Result of FASTA (ccds) for pF1KB8807
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8807, 355 aa
  1>>>pF1KB8807 355 - 355 aa - 355 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2551+/-0.00113; mu= 16.2069+/- 0.066
 mean_var=109.3116+/-33.477, 0's: 0 Z-trim(103.0): 294  B-trim: 1007 in 2/48
 Lambda= 0.122671
 statistics sampled from 6713 (7213) to 6713 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.222), width:  16
 Scan time:  2.330

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355) 2346 426.8 1.4e-119
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376) 2346 426.8 1.4e-119
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355) 1528 282.0 5.1e-76
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 360) 1235 230.2 2.1e-60
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352) 1230 229.3 3.8e-60
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 374) 1152 215.5 5.7e-56
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3            ( 360) 1069 200.8 1.5e-51
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3            ( 355)  925 175.3 6.8e-44
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 355)  902 171.3 1.1e-42
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 387)  902 171.3 1.2e-42
CCDS43079.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3          ( 344)  853 162.6 4.6e-40
CCDS46814.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3          ( 356)  853 162.6 4.7e-40
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3           ( 384)  782 150.1   3e-36
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  748 144.0 1.8e-34
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  748 144.0 1.9e-34
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  742 143.0   4e-34
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 372)  711 137.5 1.8e-32
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 378)  711 137.5 1.8e-32
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 352)  677 131.4 1.1e-30
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 356)  677 131.4 1.1e-30
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  677 131.4 1.1e-30
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2           ( 350)  647 126.1 4.4e-29
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 368)  643 125.4 7.4e-29
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 415)  643 125.5   8e-29
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3          ( 350)  623 121.9 8.3e-28
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  607 119.1 6.2e-27
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  595 117.0 2.8e-26
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  595 117.0 2.8e-26
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  592 116.4 3.8e-26
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX           ( 363)  585 115.2   9e-26
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14          ( 391)  560 110.8   2e-24
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3          ( 342)  553 109.5 4.4e-24
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17         ( 362)  552 109.3 5.2e-24
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  549 108.8 7.8e-24
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  549 108.8 7.8e-24
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  549 108.8 7.9e-24
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 400)  549 108.8 7.9e-24
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 403)  549 108.8   8e-24
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 406)  549 108.8   8e-24
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 418)  549 108.9 8.2e-24
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 420)  549 108.9 8.2e-24
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 446)  549 108.9 8.5e-24
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 493)  549 108.9 9.1e-24
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  538 106.8 2.9e-23
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20         ( 370)  503 100.7 2.1e-21
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20         ( 388)  496 99.4 5.2e-21
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13         ( 337)  493 98.8 6.8e-21
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13       ( 346)  493 98.9   7e-21
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1            ( 372)  490 98.4 1.1e-20
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  489 98.2 1.2e-20


>>CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 2346 init1: 2346 opt: 2346  Z-score: 2260.6  bits: 426.8 E(32554): 1.4e-119
Smith-Waterman score: 2346; 100.0% identity (100.0% similar) in 355 aa overlap (1-355:1-355)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMILI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMILI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 KYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYSE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 IFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETEELFEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 IFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETEELFEE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 TLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKKKYKAIRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 TLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKKKYKAIRL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 IFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNPVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 IFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNPVI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350     
pF1KB8 YAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPELSIVF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 YAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPELSIVF
              310       320       330       340       350     

>>CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3                (376 aa)
 initn: 2346 init1: 2346 opt: 2346  Z-score: 2260.3  bits: 426.8 E(32554): 1.4e-119
Smith-Waterman score: 2346; 100.0% identity (100.0% similar) in 355 aa overlap (1-355:22-376)

                                    10        20        30         
pF1KB8                      MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPP
                            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MPFGIRMLLRAHKPGSSRRSEMTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPP
               10        20        30        40        50        60

      40        50        60        70        80        90         
pF1KB8 LYSLVFTVGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LYSLVFTVGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNW
               70        80        90       100       110       120

     100       110       120       130       140       150         
pF1KB8 VFGHGMCKLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFGHGMCKLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWG
              130       140       150       160       170       180

     160       170       180       190       200       210         
pF1KB8 LAVLAALPEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAVLAALPEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICY
              190       200       210       220       230       240

     220       230       240       250       260       270         
pF1KB8 TGIIKTLLRCPSKKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TGIIKTLLRCPSKKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHL
              250       260       270       280       290       300

     280       290       300       310       320       330         
pF1KB8 DLVMLVTEVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DLVMLVTEVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERT
              310       320       330       340       350       360

     340       350     
pF1KB8 SSVSPSTAEPELSIVF
       ::::::::::::::::
CCDS54 SSVSPSTAEPELSIVF
              370      

>>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 1510 init1: 1510 opt: 1528  Z-score: 1478.2  bits: 282.0 E(32554): 5.1e-76
Smith-Waterman score: 1528; 63.2% identity (86.3% similar) in 351 aa overlap (6-355:5-355)

               10         20        30        40        50         
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMIL
            .:.: . ::. .:   .  :.:.. ::. ::..::::::::..::.::..::..:
CCDS27  METPNTTEDYDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGNILVVLVL
                10        20        30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 IKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYS
       ..:.::. ::.:::::::::::::: :::::: :    .:::: .:::.:::::.:::::
CCDS27 VQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGFYYTGLYS
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 EIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETEELFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.::.::..: . : .:.  : 
CCDS27 EIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQWEFT
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB8 ETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKKKYKAIR
       .  ::  .:....  :. :..:....: :::::::: :::::::: ::: :..:: ::.:
CCDS27 HHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNEKKSKAVR
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB8 LIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNPV
       :::::: .::.::::::..::.: .:..:: ..::.:.::::.. :::::::.:::.:::
CCDS27 LIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAYTHCCVNPV
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350     
pF1KB8 IYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPELSIVF
       ::::::::::::::..:::.. .:: ...:::  ..:::.::.::::.: :::  :
CCDS27 IYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSPSTGEHELSAGF
     300       310       320       330       340       350     

>>CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3              (360 aa)
 initn: 1228 init1: 374 opt: 1235  Z-score: 1197.9  bits: 230.2 E(32554): 2.1e-60
Smith-Waterman score: 1235; 52.8% identity (82.2% similar) in 343 aa overlap (14-352:21-357)

                      10         20        30        40        50  
pF1KB8        MTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGN
                           :...: : :  :.: :.. . ::..::::::::  :..::
CCDS46 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB8 VVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGF
       ..::.:::. ..:. .:.::::::::::::::.:::.: : . ...::::..::::..:.
CCDS46 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSA-ANEWVFGNAMCKLFTGL
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pF1KB8 YHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFY
       :: : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::..:: .::.:..: .:: 
CCDS46 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT
     120       130       140       150       160       170         

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pF1KB8 ETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPS-
       . ..     .:.  .:.    .: .:::.  .:. ::::::.:.:::.::.:::::: . 
CCDS46 KCQKEDSVYVCGPYFPR----GWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE
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pF1KB8 KKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFG-NDCERSKHLDLVMLVTEVIA
       ::...:.:.::.:: :.:.::::::..:::...:  .:: ..:: ...:: .  :::...
CCDS46 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQE-FFGLSNCESTSQLDQATQVTETLG
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pF1KB8 YSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLER-TSSVSPSTAEP
       ..:::.::.:::::::.::.::  ::..:.  .. .  : .  : ..  ::. .:::.: 
CCDS46 MTHCCINPIIYAFVGEKFRRYLSVFFRKHITKRFCKQCPVFYRETVDGVTSTNTPSTGEQ
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     350     
pF1KB8 ELSIVF
       :.:   
CCDS46 EVSAGL
          360

>>CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3                 (352 aa)
 initn: 570 init1: 570 opt: 1230  Z-score: 1193.2  bits: 229.3 E(32554): 3.8e-60
Smith-Waterman score: 1230; 53.8% identity (83.8% similar) in 333 aa overlap (24-353:20-350)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMILI
                              :.: ... . :...::::::::  :..::..:..:::
CCDS27     MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVILILI
                   10        20        30        40        50      

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pF1KB8 KYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYSE
       . .::. ::.:::::::::::.::.:.::: ::. .. : ::. ::.::.:.:  :..: 
CCDS27 NCKRLKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQ-WDFGNTMCQLLTGLYFIGFFSG
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pF1KB8 IFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETEELFEE
       ::::::::::::::.:::::::.::::::::.::..:: .::.:.:: .:: ....   .
CCDS27 IFFIILLTIDRYLAVVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWVVAVFASLPGIIFTRSQKEGLH
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pF1KB8 TLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPS-KKKYKAIR
         ::. .: .    :..:.::...:. ::::::::.:::.::.:::::: . ::...:.:
CCDS27 YTCSSHFPYSQYQFWKNFQTLKIVILGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHRAVR
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pF1KB8 LIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFG-NDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNP
       :::.:: :.:.::.:::...::...:  .:: :.:  :..:: .: :::.....:::.::
CCDS27 LIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQE-FFGLNNCSSSNRLDQAMQVTETLGMTHCCINP
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pF1KB8 VIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSV-SPSTAEPELSIVF
       .:::::::.::.::  ::..:.  .. .   .. .:  ::.::: . ::.: :.:.  
CCDS27 IIYAFVGEKFRNYLLVFFQKHIAKRFCKCCSIFQQEAPERASSVYTRSTGEQEISVGL
          300       310       320       330       340       350  

>>CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3              (374 aa)
 initn: 994 init1: 379 opt: 1152  Z-score: 1118.3  bits: 215.5 E(32554): 5.7e-56
Smith-Waterman score: 1152; 54.7% identity (83.7% similar) in 307 aa overlap (14-317:21-317)

                      10         20        30        40        50  
pF1KB8        MTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGN
                           :...: : :  :.: :.. . ::..::::::::  :..::
CCDS43 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB8 VVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGF
       ..::.:::. ..:. .:.::::::::::::::.:::.: : . ...::::..::::..:.
CCDS43 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSA-ANEWVFGNAMCKLFTGL
               70        80        90       100        110         

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pF1KB8 YHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFY
       :: : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::..:: .::.:..: .:: 
CCDS43 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT
     120       130       140       150       160       170         

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pF1KB8 ETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPS-
       . ..     .:.  .:.    .: .:::.  .:. ::::::.:.:::.::.:::::: . 
CCDS43 KCQKEDSVYVCGPYFPR----GWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE
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pF1KB8 KKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFG-NDCERSKHLDLVMLVTEVIA
       ::...:.:.::.:: :.:.::::::..:::...:  .:: ..:: ...:: .  :::...
CCDS43 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQE-FFGLSNCESTSQLDQATQVTETLG
         240       250       260       270        280       290    

              300       310       320       330       340       350
pF1KB8 YSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPE
       ..:::.::.:::::::.::.    .::                                 
CCDS43 MTHCCINPIIYAFVGEKFRS----LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGL
          300       310           320       330       340       350

>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3                 (360 aa)
 initn: 728 init1: 384 opt: 1069  Z-score: 1039.1  bits: 200.8 E(32554): 1.5e-51
Smith-Waterman score: 1069; 46.2% identity (77.1% similar) in 353 aa overlap (3-351:9-356)

                     10         20        30        40        50   
pF1KB8       MTTSLDTVETFGTTSY-YDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNV
               :.::  :.. .. : :...   : :   .:.   :.::::::::. ::::: 
CCDS26 MNPTDIADTTLD--ESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFVFGLLGNS
               10          20        30        40        50        

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB8 VVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFY
       :::..:.::.::: ::..::::::::::::. .:::: .:. . .:::: :.::..: .:
CCDS26 VVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYA-ADQWVFGLGLCKMISWMY
       60        70        80        90        100       110       

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pF1KB8 HTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYE
        .:.:: :::..:..::::::::::::.:::::.:.:::::..::..::.:.:: :.:  
CCDS26 LVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASLPGFLFST
       120       130       140       150       160       170       

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pF1KB8 TEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKK
            ..: :.. :  ... .:. . .:...:. ::.:: .: .::. ::.:: .: ..:
CCDS26 CYTERNHTYCKTKYSLNST-TWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEK
       180       190        200       210       220       230      

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pF1KB8 KYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSH
       : ::...::.....:. ::::::....: .   .   .::   ..:: .. .::..:. :
CCDS26 KNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQDCTFERYLDYAIQATETLAFVH
        240       250       260       270       280       290      

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pF1KB8 CCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFH--RHLLMHLGRYIPFLPSEKLER-TSSVSPSTAEPE
       ::.::.:: :.::.::::. ..:.  : :.. : .:  .:   . .  .:: . :: . .
CCDS26 CCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFV-LCQYCGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHD
        300       310       320        330       340       350     

            
pF1KB8 LSIVF
       :    
CCDS26 LHDAL
         360

>>CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 882 init1: 415 opt: 925  Z-score: 901.5  bits: 175.3 E(32554): 6.8e-44
Smith-Waterman score: 925; 39.3% identity (73.4% similar) in 349 aa overlap (1-341:1-340)

               10        20             30        40        50     
pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYDDV-GLLCE----KADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVV
       :  .::   :  :  :: :. .  :.    ... . :.: :    : :.:. .:::: .:
CCDS26 MDYTLDLSVTTVTDYYYPDIFSSPCDAELIQTNGKLLLAVF----YCLLFVFSLLGNSLV
               10        20        30        40            50      

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB8 VMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHT
       ...:.  ..:: .:..::::::.:::::. ..::  .:.  . ::::  :::..::::. 
CCDS26 ILVLVVCKKLRSITDVYLLNLALSDLLFVFSFPFQTYYLLDQ-WVFGTVMCKVVSGFYYI
         60        70        80        90        100       110     

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pF1KB8 GLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETE
       :.:: .::: :...:::::.::::.::..::. .:.   ...:  :..:..: ..::.. 
CCDS26 GFYSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYALKVRTIRMGTTLCLAVWLTAIMATIPLLVFYQVA
         120       130       140       150       160       170     

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pF1KB8 ELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKKKY
              : ..: ..:. .:. : ...:.:. :..:. .. .::  :.. : :: ...: 
CCDS26 SEDGVLQCYSFYNQQTL-KWKIFTNFKMNILGLLIPFTIFMFCYIKILHQLKRCQNHNKT
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pF1KB8 KAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCC
       :::::..... . ..::.:.::...:.: .:. . . :  :..:  .  :::.:...:::
CCDS26 KAIRLVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGCSISQQLTYATHVTEIISFTHCC
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pF1KB8 MNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHR---HLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPELS
       .::::::::::.:.:.: ..:..   ... .:::    .: :. :..::           
CCDS26 VNPVIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQ---MPRESCEKSSSCQQHSSRSSSV
          300       310       320          330       340       350 

           
pF1KB8 IVF 
           
CCDS26 DYIL
           

>>CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3              (355 aa)
 initn: 901 init1: 457 opt: 902  Z-score: 879.5  bits: 171.3 E(32554): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 902; 42.2% identity (72.9% similar) in 332 aa overlap (17-345:14-340)

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pF1KB8 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMILI
                       :::..  :  .:  .. . :.  .::..:..::.::..::. : 
CCDS43    MDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFAIGLVGNLLVVFALT
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pF1KB8 KYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYSE
       . .. . .:.:::::::.:::::..::::: ::. ... .  ..:::. ..:.  :... 
CCDS43 NSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLH-NAMCKFTTAFFFIGFFGS
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pF1KB8 IFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETEELFEE
       :::: ...:::::::: :. ..  :::  ::  :. .:. :.:.: :.:.: . .:    
CCDS43 IFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKE----
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pF1KB8 TLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKKKYKAIRL
       . : . :::     :  ..... ... ..::::.:. ::  ::.::. : ..:: :::.:
CCDS43 NECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTLFSCKNHKKAKAIKL
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pF1KB8 IFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNPVI
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CCDS43 ILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRLALSVTETVAFSHCCLNPLI
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pF1KB8 YAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGR--YIPFLPSEKLE-RTSSVSPSTAEPELSIVF  
       :::.::.::.:: :.. . : .  ::  .. :  ::. . : .::  :            
CCDS43 YAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVLSSNFTYHTSDGDAL
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CCDS43 LLL
          

>>CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3              (387 aa)
 initn: 901 init1: 457 opt: 902  Z-score: 879.0  bits: 171.3 E(32554): 1.2e-42
Smith-Waterman score: 902; 42.2% identity (72.9% similar) in 332 aa overlap (17-345:46-372)

                             10        20        30        40      
pF1KB8               MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFT
                                     :::..  :  .:  .. . :.  .::..:.
CCDS54 RKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFA
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pF1KB8 VGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMC
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CCDS54 IGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLH-NAMC
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pF1KB8 KLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAAL
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CCDS54 KFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAA
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pF1KB8 PEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTL
       :.:.: . .:    . : . :::     :  ..... ... ..::::.:. ::  ::.::
CCDS54 PQFMFTKQKE----NECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTL
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pF1KB8 LRCPSKKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVT
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CCDS54 FSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRLALSVT
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pF1KB8 EVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGR--YIPFLPSEKLE-RTSSVS
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CCDS54 ETVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVL
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pF1KB8 PSTAEPELSIVF     
        :               
CCDS54 SSNFTYHTSDGDALLLL
              380       




355 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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