Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8839
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8839, 466 aa
1>>>pF1KB8839 466 - 466 aa - 466 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6365+/-0.00106; mu= 11.5871+/- 0.064
mean_var=184.9119+/-66.663, 0's: 0 Z-trim(106.3): 233 B-trim: 1079 in 2/51
Lambda= 0.094317
statistics sampled from 8402 (8906) to 8402 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16
Scan time: 3.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 3081 432.5 4.4e-121
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 1744 250.6 2.6e-66
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 957 143.7 5.1e-34
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 919 138.3 1.6e-32
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 897 135.4 1.4e-31
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 479 78.5 1.6e-14
CCDS13493.1 HRH3 gene_id:11255|Hs108|chr20 ( 445) 470 77.2 3.8e-14
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 455 75.2 1.5e-13
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 ( 487) 452 74.8 2.2e-13
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 443 73.5 4.5e-13
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 439 72.9 6e-13
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 439 73.0 6.9e-13
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 439 73.0 7.2e-13
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 439 73.0 7.3e-13
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 439 73.1 7.4e-13
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 428 71.4 1.8e-12
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 424 70.9 2.6e-12
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 415 69.6 6e-12
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 408 68.9 1.4e-11
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 404 68.3 2e-11
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 403 68.1 2.1e-11
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 403 68.1 2.1e-11
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 403 68.2 2.2e-11
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 399 67.5 2.9e-11
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 393 66.8 5.4e-11
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 392 66.6 6.1e-11
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 393 66.9 6.3e-11
>>CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 (466 aa)
initn: 3081 init1: 3081 opt: 3081 Z-score: 2287.3 bits: 432.5 E(32554): 4.4e-121
Smith-Waterman score: 3081; 100.0% identity (100.0% similar) in 466 aa overlap (1-466:1-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MNNSTNSSNNSLALTSPYKTFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVNRHLQTVNNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MNNSTNSSNNSLALTSPYKTFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVNRHLQTVNNY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 FLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASVMNLLIISFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASVMNLLIISFD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVGVRTVEDGECYIQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVGVRTVEDGECYIQF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 FSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRIKKDKKEPVANQDPVSPSLVQGRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRIKKDKKEPVANQDPVSPSLVQGRI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VKPNNNNMPSSDDGLEHNKIQNGKAPRDPVTENCVQGEEKESSNDSTSVSAVASNMRDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VKPNNNNMPSSDDGLEHNKIQNGKAPRDPVTENCVQGEEKESSNDSTSVSAVASNMRDDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ITQDENTVSTSLGHSKDENSKQTCIRIGTKTPKSDSCTPTNTTVEVVGSSGQNGDEKQNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ITQDENTVSTSLGHSKDENSKQTCIRIGTKTPKSDSCTPTNTTVEVVGSSGQNGDEKQNI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VARKIVKMTKQPAKKKPPPSREKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIPNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VARKIVKMTKQPAKKKPPPSREKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIPNT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB8 VWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLMCHYKNIGATR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLMCHYKNIGATR
430 440 450 460
>>CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 (479 aa)
initn: 1686 init1: 1158 opt: 1744 Z-score: 1304.0 bits: 250.6 E(32554): 2.6e-66
Smith-Waterman score: 1744; 57.7% identity (79.4% similar) in 480 aa overlap (1-466:7-479)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MNNSTNSSNNSLALTSP---YKTFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVN
.:.:..... :. .: :.: :.:::. :.:::::::..::::::.:::::
CCDS44 MANFTPVNGSSGNQSVRLVTSSSHNRYETVEMVFIATVTGSLSLVTVVGNILVMLSIKVN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 RHLQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASV
:.::::::::::::::::::::.:::::::.: . :::::: ::::::::::::::::::
CCDS44 RQLQTVNNYFLFSLACADLIIGAFSMNLYTVYIIKGYWPLGAVVCDLWLALDYVVSNASV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 MNLLIISFDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVGVRTV
:::::::::::::::::::::..:::::::.::::::::::.:::::::::::.:: :::
CCDS44 MNLLIISFDRYFCVTKPLTYPARRTTKMAGLMIAAAWVLSFVLWAPAILFWQFVVGKRTV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EDGECYIQFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRIKKDKKEPVANQDPV
:..:.:::.:: :::::::::::::::.:::::: ::: ::.::..: . : ..
CCDS44 PDNQCFIQFLSNPAVTFGTAIAAFYLPVVIMTVLYIHISLASRSRVHKHRPEGPKEKKAK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB8 SPSLVQGRIVKPNNNNMPSSD---DGLEHNKIQNGKAPRDPVTENCVQGEEKESSNDSTS
. ..... ..: . .. : .. . :...:.... : : : .:..::.:.:
CCDS44 TLAFLKSPLMKQSVKKPPPGEAAREELRNGKLEEAPPPALPPPPRPVA--DKDTSNESSS
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 VSAV-------ASNMRDDEITQDENTVSTSLGHSKDENSKQTCIRIGTKTPKSDSCTPTN
::. :... : : . .. . :. . :.: :: .. :.
CCDS44 GSATQNTKERPATELSTTEATTPAMPAPPLQPRALNPASRWSKIQIVTKQT-GNECV---
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 TTVEVVGSSGQNGDEKQNIVARKIVKMTK-QPAKKKPPPSREKKVTRTILAILLAFIITW
:..:.: .. : . ::::...... : ::. .::.::::::.:::::::.::
CCDS44 TAIEIVPAT-PAGMRPAANVARKFASIARNQVRKKRQMAARERKVTRTIFAILLAFILTW
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 APYNVMVLINTFCAPCIPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLMCHYK
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CCDS44 TPYNVMVLVNTFCQSCIPDTVWSIGYWLCYVNSTINPACYALCNATFKKTFRHLLLCQYR
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 NIGATR
:::..:
CCDS44 NIGTAR
>>CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 (590 aa)
initn: 1355 init1: 944 opt: 957 Z-score: 724.2 bits: 143.7 E(32554): 5.1e-34
Smith-Waterman score: 1238; 44.1% identity (69.2% similar) in 481 aa overlap (18-439:63-543)
10 20 30 40
pF1KB8 MNNSTNSSNNSLALTSPYKTFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVS
. ...::::....: :.::::::::::.::
CCDS16 TVTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGTTDDPLGGHTVWQVVFIAFLTGILALVTIIGNILVIVS
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 IKVNRHLQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVS
.:::..:.:::::::.:::::::::::.::::.: : ... : :: ..::::::.:::.:
CCDS16 FKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLAIDYVAS
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 NASVMNLLIISFDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVG
::::::::.::::::: .:.:::: .::::: ::.::. :::.::.::::::::::..::
CCDS16 NASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVG
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210
pF1KB8 VRTVEDGECYIQFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRIKK--------
::: :::.:::.:. ..::::::::::.:: :::.:::.: . ...: :.
CCDS16 KRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEKRTKELAGLQASG
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250
pF1KB8 DKKE------PVANQDPVSPSLVQGRIVKPNNNNM--------------PSSDDGLEHNK
. : :.... : .: . .: .: :::.. . ..
CCDS16 TEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRSNRRKYGRCHFWFTTKSWKPSSEQMDQDHS
280 290 300 310 320 330
260 270 280 290 300
pF1KB8 IQNGKAPRDPVT--ENCVQGEEKESSNDSTSVSAVASNM--------------RDDEITQ
... : .. :: ....:.. .... .. ... .. :. .
CCDS16 SSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRAIYSIVLKLPGHSTILNSTKLPSSDNLQVP
340 350 360 370 380 390
310 320 330 340 350
pF1KB8 DENTVSTSLGHSKDENSKQTCIRIGTKTPKSDSCTP--------TNTTVEVVGSSGQNGD
.:. ..: .. :. . : . : . ::: : : : : .: .: :..
CCDS16 EEELGMVDLERKADKLQAQKSVDDGGSFPKSFSKLPIQLESAVDTAKTSDVNSSVGKSTA
400 410 420 430 440 450
360 370 380 390 400
pF1KB8 E-----KQNIVARKIVKMTKQPAKKKPPPS--REKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVL
:. .:.... :.. :. : .:::...:. ::::::::::.:::.:::
CCDS16 TLPLSFKEATLAKRFALKTRSQITKRKRMSLVKEKKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVL
460 470 480 490 500 510
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 INTFCAPCIPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLMCHYKNIGATR
.:::: :::.: :..::::::::::.::.:
CCDS16 VNTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKTFRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQ
520 530 540 550 560 570
CCDS16 YQQRQSVIFHKRAPEQAL
580 590
>>CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 (460 aa)
initn: 1304 init1: 905 opt: 919 Z-score: 697.5 bits: 138.3 E(32554): 1.6e-32
Smith-Waterman score: 1311; 45.8% identity (72.2% similar) in 461 aa overlap (1-459:1-437)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MNNSTNSS-NNSLALTSPYK-TFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVNRHLQTVN
::.:. . . .... .: : ..:.:: ...: :::.:. ::.::..:.::: .:.:::
CCDS80 MNTSAPPAVSPNITVLAPGKGPWQVAFIGITTGLLSLATVTGNLLVLISFKVNTELKTVN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 NYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASVMNLLIIS
::::.::::::::::.::::::: : ..:.: :: ..::::::::::.:::::::::.::
CCDS80 NYFLLSLACADLIIGTFSMNLYTTYLLMGHWALGTLACDLWLALDYVASNASVMNLLLIS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 FDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVGVRTVEDGECYI
::::: ::.::.: .::: . :..::. ::..::.::::::::::..:: ::: :.:::
CCDS80 FDRYFSVTRPLSYRAKRTPRRAALMIGLAWLVSFVLWAPAILFWQYLVGERTVLAGQCYI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 QFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRIKKDKKEPVANQDPVSPSLVQG
::.:. .:::::.::::::: .: .:::.: : ...: .: .: : .:. :
CCDS80 QFLSQPIITFGTAMAAFYLPVTVMCTLYWRIYRETENRA----RELAALQGSETPGKGGG
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 RIVKPNNNNMPSSDDGLEHNKIQNGKAPRDPVTENCVQGEEKESSNDSTSVSAVASNMRD
. .. ..:... . : . . : : . . .:.: .... : ..: .
CCDS80 S-SSSSERSQPGAEGSPETPPGRCCRCCRAPRLLQAYSWKEEEEEDEGSMESLTSS---E
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 DEITQDENTVSTSLGHSKDENSKQTCIRIGTKTPKSDSCTPTNTTVEVVGSSGQNGDEKQ
: .: ... . . . . : . .: : ::. . .:. ::. :.
CCDS80 GEEPGSEVVIKMPMVDPEAQAPTKQPPRSSPNTVKR----PTKKGRDRAGK-GQKPRGKE
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 NIVARKIVKMTKQPAKKKPPPSREKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIP
... :: ...: :::..::. :::::::.::.:::.:::..::: :.:
CCDS80 QLAKRKTFSLVK-----------EKKAARTLSAILLAFILTWTPYNIMVLVSTFCKDCVP
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KB8 NTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLMCHYKNIGATR
.:.: .::::::.:::::: :::::: .:. ::. ::.:..
CCDS80 ETLWELGYWLCYVNSTINPMCYALCNKAFRDTFRLLLLCRWDKRRWRKIPKRPGSVHRTP
400 410 420 430 440 450
CCDS80 SRQC
460
>>CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 (532 aa)
initn: 1312 init1: 897 opt: 897 Z-score: 680.6 bits: 135.4 E(32554): 1.4e-31
Smith-Waterman score: 1233; 44.1% identity (68.4% similar) in 487 aa overlap (18-450:25-505)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MNNSTNSSNNSLALTSPYKTFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVNRH
.. .::. :. :.. .::.::.::.:::.:.::: .
CCDS10 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVTAVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASVMN
:.:::::.:.::::::::::.::::::: : ..: : :: ..::::::::::.:::::::
CCDS10 LKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWALGSLACDLWLALDYVASNASVMN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LLIISFDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVGVRTVED
::.::::::: .:.:::: .::: : ::.::. ::..:::::::::: ::..:: :::
CCDS10 LLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLISFILWAPAILCWQYLVGKRTVPL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB8 GECYIQFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRIK-------KDKKEPVA
:: :::.:. ..::::::::::.:: .::.:: .: : ...: : .:. .
CCDS10 DECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIYRETEKRTKDLADLQGSDSVTKAE
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 NQDPVSPSLVQGRIVKPNNNNMPSSDDGLEHNKIQNGKAPRDPVTENCVQGEEKESSN--
.. :. .: .. . : :. . :.:. . ... :. : . . :.:
CCDS10 KRKPAHRALFRSCLRCPR----PTLAQR-ERNQASWSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWA
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB8 ---DSTSVSAVASNMRDDEITQDE--NTVSTSLGHSKD------ENSKQTCIRIGTKT--
. :. :. :. .:. . : ..: : :. . :....: .. :.
CCDS10 KAEQLTTCSSYPSSEDEDKPATDPVLQVVYKSQGKESPGEEFSAEETEETFVKAETEKSD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB8 ---------------PKSDSCTPTNTTVEVVGSSGQ---NGDEKQNIVARKIVKMTKQPA
:::..:. . . : ....: :: .: .:. . ..:.:.
CCDS10 YDTPNYLLSPAAAHRPKSQKCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHKVKIMPCPF-PVAKEPS
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410
pF1KB8 KK--KPPPS------------REKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIPN
: .: :: .:.:...:. ::::::::::.:::.:::..::: :.:
CCDS10 TKGLNPNPSHQMTKRKRVVLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPV
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460
pF1KB8 TVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLMCHYKNIGATR
:.: .::::::.:::.:: :::::: ::.::
CCDS10 TLWHLGYWLCYVNSTVNPICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
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:: ::: ::...... . . ..::: . . :...:::: . ..:...: ::.:
CCDS56 FLVSLAAADILVATLIIPFSLANELLGYWYFRRTWCEVYLALDVLFCTSSIVHLCAISLD
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::. :.. : : ::: . .: ..:... .. : ... . : . .: ..
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..: ....:..:. : .:: ..: .: .: ..... : :. : .:
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CCDS56 DHGGALASAKLPALASVASAREVNGHSKSTGEKEEGETPEDTGTRALPPSWAALPNSGQG
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. .: . .:: ..: ..:. .. : .. . ...:.: .
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:: . : ...: . . : ... .:::. : .. ... .:.. : :.
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pF1KB8 LINTFCAP-C-IPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLMCHYKNIGAT
....: : .:. .. . .:. : ::..::. :.. : :...:...: :
CCDS56 SLGAICPKHCKVPHGLFQFFFWIGYCNSSLNPVIYTIFNQDFRRAFRRIL-CRPWTQTAW
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pF1KB8 R
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CCDS13 ADSSLRTQNNFFLLNLAISDFLVGAFCIPLYVPYVLTGRWTFGRGLCKLWLVVDYLLCTS
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CCDS13 SAFNIVLISYDRFLSVTRAVSYRAQQGDTRRAVRKMLLVWVLAFLLYGPAILSWEYLSGG
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.. .:.:: .:: : . .. :. : . .: .: .:.: ..:.. : .
CCDS13 SSIPEGHCYAEFFYNWYFLITASTLEFFTPFLSVTFFNLSIYLNIQR--RTRLRLDGARE
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.:. .: : .: :. :. .... . : : : : .: :..
CCDS13 AAGPEP--PPEAQ-----PSPPPPPGCWGCWQKGHGEAMPLHRYGVGEAAVGAEAGEATL
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. . . ..::: ..: : :. . . .. :.: :. ..
CCDS13 GGGGGGGSVASP-------------TSSSGSSSRGTERPRSLKRGSK--------PSASS
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pF1KB8 VEVVGSSGQNGDEKQNIVARKIVKMTKQPAKKKPPPSREKKVTRTILAILLAFIITWAPY
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CCDS13 ASL---------EKR-------MKMVSQSFTQRFRLSRDRKVAKSLAVIVSIFGLCWAPY
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pF1KB8 NVMVLINTFC-APCIPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLMCHYKNI
.....: . : . :.:. . ..:: . ::..::. : ::. .:...: .:: : :
CCDS13 TLLMIIRAACHGHCVPDYWYETSFWLLWANSAVNPVLYPLCHHSFRRAFTKLL-CPQKLK
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pF1KB8 GATR
CCDS13 IQPHSSLEHCWK
440
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10 20 30 40
pF1KB8 MNNSTNSSNNSLALTSPYKTFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMV
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CCDS34 AIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLC
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..:...: :..:::. .: :. : ::: . :. .:. .:...:.. : .: :
CCDS34 CTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGW----
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:: :: : :. .. . :. ....:::.:...: ::: .: ::.. ::.: :
CCDS34 --RTPEDRSDPDACTIS--KDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVK
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.. : . .. ... . . .: ::.. ..: : :...
CCDS34 ----------------KVEKTGADTRHGASPAPQPKKSVNGESG----SRNWRLGVESKA
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pF1KB8 SNDSTSVSAVASNMRDDEITQDENTVSTSLGHSKDENSKQTCIRIGTKTPKSDSCTPTNT
.. . .:: .. :: . . : .:.::.. . . : :: :.:..
CCDS34 GGALCANGAVRQG--DDGAALEVIEVHR-VGNSKEHLPLPS--EAGP-TP----CAPASF
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:..: . ::.: .::.:...:. :. .::. : :
CCDS34 -------------ERKN--------ERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLP
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pF1KB8 YNVMVLINTFC-APC-IPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLMCHYK
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CCDS34 FFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFC
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pF1KB8 NIGATR
CCDS34 RQ
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CCDS26 KLHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASIF
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. . : .: ::.... :.. : . .. :. : ..::. . : .
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..: .. ...: . :: : .. ::. ..: :. .: :..
CCDS26 DREVDKLYCFPLDIVHMQAAAEGSSRDYVAVNRSHGQLKTDEQGLNT---HGASEISEDQ
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pF1KB8 CIRIGTKTPKSDSCTPTNTTVEVVGS--SGQN-GDEKQNIVARKIVKMTKQPAKKKPPPS
. . . ..:: : :.:. :. ::.: : . ... ... . ..: .. .
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pF1KB8 REKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIPNTVWTIGYWLCYINSTINPACY
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CCDS26 RERKAAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIY
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450 460
pF1KB8 ALCNATFKKTFKHLLMCHYKNIGATR
::: .::::::..:
CCDS26 PLCNENFKKTFKRILHIRS
470 480
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pF1KB8 MNNSTNSSNNSLALTSPYKTFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNI
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CCDS49 PAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALI----TLATTLSNA
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pF1KB8 LVMVSIKVNRHLQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLAL
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CCDS49 FVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQVVCDFWLSS
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CCDS49 DITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISISLPP-FFW
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CCDS49 RQAKAEEEV--SECVVNT-DHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRILKQ--
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CCDS49 PGSTSSVTSINSRVPD---------VPSESGSPVYVN--QVKVRV------SDALL----
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CCDS49 S
390
466 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]