Result of SIM4 for pF1KB8917

seq1 = pF1KB8917.tfa, 780 bp
seq2 = pF1KB8917/gi568815586f_53900189.tfa (gi568815586f:53900189_54102671), 202483 bp

>pF1KB8917 780
>gi568815586f:53900189_54102671 (Chr12)

1-538  (100001-100538)   100% ->
539-780  (102242-102483)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGCGACGGGGCCCATCAGTAACTATTACGTGGACTCGCTCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGCGACGGGGCCCATCAGTAACTATTACGTGGACTCGCTCATCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCACGACAATGAAGACCTCCTAGCGTCCAGGTTTCCGGCCACCGGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCACGACAATGAAGACCTCCTAGCGTCCAGGTTTCCGGCCACCGGGGCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATCCCGCCGCCGCCAGACCCAGCGGTTTGGTGCCGGACTGTAGCGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATCCCGCCGCCGCCAGACCCAGCGGTTTGGTGCCGGACTGTAGCGATTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGTCCTGTAGCTTCGCGCCCAAGCCGGCAGTGTTCAGCACGTCGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGTCCTGTAGCTTCGCGCCCAAGCCGGCAGTGTTCAGCACGTCGTGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCCGTGCCCTCTCAGTCGTCCGTGGTATATCACCCGTACGGCCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCCGTGCCCTCTCAGTCGTCCGTGGTATATCACCCGTACGGCCCCCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCACCTCGGCGCCGACACGCGCTACATGCGGACTTGGCTCGAGCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCACCTCGGCGCCGACACGCGCTACATGCGGACTTGGCTCGAGCCGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCGGCGCCGTCTCCTTCCCCAGCTTCCCGGCCGGGGGCCGTCACTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCCGGCGCCGTCTCCTTCCCCAGCTTCCCGGCCGGGGGCCGTCACTACGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTCAAGCCGGACGCCTACCCCGGGCGCCGCGCGGACTGCGGCCCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTCAAGCCGGACGCCTACCCCGGGCGCCGCGCGGACTGCGGCCCAGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGGCCGCAGCTACCCGGACTACATGTACGGCTCGCCCGGGGAGCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGGCCGCAGCTACCCGGACTACATGTACGGCTCGCCCGGGGAGCTGCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACCGCGCCCCGCAGACACTGCCCTCGCCCGAGGCGGACGCGCTCGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GACCGCGCCCCGCAGACACTGCCCTCGCCCGAGGCGGACGCGCTCGCCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGCAAGCACAAAGAGGAGAAGGCCGACCTGGACCCCA         GCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100501 CAGCAAGCACAAAGAGGAGAAGGCCGACCTGGACCCCAGTA...CAGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACCCCGTGGCCAACTGGATTCACGCCCGCTCCACGAGGAAGAAGCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102245 ACCCCGTGGCCAACTGGATTCACGCCCGCTCCACGAGGAAGAAGCGCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCCTACACCAAGTACCAGACGCTGGAACTGGAGAAGGAGTTTCTCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102295 CCCTACACCAAGTACCAGACGCTGGAACTGGAGAAGGAGTTTCTCTTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TATGTATTTAACCAGGGACCGTCGGTATGAGGTGGCCCGGGTTCTCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102345 TATGTATTTAACCAGGGACCGTCGGTATGAGGTGGCCCGGGTTCTCAATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCACCGAGCGGCAGGTCAAAATCTGGTTTCAGAATCGAAGGATGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102395 TCACCGAGCGGCAGGTCAAAATCTGGTTTCAGAATCGAAGGATGAAGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .
    742 AAAAAGATGAATAAAGAGAAAACCGACAAGGAGCAGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102445 AAAAAGATGAATAAAGAGAAAACCGACAAGGAGCAGTCC

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