Result of SIM4 for pF1KB8976

seq1 = pF1KB8976.tfa, 1116 bp
seq2 = pF1KB8976/gi568815587f_118783942.tfa (gi568815587f:118783942_118994660), 210719 bp

>pF1KB8976 1116
>gi568815587f:118783942_118994660 (Chr11)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-1116  (109655-110719)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACTACCCGCTAACGCTGGAAATGGACCTCGAGAACCTGGAGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACTACCCGCTAACGCTGGAAATGGACCTCGAGAACCTGGAGGACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         TTCTGGGAACTGGACAGATTGGACAACTATAACGACACCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTG...CAGTTCTGGGAACTGGACAGATTGGACAACTATAACGACACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCTGGTGGAAAATCATCTCTGCCCTGCCACAGAGGGGCCCCTCATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109695 CCCTGGTGGAAAATCATCTCTGCCCTGCCACAGAGGGGCCCCTCATGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCTTCAAGGCCGTGTTCGTGCCCGTGGCCTACAGCCTCATCTTCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109745 TCCTTCAAGGCCGTGTTCGTGCCCGTGGCCTACAGCCTCATCTTCCTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGCGTGATCGGCAACGTCCTGGTGCTGGTGATCCTGGAGCGGCACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109795 GGGCGTGATCGGCAACGTCCTGGTGCTGGTGATCCTGGAGCGGCACCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGACACGCAGTTCCACGGAGACCTTCCTGTTCCACCTGGCCGTGGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109845 AGACACGCAGTTCCACGGAGACCTTCCTGTTCCACCTGGCCGTGGCCGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCCTGCTGGTCTTCATCTTGCCCTTTGCCGTGGCCGAGGGCTCTGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109895 CTCCTGCTGGTCTTCATCTTGCCCTTTGCCGTGGCCGAGGGCTCTGTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTGGGTCCTGGGGACCTTCCTCTGCAAAACTGTGATTGCCCTGCACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109945 CTGGGTCCTGGGGACCTTCCTCTGCAAAACTGTGATTGCCCTGCACAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCAACTTCTACTGCAGCAGCCTGCTCCTGGCCTGCATCGCCGTGGACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109995 TCAACTTCTACTGCAGCAGCCTGCTCCTGGCCTGCATCGCCGTGGACCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TACCTGGCCATTGTCCACGCCGTCCATGCCTACCGCCACCGCCGCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110045 TACCTGGCCATTGTCCACGCCGTCCATGCCTACCGCCACCGCCGCCTCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CTCCATCCACATCACCTGTGGGACCATCTGGCTGGTGGGCTTCCTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110095 CTCCATCCACATCACCTGTGGGACCATCTGGCTGGTGGGCTTCCTCCTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCTTGCCAGAGATTCTCTTCGCCAAAGTCAGCCAAGGCCATCACAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110145 CCTTGCCAGAGATTCTCTTCGCCAAAGTCAGCCAAGGCCATCACAACAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TCCCTGCCACGTTGCACCTTCTCCCAAGAGAACCAAGCAGAAACGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110195 TCCCTGCCACGTTGCACCTTCTCCCAAGAGAACCAAGCAGAAACGCATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTGGTTCACCTCCCGATTCCTCTACCATGTGGCGGGATTCCTGCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110245 CTGGTTCACCTCCCGATTCCTCTACCATGTGGCGGGATTCCTGCTGCCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGCTGGTGATGGGCTGGTGCTACGTGGGGGTAGTGCACAGGTTGCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110295 TGCTGGTGATGGGCTGGTGCTACGTGGGGGTAGTGCACAGGTTGCGCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCCCAGCGGCGCCCTCAGCGGCAGAAGGCAGTCAGGGTGGCCATCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110345 GCCCAGCGGCGCCCTCAGCGGCAGAAGGCAGTCAGGGTGGCCATCCTGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GACAAGCATCTTCTTCCTCTGCTGGTCACCCTACCACATCGTCATCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110395 GACAAGCATCTTCTTCCTCTGCTGGTCACCCTACCACATCGTCATCTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TGGACACCCTGGCGAGGCTGAAGGCCGTGGACAATACCTGCAAGCTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110445 TGGACACCCTGGCGAGGCTGAAGGCCGTGGACAATACCTGCAAGCTGAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GGCTCTCTCCCCGTGGCCATCACCATGTGTGAGTTCCTGGGCCTGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110495 GGCTCTCTCCCCGTGGCCATCACCATGTGTGAGTTCCTGGGCCTGGCCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTGCTGCCTCAACCCCATGCTCTACACTTTCGCCGGCGTGAAGTTCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110545 CTGCTGCCTCAACCCCATGCTCTACACTTTCGCCGGCGTGAAGTTCCGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GTGACCTGTCGCGGCTCCTGACCAAGCTGGGCTGTACCGGCCCTGCCTCC
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 110595 GTGACCTGTCGCGGCTCCTGACGAAGCTGGGCTGTACCGGCCCTGCCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CTGTGCCAGCTCTTCCCTAGCTGGCGCAGGAGCAGTCTCTCTGAGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110645 CTGTGCCAGCTCTTCCCTAGCTGGCGCAGGAGCAGTCTCTCTGAGTCAGA

   1100     .    :    .    :    .
   1092 GAATGCCACCTCTCTCACCACGTTC
        |||||||||||||||||||||||||
 110695 GAATGCCACCTCTCTCACCACGTTC

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