Result of FASTA (ccds) for pF1KB8726
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8726, 358 aa
  1>>>pF1KB8726 358 - 358 aa - 358 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0240+/-0.00135; mu= 2.4814+/- 0.077
 mean_var=253.5815+/-59.051, 0's: 0 Z-trim(106.6): 674  B-trim: 94 in 1/52
 Lambda= 0.080541
 statistics sampled from 8272 (9068) to 8272 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.279), width:  16
 Scan time:  2.590

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22        ( 358) 2393 291.9 5.5e-79
CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5         ( 367) 1597 199.5 3.9e-51
CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1           ( 268)  893 117.5 1.3e-26
CCDS12403.1 TSSK6 gene_id:83983|Hs108|chr19        ( 273)  818 108.8 5.7e-24
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21        ( 783)  670 92.1 1.7e-18
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783)  670 92.1 1.7e-18
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3          ( 765)  632 87.7 3.6e-17
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14         ( 713)  630 87.4   4e-17
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14         ( 729)  630 87.4   4e-17
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14         ( 744)  630 87.4 4.1e-17
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14         ( 753)  630 87.5 4.1e-17
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11          ( 926)  629 87.4 5.1e-17
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11         (1261)  629 87.6 6.3e-17
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11          (1321)  629 87.6 6.4e-17
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11         ( 709)  624 86.7 6.4e-17
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11         ( 719)  624 86.7 6.5e-17
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11          ( 724)  624 86.7 6.5e-17
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11         ( 745)  624 86.8 6.7e-17
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1          ( 780)  624 86.8 6.9e-17
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11         ( 788)  624 86.8 6.9e-17
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1          ( 795)  624 86.8 6.9e-17
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1          ( 796)  624 86.8 6.9e-17
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19        ( 688)  619 86.1 9.5e-17
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19        ( 752)  619 86.2   1e-16
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12         ( 661)  599 83.8 4.6e-16
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1          ( 672)  599 83.8 4.7e-16
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5          ( 559)  570 80.3 4.3e-15
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1           ( 552)  563 79.5 7.5e-15
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9           ( 610)  556 78.8 1.4e-14
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9            ( 651)  556 78.8 1.5e-14
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21         ( 714)  552 78.4 2.1e-14
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11         ( 668)  549 78.0 2.6e-14
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11         ( 674)  549 78.0 2.6e-14
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11         ( 736)  549 78.0 2.8e-14
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19        ( 778)  544 77.5 4.3e-14
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5         ( 436)  535 76.1 6.1e-14
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3           ( 370)  530 75.5 8.2e-14
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11         ( 766)  535 76.4 8.8e-14
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11         ( 614)  504 72.7 9.3e-13
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9           ( 619)  504 72.7 9.3e-13
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3         ( 648)  490 71.1   3e-12
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1         ( 476)  487 70.6 3.1e-12
CCDS76779.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15         ( 470)  485 70.4 3.6e-12
CCDS45305.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15         ( 472)  485 70.4 3.6e-12
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16         ( 424)  478 69.5 5.9e-12
CCDS73254.1 STK33 gene_id:65975|Hs108|chr11        ( 473)  474 69.1 8.8e-12
CCDS7789.1 STK33 gene_id:65975|Hs108|chr11         ( 514)  474 69.1 9.2e-12
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10        ( 357)  471 68.6 9.3e-12
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10        ( 385)  471 68.6 9.8e-12
CCDS13843.1 CHEK2 gene_id:11200|Hs108|chr22        ( 543)  471 68.8 1.2e-11


>>CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22             (358 aa)
 initn: 2393 init1: 2393 opt: 2393  Z-score: 1531.5  bits: 291.9 E(32554): 5.5e-79
Smith-Waterman score: 2393; 100.0% identity (100.0% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKKTPTDFVERFLPRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKKTPTDFVERFLPRE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 MDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQGALHEDVARKMFRQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQGALHEDVARKMFRQL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 SSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDSNGRIILSKTFCGSAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDSNGRIILSKTFCGSAA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 YAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKMLRIQKEHRVDFPRSKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKMLRIQKEHRVDFPRSKN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 LTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQPPKPKATSSASFKREGEGKYRAECKLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQPPKPKATSSASFKREGEGKYRAECKLD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350        
pF1KB8 TKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAETSRAKDHHISGAEVGKAST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAETSRAKDHHISGAEVGKAST
              310       320       330       340       350        

>>CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5              (367 aa)
 initn: 1602 init1: 1566 opt: 1597  Z-score: 1031.5  bits: 199.5 E(32554): 3.9e-51
Smith-Waterman score: 1597; 71.8% identity (89.4% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-327)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKKTPTDFVERFLPRE
       ::::.::...::..:::::.:::::::::::::::::::.:::::::.:.::.:.:::::
CCDS41 MDDAAVLKRRGYLLGINLGEGSYAKVKSAYSERLKFNVAIKIIDRKKAPADFLEKFLPRE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 MDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQGALHEDVARKMFRQL
       ..::: .:: :::::::::::: :..::.:::.:::::::.:: .:::::: ::: :.::
CCDS41 IEILAMLNHCSIIKTYEIFETSHGKVYIVMELAVQGDLLELIKTRGALHEDEARKKFHQL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 SSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDSNGRIILSKTFCGSAA
       : :.:::::::.:::::::.:::::::::::::::.::::::::..::. :::::::: :
CCDS41 SLAIKYCHDLDVVHRDLKCDNLLLDKDFNIKLSDFSFSKRCLRDDSGRMALSKTFCGSPA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 YAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKMLRIQKEHRVDFPRSKN
       ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::.:::::.
CCDS41 YAAPEVLQGIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSNIKKMLRIQKEHRVNFPRSKH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 LTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQPPKPKATSSASFKREGEGKYRAECKLD
       :: :::::::.::::::..:::::::::: :.:: : ... :.....:::..  .:    
CCDS41 LTGECKDLIYHMLQPDVNRRLHIDEILSHCWMQP-KARGSPSVAINKEGESSRGTEPLWT
              250       260       270        280       290         

              310       320       330       340       350          
pF1KB8 TKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAETSRAKDHHISGAEVGKAST  
        . :   :..   ::  . . .  . ::..                              
CCDS41 PEPG--SDKKSATKLEPEGEAQPQAQPETKPEGTAMQMSRQSEILGFPSKPSTMETEEGP
     300         310       320       330       340       350       

>>CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1                (268 aa)
 initn: 843 init1: 458 opt: 893  Z-score: 591.0  bits: 117.5 E(32554): 1.3e-26
Smith-Waterman score: 893; 47.4% identity (77.9% similar) in 272 aa overlap (1-272:1-265)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKKTPTDFVERFLPRE
       :.:   : ..:: .: ..:.:.:.::: :.:.. . .::.:.::.   : .:..::::::
CCDS36 MED--FLLSNGYQLGKTIGEGTYSKVKEAFSKKHQRKVAIKVIDKMGGPEEFIQRFLPRE
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 MDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQGALHEDVARKMFRQL
       ..:. :..: .::..::..:..::.: ..:::.  ::... .   : : :. :. .:::.
CCDS36 LQIVRTLDHKNIIQVYEMLESADGKICLVMELAEGGDVFDCVLNGGPLPESRAKALFRQM
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 SSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDSNGRIILSKTFCGSAA
         :..:::   ..:::::::: :: . ::.::.::::.:  :  :. .  ::.:::::.:
CCDS36 VEAIRYCHGCGVAHRDLKCENALL-QGFNLKLTDFGFAK-VLPKSHRE--LSQTFCGSTA
      120       130       140        150        160         170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 YAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKMLRIQKEHRVDFPRSKN
       ::::::::.::.. :  :.::.::.::.:.:.:.:.::.:: :::  :... :.::   .
CCDS36 YAAPEVLQGIPHDSKKGDVWSMGVVLYVMLCASLPFDDTDIPKMLW-QQQKGVSFPTHLS
          180       190       200       210       220        230   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 LTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQPPKPKATSSASFKREGEGKYRAECKLD
       .. .:.::. :.:.::.  :  :.:.  : ::                            
CCDS36 ISADCQDLLKRLLEPDMILRPSIEEVSWHPWLAST                         
           240       250       260                                 

              310       320       330       340       350        
pF1KB8 TKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAETSRAKDHHISGAEVGKAST

>>CCDS12403.1 TSSK6 gene_id:83983|Hs108|chr19             (273 aa)
 initn: 765 init1: 292 opt: 818  Z-score: 543.8  bits: 108.8 E(32554): 5.7e-24
Smith-Waterman score: 818; 46.4% identity (74.5% similar) in 274 aa overlap (1-273:1-268)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKKTPTDFVERFLPRE
       :.   .: . :: .: ..:.:::.::: : :.. : .::.:..::...: :::..:::::
CCDS12 MSGDKLLSELGYKLGRTIGEGSYSKVKVATSKKYKGTVAIKVVDRRRAPPDFVNKFLPRE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 MDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQGALHEDVARKMFRQL
       ..::  : :  :....:..:. .:..::.:: ..  :::. .. .: .    :: .: :.
CCDS12 LSILRGVRHPHIVHVFEFIEVCNGKLYIVME-AAATDLLQAVQRNGRIPGVQARDLFAQI
               70        80        90        100       110         

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pF1KB8 SSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFN-IKLSDFGFSKRCLRDSNGRIILSKTFCGSA
       ..::.: ::  .:::::::::.::. :   .::.::::.    :...:   :: :.::::
CCDS12 AGAVRYLHDHHLVHRDLKCENVLLSPDERRVKLTDFGFG----RQAHGYPDLSTTYCGSA
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pF1KB8 AYAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKMLRIQKEHRVDFPRSK
       :::.:::: .:::.:: ::.::.::.::.:: : ::.:::::  . : ::.  : .:.. 
CCDS12 AYASPEVLLGIPYDPKKYDVWSMGVVLYVMVTGCMPFDDSDIAGLPRRQKRG-VLYPEGL
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pF1KB8 NLTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQPPKPKATSSASFKREGEGKYRAECKL
       .:. .:: :: ..:: . : :    ..  . ::.                          
CCDS12 ELSERCKALIAELLQFSPSARPSAGQVARNCWLRAGDSG                     
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pF1KB8 DTKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAETSRAKDHHISGAEVGKAST

>>CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21             (783 aa)
 initn: 621 init1: 267 opt: 670  Z-score: 445.6  bits: 92.1 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 670; 41.1% identity (68.4% similar) in 285 aa overlap (7-285:22-297)

                              10        20        30        40     
pF1KB8                MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDR
                            ::   : .  .::::..: :: :  .  : .::.::::.
CCDS33 MVIMSEFSADPAGQGQGQQKPLRVGFYDIERTLGKGNFAVVKLARHRVTKTQVAIKIIDK
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pF1KB8 KKTPTDFVERFLPREMDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQ
        .  .. .:..  ::....  .::  ::: :...::.:  .::. :.. .:......  .
CCDS33 TRLDSSNLEKIY-REVQLMKLLNHPHIIKLYQVMETKD-MLYIVTEFAKNGEMFDYLTSN
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pF1KB8 GALHEDVARKMFRQLSSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDS
       : : :. ::: : :. :::.::::  ::::::: :::::: ...:::.::::..     .
CCDS33 GHLSENEARKKFWQILSAVEYCHDHHIVHRDLKTENLLLDGNMDIKLADFGFGN---FYK
      120       130       140       150       160       170        

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pF1KB8 NGRIILSKTFCGSAAYAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKML
       .:. .  .:.:::  ::::::...  :.    :::::::.::..::::.:.:  ..  . 
CCDS33 SGEPL--STWCGSPPYAAPEVFEGKEYEGPQLDIWSLGVVLYVLVCGSLPFDGPNLPTLR
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pF1KB8 RIQKEHRVDFPRSKNLTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWL--QP--PKPK--A
       .   : :  .:    .. .:..:: :::  : ..:. : .: .: :.  .:  : :   :
CCDS33 QRVLEGRFRIPFF--MSQDCESLIRRMLVVDPARRITIAQIRQHRWMRAEPCLPGPACPA
           240         250       260       270       280       290 

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pF1KB8 TSSASFKREGEGKYRAECKLDTKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAE
        :. :.                                                      
CCDS33 FSAHSYTSNLGDYDEQALGIMQTLGVDRQRTVESLQNSSYNHFAAIYYLLLERLKEYRNA
             300       310       320       330       340       350 

>>CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|chr21  (783 aa)
 initn: 621 init1: 267 opt: 670  Z-score: 445.6  bits: 92.1 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 670; 41.1% identity (68.4% similar) in 285 aa overlap (7-285:22-297)

                              10        20        30        40     
pF1KB8                MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDR
                            ::   : .  .::::..: :: :  .  : .::.::::.
CCDS82 MVIMSEFSADPAGQGQGQQKPLRVGFYDIERTLGKGNFAVVKLARHRVTKTQVAIKIIDK
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB8 KKTPTDFVERFLPREMDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQ
        .  .. .:..  ::....  .::  ::: :...::.:  .::. :.. .:......  .
CCDS82 TRLDSSNLEKIY-REVQLMKLLNHPHIIKLYQVMETKD-MLYIVTEFAKNGEMFDYLTSN
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pF1KB8 GALHEDVARKMFRQLSSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDS
       : : :. ::: : :. :::.::::  ::::::: :::::: ...:::.::::..     .
CCDS82 GHLSENEARKKFWQILSAVEYCHDHHIVHRDLKTENLLLDGNMDIKLADFGFGN---FYK
      120       130       140       150       160       170        

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pF1KB8 NGRIILSKTFCGSAAYAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKML
       .:. .  .:.:::  ::::::...  :.    :::::::.::..::::.:.:  ..  . 
CCDS82 SGEPL--STWCGSPPYAAPEVFEGKEYEGPQLDIWSLGVVLYVLVCGSLPFDGPNLPTLR
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pF1KB8 RIQKEHRVDFPRSKNLTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWL--QP--PKPK--A
       .   : :  .:    .. .:..:: :::  : ..:. : .: .: :.  .:  : :   :
CCDS82 QRVLEGRFRIPFF--MSQDCESLIRRMLVVDPARRITIAQIRQHRWMRAEPCLPGPACPA
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pF1KB8 TSSASFKREGEGKYRAECKLDTKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAE
        :. :.                                                      
CCDS82 FSAHSYTSNLGDYDEQALGIMQTLGVDRQRTVESLQNSSYNHFAAIYYLLLERLKEYRNA
             300       310       320       330       340       350 

>>CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3               (765 aa)
 initn: 557 init1: 178 opt: 632  Z-score: 421.8  bits: 87.7 E(32554): 3.6e-17
Smith-Waterman score: 632; 39.9% identity (68.3% similar) in 281 aa overlap (9-277:5-276)

               10                20        30        40        50  
pF1KB8 MDDATVLRKKGY---IVGI-----NLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKKTPTDF
               :.::   :.:.     .::.: .: :: :       .::::.::. :  : .
CCDS43     MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDT-L
                   10        20        30        40        50      

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pF1KB8 VERFLPREMDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFI-KCQGALHED
       .   : .:.  .  :.: .:.. ::...:.  ..:.:.:::  ::....: : . .:.::
CCDS43 ATGHLFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQT-KLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNED
          60        70        80         90       100       110    

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pF1KB8 VARKMFRQLSSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLL-DKDFNIKLSDFGFSKRCLRDSNGRII
       .:.:.: :.  :..::: : .:::::: ::... .:.  .::.:::::..    . :. .
CCDS43 LAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKF---QPGKKL
          120       130       140       150       160          170 

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pF1KB8 LSKTFCGSAAYAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKMLRIQKE
          : ::: ::.:::.: .  :.  . :::::::::...:::. :.....  . : .  .
CCDS43 --TTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMD
               180       190       200       210       220         

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pF1KB8 HRVDFPRSKNLTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQ--PPKPKATSSASFKRE
        .   :  .... :::::: :::: : ..:  ..:: .: :::   :.:           
CCDS43 CKYTVP--SHVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSY
     230         240       250       260       270       280       

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pF1KB8 GEGKYRAECKLDTKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAETSRAKDHHI
                                                                   
CCDS43 KNLSEEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQT
       290       300       310       320       330       340       

>>CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14              (713 aa)
 initn: 530 init1: 275 opt: 630  Z-score: 420.9  bits: 87.4 E(32554): 4e-17
Smith-Waterman score: 630; 40.3% identity (70.5% similar) in 258 aa overlap (18-272:62-307)

                            10        20        30        40       
pF1KB8              MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKK
                                     .:::..:::: :       .::.::::. .
CCDS55 TSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQ
              40        50        60        70        80        90 

         50        60        70        80        90       100      
pF1KB8 -TPTDFVERFLPREMDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQG
        .::.. . :  ::. :.  .:: .:.: .:..:: .  .:.::: .  :......  .:
CCDS55 LNPTSLQKLF--REVRIMKILNHPNIVKLFEVIET-EKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHG
             100         110       120        130       140        

        110       120       130       140       150       160      
pF1KB8 ALHEDVARKMFRQLSSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDSN
        ..:  ::. :::. :::.:::.  ::::::: :::::: :.:::..:::::..     .
CCDS55 RMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFT--VG
      150       160       170       180       190       200        

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pF1KB8 GRIILSKTFCGSAAYAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKML-
       :..    :::::  :::::..:.  :.    :.:::::::: .: ::.:.: ......  
CCDS55 GKL---DTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRE
           210       220       230       240       250       260   

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pF1KB8 RIQK-EHRVDFPRSKNLTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQPPKPKATSSAS
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CCDS45 LNPTSLQKLF--REVRIMKILNHPNIVKLFEVIET-EKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHG
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pF1KB8 ALHEDVARKMFRQLSSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDSN
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CCDS45 GKL---DTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRE
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CCDS45 RVLRGKYRIPF----YMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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