (2-231:239-468)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSA
                                     ..:.:::  :: .: .::.:::::::  : 
CCDS12 CGSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSSYLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSN
      210       220       230       240       250       260        

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB9 LIDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEH
       ::::::::.:::::::: ::.:::.:.::..: . :.:::::::..: :.:.. :.:..:
CCDS12 LIDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQHARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQH
      270       280       290       300       310       320        

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB9 WRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTH
        :::::::::.::.: :.:     .: :.:::::::::.::::::.:.  :.:  :.: :
CCDS12 QRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQHQRIH
      330       340       350       360       370       380        

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB9 SGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEK
       .::::..: ::::::. .:.:  :.: :. :::: :. ::::::  :.: .: :::::::
CCDS12 AGEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEK
      390       400       410       420       430       440        

             220       230       240 
pF1KB9 PFQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
       :..:..:::.:: .: : ::          
CCDS12 PYNCKECGKAFSSGSDLIRHQGIHTNK   
      450       460       470        

>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19           (688 aa)
 initn: 8409 init1: 1083 opt: 1086  Z-score: 721.8  bits: 142.5 E(32554): 7e-34
Smith-Waterman score: 1086; 60.3% identity (83.5% similar) in 237 aa overlap (2-238:264-500)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSA
                                     ..:: ::  :: ::..::.:: :.:...: 
CCDS12 RSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTGEKLYECKECRKVFTQLSQ
           240       250       260       270       280       290   

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB9 LIDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEH
       :: :.:::.:::::::::::.::  ..:: .::: :.:::::::..: ..:.. : :..:
CCDS12 LILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECKECGRAFIRGSLLMQH
           300       310       320       330       340       350   

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB9 WRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTH
        :::::::::.:..: :.: :  :.: :.::::.::::::::::: ::  :.:. :.: :
CCDS12 QRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQLTQHQRIH
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             160       170       180       190       200       210 
pF1KB9 SGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEK
       .:::::.::::::::.  : :. :.: :.::::: :. :::.:. .: : ::.:::::::
CCDS12 TGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQHERIHTGEK
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             220       230       240                               
pF1KB9 PFQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK                              
       :..:..:::::  .:.::.: :. .:.                                 
CCDS12 PYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKPYVC
           480       490       500       510       520       530   

>--
 initn: 1609 init1: 842 opt: 842  Z-score: 565.4  bits: 113.5 E(32554): 3.6e-25
Smith-Waterman score: 842; 60.8% identity (80.6% similar) in 186 aa overlap (43-228:501-686)

             20        30        40        50        60        70  
pF1KB9 REKFHECSECGKAFSRVSALIDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKP
                                     ::::::::  :::::..: .::. :.::::
CCDS12 GEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKP
              480       490       500       510       520       530

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB9 YECSKCKKSFVHLSSLIEHWRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECK
       : :..: :.:..   ::.: ::::::::::::.: :.: :  :.: :.::::::::::::
CCDS12 YVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECK
              540       550       560       570       580       590

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB9 ECGKSFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGK
       ::::.::  :.:. :.: :.:::::.:.:: :::.  : :  :.: :.::::: :. :::
CCDS12 ECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGK
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            200       210       220       230       240 
pF1KB9 AFNTSSTLCQHNRIHTGEKPFQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK
       ::. .: : ::.::: .:: :. ..:: .:: .:..             
CCDS12 AFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM           
              660       670       680                   

>--
 initn: 1244 init1: 641 opt: 641  Z-score: 436.5  bits: 89.7 E(32554): 5.4e-18
Smith-Waterman score: 652; 60.1% identity (84.8% similar) in 138 aa overlap (2-139:124-261)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSA
                                     :.:.::.  :. :: ..:.:::::: :.: 
CCDS12 GKMEKQQENQKEYFRQGMIIYDKMSIFNQHTYLSQHSRCHSTEKPYKCKECGKAFRRASH
           100       110       120       130       140       150   

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB9 LIDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEH
       : .:: ::.::::::::.::.::....::  ::. :.::::: :..: :.:.. :.:: :
CCDS12 LTQHQSIHTGEKPYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILH
           160       170       180       190       200       210   

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB9 WRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTH
        :::::::::.:..: :.: :  :.: :...::::::::::::::.:.            
CCDS12 HRIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLH
           220       230       240       250       260       270   

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB9 SGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEK
                                                                   
CCDS12 TGEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEK
           280       290       300       310       320       330   

>>CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (665 aa)
 initn: 3185 init1: 1083 opt: 1085  Z-score: 721.3  bits: 142.3 E(32554): 7.4e-34
Smith-Waterman score: 1099; 60.8% identity (83.1% similar) in 237 aa overlap (2-238:339-575)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSA
                                     .::. :: ::: :: .:::::::.::: : 
CCDS62 HSSSLTQNMRNNSEEKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRSSH
      310       320       330       340       350       360        

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB9 LIDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEH
       :..::: :.:::::.:..::..:.::  :. ::.::.:::::::..: ::: .  .:: :
CCDS62 LVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAH
      370       380       390       400       410       420        

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB9 WRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTH
        : :::::::.:..: :.: . ...  :.:::::::::::..::::::   .::.:.:::
CCDS62 QRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTH
      430       440       450       460       470       480        

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB9 SGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEK
       .::::..:..:::.::  :.::.:.:::.::::: :  :::.:: :: : .:.:::::::
CCDS62 TGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEK
      490       500       510       520       530       540        

             220       230       240                               
pF1KB9 PFQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK                              
       :..:.::::::: :  :. : :  .:.                                 
CCDS62 PYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFEC
      550       560       570       580       590       600        

>>CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (667 aa)
 initn: 3185 init1: 1083 opt: 1085  Z-score: 721.3  bits: 142.3 E(32554): 7.4e-34
Smith-Waterman score: 1099; 60.8% identity (83.1% similar) in 237 aa overlap (2-238:341-577)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSA
                                     .::. :: ::: :: .:::::::.::: : 
CCDS62 HSSSLTQNMRNNSEEKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRSSH
              320       330       340       350       360       370

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pF1KB9 LIDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEH
       :..::: :.:::::.:..::..:.::  :. ::.::.:::::::..: ::: .  .:: :
CCDS62 LVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAH
              380       390       400       410       420       430

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pF1KB9 WRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTH
        : :::::::.:..: :.: . ...  :.:::::::::::..::::::   .::.:.:::
CCDS62 QRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTH
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pF1KB9 SGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEK
       .::::..:..:::.::  :.::.:.:::.::::: :  :::.:: :: : .:.:::::::
CCDS62 TGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEK
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       :..:.::::::: :  :. : :  .:.                                 
CCDS62 PYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFEC
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>>CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (692 aa)
 initn: 3185 init1: 1083 opt: 1085  Z-score: 721.1  bits: 142.4 E(32554): 7.6e-34
Smith-Waterman score: 1099; 60.8% identity (83.1% similar) in 237 aa overlap (2-238:366-602)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSA
                                     .::. :: ::: :: .:::::::.::: : 
CCDS12 HSSSLTQNMRNNSEEKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRSSH
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pF1KB9 LIDHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEH
       :..::: :.:::::.:..::..:.::  :. ::.::.:::::::..: ::: .  .:: :
CCDS12 LVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAH
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pF1KB9 WRIHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTH
        : :::::::.:..: :.: . ...  :.:::::::::::..::::::   .::.:.:::
CCDS12 QRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTH
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pF1KB9 SGEKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEK
       .::::..:..:::.::  :.::.:.:::.::::: :  :::.:: :: : .:.:::::::
CCDS12 TGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEK
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pF1KB9 PFQCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK                              
       :..:.::::::: :  :. : :  .:.                                 
CCDS12 PYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFEC
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>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (616 aa)
 initn: 7374 init1: 1079 opt: 1083  Z-score: 720.4  bits: 142.1 E(32554): 8.3e-34
Smith-Waterman score: 1083; 60.4% identity (80.0% similar) in 235 aa overlap (4-238:243-477)

                                          10        20        30   
pF1KB9                            MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSALI
                                     : ::: ::: :: .:::::::.::  :.. 
CCDS74 SALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFS
            220       230       240       250       260       270  

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pF1KB9 DHQRIHSGEKPYECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHWR
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CCDS74 QHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQR
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pF1KB9 IHTGEKPYQCKDCKKTFCRVMQFTLHRRIHTGEKPYECKECGKSFSAHSSLVTHKRTHSG
       ::::::::.:..: :.: ..  .  :.: ::::::::: ::::.::  . :. :.: :.:
CCDS74 IHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTG
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pF1KB9 EKPYKCKECGKAFSAHSSLVTHKRTHSGEKPYTCHACGKAFNTSSTLCQHNRIHTGEKPF
       :::: :.::::.::  :::  :.:::.::::: :  :::::  :. : ::.::::::::.
CCDS74 EKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPY
            400       410       420       430       440       450  

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pF1KB9 QCSQCGKSFSCSSHLTRHCRMCNGKFSK                                
       .:..:::.:: :: ::.: :. .:.                                   
CCDS74 ECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQ
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>--
 initn: 1303 init1: 667 opt: 671  Z-score: 456.3  bits: 93.2 E(32554): 4.3e-19
Smith-Waterman score: 671; 61.9% identity (84.9% similar) in 139 aa overlap (15-153:478-616)

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pF1KB9                 MTHLTQHQTTHTREKFHECSECGKAFSRVSALIDHQRIHSGEKP
                                     : .::..::.:::... ::.:::::.::::
CCDS74 GEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKP
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pF1KB9 YECKECGRAFTQSAQLIRHQKTHSGEKPYECSKCKKSFVHLSSLIEHWRIHTGEKPYQCK
       :::..:::::.::. ::.::. :. :::: :..: ::: : ::: .: : :::::::.:.
CCDS74 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
       510       520       530       540       550       560       

          110       120       130       140       150       160    
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       :: :.: .  ..: ::::::::::: :..:::.:.  :::. :.:::.:           
CCDS74 DCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG           
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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