Result of FASTA (omim) for pF1KB8734
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8734, 551 aa
  1>>>pF1KB8734 551 - 551 aa - 551 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2555+/-0.000394; mu= -14.5750+/- 0.025
 mean_var=338.0557+/-69.717, 0's: 0 Z-trim(122.8): 63  B-trim: 183 in 1/59
 Lambda= 0.069756
 statistics sampled from 41384 (41469) to 41384 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.777), E-opt: 0.2 (0.486), width:  16
 Scan time: 13.270

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001273620 (OMIM: 159558) protein AF-9 isoform b ( 565) 2580 273.4 1.3e-72
NP_004520 (OMIM: 159558) protein AF-9 isoform a [H ( 568) 2580 273.4 1.3e-72
XP_016870216 (OMIM: 159558) PREDICTED: protein AF- ( 517) 2005 215.5 3.2e-55
XP_016870215 (OMIM: 159558) PREDICTED: protein AF- ( 520) 2005 215.5 3.2e-55
NP_005925 (OMIM: 159556) protein ENL [Homo sapiens ( 559)  990 113.4 1.9e-24
XP_011526324 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL ( 561)  984 112.8 2.9e-24
XP_011526323 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL ( 600)  984 112.8 3.1e-24
XP_011526325 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL ( 558)  981 112.5 3.6e-24
XP_016882308 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL ( 527)  803 94.6 8.4e-19


>>NP_001273620 (OMIM: 159558) protein AF-9 isoform b [Ho  (565 aa)
 initn: 2580 init1: 2580 opt: 2580  Z-score: 1424.5  bits: 273.4 E(85289): 1.3e-72
Smith-Waterman score: 3552; 97.0% identity (97.0% similar) in 564 aa overlap (5-551:2-565)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001    MCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170          
pF1KB8 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS-------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       
NP_001 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
       120       130       140       150       160       170       

                     180       190       200       210       220   
pF1KB8 ----------TSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
       180       190       200       210       220       230       

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB8 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
       240       250       260       270       280       290       

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB8 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
       300       310       320       330       340       350       

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB8 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
       360       370       380       390       400       410       

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB8 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILE
       420       430       440       450       460       470       

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB8 VKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITN
       480       490       500       510       520       530       

           530       540       550 
pF1KB8 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
       540       550       560     

>>NP_004520 (OMIM: 159558) protein AF-9 isoform a [Homo   (568 aa)
 initn: 2580 init1: 2580 opt: 2580  Z-score: 1424.5  bits: 273.4 E(85289): 1.3e-72
Smith-Waterman score: 3574; 97.0% identity (97.0% similar) in 568 aa overlap (1-551:1-568)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170          
pF1KB8 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS-------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       
NP_004 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
              130       140       150       160       170       180

                     180       190       200       210       220   
pF1KB8 ----------TSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
              190       200       210       220       230       240

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB8 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
              250       260       270       280       290       300

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB8 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
              310       320       330       340       350       360

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB8 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
              370       380       390       400       410       420

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB8 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILE
              430       440       450       460       470       480

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB8 VKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITN
              490       500       510       520       530       540

           530       540       550 
pF1KB8 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
              550       560        

>>XP_016870216 (OMIM: 159558) PREDICTED: protein AF-9 is  (517 aa)
 initn: 3333 init1: 2002 opt: 2005  Z-score: 1112.4  bits: 215.5 E(85289): 3.2e-55
Smith-Waterman score: 3137; 88.5% identity (88.5% similar) in 564 aa overlap (5-551:2-517)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016    MCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170          
pF1KB8 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS-------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       
XP_016 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
       120       130       140       150       160       170       

                     180       190       200       210       220   
pF1KB8 ----------TSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
       180       190       200       210       220       230       

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB8 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
       240       250       260       270       280       290       

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB8 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
       300       310       320       330       340       350       

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB8 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
       360       370       380       390       400       410       

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB8 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
XP_016 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQI--
       420       430       440       450       460       470       

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB8 VKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITN
                                                     ::::::::::::::
XP_016 ----------------------------------------------VNLIEETGHFHITN
                                                       480         

           530       540       550 
pF1KB8 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
     490       500       510       

>>XP_016870215 (OMIM: 159558) PREDICTED: protein AF-9 is  (520 aa)
 initn: 3355 init1: 2002 opt: 2005  Z-score: 1112.4  bits: 215.5 E(85289): 3.2e-55
Smith-Waterman score: 3159; 88.6% identity (88.6% similar) in 568 aa overlap (1-551:1-520)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170          
pF1KB8 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS-------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       
XP_016 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
              130       140       150       160       170       180

                     180       190       200       210       220   
pF1KB8 ----------TSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
              190       200       210       220       230       240

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB8 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
              250       260       270       280       290       300

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB8 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
              310       320       330       340       350       360

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB8 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
              370       380       390       400       410       420

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB8 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
XP_016 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQI--
              430       440       450       460       470          

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB8 VKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITN
                                                     ::::::::::::::
XP_016 ----------------------------------------------VNLIEETGHFHITN
                                                    480       490  

           530       540       550 
pF1KB8 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
            500       510       520

>>NP_005925 (OMIM: 159556) protein ENL [Homo sapiens]     (559 aa)
 initn: 1485 init1: 831 opt: 990  Z-score: 559.8  bits: 113.4 E(85289): 1.9e-24
Smith-Waterman score: 1792; 54.7% identity (74.0% similar) in 578 aa overlap (1-550:1-559)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
       : ..:.:::.::::::::.:::::.:::::::::::::::. .:::::::::: ::.:::
NP_005 MDNQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
       .:.::::.::::::::::::::.::::.:::::::::: : :::::.:::.:::::::::
NP_005 KPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCE
               70        80        90       100       110       120

              130       140                      150       160     
pF1KB8 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGG--------------DPNRSI-HTSSSSSSSSSSSSSSSSS
       :::::::: .:: :::.:::              .:.  .  :   :. :. .... : .
NP_005 KLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHG
              130       140       150       160       170       180

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB8 SSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENKPL
       :..... :.. :::::. :::.:.: ::: : ::. ::  :.. ::::..:.:  :..  
NP_005 SKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLP
              190       200        210       220       230         

         230        240       250       260             270        
pF1KB8 KEEKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAP------SKRPPISDSEELSA
       ::::  : : ::::::   :: : .:.  .  .:     :      ::::  .:: . ::
NP_005 KEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKPSA
     240       250       260         270       280       290       

      280       290       300        310       320       330       
pF1KB8 KKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPP
       ::.:::::..  .. ...:    . : .:::  :::: ..  ::: :::  : ::.    
NP_005 KKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKA----
       300       310       320       330       340       350       

       340       350       360       370           380       390   
pF1KB8 FDDIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSS----FTPSQTRQQGPLRSIMKDL
           .. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::.::    : :::...::::::...::
NP_005 ----LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVEDL
               360       370       380       390       400         

           400       410       420       430       440       450   
pF1KB8 HSDDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPL
       .:    ::::: .:...  :    .: :  :. :.:.:: :.:..:. ::   .::::: 
NP_005 QS----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSRLSFSD-SESDNSADSSLPSREPPPPQ
     410            420       430         440        450       460 

            460       470       480       490       500       510  
pF1KB8 LKTN-NNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNL
            :...   .:: . :: .: .:.:  :::: :::::::::::.::::..:::::::
NP_005 KPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIVNL
             470       480       490       500       510       520 

            520       530       540       550 
pF1KB8 IEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
       :::::::..::::::::: :::.:::::::: ::. .: 
NP_005 IEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT 
             530       540       550          

>>XP_011526324 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL iso  (561 aa)
 initn: 1479 init1: 825 opt: 984  Z-score: 556.5  bits: 112.8 E(85289): 2.9e-24
Smith-Waterman score: 1786; 54.9% identity (74.0% similar) in 574 aa overlap (5-550:7-561)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB8   MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHES
             :.:::.::::::::.:::::.:::::::::::::::. .:::::::::: ::.:
XP_011 MPKKRQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDS
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB8 FPRPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLR
       ::.:.::::.::::::::::::::.::::.:::::::::: : :::::.:::.:::::::
XP_011 FPKPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLR
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140                      150       160   
pF1KB8 CEKLTFNNPTEDFRRKLLKAGG--------------DPNRSI-HTSSSSSSSSSSSSSSS
       :::::::::: .:: :::.:::              .:.  .  :   :. :. .... :
XP_011 CEKLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPS
              130       140       150       160       170       180

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB8 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
        .:..... :.. :::::. :::.:.: ::: : ::. ::  :.. ::::..:.:  :..
XP_011 HGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGR
              190       200       210        220       230         

           230        240       250       260             270      
pF1KB8 PLKEEKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAP------SKRPPISDSEEL
         ::::  : : ::::::   :: : .:.  .  .:     :      ::::  .:: . 
XP_011 LPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKP
     240       250       260         270       280       290       

        280       290       300        310       320       330     
pF1KB8 SAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTL
       ::::.:::::..  .. ...:    . : .:::  :::: ..  ::: :::  : ::.  
XP_011 SAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKA--
       300       310       320       330       340       350       

         340       350       360       370           380       390 
pF1KB8 PPFDDIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSS----FTPSQTRQQGPLRSIMK
             .. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::.::    : :::...::::::...
XP_011 ------LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVE
               360       370       380       390       400         

             400       410       420       430       440       450 
pF1KB8 DLHSDDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPP
       ::.:    ::::: .:...  :    .: :  :. :.:.:: :.:..:. ::   .::::
XP_011 DLQS----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSRLSFSD-SESDNSADSSLPSREPPP
     410            420       430         440        450       460 

              460       470       480       490       500       510
pF1KB8 PLLKTN-NNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIV
       :      :...   .:: . :: .: .:.:  :::: :::::::::::.::::..:::::
XP_011 PQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIV
             470       480       490       500       510       520 

              520       530       540       550 
pF1KB8 NLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
       :::::::::..::::::::: :::.:::::::: ::. .: 
XP_011 NLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT 
             530       540       550       560  

>>XP_011526323 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL iso  (600 aa)
 initn: 1479 init1: 825 opt: 984  Z-score: 556.1  bits: 112.8 E(85289): 3.1e-24
Smith-Waterman score: 1786; 54.9% identity (74.0% similar) in 574 aa overlap (5-550:46-600)

                                         10        20        30    
pF1KB8                           MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMV
                                     :.:::.::::::::.:::::.:::::::::
XP_011 PGQRHQLRSSFCVCVCTCAPVCRLDSDFKRCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMV
          20        30        40        50        60        70     

           40        50        60        70        80        90    
pF1KB8 FVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFPRPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEE
       ::::::. .:::::::::: ::.:::.:.::::.::::::::::::::.::::.::::::
XP_011 FVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFPKPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEE
          80        90       100       110       120       130     

          100       110       120       130       140              
pF1KB8 PRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCEKLTFNNPTEDFRRKLLKAGG--------------
       :::: : :::::.:::.::::::::::::::::: .:: :::.:::              
XP_011 PRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCEKLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRP
         140       150       160       170       180       190     

               150       160       170       180       190         
pF1KB8 DPNRSI-HTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKS
       .:.  .  :   :. :. .... : .:..... :.. :::::. :::.:.: ::: : ::
XP_011 SPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKS
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     200       210       220       230        240       250        
pF1KB8 AFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENKPLKEEKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSG
       . ::  :.. ::::..:.:  :..  ::::  : : ::::::   :: : .:.  .  .:
XP_011 SSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGG
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      260             270       280       290       300        310 
pF1KB8 QDKKAP------SKRPPISDSEELSAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIK
            :      ::::  .:: . ::::.:::::..  .. ...:    . : .:::  :
XP_011 PPPPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAK
            320       330       340       350       360       370  

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB8 DKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSS
       ::: ..  ::: :::  : ::.        .. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::
XP_011 DKSSTRGEKVKAESEPREAKKA--------LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSS
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pF1KB8 SSS----FTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRR
       .::    : :::...::::::...::.:    ::::: .:...  :    .: :  :. :
XP_011 DSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVEDLQS----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSR
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pF1KB8 VSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTN-NNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAY
       .:.:: :.:..:. ::   .:::::      :...   .:: . :: .: .:.:  ::::
XP_011 LSFSD-SESDNSADSSLPSREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAY
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pF1KB8 LDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLE
        :::::::::::.::::..::::::::::::::..::::::::: :::.:::::::: ::
XP_011 TDELVELHRRLMALRERNVLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLE
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        550 
pF1KB8 TSGTS
       . .: 
XP_011 AVAT 
        600 

>>XP_011526325 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL iso  (558 aa)
 initn: 1435 init1: 872 opt: 981  Z-score: 554.9  bits: 112.5 E(85289): 3.6e-24
Smith-Waterman score: 1762; 56.0% identity (73.0% similar) in 559 aa overlap (5-550:46-558)

                                         10        20        30    
pF1KB8                           MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMV
                                     :.:::.::::::::.:::::.:::::::::
XP_011 PGQRHQLRSSFCVCVCTCAPVCRLDSDFKRCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMV
          20        30        40        50        60        70     

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pF1KB8 FVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFPRPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEE
       ::::::. .:::::::::: ::.:::.:.::::.::::::::::::::.::::.::::::
XP_011 FVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFPKPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEE
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pF1KB8 PRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCEKLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSS
       :::: : :::::.:::.::::::::::::::::: .:: :::.:::: :.          
XP_011 PRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCEKLTFNNPTTEFRYKLLRAGGDANKE---------
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pF1KB8 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKE
                       ::.:  :::::. :::.:.: ::: : ::. ::  :.. ::::.
XP_011 ----------------SSKT--SKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKSSSKELEREQAKSSKD
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pF1KB8 SSKKPKENKPLKEEKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAP------SKR
       .:.:  :..  ::::  : : ::::::   :: : .:.  .  .:     :      :::
XP_011 TSRKLGEGRLPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGGPPPPPPPPPRASSKR
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pF1KB8 PPISDSEELSAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIKDKSHVKMGKVKIESE
       :  .:: . ::::.:::::..  .. ...:    . : .:::  :::: ..  ::: :::
XP_011 PATADSPKPSAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESE
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pF1KB8 TSEKKKSTLPPFDDIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSS----FTPSQTRQ
         : ::.        .. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::.::    : :::...
XP_011 PREAKKA--------LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHS
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pF1KB8 QGPLRSIMKDLHSDDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSAS
       ::::::...::.:    ::::: .:...  :    .: :  :. :.:.:: :.:..:. :
XP_011 QGPLRSMVEDLQS----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSRLSFSD-SESDNSADS
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pF1KB8 SPLHHEPPPPLLKTN-NNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLR
       :   .:::::      :...   .:: . :: .: .:.:  :::: :::::::::::.::
XP_011 SLPSREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALR
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pF1KB8 ERHILQQIVNLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
       ::..::::::::::::::..::::::::: :::.:::::::: ::. .: 
XP_011 ERNVLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT 
     510       520       530       540       550         

>>XP_016882308 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL iso  (527 aa)
 initn: 1298 init1: 644 opt: 803  Z-score: 458.5  bits: 94.6 E(85289): 8.4e-19
Smith-Waterman score: 1605; 53.3% identity (72.7% similar) in 546 aa overlap (33-550:1-527)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB8 SSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFPRP
                                     ::::::::. .:::::::::: ::.:::.:
XP_016                               MVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFPKP
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             70        80        90       100       110       120  
pF1KB8 KRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCEKL
       .::::.::::::::::::::.::::.:::::::::: : :::::.:::.:::::::::::
XP_016 RRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCEKL
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pF1KB8 TFNNPTEDFRRKLLKAGG--------------DPNRSI-HTSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
       :::::: .:: :::.:::              .:.  .  :   :. :. .... : .:.
XP_016 TFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHGSK
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pF1KB8 SSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENKPLKE
       .... :.. :::::. :::.:.: ::: : ::. ::  :.. ::::..:.:  :..  ::
XP_016 DANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLPKE
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pF1KB8 EKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAP------SKRPPISDSEELSAKK
       ::  : : ::::::   :: : .:.  .  .:     :      ::::  .:: . ::::
XP_016 EKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAKK
     210       220       230         240       250       260       

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pF1KB8 RKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFD
       .:::::..  .. ...:    . : .:::  :::: ..  ::: :::  : ::.      
XP_016 QKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKA------
       270       280       290       300       310       320       

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pF1KB8 DIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSS----FTPSQTRQQGPLRSIMKDLHS
         .. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::.::    : :::...::::::...::.:
XP_016 --LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVEDLQS
               330       340       350       360       370         

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pF1KB8 DDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLK
           ::::: .:...  :    .: :  :. :.:.:: :.:..:. ::   .:::::   
XP_016 ----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSRLSFSD-SESDNSADSSLPSREPPPPQKP
         380        390       400          410       420       430 

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pF1KB8 TN-NNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIE
          :...   .:: . :: .: .:.:  :::: :::::::::::.::::..:::::::::
XP_016 PPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIVNLIE
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pF1KB8 ETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
       :::::..::::::::: :::.:::::::: ::. .: 
XP_016 ETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT 
             500       510       520        




551 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 15:04:12 2016 done: Fri Nov  4 15:04:14 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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