Result of FASTA (ccds) for pF1KB9608
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9608, 284 aa
  1>>>pF1KB9608 284 - 284 aa - 284 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6786+/-0.000985; mu= 10.5385+/- 0.058
 mean_var=202.8747+/-41.232, 0's: 0 Z-trim(111.9): 929  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.090045
 statistics sampled from 11733 (12750) to 11733 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.392), width:  16
 Scan time:  2.590

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS476.1 ZNF691 gene_id:51058|Hs108|chr1          ( 284) 2058 279.6 1.8e-75
CCDS55595.1 ZNF691 gene_id:51058|Hs108|chr1        ( 315) 2058 279.6 1.9e-75
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15       ( 614)  898 129.3 6.7e-30
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11        ( 606)  882 127.2 2.8e-29
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 364)  876 126.2 3.5e-29
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 474)  876 126.3 4.2e-29
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9           ( 498)  876 126.3 4.3e-29
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665)  872 126.0 7.3e-29
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667)  872 126.0 7.3e-29
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692)  872 126.0 7.5e-29
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 580)  870 125.6 8.1e-29
CCDS42462.1 ZNF554 gene_id:115196|Hs108|chr19      ( 538)  869 125.5 8.4e-29
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 644)  870 125.7 8.6e-29
CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8        ( 529)  866 125.1 1.1e-28
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6       ( 358)  859 123.9 1.6e-28
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9       ( 699)  861 124.6   2e-28
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19       ( 670)  860 124.4 2.2e-28
CCDS10494.2 ZNF205 gene_id:7755|Hs108|chr16        ( 554)  858 124.1 2.3e-28
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX          ( 779)  857 124.1 3.1e-28
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19       ( 687)  854 123.7 3.8e-28
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19       ( 715)  854 123.7 3.9e-28
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19         ( 718)  854 123.7 3.9e-28
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19      ( 808)  854 123.8 4.2e-28
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19      ( 924)  854 123.8 4.5e-28
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461)  849 122.8 4.7e-28
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1          ( 470)  847 122.5 5.6e-28
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616)  848 122.8 6.1e-28
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3        ( 754)  849 123.1 6.3e-28
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658)  848 122.9 6.3e-28
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670)  848 122.9 6.4e-28
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682)  848 122.9 6.4e-28
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682)  846 122.6 7.7e-28
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16       ( 869)  847 122.9 8.2e-28
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 568)  842 122.0 9.9e-28
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19      ( 936)  845 122.7   1e-27
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5         ( 604)  842 122.0   1e-27
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19      ( 616)  842 122.0   1e-27
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 620)  842 122.0   1e-27
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7           ( 446)  839 121.5 1.1e-27
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17       ( 761)  841 122.0 1.3e-27
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3         ( 544)  838 121.5 1.4e-27
CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15      ( 483)  837 121.3 1.4e-27
CCDS7205.2 ZNF485 gene_id:220992|Hs108|chr10       ( 441)  836 121.1 1.5e-27
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19      ( 617)  835 121.1   2e-27
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738)  836 121.4   2e-27
CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3    ( 864)  837 121.6   2e-27
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19        ( 748)  836 121.4   2e-27
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19       ( 678)  835 121.2 2.1e-27
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 503)  833 120.8 2.1e-27
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19        ( 799)  836 121.4 2.1e-27


>>CCDS476.1 ZNF691 gene_id:51058|Hs108|chr1               (284 aa)
 initn: 2058 init1: 2058 opt: 2058  Z-score: 1468.3  bits: 279.6 E(32554): 1.8e-75
Smith-Waterman score: 2058; 100.0% identity (100.0% similar) in 284 aa overlap (1-284:1-284)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 VTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 FSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 ATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280    
pF1KB9 AHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
              250       260       270       280    

>>CCDS55595.1 ZNF691 gene_id:51058|Hs108|chr1             (315 aa)
 initn: 2058 init1: 2058 opt: 2058  Z-score: 1467.8  bits: 279.6 E(32554): 1.9e-75
Smith-Waterman score: 2058; 100.0% identity (100.0% similar) in 284 aa overlap (1-284:32-315)

                                             10        20        30
pF1KB9                               MGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SLCSPTHSAEMSLFLQGPEEMLPLSSEGSEMGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEG
              10        20        30        40        50        60 

               40        50        60        70        80        90
pF1KB9 SWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCG
              70        80        90       100       110       120 

              100       110       120       130       140       150
pF1KB9 KTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFR
             130       140       150       160       170       180 

              160       170       180       190       200       210
pF1KB9 RRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSS
             190       200       210       220       230       240 

              220       230       240       250       260       270
pF1KB9 FGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRH
             250       260       270       280       290       300 

              280    
pF1KB9 QKTHLGEQAGKDSS
       ::::::::::::::
CCDS55 QKTHLGEQAGKDSS
             310     

>>CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15            (614 aa)
 initn: 7378 init1: 893 opt: 898  Z-score: 650.3  bits: 129.3 E(32554): 6.7e-30
Smith-Waterman score: 898; 54.0% identity (73.6% similar) in 235 aa overlap (50-281:297-531)

      20        30        40        50         60        70        
pF1KB9 GKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHP-KKPWQKVTVRARELGDP--IAHPR
                                     :. :  .::.: .        .:  ::: :
CCDS10 RHQTTHTGEKPYKCRDCGKSFSRSANLITHQRIHTGEKPFQCAECGKSFSRSPNLIAHQR
        270       280       290       300       310       320      

         80        90       100       110       120       130      
pF1KB9 HEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLE
        .. :::. : .:::.:.: :.: ::: ::::::::.:.:::.::: .:: :::.:::  
CCDS10 THTGEKPYSCPECGKSFGNRSSLNTHQGIHTGEKPYECKECGESFSYNSNLIRHQRIHTG
        330       340       350       360       370       380      

        140       150       160       170       180       190      
pF1KB9 EKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPY
       :: :::  : . : . : : ::.. : :..::.:. ::::::.:..::.:.:::.   ::
CCDS10 EKPYKCTDCGQRFSQSSALITHRRTHTGEKPYQCSECGKSFSRSSNLATHRRTHMVEKPY
        390       400       410       420       430       440      

        200       210       220       230       240       250      
pF1KB9 ICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTV
        :  ::::::.:::. .:.  ::::.::::  ::..::  ::.  ::: : :::::.:. 
CCDS10 KCGVCGKSFSQSSSLIAHQGMHTGEKPYECLTCGESFSWSSNLLKHQRIHTGEKPYKCSE
        450       460       470       480       490       500      

        260       270       280                                    
pF1KB9 CGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS                                
       ::: ::. :.:. ::.:: ::.  :                                   
CCDS10 CGKCFSQRSQLVVHQRTHTGEKPYKCLMCGKSFSRGSILVMHQRAHLGDKPYRCPECGKG
        510       520       530       540       550       560      

>>CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11             (606 aa)
 initn: 3811 init1: 870 opt: 882  Z-score: 639.1  bits: 127.2 E(32554): 2.8e-29
Smith-Waterman score: 882; 50.2% identity (72.4% similar) in 243 aa overlap (38-278:310-552)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB9 SPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVTVRARE
                                     :  .: :   . :..: .. . :.      
CCDS31 VDGNFHQSSGVHFHQRVHIGEVPYSCNACGKSFSQISSLHNHQRVHTEEKFYKIECDKDL
     280       290       300       310       320       330         

        70          80        90       100       110       120     
pF1KB9 LGDPI--AHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSS
         . .   : : .  :::: : ::::.:: .: :..:::.:::::::::.::::.::.::
CCDS31 SRNSLLHIHQRLHIGEKPFKCNQCGKSFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSQSS
     340       350       360       370       380       390         

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB9 NRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAV
       :   :. .:  :: :::  : ..: .::.:  ::. : :..::.:: :::.::.:. : .
CCDS31 NLRIHQLVHTGEKSYKCEDCGKGFTQRSNLQIHQRVHTGEKPYKCDDCGKDFSHSSDLRI
     400       410       420       430       440       450         

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB9 HHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRT
       :.:.:    :: : ::::.::.::.. .:.:.::::.::.: :::. ::. :..  :::.
CCDS31 HQRVHTGEKPYTCPECGKGFSKSSKLHTHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQRSHLLIHQRV
     460       470       480       490       500       510         

         250       260       270       280                         
pF1KB9 HRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS                     
       : :::::.:  ::: ::.::::  ::..: ::.                           
CCDS31 HTGEKPYKCHDCGKGFSHSSNLHIHQRVHTGEKPYQCAKCGKGFSHSSALRIHQRVHAGE
     520       530       540       550       560       570         

CCDS31 KPYKCREYYKGFDHNSHLHNNHRRGNL
     580       590       600      

>>CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9               (364 aa)
 initn: 2509 init1: 859 opt: 876  Z-score: 637.3  bits: 126.2 E(32554): 3.5e-29
Smith-Waterman score: 892; 47.9% identity (71.3% similar) in 261 aa overlap (33-283:1-258)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB9 SEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVT
                                     .:::...::  .:   ..     .: :.: 
CCDS75                               MPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVP
                                             10        20        30

                       70        80        90       100       110  
pF1KB9 VRAREL----------GDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPY
       :.::            .. : .: :.:  ::. : .:::.:.  :.:  ::. :::::::
CCDS75 VEARPRKCETHTESFKNSEILKP-HRA--KPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPY
               40        50           60        70        80       

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB9 KCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDI
       .::::::.::.::. :.:.:::  :: ::: .: ..: . ..:: ::. : :..::::. 
CCDS75 ECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSE
        90       100       110       120       130       140       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB9 CGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRT
       : :.::. ..:. :.: :    :: : .:::.: .:...  :.::::::.::.:.:::..
CCDS75 CEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKA
       150       160       170       180       190       200       

            240       250       260       270       280            
pF1KB9 FSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS        
       ::  . :  ::: : :::::::..::: ::.:.::  ::.:: ::.  : :         
CCDS75 FSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQS
       210       220       230       240       250       260       

CCDS75 TNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLS
       270       280       290       300       310       320       

>--
 initn: 447 init1: 447 opt: 447  Z-score: 336.1  bits: 70.4 E(32554): 2.1e-12
Smith-Waterman score: 447; 55.2% identity (77.1% similar) in 105 aa overlap (173-277:260-364)

            150       160       170       180       190       200  
pF1KB9 PKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECG
                                     :::.::::..: .:..::    :: : :::
CCDS75 AACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECG
     230       240       250       260       270       280         

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB9 KSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFS
       : ::.::..  ::  ::::.::::.:::..:.. :... ::: : : :::.:. ::: : 
CCDS75 KFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFR
     290       300       310       320       330       340         

            270       280    
pF1KB9 RSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
        :: ..:::. : ::       
CCDS75 CSSAFVRHQRLHAGE       
     350       360           

>>CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9               (474 aa)
 initn: 2509 init1: 859 opt: 876  Z-score: 636.0  bits: 126.3 E(32554): 4.2e-29
Smith-Waterman score: 892; 47.9% identity (71.3% similar) in 261 aa overlap (33-283:111-368)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB9 SEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVT
                                     .:::...::  .:   ..     .: :.: 
CCDS69 RSPSPGWKIISGSPPEQALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVP
               90       100       110       120       130       140

                       70        80        90       100       110  
pF1KB9 VRAREL----------GDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPY
       :.::            .. : .: :.:  ::. : .:::.:.  :.:  ::. :::::::
CCDS69 VEARPRKCETHTESFKNSEILKP-HRA--KPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPY
              150       160          170       180       190       

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB9 KCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDI
       .::::::.::.::. :.:.:::  :: ::: .: ..: . ..:: ::. : :..::::. 
CCDS69 ECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSE
       200       210       220       230       240       250       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB9 CGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRT
       : :.::. ..:. :.: :    :: : .:::.: .:...  :.::::::.::.:.:::..
CCDS69 CEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKA
       260       270       280       290       300       310       

            240       250       260       270       280            
pF1KB9 FSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS        
       ::  . :  ::: : :::::::..::: ::.:.::  ::.:: ::.  : :         
CCDS69 FSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQS
       320       330       340       350       360       370       

CCDS69 TNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLS
       380       390       400       410       420       430       

>--
 initn: 447 init1: 447 opt: 447  Z-score: 334.8  bits: 70.6 E(32554): 2.5e-12
Smith-Waterman score: 447; 55.2% identity (77.1% similar) in 105 aa overlap (173-277:370-474)

            150       160       170       180       190       200  
pF1KB9 PKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECG
                                     :::.::::..: .:..::    :: : :::
CCDS69 AACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECG
     340       350       360       370       380       390         

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB9 KSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFS
       : ::.::..  ::  ::::.::::.:::..:.. :... ::: : : :::.:. ::: : 
CCDS69 KFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFR
     400       410       420       430       440       450         

            270       280    
pF1KB9 RSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
        :: ..:::. : ::       
CCDS69 CSSAFVRHQRLHAGE       
     460       470           

>>CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9                (498 aa)
 initn: 2509 init1: 859 opt: 876  Z-score: 635.8  bits: 126.3 E(32554): 4.3e-29
Smith-Waterman score: 892; 47.9% identity (71.3% similar) in 261 aa overlap (33-283:135-392)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB9 SEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHGQESLSDELQETHPKKPWQKVT
                                     .:::...::  .:   ..     .: :.: 
CCDS68 RSPSPGWKIISGSPPEQALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVP
          110       120       130       140       150       160    

                       70        80        90       100       110  
pF1KB9 VRAREL----------GDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNTSNLRTHQRIHTGEKPY
       :.::            .. : .: :.:  ::. : .:::.:.  :.:  ::. :::::::
CCDS68 VEARPRKCETHTESFKNSEILKP-HRA--KPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPY
          170       180        190         200       210       220 

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB9 KCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDI
       .::::::.::.::. :.:.:::  :: ::: .: ..: . ..:: ::. : :..::::. 
CCDS68 ECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSE
             230       240       250       260       270       280 

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB9 CGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRT
       : :.::. ..:. :.: :    :: : .:::.: .:...  :.::::::.::.:.:::..
CCDS68 CEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKA
             290       300       310       320       330       340 

            240       250       260       270       280            
pF1KB9 FSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS        
       ::  . :  ::: : :::::::..::: ::.:.::  ::.:: ::.  : :         
CCDS68 FSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQS
             350       360       370       380       390       400 

CCDS68 TNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLS
             410       420       430       440       450       460 

>--
 initn: 447 init1: 447 opt: 447  Z-score: 334.6  bits: 70.6 E(32554): 2.6e-12
Smith-Waterman score: 447; 55.2% identity (77.1% similar) in 105 aa overlap (173-277:394-498)

            150       160       170       180       190       200  
pF1KB9 PKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECG
                                     :::.::::..: .:..::    :: : :::
CCDS68 AACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECG
           370       380       390       400       410       420   

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB9 KSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFS
       : ::.::..  ::  ::::.::::.:::..:.. :... ::: : : :::.:. ::: : 
CCDS68 KFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFR
           430       440       450       460       470       480   

            270       280    
pF1KB9 RSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
        :: ..:::. : ::       
CCDS68 CSSAFVRHQRLHAGE       
           490               

>>CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (665 aa)
 initn: 6281 init1: 864 opt: 872  Z-score: 631.6  bits: 126.0 E(32554): 7.3e-29
Smith-Waterman score: 872; 44.9% identity (71.7% similar) in 272 aa overlap (15-278:278-548)

                               10        20        30        40    
pF1KB9                 MGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHG---
                                     : :.  .: ... .: . ::  :...    
CCDS62 FSDRIQSFCHGTPLHIHEKIHGGGKTFDFKECGQVLNP-KISHNEQQRIPFEESQYKCSE
       250       260       270       280        290       300      

                 50          60        70        80        90      
pF1KB9 ---QESLSDELQETHPKKPWQ--KVTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNT
          . ::.......  .::..  .        .  .:: : .. :::. :..:::.:. .
CCDS62 TSHSSSLTQNMRNNSEEKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRS
        310       320       330       340       350       360      

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB9 SNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLT
       :.: .::: :::::::.:..::::::.:   . :.: :  :: :.: .: .:::.   : 
CCDS62 SHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLI
        370       380       390       400       410       420      

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB9 THQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHR
       .::. : :..::.:. ::::: ::  : .:.: :    :: : .::::::.: .. .:.:
CCDS62 AHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQR
        430       440       450       460       470       480      

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB9 THTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLG
       :::::.:.::..::..::  :.. :::::: :::::.:. ::: :.:::.:. ::. : :
CCDS62 THTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTG
        490       500       510       520       530       540      

        280                                                        
pF1KB9 EQAGKDSS                                                    
       :.                                                          
CCDS62 EKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPF
        550       560       570       580       590       600      

>--
 initn: 480 init1: 480 opt: 480  Z-score: 356.4  bits: 75.1 E(32554): 1.6e-13
Smith-Waterman score: 480; 58.0% identity (75.9% similar) in 112 aa overlap (167-278:549-660)

        140       150       160       170       180       190      
pF1KB9 EKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPY
                                     ::.:. :::::::: .:.::.:::    ::
CCDS62 EKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPY
      520       530       540       550       560       570        

        200       210       220       230       240       250      
pF1KB9 ICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTV
        : .::::: .:: .  :.::::::.:.::..::.:::  . . .::::: ::::. :  
CCDS62 ECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQ
      580       590       600       610       620       630        

        260       270       280    
pF1KB9 CGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
       ::: :  : .::::: ::  :.      
CCDS62 CGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN 
      640       650       660      

>>CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (667 aa)
 initn: 6281 init1: 864 opt: 872  Z-score: 631.6  bits: 126.0 E(32554): 7.3e-29
Smith-Waterman score: 872; 44.9% identity (71.7% similar) in 272 aa overlap (15-278:280-550)

                               10        20        30        40    
pF1KB9                 MGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHG---
                                     : :.  .: ... .: . ::  :...    
CCDS62 FSDRIQSFCHGTPLHIHEKIHGGGKTFDFKECGQVLNP-KISHNEQQRIPFEESQYKCSE
     250       260       270       280        290       300        

                 50          60        70        80        90      
pF1KB9 ---QESLSDELQETHPKKPWQ--KVTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNT
          . ::.......  .::..  .        .  .:: : .. :::. :..:::.:. .
CCDS62 TSHSSSLTQNMRNNSEEKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRS
      310       320       330       340       350       360        

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB9 SNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLT
       :.: .::: :::::::.:..::::::.:   . :.: :  :: :.: .: .:::.   : 
CCDS62 SHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLI
      370       380       390       400       410       420        

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB9 THQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHR
       .::. : :..::.:. ::::: ::  : .:.: :    :: : .::::::.: .. .:.:
CCDS62 AHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQR
      430       440       450       460       470       480        

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB9 THTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLG
       :::::.:.::..::..::  :.. :::::: :::::.:. ::: :.:::.:. ::. : :
CCDS62 THTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTG
      490       500       510       520       530       540        

        280                                                        
pF1KB9 EQAGKDSS                                                    
       :.                                                          
CCDS62 EKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPF
      550       560       570       580       590       600        

>--
 initn: 480 init1: 480 opt: 480  Z-score: 356.4  bits: 75.1 E(32554): 1.6e-13
Smith-Waterman score: 480; 58.0% identity (75.9% similar) in 112 aa overlap (167-278:551-662)

        140       150       160       170       180       190      
pF1KB9 EKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPY
                                     ::.:. :::::::: .:.::.:::    ::
CCDS62 EKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPY
              530       540       550       560       570       580

        200       210       220       230       240       250      
pF1KB9 ICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTV
        : .::::: .:: .  :.::::::.:.::..::.:::  . . .::::: ::::. :  
CCDS62 ECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQ
              590       600       610       620       630       640

        260       270       280    
pF1KB9 CGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
       ::: :  : .::::: ::  :.      
CCDS62 CGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN 
              650       660        

>>CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (692 aa)
 initn: 6281 init1: 864 opt: 872  Z-score: 631.5  bits: 126.0 E(32554): 7.5e-29
Smith-Waterman score: 872; 44.9% identity (71.7% similar) in 272 aa overlap (15-278:305-575)

                               10        20        30        40    
pF1KB9                 MGSEKEQSPEPHLPEEGEGGKPWRVDDSEGSWIPPGEKEHG---
                                     : :.  .: ... .: . ::  :...    
CCDS12 FSDRIQSFCHGTPLHIHEKIHGGGKTFDFKECGQVLNP-KISHNEQQRIPFEESQYKCSE
          280       290       300       310        320       330   

                 50          60        70        80        90      
pF1KB9 ---QESLSDELQETHPKKPWQ--KVTVRARELGDPIAHPRHEADEKPFICAQCGKTFNNT
          . ::.......  .::..  .        .  .:: : .. :::. :..:::.:. .
CCDS12 TSHSSSLTQNMRNNSEEKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRS
           340       350       360       370       380       390   

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB9 SNLRTHQRIHTGEKPYKCSECGKSFSRSSNRIRHERIHLEEKHYKCPKCQESFRRRSDLT
       :.: .::: :::::::.:..::::::.:   . :.: :  :: :.: .: .:::.   : 
CCDS12 SHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLI
           400       410       420       430       440       450   

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB9 THQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPYICCECGKSFSNSSSFGVHHR
       .::. : :..::.:. ::::: ::  : .:.: :    :: : .::::::.: .. .:.:
CCDS12 AHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQR
           460       470       480       490       500       510   

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB9 THTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTVCGKHFSRSSNLIRHQKTHLG
       :::::.:.::..::..::  :.. :::::: :::::.:. ::: :.:::.:. ::. : :
CCDS12 THTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTG
           520       530       540       550       560       570   

        280                                                        
pF1KB9 EQAGKDSS                                                    
       :.                                                          
CCDS12 EKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPF
           580       590       600       610       620       630   

>--
 initn: 480 init1: 480 opt: 480  Z-score: 356.2  bits: 75.1 E(32554): 1.6e-13
Smith-Waterman score: 480; 58.0% identity (75.9% similar) in 112 aa overlap (167-278:576-687)

        140       150       160       170       180       190      
pF1KB9 EKHYKCPKCQESFRRRSDLTTHQQDHLGKRPYRCDICGKSFSQSATLAVHHRTHLEPAPY
                                     ::.:. :::::::: .:.::.:::    ::
CCDS12 EKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPY
         550       560       570       580       590       600     

        200       210       220       230       240       250      
pF1KB9 ICCECGKSFSNSSSFGVHHRTHTGERPYECTECGRTFSDISNFGAHQRTHRGEKPYRCTV
        : .::::: .:: .  :.::::::.:.::..::.:::  . . .::::: ::::. :  
CCDS12 ECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQ
         610       620       630       640       650       660     

        260       270       280    
pF1KB9 CGKHFSRSSNLIRHQKTHLGEQAGKDSS
       ::: :  : .::::: ::  :.      
CCDS12 CGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN 
         670       680       690   




284 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 17:40:52 2016 done: Fri Nov  4 17:40:52 2016
 Total Scan time:  2.590 Total Display time:  0.050

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com