seq1 = pF1KB8822.tfa, 1188 bp
seq2 = pF1KB8822/gi568815586r_54262664.tfa (gi568815586r:54262664_54463851), 201188 bp

>pF1KB8822 1188
>gi568815586r:54262664_54463851 (Chr12)

(complement)

1-1188  (100001-101188)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGAACAGCTCTGACGCCAACTTCTCCTGCTACCATGAGTCTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGAACAGCTCTGACGCCAACTTCTCCTGCTACCATGAGTCTGTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCTATCGTTATGTTGCAGTTAGCTGGGGGGTGGTGGTGGCTGTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCTATCGTTATGTTGCAGTTAGCTGGGGGGTGGTGGTGGCTGTGACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCACCGTGGGCAATGTGCTCACCCTACTGGCCTTGGCCATCCAGCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCACCGTGGGCAATGTGCTCACCCTACTGGCCTTGGCCATCCAGCCCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCCGTACCCGATTCAACCTGCTCATAGCCAACCTCACACTGGCTGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCCGTACCCGATTCAACCTGCTCATAGCCAACCTCACACTGGCTGATCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCTACTGCACGCTCCTTCAGCCCTTCTCTGTGGACACCTACCTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCTACTGCACGCTCCTTCAGCCCTTCTCTGTGGACACCTACCTCCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCACTGGCGCACCGGTGCCACCTTCTGCAGGGTATTTGGGCTCCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCACTGGCGCACCGGTGCCACCTTCTGCAGGGTATTTGGGCTCCTCCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTGCCTCCAATTCTGTCTCCATCCTGACCCTCTGCCTCATCGCACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTGCCTCCAATTCTGTCTCCATCCTGACCCTCTGCCTCATCGCACTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACGCTACCTCCTCATTGCCCACCCTAAGCTTTTTCCCCAAGTTTTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACGCTACCTCCTCATTGCCCACCCTAAGCTTTTTCCCCAAGTTTTCAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCAAGGGGATAGTGCTGGCACTGGTGAGCACCTGGGTTGTGGGCGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCAAGGGGATAGTGCTGGCACTGGTGAGCACCTGGGTTGTGGGCGTGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCTTTGCTCCCCTCTGGCCTATTTATATCCTGGTACCTGTAGTCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCTTTGCTCCCCTCTGGCCTATTTATATCCTGGTACCTGTAGTCTGCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGCAGCTTTGACCGCATCCGAGGCCGGCCTTACACCACCATCCTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGCAGCTTTGACCGCATCCGAGGCCGGCCTTACACCACCATCCTCATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCATCTACTTTGTGCTTGGGCTCAGCAGTGTTGGCATCTTCTATTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCATCTACTTTGTGCTTGGGCTCAGCAGTGTTGGCATCTTCTATTGCCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCCACCGCCAGGTCAAACGAGCAGCACAGGCACTGGACCAATACAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCCACCGCCAGGTCAAACGAGCAGCACAGGCACTGGACCAATACAAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCGACAGGCAAGCATCCACTCCAACCATGTGGCCAGGACTGATGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCGACAGGCAAGCATCCACTCCAACCATGTGGCCAGGACTGATGAGGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGCCTGGTCGTTTCCAGGAGCTGGACAGCAGGTTAGCATCAGGAGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGCCTGGTCGTTTCCAGGAGCTGGACAGCAGGTTAGCATCAGGAGGACCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGTGAGGGGATTTCATCTGAGCCAGTCAGTGCTGCCACCACCCAGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGTGAGGGGATTTCATCTGAGCCAGTCAGTGCTGCCACCACCCAGACCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGAAGGGGACTCATCAGAAGTGGGAGACCAGATCAACAGCAAGAGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGAAGGGGACTCATCAGAAGTGGGAGACCAGATCAACAGCAAGAGAGCTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGCAGATGGCAGAGAAAAGCCCTCCAGAAGCATCTGCCAAAGCCCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGCAGATGGCAGAGAAAAGCCCTCCAGAAGCATCTGCCAAAGCCCAGCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATTAAAGGAGCCAGAAGAGCTCCGGATTCTTCATCGGAATTTGGGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATTAAAGGAGCCAGAAGAGCTCCGGATTCTTCATCGGAATTTGGGAAGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GACTCGAATGTGTTTTGCTGTGTTCCTCTGCTTTGCCCTGAGCTACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GACTCGAATGTGTTTTGCTGTGTTCCTCTGCTTTGCCCTGAGCTACATCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCTTCTTGCTGCTCAACATTCTGGATGCCAGAGTCCAGGCTCCCCGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCTTCTTGCTGCTCAACATTCTGGATGCCAGAGTCCAGGCTCCCCGGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTCCACATGCTTGCTGCCAACCTCACCTGGCTCAATGGTTGCATCAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTCCACATGCTTGCTGCCAACCTCACCTGGCTCAATGGTTGCATCAACCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGTGCTCTATGCAGCCATGAACCGCCAATTCCGCCAAGCATATGGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGTGCTCTATGCAGCCATGAACCGCCAATTCCGCCAAGCATATGGCTCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .
   1151 TTTTAAAAAGAGGGCCCCGGAGTTTCCATAGGCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTTTAAAAAGAGGGCCCCGGAGTTTCCATAGGCTCCAT