Result of FASTA (ccds) for pF1KB8759
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8759, 201 aa
  1>>>pF1KB8759 201 - 201 aa - 201 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6483+/-0.000936; mu= 11.0076+/- 0.056
 mean_var=80.5881+/-16.447, 0's: 0 Z-trim(106.3): 202  B-trim: 287 in 1/50
 Lambda= 0.142869
 statistics sampled from 8690 (8928) to 8690 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.274), width:  16
 Scan time:  1.720

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14515.1 RAB9B gene_id:51209|Hs108|chrX         ( 201) 1359 289.7 8.3e-79
CCDS14156.1 RAB9A gene_id:9367|Hs108|chrX          ( 201) 1072 230.5 5.3e-61
CCDS3052.1 RAB7A gene_id:7879|Hs108|chr3           ( 207)  696 153.0 1.2e-37
CCDS73011.1 RAB7B gene_id:338382|Hs108|chr1        ( 199)  493 111.2 4.5e-25
CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15        ( 216)  444 101.1 5.2e-22
CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19        ( 218)  435 99.2 1.9e-21
CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15        ( 207)  428 97.8   5e-21
CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19         ( 207)  428 97.8   5e-21
CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1           ( 203)  419 95.9 1.8e-20
CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10         ( 206)  418 95.7 2.1e-20
CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9          ( 215)  418 95.7 2.1e-20
CCDS41413.1 RAB25 gene_id:57111|Hs108|chr1         ( 213)  413 94.7 4.3e-20
CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11        ( 201)  409 93.9 7.3e-20
CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1          ( 218)  409 93.9 7.8e-20
CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2          ( 205)  405 93.0 1.3e-19
CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 216)  405 93.1 1.4e-19
CCDS10460.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16        ( 256)  402 92.5 2.4e-19
CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2          ( 200)  400 92.0 2.6e-19
CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11         ( 203)  400 92.0 2.7e-19
CCDS8338.1 RAB39A gene_id:54734|Hs108|chr11        ( 217)  400 92.0 2.8e-19
CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 228)  399 91.8 3.4e-19
CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 196)  397 91.4   4e-19
CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 223)  397 91.4 4.4e-19
CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12        ( 201)  393 90.6 7.2e-19
CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19        ( 213)  392 90.4 8.7e-19
CCDS14766.1 RAB39B gene_id:116442|Hs108|chrX       ( 213)  392 90.4 8.7e-19
CCDS4962.1 RAB23 gene_id:51715|Hs108|chr6          ( 237)  392 90.4 9.5e-19
CCDS76806.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16        ( 190)  390 89.9 1.1e-18
CCDS76691.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14       ( 212)  386 89.1   2e-18
CCDS1459.1 RAB29 gene_id:8934|Hs108|chr1           ( 203)  383 88.5   3e-18
CCDS42410.1 RAB12 gene_id:201475|Hs108|chr18       ( 244)  384 88.8   3e-18
CCDS58373.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15        ( 155)  379 87.6 4.3e-18
CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8           ( 212)  373 86.5 1.3e-17
CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14         ( 216)  373 86.5 1.3e-17
CCDS33850.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3        ( 212)  370 85.8   2e-17
CCDS9003.1 RAB21 gene_id:23011|Hs108|chr12         ( 225)  369 85.6 2.4e-17
CCDS45826.1 RAB31 gene_id:11031|Hs108|chr18        ( 195)  362 84.2 5.9e-17
CCDS33497.1 RAB22A gene_id:57403|Hs108|chr20       ( 194)  361 84.0 6.8e-17
CCDS34762.2 RAB19 gene_id:401409|Hs108|chr7        ( 217)  361 84.0 7.4e-17
CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5         ( 227)  357 83.2 1.4e-16
CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12          ( 215)  355 82.7 1.7e-16
CCDS2520.1 RAB17 gene_id:64284|Hs108|chr2          ( 212)  353 82.3 2.3e-16
CCDS2633.1 RAB5A gene_id:5868|Hs108|chr3           ( 215)  353 82.3 2.3e-16
CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17         ( 216)  352 82.1 2.7e-16
CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17         ( 249)  352 82.2   3e-16
CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19         ( 220)  351 81.9 3.1e-16
CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11         ( 204)  348 81.3 4.5e-16
CCDS33683.1 RABL2B gene_id:11158|Hs108|chr22       ( 229)  348 81.3   5e-16
CCDS5210.1 RAB32 gene_id:10981|Hs108|chr6          ( 225)  346 80.9 6.5e-16
CCDS76258.1 RAB7B gene_id:338382|Hs108|chr1        ( 157)  342 80.0 8.6e-16


>>CCDS14515.1 RAB9B gene_id:51209|Hs108|chrX              (201 aa)
 initn: 1359 init1: 1359 opt: 1359  Z-score: 1528.3  bits: 289.7 E(32554): 8.3e-79
Smith-Waterman score: 1359; 100.0% identity (100.0% similar) in 201 aa overlap (1-201:1-201)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFVTLQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFVTLQI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 WDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEHFPFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEHFPFV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 VLGNKVDKEDRQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLAVEEQLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VLGNKVDKEDRQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLAVEEQLE
              130       140       150       160       170       180

              190       200 
pF1KB8 HCMLGHTIDLNSGSKAGSSCC
       :::::::::::::::::::::
CCDS14 HCMLGHTIDLNSGSKAGSSCC
              190       200 

>>CCDS14156.1 RAB9A gene_id:9367|Hs108|chrX               (201 aa)
 initn: 1072 init1: 1072 opt: 1072  Z-score: 1208.6  bits: 230.5 E(32554): 5.3e-61
Smith-Waterman score: 1072; 76.1% identity (91.5% similar) in 201 aa overlap (1-201:1-201)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFVTLQI
       :.::: :.:::::::::::::::::::::::::.: ::::::::::.::::::.:::.::
CCDS14 MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 WDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEHFPFV
       :::::::::.:::::::::.::::::::::: :::.::.::.::::::::::.:: ::::
CCDS14 WDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPFV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 VLGNKVDKEDRQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLAVEEQLE
       .::::.:  .:::.:::::.:: .::::::.:::::: :::..:::::::.:::.:.. .
CCDS14 ILGNKIDISERQVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAVRRVLATEDRSD
              130       140       150       160       170       180

              190       200 
pF1KB8 HCMLGHTIDLNSGSKAGSSCC
       : .   :..:.   : .::::
CCDS14 HLIQTDTVNLHRKPKPSSSCC
              190       200 

>>CCDS3052.1 RAB7A gene_id:7879|Hs108|chr3                (207 aa)
 initn: 710 init1: 679 opt: 696  Z-score: 789.6  bits: 153.0 E(32554): 1.2e-37
Smith-Waterman score: 696; 52.2% identity (80.8% similar) in 203 aa overlap (2-201:3-205)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFVTLQ
         : :..:::::.:::.::::.::::.::..::..:   :::..::.... :: :.::.:
CCDS30 MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 IWDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEHFPF
       ::::::::::.:: . ::::::::.:.:.:   ..:..: .:. ::.  :. .:::.:::
CCDS30 IWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPF
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 VVLGNKVDKEDRQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLAVEEQL
       ::::::.: :.:::.:..::.::. ... ::.:::::.  ::  ::.  .:..:  : ..
CCDS30 VVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEV
              130       140       150       160       170       180

     180          190       200   
pF1KB8 E-HCMLGHTI--DLNSGSKAGSSCC  
       : .  . . :  : :. .::..  :  
CCDS30 ELYNEFPEPIKLDKNDRAKASAESCSC
              190       200       

>>CCDS73011.1 RAB7B gene_id:338382|Hs108|chr1             (199 aa)
 initn: 481 init1: 285 opt: 493  Z-score: 563.7  bits: 111.2 E(32554): 4.5e-25
Smith-Waterman score: 493; 40.9% identity (69.2% similar) in 198 aa overlap (4-201:5-199)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFVTLQ
           :.. ::.:..:  ::::.::...:: . :  .   :.:. .:.. . .    . ::
CCDS73 MNPRKKVDLKLIIVGAIGVGKTSLLHQYVHKTFYEEYQTTLGASILSKIIILGDTTLKLQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 IWDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEHFPF
       ::::.:::::.:. . ::.:.: :.:.:.: : .::: :  :. . .    :   . .:.
CCDS73 IWDTGGQERFRSMVSTFYKGSDGCILAFDVTDLESFEALDIWRGD-VLAKIVPMEQSYPM
               70        80        90       100        110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 VVLGNKVDKEDRQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLAVEEQL
       :.::::.:  ::.:  : :: :: :. : ::.:.:::.: ::. :::  . ..:.  ...
CCDS73 VLLGNKIDLADRKVPQEVAQGWCREK-DIPYFEVSAKNDINVVQAFEMLASRALSRYQSI
     120       130       140        150       160       170        

     180       190       200 
pF1KB8 EHCMLGHTIDLNSGSKAGSSCC
        .  : ..: : : ... : ::
CCDS73 LENHLTESIKL-SPDQSRSRCC
      180        190         

>>CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15             (216 aa)
 initn: 449 init1: 348 opt: 444  Z-score: 508.6  bits: 101.1 E(32554): 5.2e-22
Smith-Waterman score: 444; 40.5% identity (73.4% similar) in 173 aa overlap (7-178:11-178)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB8     MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFV
                 :.::.:.::.:::::.:..:.. :.:. ..  :::::: .:...:::. .
CCDS10 MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTI
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 TLQIWDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEH
         ::::::::::.... . .::::   ::....  . ..::.  : ::.  .::     .
CCDS10 KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHAD----SN
               70        80        90       100       110          

        120        130       140       150       160       170     
pF1KB8 FPFVVLGNKVD-KEDRQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLAV
       . ....::: : .. : : :.::...  .::   ..:::: :.::: .::.  . ..  .
CCDS10 IVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNG-LSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRI
        120       130       140        150       160       170     

         180       190       200                
pF1KB8 EEQLEHCMLGHTIDLNSGSKAGSSCC               
         :                                      
CCDS10 VSQKQMSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI
         180       190       200       210      

>>CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19             (218 aa)
 initn: 420 init1: 348 opt: 435  Z-score: 498.5  bits: 99.2 E(32554): 1.9e-21
Smith-Waterman score: 435; 39.9% identity (73.4% similar) in 173 aa overlap (7-178:11-178)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB8     MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFV
                 :.::.:.::.:::::.:..:.. :.:. ..  :::::: .:...:::. .
CCDS12 MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTI
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 TLQIWDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEH
         ::::::::::.... . .::::   ::....  . ..::.  : ::.  .::     .
CCDS12 KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHAD----SN
               70        80        90       100       110          

        120        130       140       150       160       170     
pF1KB8 FPFVVLGNKVD-KEDRQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLAV
       . ....::: : .. : : :.::...  .: .  ..:::: :.:::  ::.. . ..  .
CCDS12 IVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKN-NLSFIETSALDSTNVEEAFKNILTEIYRI
        120       130       140        150       160       170     

         180       190       200                  
pF1KB8 EEQLEHCMLGHTIDLNSGSKAGSSCC                 
         :                                        
CCDS12 VSQKQIADRAAHDESPGNNVVDISVPPTTDGQKPNKLQCCQNL
         180       190       200       210        

>>CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15             (207 aa)
 initn: 406 init1: 328 opt: 428  Z-score: 491.0  bits: 97.8 E(32554): 5e-21
Smith-Waterman score: 428; 40.5% identity (73.8% similar) in 168 aa overlap (7-173:8-170)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFVTLQ
              :.:..:.::.::::. :. :.  . :..  . :::..:  : .:.::. . ::
CCDS10 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAFNTTFISTIGIDFKIRTIELDGKKIKLQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 IWDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEHFPF
       ::::::::::... : .::::   .:.... ...::.:. :: ...  .:. .: :.   
CCDS10 IWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHAS-SDVER---
               70        80        90       100       110          

     120       130        140       150       160       170        
pF1KB8 VVLGNKVDKED-RQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLAVEEQ
       ..:::: : .: :::. :...   .. :   .::::::...::  ::   .:...     
CCDS10 MILGNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYG-IKFLETSAKSSANVEEAFFTLARDIMTKLNR
        120       130       140        150       160       170     

      180       190       200          
pF1KB8 LEHCMLGHTIDLNSGSKAGSSCC         
                                       
CCDS10 KMNDSNSAGAGGPVKITENRSKKTSFFRCSLL
         180       190       200       

>>CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19              (207 aa)
 initn: 402 init1: 327 opt: 428  Z-score: 491.0  bits: 97.8 E(32554): 5e-21
Smith-Waterman score: 428; 39.8% identity (72.7% similar) in 176 aa overlap (7-180:8-178)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFVTLQ
              :.:..:.::.::::. .. :.  . :.:  . :::..:  : .:.::. . ::
CCDS12 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 IWDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEHFPF
       ::::::::::... : .::::   .:.... ...::.:. :: ...  .:.. : :.   
CCDS12 IWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASA-DVEK---
               70        80        90       100       110          

     120       130        140       150       160       170        
pF1KB8 VVLGNKVDKED-RQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLA-VEE
       ..:::: : .: :::. :...   .. :   ..::::: . ::  ::   .:.. : ...
CCDS12 MILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYG-IKFMETSAKANINVENAFFTLARDIKAKMDK
        120       130       140        150       160       170     

       180       190       200         
pF1KB8 QLEHCMLGHTIDLNSGSKAGSSCC        
       .::                             
CCDS12 KLEGNSPQGSNQGVKITPDQQKRSSFFRCVLL
         180       190       200       

>>CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1                (203 aa)
 initn: 393 init1: 317 opt: 419  Z-score: 481.1  bits: 95.9 E(32554): 1.8e-20
Smith-Waterman score: 419; 40.5% identity (71.4% similar) in 168 aa overlap (7-173:8-170)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFVTLQ
              :.:..:.::.::::. :. :.. ..:..  . :::..:  : ....:. . ::
CCDS10 MAKAYDHLFKLLLIGDSGVGKTCLIIRFAEDNFNNTYISTIGIDFKIRTVDIEGKKIKLQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 IWDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEHFPF
       .::::::::::.. : .::::   .:.... :..::::. ::.: .   :..   .    
CCDS10 VWDTAGQERFKTITTAYYRGAMGIILVYDITDEKSFENIQNWMKSIKENASAGVER----
               70        80        90       100       110          

     120        130       140       150       160       170        
pF1KB8 VVLGNKVDKE-DRQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLAVEEQ
       ..:::: : :  :.:  :.:.    :.:   ..:::::.. ::  ::   .:..:     
CCDS10 LLLGNKCDMEAKRKVQKEQADKLAREHG-IRFFETSAKSSMNVDEAFSSLARDILLKSGG
        120       130       140        150       160       170     

      180       190       200      
pF1KB8 LEHCMLGHTIDLNSGSKAGSSCC     
                                   
CCDS10 RRSGNGNKPPSTDLKTCDKKNTNKCSLG
         180       190       200   

>>CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10              (206 aa)
 initn: 395 init1: 309 opt: 418  Z-score: 479.9  bits: 95.7 E(32554): 2.1e-20
Smith-Waterman score: 418; 36.7% identity (66.8% similar) in 199 aa overlap (8-200:9-203)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFVTLQ
               ::....:..:::::::. :.. . :: .   ::::.:  . . :::  . : 
CCDS71 MDEDVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDTFDPELAATIGVDFKVKTISVDGNKAKLA
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 IWDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEHFPF
       ::::::::::..:   .::::.  .:...:  :..: .: :: .:.  :   .:  .   
CCDS71 IWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVILVYDVTRRDTFVKLDNWLNELETYCTRNDIVN---
               70        80        90       100       110          

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 VVLGNKVDKEDRQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLAV----
       ...:::.:::.:.:  .:.  .  ... . ..:.:::   .:  :::: :.... .    
CCDS71 MLVGNKIDKENREVDRNEGLKFARKHS-MLFIEASAKTCDGVQCAFEELVEKIIQTPGLW
       120       130       140        150       160       170      

           180       190       200   
pF1KB8 --EEQLEHCMLGHTIDLNSGSKAGSSCC  
         :.: .   :.:  . ..:.  :. :   
CCDS71 ESENQNKGVKLSHREEGQGGGACGGYCSVL
        180       190       200      




201 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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