Result of FASTA (ccds) for pF1KB8678
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8678, 376 aa
  1>>>pF1KB8678 376 - 376 aa - 376 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6251+/-0.00106; mu= 14.2290+/- 0.063
 mean_var=61.0595+/-12.009, 0's: 0 Z-trim(102.1): 41  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.164134
 statistics sampled from 6770 (6810) to 6770 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.209), width:  16
 Scan time:  2.260

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7536.1 ACTR1A gene_id:10121|Hs108|chr10        ( 376) 2488 598.1 4.2e-171
CCDS2033.1 ACTR1B gene_id:10120|Hs108|chr2         ( 376) 2344 564.0 7.7e-161
CCDS10041.1 ACTC1 gene_id:70|Hs108|chr15           ( 377) 1429 347.3 1.3e-95
CCDS11782.1 ACTG1 gene_id:71|Hs108|chr17           ( 375) 1427 346.8 1.8e-95
CCDS5341.1 ACTB gene_id:60|Hs108|chr7              ( 375) 1426 346.6 2.1e-95
CCDS1578.1 ACTA1 gene_id:58|Hs108|chr1             ( 377) 1424 346.1 2.9e-95
CCDS7392.1 ACTA2 gene_id:59|Hs108|chr10            ( 377) 1421 345.4 4.8e-95
CCDS1930.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2             ( 376) 1418 344.7 7.9e-95
CCDS34163.1 ACTBL2 gene_id:345651|Hs108|chr5       ( 376) 1399 340.2 1.8e-93
CCDS46414.1 POTEE gene_id:445582|Hs108|chr2        (1075) 1358 330.6 3.9e-90
CCDS59431.1 POTEI gene_id:653269|Hs108|chr2        (1075) 1356 330.1 5.5e-90
CCDS46409.1 POTEF gene_id:728378|Hs108|chr2        (1075) 1351 329.0 1.2e-89
CCDS59432.1 POTEJ gene_id:653781|Hs108|chr2        (1038) 1336 325.4 1.4e-88
CCDS56124.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2            ( 333) 1102 269.9 2.4e-72
CCDS3206.1 ACTRT3 gene_id:84517|Hs108|chr3         ( 372) 1065 261.1 1.1e-69
CCDS45.1 ACTRT2 gene_id:140625|Hs108|chr1          ( 377) 1036 254.3 1.3e-67
CCDS1881.1 ACTR2 gene_id:10097|Hs108|chr2          ( 394) 1001 246.0 4.4e-65
CCDS14611.1 ACTRT1 gene_id:139741|Hs108|chrX       ( 376)  999 245.5 5.8e-65
CCDS46307.1 ACTR2 gene_id:10097|Hs108|chr2         ( 399)  990 243.4 2.7e-64
CCDS6772.1 ACTL7A gene_id:10881|Hs108|chr9         ( 435)  922 227.3   2e-59
CCDS6771.1 ACTL7B gene_id:10880|Hs108|chr9         ( 415)  897 221.3 1.2e-57
CCDS12207.1 ACTL9 gene_id:284382|Hs108|chr19       ( 416)  850 210.2 2.7e-54
CCDS183.1 ACTL8 gene_id:81569|Hs108|chr1           ( 366)  681 170.2 2.6e-42
CCDS33277.1 ACTR3 gene_id:10096|Hs108|chr2         ( 418)  501 127.6   2e-29
CCDS34782.1 ACTR3B gene_id:57180|Hs108|chr7        ( 348)  495 126.1 4.6e-29
CCDS5934.1 ACTR3B gene_id:57180|Hs108|chr7         ( 418)  495 126.2 5.4e-29
CCDS63000.1 ACTR3 gene_id:10096|Hs108|chr2         ( 367)  482 123.1   4e-28
CCDS33463.1 ACTL10 gene_id:170487|Hs108|chr20      ( 245)  474 121.1   1e-27
CCDS5702.1 ACTL6B gene_id:51412|Hs108|chr7         ( 426)  410 106.0 6.3e-23
CCDS43174.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3           ( 387)  337 88.7 9.2e-18
CCDS3231.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3            ( 429)  337 88.7   1e-17
CCDS9074.1 ACTR6 gene_id:64431|Hs108|chr12         ( 396)  323 85.4 9.4e-17
CCDS47744.1 ACTR3C gene_id:653857|Hs108|chr7       ( 210)  296 79.0 4.4e-15
CCDS13308.1 ACTR5 gene_id:79913|Hs108|chr20        ( 607)  275 74.1 3.7e-13


>>CCDS7536.1 ACTR1A gene_id:10121|Hs108|chr10             (376 aa)
 initn: 2488 init1: 2488 opt: 2488  Z-score: 3185.3  bits: 598.1 E(32554): 4.2e-171
Smith-Waterman score: 2488; 100.0% identity (100.0% similar) in 376 aa overlap (1-376:1-376)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 KAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 RERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 MRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 SGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSK
              310       320       330       340       350       360

              370      
pF1KB8 KEYEEDGARSIHRKTF
       ::::::::::::::::
CCDS75 KEYEEDGARSIHRKTF
              370      

>>CCDS2033.1 ACTR1B gene_id:10120|Hs108|chr2              (376 aa)
 initn: 2344 init1: 2344 opt: 2344  Z-score: 3001.0  bits: 564.0 E(32554): 7.7e-161
Smith-Waterman score: 2344; 90.4% identity (98.9% similar) in 376 aa overlap (1-376:1-376)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGP
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::
CCDS20 MESYDIIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHMRVMAGALEGDLFIGP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 KAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKN
       :::::::::.::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS20 KAEEHRGLLTIRYPMEHGVVRDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPSKN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 RERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSI
       ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 REKAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 MRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQ
       ::.:::::::::.::: ::::: :::.:.:::.:..::::::::::::::::.:::::.:
CCDS20 MRVDIAGRDVSRYLRLLLRKEGVDFHTSAEFEVVRTIKERACYLSINPQKDEALETEKVQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVL
       : ::::::...::.:::::::::.:::.:.::::.:::..:::.:::::::::::.::::
CCDS20 YTLPDGSTLDVGPARFRAPELLFQPDLVGDESEGLHEVVAFAIHKSDMDLRRTLFANIVL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 SGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSK
       :::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDIKIKISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSK
              310       320       330       340       350       360

              370      
pF1KB8 KEYEEDGARSIHRKTF
       :::::::.:.::::::
CCDS20 KEYEEDGSRAIHRKTF
              370      

>>CCDS10041.1 ACTC1 gene_id:70|Hs108|chr15                (377 aa)
 initn: 1421 init1: 571 opt: 1429  Z-score: 1830.0  bits: 347.3 E(32554): 1.3e-95
Smith-Waterman score: 1429; 53.7% identity (82.1% similar) in 369 aa overlap (12-376:10-377)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGP
                  .: :::::..:::::::. :.  ::. ::::.:  ::.:  . : ..: 
CCDS10   MCDDEETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 KAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKN
       .:. .::.:...::.::::. .:.:::.::....  ..:..  ::::.:::::::::. :
CCDS10 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFY-NELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKAN
       60        70        80        90        100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 RERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSI
       ::. ....::::::::.....::::::::.:::::.:::::::::: ::::::.:.::.:
CCDS10 REKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAI
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 MRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQ
       ::.:.::::.. .:   : ..::.: ...: :::. :::. ::.... ... .  . ...
CCDS10 MRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSS
       180       190       200       210       220       230       

                  250       260       270       280       290      
pF1KB8 ----YYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFS
           : ::::..: ::  ::: :: ::.:..:: :: ::::.   .:.: :.:.:. :..
CCDS10 LEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYA
       240       250       260       270       280       290       

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB8 NIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKM
       : :::::.:.. :..::. .:.  :::. .::.: :: :: ::.::::::::::.::..:
CCDS10 NNVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQM
       300       310       320       330       340       350       

        360       370      
pF1KB8 WVSKKEYEEDGARSIHRKTF
       :.::.::.: :   .::: :
CCDS10 WISKQEYDEAGPSIVHRKCF
       360       370       

>>CCDS11782.1 ACTG1 gene_id:71|Hs108|chr17                (375 aa)
 initn: 1422 init1: 570 opt: 1427  Z-score: 1827.5  bits: 346.8 E(32554): 1.8e-95
Smith-Waterman score: 1427; 53.4% identity (82.7% similar) in 369 aa overlap (12-376:8-375)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGP
                  .:::::::. :::::::. :.  ::. ::::.:  ::.:  . : ..: 
CCDS11     MEEEIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 KAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKN
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CCDS11 EAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY-NELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKAN
         60        70        80        90        100       110     

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pF1KB8 RERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSI
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CCDS11 REKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAI
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CCDS11 LRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSS
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pF1KB8 ----YYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFS
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CCDS11 LEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYA
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CCDS11 WISKQEYDESGPSIVHRKCF
         360       370     

>>CCDS5341.1 ACTB gene_id:60|Hs108|chr7                   (375 aa)
 initn: 1412 init1: 570 opt: 1426  Z-score: 1826.2  bits: 346.6 E(32554): 2.1e-95
Smith-Waterman score: 1426; 53.1% identity (82.7% similar) in 369 aa overlap (12-376:8-375)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGP
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CCDS53     MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD
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pF1KB8 KAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKN
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CCDS53 EAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFY-NELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKAN
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CCDS53 REKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAI
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pF1KB8 MRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQ
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CCDS53 LRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSS
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pF1KB8 ----YYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFS
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CCDS53 LEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYA
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CCDS53 NTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQM
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pF1KB8 WVSKKEYEEDGARSIHRKTF
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CCDS53 WISKQEYDESGPSIVHRKCF
         360       370     

>>CCDS1578.1 ACTA1 gene_id:58|Hs108|chr1                  (377 aa)
 initn: 1416 init1: 571 opt: 1424  Z-score: 1823.6  bits: 346.1 E(32554): 2.9e-95
Smith-Waterman score: 1424; 53.1% identity (82.1% similar) in 369 aa overlap (12-376:10-377)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGP
                  .: :::::..:::::::. :.  ::. ::::.:  ::.:  . : ..: 
CCDS15   MCDEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD
                 10        20        30        40        50        

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pF1KB8 KAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKN
       .:. .::.:...::.::::. .:.:::.::....  ..:..  ::::.:::::::::. :
CCDS15 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFY-NELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKAN
       60        70        80        90        100       110       

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pF1KB8 RERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSI
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CCDS15 REKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAI
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pF1KB8 MRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQ
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CCDS15 MRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSS
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pF1KB8 ----YYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFS
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CCDS15 LEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYA
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pF1KB8 NIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKM
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CCDS15 NNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQM
       300       310       320       330       340       350       

        360       370      
pF1KB8 WVSKKEYEEDGARSIHRKTF
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CCDS15 WITKQEYDEAGPSIVHRKCF
       360       370       

>>CCDS7392.1 ACTA2 gene_id:59|Hs108|chr10                 (377 aa)
 initn: 1413 init1: 571 opt: 1421  Z-score: 1819.8  bits: 345.4 E(32554): 4.8e-95
Smith-Waterman score: 1421; 53.7% identity (81.6% similar) in 369 aa overlap (12-376:10-377)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGP
                  .: :::::. :::::::. :.  ::. ::::.:  ::.:  . : ..: 
CCDS73   MCEEEDSTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD
                 10        20        30        40        50        

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pF1KB8 KAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKN
       .:. .::.:...::.::::. .:.:::.::.. .  ..:..  ::::.:::::::::. :
CCDS73 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFY-NELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKAN
       60        70        80        90        100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 RERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSI
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CCDS73 REKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAI
       120       130       140       150       160       170       

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pF1KB8 MRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQ
       ::.:.::::.. .:   : ..::.: ...: :::. :::. ::.... ... .  . ...
CCDS73 MRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSS
       180       190       200       210       220       230       

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pF1KB8 ----YYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFS
           : ::::..: ::  ::: :: ::.:..:: :: ::::.   .:.: :.:.:. :..
CCDS73 LEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYA
       240       250       260       270       280       290       

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pF1KB8 NIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKM
       : :::::.:.. :..::. .:.  :::. .::.: :: :: ::.::::::::::.::..:
CCDS73 NNVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQM
       300       310       320       330       340       350       

        360       370      
pF1KB8 WVSKKEYEEDGARSIHRKTF
       :.::.::.: :   .::: :
CCDS73 WISKQEYDEAGPSIVHRKCF
       360       370       

>>CCDS1930.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2                  (376 aa)
 initn: 1410 init1: 571 opt: 1418  Z-score: 1816.0  bits: 344.7 E(32554): 7.9e-95
Smith-Waterman score: 1418; 53.7% identity (81.3% similar) in 369 aa overlap (12-376:9-376)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGP
                  .: :::::. :::::::. :.  ::. ::::.:  ::.:  . : ..: 
CCDS19    MCEEETTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD
                  10        20        30        40        50       

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pF1KB8 KAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKN
       .:. .::.:...::.::::. .:.:::.::.. .  ..:..  ::::.:::::::::. :
CCDS19 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFY-NELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKAN
        60        70        80        90        100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 RERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSI
       ::. ....::::::::.....::::::::.:::::.:::::::::: ::::::.:.::.:
CCDS19 REKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAI
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 MRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQ
       ::.:.::::.. .:   : ..::.: ...: :::. :::. ::.... ... .  . ...
CCDS19 MRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSS
        180       190       200       210       220       230      

                  250       260       270       280       290      
pF1KB8 ----YYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFS
           : ::::..: ::  ::: :: ::.:..:: :: ::::.   .:.: :.:.:. :..
CCDS19 LEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYA
        240       250       260       270       280       290      

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB8 NIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKM
       : :::::.:.. :..::. .:.  :::. .::.: :: :: ::.::::::::::.::..:
CCDS19 NNVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQM
        300       310       320       330       340       350      

        360       370      
pF1KB8 WVSKKEYEEDGARSIHRKTF
       :.:: ::.: :   .::: :
CCDS19 WISKPEYDEAGPSIVHRKCF
        360       370      

>>CCDS34163.1 ACTBL2 gene_id:345651|Hs108|chr5            (376 aa)
 initn: 1384 init1: 556 opt: 1399  Z-score: 1791.7  bits: 340.2 E(32554): 1.8e-93
Smith-Waterman score: 1399; 51.2% identity (81.8% similar) in 369 aa overlap (12-376:9-376)

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pF1KB8 MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGP
                  .:.:::::. ::::.::. :.  ::...:::.:  ::.:  . : ..: 
CCDS34    MTDNELSALVVDNGSGMCKAGFGGDDAPRAVFPSMIGRPRHQGVMVGMGQKDCYVGD
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pF1KB8 KAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKN
       .:. .::.:...::.:::.: .:.:::.:: ...  ..:..  .:::.:::::::::. :
CCDS34 EAQSKRGVLTLKYPIEHGVVTNWDDMEKIWYHTFY-NELRVAPDEHPILLTEAPLNPKIN
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pF1KB8 RERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSI
       ::. ....::.::.::.....::::::::.:::::.:.:::::::: ::::::.:.::.:
CCDS34 REKMTQIMFEAFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHIVPIYEGYALPHAI
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pF1KB8 MRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKD----ETLET
       .:.:.::::.. .:   : ..::.: ...: :::. .::. ::.... ...     .  .
CCDS34 LRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYNFTTTAEREIVRDVKEKLCYVALDFEQEMVRAAASSS
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pF1KB8 EKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFS
        . .: ::::..: ::  ::: :: .:.:...: :: ::::.   .:.: :.:.:. :..
CCDS34 PERSYELPDGQVITIGNERFRCPEAIFQPSFLGIESSGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYA
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pF1KB8 NIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKM
       : :::::::.. :..::. .:.  :::. .::.: :: :: ::.::::::::::.::..:
CCDS34 NTVLSGGSTMYPGIADRMQKEIITLAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQM
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        360       370      
pF1KB8 WVSKKEYEEDGARSIHRKTF
       :.::.::.: :   .::: :
CCDS34 WISKQEYDEAGPPIVHRKCF
        360       370      

>>CCDS46414.1 POTEE gene_id:445582|Hs108|chr2             (1075 aa)
 initn: 1353 init1: 526 opt: 1358  Z-score: 1731.6  bits: 330.6 E(32554): 3.9e-90
Smith-Waterman score: 1358; 50.9% identity (80.8% similar) in 369 aa overlap (12-376:708-1075)

                                  10        20        30        40 
pF1KB8                    MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGR
                                     .:::::::. :::::::. :.  ::. :::
CCDS46 EDIESVKKKNDNLLKALQLNELTMDDDTAVLVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR
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pF1KB8 PKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQT
       :..  .:.:  . . ..: .:. .::.:...:::::::. .:.:::.::....  ..:..
CCDS46 PRQQGMMGGMHQKESYVGKEAQSKRGILTLKYPMEHGIITNWDDMEKIWHHTFY-NELRV
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pF1KB8 FSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSG
         ::::.:::::::::. :::. ....:::::.::.....::: :::..:::::.:.:::
CCDS46 APEEHPILLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVPSLYTSGRTTGIVMDSG
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pF1KB8 DGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERA
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CCDS46 DGVTHTVPIYEGNALPHATLRLDLAGRELPDYLMKILTERGYRFTTMAEREIVRDIKEKL
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CCDS46 CYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPCFLGMESCGIHE
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CCDS46 TTFNSIMKSDVDIRKDLYTNTVLSGGTTMYPGMAHRMQKEIAALAPSMMKIRIIAPPKRK
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pF1KB8 YSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF
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CCDS46 YSVWVGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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376 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Fri Nov  4 14:30:43 2016 done: Fri Nov  4 14:30:44 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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