Result of FASTA (ccds) for pF1KB8617
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8617, 619 aa
  1>>>pF1KB8617 619 - 619 aa - 619 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0204+/-0.000923; mu= 16.1906+/- 0.056
 mean_var=91.0974+/-18.074, 0's: 0 Z-trim(107.6): 69  B-trim: 52 in 1/52
 Lambda= 0.134376
 statistics sampled from 9611 (9680) to 9611 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.297), width:  16
 Scan time:  3.010

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1         ( 619) 4049 795.4       0
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1031)  932 191.3 5.3e-48
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1032)  932 191.3 5.3e-48
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17        ( 938)  822 170.0 1.3e-41
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 729)  816 168.7 2.4e-41
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 731)  816 168.7 2.4e-41
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614)  810 167.5 4.6e-41
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614)  810 167.5 4.6e-41
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6          ( 648)  749 155.7 1.8e-37
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17        ( 411)  734 152.7 9.1e-37
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX        ( 631)  710 148.1 3.2e-35
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17        ( 599)  703 146.8   8e-35
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20        ( 796)  699 146.1 1.7e-34
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12         ( 455)  695 145.1 1.9e-34
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 406)  690 144.1 3.3e-34
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3          ( 407)  688 143.8 4.4e-34
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11          ( 483)  681 142.4 1.3e-33
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6          ( 428)  648 136.0 9.8e-32
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY          ( 660)  641 134.8 3.6e-31
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 646)  639 134.4 4.6e-31
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 662)  639 134.4 4.7e-31
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19       ( 427)  636 133.7 4.9e-31
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 881)  640 134.7 5.2e-31
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 882)  640 134.7 5.2e-31
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19        ( 483)  597 126.2   1e-28
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5          ( 622)  596 126.0 1.4e-28
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 575)  592 125.2 2.3e-28
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 690)  592 125.3 2.7e-28
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 704)  592 125.3 2.7e-28
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5           ( 724)  592 125.3 2.8e-28
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11          ( 875)  565 120.1 1.2e-26
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1           ( 824)  542 115.6 2.6e-25
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2           ( 670)  539 115.0 3.2e-25
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 478)  519 111.0 3.6e-24
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 483)  518 110.8 4.2e-24
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 347)  516 110.4 4.2e-24
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 479)  505 108.3 2.4e-23
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 369)  502 107.7 2.9e-23
CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12         ( 406)  496 106.5   7e-23
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 370)  487 104.8 2.2e-22
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 447)  466 100.7 4.3e-21
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 448)  464 100.4 5.6e-21
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 453)  464 100.4 5.6e-21
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 783)  461 99.9 1.3e-20
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 715)  460 99.7 1.4e-20
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10         ( 737)  448 97.4 7.2e-20
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9          ( 585)  425 92.9 1.3e-18
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12          ( 820)  408 89.7 1.7e-17
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12         ( 600)  314 71.4   4e-12
CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7         ( 507)  304 69.4 1.3e-11


>>CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1              (619 aa)
 initn: 4049 init1: 4049 opt: 4049  Z-score: 4244.2  bits: 795.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4049; 99.7% identity (99.7% similar) in 619 aa overlap (1-619:1-619)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MFVPRSLKIKRNANDDGKSCVAKIIKPDPEDLQLDKSRDVPVDAVATEAATIDRHISESC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MFVPRSLKIKRNANDDGKSCVAKIIKPDPEDLQLDKSRDVPVDAVATEAATIDRHISESC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 PFPSPGGQLAEVHSVSPEQGAKDSHPSEEPVKSFSKTQRWAEPGEPICVVCGRYGEYICD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PFPSPGGQLAEVHSVSPEQGAKDSHPSEEPVKSFSKTQRWAEPGEPICVVCGRYGEYICD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 KTDEDVCSLECKAKHLLQVKEKEEKSKLSNPQKADSEPESPLNASYVYKEHPFILNLQED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KTDEDVCSLECKAKHLLQVKEKEEKSKLSNPQKADSEPESPLNASYVYKEHPFILNLQED
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 QIENLKQQLGILVQGQEVTRPIIDFEHCSLPEVLNHNLKKSGYEVPTPIQMQMIPVGLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QIENLKQQLGILVQGQEVTRPIIDFEHCSLPEVLNHNLKKSGYEVPTPIQMQMIPVGLLG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 RDILASADTGSGKTAAFLLPVIMRALFESKTPSALILTPTRELAIQIERQAKELMSGLPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RDILASADTGSGKTAAFLLPVIMRALFESKTPSALILTPTRELAIQIERQAKELMSGLPR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 MKTVLLVGGLPLPPQLYRLQQHVKVIIATPGRLLDIIKQSSVELCGVKIVVVDEADTMLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MKTVLLVGGLPLPPQLYRLQQHVKVIIATPGRLLDIIKQSSVELCGVKIVVVDEADTMLK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 MGFQQQVLDILENIPNDCQTILVSATIPTSIEQLASQLLHNPVRIITGEKNLPCANVRQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MGFQQQVLDILENIPNDCQTILVSATIPTSIEQLASQLLHNPVRIITGEKNLPCANVRQI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 ILWVEDPAKKKKLFEILNDKKLFKPPVLVFVDCKLGADLLSEAVQKITGLKRISIHSEKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::: 
CCDS30 ILWVEDPAKKKKLFEILNDKKLFKPPVLVFVDCKLGADLLSEAVQKITGLKSISIHSEKS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 QIERKNILKGLLEGDYEVVVSTGVLGRGLDLISVRLVVNFDMPSSMDEYVHQIGRVGRLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QIERKNILKGLLEGDYEVVVSTGVLGRGLDLISVRLVVNFDMPSSMDEYVHQIGRVGRLG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 QNGTAITFINNNSKRLFWDIAKRVKPTGSILPPQLLNSPYLHDQKRKEQQKDKQTQNDLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QNGTAITFINNNSKRLFWDIAKRVKPTGSILPPQLLNSPYLHDQKRKEQQKDKQTQNDLV
              550       560       570       580       590       600

              610         
pF1KB8 TGANLMDIIRKHDKSNSQK
       :::::::::::::::::::
CCDS30 TGANLMDIIRKHDKSNSQK
              610         

>>CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5               (1031 aa)
 initn: 788 init1: 252 opt: 932  Z-score: 975.2  bits: 191.3 E(32554): 5.3e-48
Smith-Waterman score: 932; 35.3% identity (68.6% similar) in 465 aa overlap (142-595:311-770)

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB8 GRYGEYICDKTDEDVCSLECKAKHLLQVKEKEEKSKLSNPQKADSEPESPLNASYVYKEH
                                     . .. :: .:    .    :.  .. : : 
CCDS34 KGELMENDQDAMEYSSEEEEVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNF-YVEV
              290       300       310       320       330          

             180        190       200       210       220       230
pF1KB8 PFILNLQEDQIENLKQQL-GILVQGQEVTRPIIDFEHCSLPEVLNHNLKKSGYEVPTPIQ
       : . ........ .. .. :: :.:.   .:: .. .:..   . ..::: ::: :::::
CCDS34 PELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQ
     340       350       360       370       380       390         

              240       250       260            270       280     
pF1KB8 MQMIPVGLLGRDILASADTGSGKTAAFLLPV---IM--RALFESKTPSALILTPTRELAI
        : ::. . :::... : :::::: :::::.   ::  :.: :.. : :.:.:::::::.
CCDS34 TQAIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELAL
     400       410       420       430       440       450         

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB8 QIERQAKELMSGLPRMKTVLLVGGLPLPPQLYRLQQHVKVIIATPGRLLDIIKQSS---V
       :: .. :.. . :  ...: . ::  .  :. .:.. ...:. ::::..:..  .:   .
CCDS34 QITKECKKFSKTLG-LRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVT
     460       470        480       490       500       510        

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB8 ELCGVKIVVVDEADTMLKMGFQQQVLDILENIPNDCQTILVSATIPTSIEQLASQLLHNP
       .:  :  ::.:::: :. :::. ::. :..:.  : ::.. :::.: ..: :: ..: .:
CCDS34 NLRRVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKP
      520       530       540       550       560       570        

            410       420       430       440       450       460  
pF1KB8 VRIITGEKNLPCANVRQIILWVEDPAKKKKLFEILNDKKLFKPPVLVFVDCKLGADLLSE
       ... .: ... :..:.: .. .:.  :  ::.:.:.  .  .  :..::: .  :: : .
CCDS34 IEVQVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQE-SGSVIIFVDKQEHADGLLK
      580       590       600       610        620       630       

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB8 AVQKITGLKRISIHSEKPQIERKNILKGLLEGDYEVVVSTGVLGRGLDLISVRLVVNFDM
        ... .    .:.:.   : .: .:.. . .:  ...:.:.: .::::.  . ::::.. 
CCDS34 DLMRAS-YPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSC
       640        650       660       670       680       690      

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pF1KB8 PSSMDEYVHQIGRVGRLGQNGTAITFINNNSKRLFWDIAKRVKPTGSILPPQL--LNSPY
       :. ...:::. ::.:: :..: : :::.... :   :: : .. .:. .::.:  : : .
CCDS34 PNHYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDF
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        .::.. : .  :..                                             
CCDS34 -KDQQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDE
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>>CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5               (1032 aa)
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CCDS75 KGELMENDQDAMEYSSEEEEVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNF-YVEV
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       : . ........ .. .. :: :.:.   .:: .. .:..   . ..::: ::: :::::
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        : ::. . :::... : :::::: :::::.   ::  :.: :.. : :.:.:::::::.
CCDS75 TQAIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELAL
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       :: .. :.. . :  ...: . ::  .  :. .:.. ...:. ::::..:..  .:   .
CCDS75 QITKECKKFSKTLG-LRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVT
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pF1KB8 ELCGVKIVVVDEADTMLKMGFQQQVLDILENIPNDCQTILVSATIPTSIEQLASQLLHNP
       .:  :  ::.:::: :. :::. ::. :..:.  : ::.. :::.: ..: :: ..: .:
CCDS75 NLRRVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKP
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pF1KB8 VRIITGEKNLPCANVRQIILWVEDPAKKKKLFEILNDKKLFKPPVLVFVDCKLGADLLSE
       ... .: ... :..:.: .. .:.  :  ::.:.:.  .  .  :..::: .  :: : .
CCDS75 IEVQVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQE-SGSVIIFVDKQEHADGLLK
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pF1KB8 AVQKITGLKRISIHSEKPQIERKNILKGLLEGDYEVVVSTGVLGRGLDLISVRLVVNFDM
        ... .    .:.:.   : .: .:.. . .:  ...:.:.: .::::.  . ::::.. 
CCDS75 DLMRAS-YPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSC
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pF1KB8 PSSMDEYVHQIGRVGRLGQNGTAITFINNNSKRLFWDIAKRVKPTGSILPPQL--LNSPY
       :. ...:::. ::.:: :..: : :::.... :   :: : .. .:. .::.:  : : .
CCDS75 PNHYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDF
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pF1KB8 LHDQKRKEQQKDKQTQNDLVTGANLMDIIRKHDKSNSQK                     
        .::.. : .  :..                                             
CCDS75 -KDQQKAEGKIIKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDE
         760       770       780       790       800       810     

>>CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17             (938 aa)
 initn: 750 init1: 287 opt: 822  Z-score: 860.6  bits: 170.0 E(32554): 1.3e-41
Smith-Waterman score: 823; 32.9% identity (65.2% similar) in 465 aa overlap (151-605:201-658)

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                                     :    :: . :   .  :.::  : ::  .
CCDS32 GVVQEEEEDNLEYDSDGNPIAPTKKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQ
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pF1KB8 QIENLKQQLGILVQGQEVTRPIIDFEHCSLPEVLNHNLKKSGYEVPTPIQMQMIPVGLLG
       :. .:...:.. :.:    ::  .: : .. : : :...:: :  ::::: : .::.: :
CCDS32 QLIDLRHKLNLRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSG
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pF1KB8 RDILASADTGSGKTAAFLLPVIM-----RALFESKTPSALILTPTRELAIQIERQAKELM
       ::... : :::::::::. :...     . :  .  : :.:. :::::  ::. . :.. 
CCDS32 RDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQKELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFG
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pF1KB8 SGLPRMKTVLLVGGLPLPPQLYRLQQHVKVIIATPGRLLDIIKQSSVELCGVKIVVVDEA
       ..   ...: . ::  .  :   ::. ..... :::::.: .:.....:  :. .: :::
CCDS32 KAY-NLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEA
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pF1KB8 DTMLKMGFQQQVLDILENIPNDCQTILVSATIPTSIEQLASQLLHNPVRIITGEKNLPCA
       : :. :::. :: .:  ..  : ::.: :::.  .::.:: ..: .:.:.. :. .    
CCDS32 DRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGEANE
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pF1KB8 NVRQIILWVED-PAK----KKKLFEILNDKKLFKPPVLVFVDCKLGADLLSEAVQKITGL
       .: ::.  ... :.:     ..: :. .. .     ::.::  : .:. :.. ...  : 
CCDS32 DVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSSGS-----VLLFVTKKANAEELANNLKQ-EGH
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pF1KB8 KRISIHSEKPQIERKNILKGLLEGDYEVVVSTGVLGRGLDLISVRLVVNFDMPSSMDEYV
       .   .:..  : ::..... . . :  :.:.: : .::::. :.. :.:.:.  ..: ..
CCDS32 NLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHT
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pF1KB8 HQIGRVGRLGQNGTAITFINNNSKRLFWDIAKRVKPTGSILPPQLLNSPYLHDQKRKEQQ
       :.:::.:: :..:.: :... ... .  :... .. ... .  .::.  . .   :: . 
CCDS32 HRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRF
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pF1KB8 KDKQTQNDLVTGANLMDIIRKHDKSNSQK                               
       :  . ..  . :..:                                             
CCDS32 KGGKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENMDRGNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAF
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>>CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22             (729 aa)
 initn: 653 init1: 261 opt: 816  Z-score: 855.9  bits: 168.7 E(32554): 2.4e-41
Smith-Waterman score: 818; 33.6% identity (66.1% similar) in 443 aa overlap (147-576:109-549)

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CCDS33 TMRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEH
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pF1KB8 PFILNLQEDQIENLKQQLGILVQGQEVT-RPIIDFEHCSLPEVLNHNLKKSGYEVPTPIQ
       : .  :   ....:...  : :.: .:  .:.. :.: ..:. .   :  . .  :::::
CCDS33 PEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPVFAFHHANFPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQ
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pF1KB8 MQMIPVGLLGRDILASADTGSGKTAAFLLPVIMRA-----LFESKTPSALILTPTRELAI
        : .:..: :::... :.:::::: :.:::.:..      : ..  :  :.:.:::::: 
CCDS33 CQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQ
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pF1KB8 QIERQAKELMSGLPRMKTVLLVGGLPLPPQLYRLQQHVKVIIATPGRLLDIIKQSSVELC
       :... : . ..   :.:.. . :: :  ::.  :.. :.. :::::::.:........: 
CCDS33 QVQQVADD-YGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLR
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pF1KB8 GVKIVVVDEADTMLKMGFQQQVLDILENIPNDCQTILVSATIPTSIEQLASQLLHNPVRI
           .:.:::: :: :::. :.  :...:  : ::.. ::: :  ..::: ..:.. ..:
CCDS33 RCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQI
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pF1KB8 ITGEKNLPCA-NVRQIILWVEDPAKKKKLFEILNDKKLFKP-PVLVFVDCKLGADLLSEA
        .:. .:    :. ::.    .  : .::......    :   ...::. :   : :.. 
CCDS33 NVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRR
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pF1KB8 VQKITGLKRISIHSEKPQIERKNILKGLLEGDYEVVVSTGVLGRGLDLISVRLVVNFDMP
       ...  :   . ::..: : ::  .:. .  :   ....: : .::::. .:..:.:.:.:
CCDS33 MRR-DGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYP
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pF1KB8 SSMDEYVHQIGRVGRLGQNGTAITFINNNSKRLFWDIAKRVKPTGSILPPQLLNSPYLHD
       .: ..:::.:::..:  ..::: ::.. .. .   .. : .. ... . :.:.       
CCDS33 NSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRG
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pF1KB8 QKRKEQQKDKQTQNDLVTGANLMDIIRKHDKSNSQK                        
                                                                   
CCDS33 GGGGGGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANG
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>>CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22             (731 aa)
 initn: 653 init1: 278 opt: 816  Z-score: 855.8  bits: 168.7 E(32554): 2.4e-41
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CCDS46 TMRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEH
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       : .  :   ....:...  : :.: .:  .:.. :.: ..:. .   :  . .  :::::
CCDS46 PEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPVFAFHHANFPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQ
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        : .:..: :::... :.:::::: :.:::.:..      : ..  :  :.:.:::::: 
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       :... : . ..   :.:.. . :: :  ::.  :.. :.. :::::::.:........: 
CCDS46 QVQQVADD-YGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLR
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           .:.:::: :: :::. :.  :...:  : ::.. ::: :  ..::: ..:.. ..:
CCDS46 RCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQI
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pF1KB8 ITGEKNLPCA-NVRQIILWVEDPAKKKKLFEILNDKKLFKP-PVLVFVDCKLGADLLSEA
        .:. .:    :. ::.    .  : .::......    :   ...::. :   : :.. 
CCDS46 NVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRR
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pF1KB8 VQKITGLKRISIHSEKPQIERKNILKGLLEGDYEVVVSTGVLGRGLDLISVRLVVNFDMP
       ...  :   . ::..: : ::  .:. .  :   ....: : .::::. .:..:.:.:.:
CCDS46 MRR-DGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYP
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pF1KB8 SSMDEYVHQIGRVGRLGQNGTAITFINNNSKRLFWDIAKRVKPTGSILPPQLLNSPYLHD
       .: ..:::.:::..:  ..::: ::.. .. .   .. : .. ... . :.:.       
CCDS46 NSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRG
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pF1KB8 QKRKEQQKDKQTQNDLVTGANLMDIIRKHDKSNSQK                        
                                                                   
CCDS46 GGGGGGKGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYA
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>>CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17               (614 aa)
 initn: 653 init1: 260 opt: 810  Z-score: 850.7  bits: 167.5 E(32554): 4.6e-41
Smith-Waterman score: 813; 33.3% identity (65.8% similar) in 442 aa overlap (147-576:33-472)

        120       130       140       150            160       170 
pF1KB8 YICDKTDEDVCSLECKAKHLLQVKEKEEKSKLSNP-----QKADSEPESPLNASYVYKEH
                                     :..::     .:  .  : :   .  :.::
CCDS82 AGRFEADEGTSVRFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEH
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pF1KB8 PFILNLQEDQIENLKQQLGILVQGQEVTRPIIDFEHCSLPEVLNHNLKKSGYEVPTPIQM
       : .     ...:. ...  : :.:..  .:...: . ..:  .   . ....  :: :: 
CCDS82 PDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQA
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pF1KB8 QMIPVGLLGRDILASADTGSGKTAAFLLPVIMRA-----LFESKTPSALILTPTRELAIQ
       :  ::.: : :... :.:::::: ..:::.:..      : ..  :  :.:.:::::: :
CCDS82 QGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQ
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pF1KB8 IERQAKELMSGLPRMKTVLLVGGLPLPPQLYRLQQHVKVIIATPGRLLDIIKQSSVELCG
       ... : :   .  :.:.. . :: :  ::.  :.. :.. :::::::.:... ....:  
CCDS82 VQQVAAEYCRAC-RLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRR
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pF1KB8 VKIVVVDEADTMLKMGFQQQVLDILENIPNDCQTILVSATIPTSIEQLASQLLHNPVRII
       .  .:.:::: :: :::. :.  :...:  : ::.. ::: :  ..::: ..:.. ..: 
CCDS82 TTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHIN
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        :  .:    :. ::.   .:  : .::......    :   ..:::. :   : :.. .
CCDS82 IGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKM
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       ..  :   ..::..: : ::  .:. . .:   ....: : .::::. .:..:.:.:.:.
CCDS82 RR-DGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPN
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pF1KB8 SMDEYVHQIGRVGRLGQNGTAITFINNNSKRLFWDIAKRVKPTGSILPPQLLNSPYLHDQ
       : ..:.:.:::..:  ..::: ::.. :. .   :. . .. ... . :.::        
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pF1KB8 KRKEQQKDKQTQNDLVTGANLMDIIRKHDKSNSQK                         
                                                                   
CCDS82 GRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANY
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>>CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17               (614 aa)
 initn: 653 init1: 260 opt: 810  Z-score: 850.7  bits: 167.5 E(32554): 4.6e-41
Smith-Waterman score: 813; 33.3% identity (65.8% similar) in 442 aa overlap (147-576:33-472)

        120       130       140       150            160       170 
pF1KB8 YICDKTDEDVCSLECKAKHLLQVKEKEEKSKLSNP-----QKADSEPESPLNASYVYKEH
                                     :..::     .:  .  : :   .  :.::
CCDS11 GYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEH
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pF1KB8 PFILNLQEDQIENLKQQLGILVQGQEVTRPIIDFEHCSLPEVLNHNLKKSGYEVPTPIQM
       : .     ...:. ...  : :.:..  .:...: . ..:  .   . ....  :: :: 
CCDS11 PDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQA
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pF1KB8 QMIPVGLLGRDILASADTGSGKTAAFLLPVIMRA-----LFESKTPSALILTPTRELAIQ
       :  ::.: : :... :.:::::: ..:::.:..      : ..  :  :.:.:::::: :
CCDS11 QGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQ
            130       140       150       160       170       180  

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB8 IERQAKELMSGLPRMKTVLLVGGLPLPPQLYRLQQHVKVIIATPGRLLDIIKQSSVELCG
       ... : :   .  :.:.. . :: :  ::.  :.. :.. :::::::.:... ....:  
CCDS11 VQQVAAEYCRAC-RLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRR
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pF1KB8 VKIVVVDEADTMLKMGFQQQVLDILENIPNDCQTILVSATIPTSIEQLASQLLHNPVRII
       .  .:.:::: :: :::. :.  :...:  : ::.. ::: :  ..::: ..:.. ..: 
CCDS11 TTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHIN
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pF1KB8 TGEKNLPCA-NVRQIILWVEDPAKKKKLFEILNDKKLFKP-PVLVFVDCKLGADLLSEAV
        :  .:    :. ::.   .:  : .::......    :   ..:::. :   : :.. .
CCDS11 IGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKM
             310       320       330       340       350       360 

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pF1KB8 QKITGLKRISIHSEKPQIERKNILKGLLEGDYEVVVSTGVLGRGLDLISVRLVVNFDMPS
       ..  :   ..::..: : ::  .:. . .:   ....: : .::::. .:..:.:.:.:.
CCDS11 RR-DGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPN
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pF1KB8 SMDEYVHQIGRVGRLGQNGTAITFINNNSKRLFWDIAKRVKPTGSILPPQLLNSPYLHDQ
       : ..:.:.:::..:  ..::: ::.. :. .   :. . .. ... . :.::        
CCDS11 SSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGS
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pF1KB8 KRKEQQKDKQTQNDLVTGANLMDIIRKHDKSNSQK                         
                                                                   
CCDS11 GRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANY
              490       500       510       520       530       540

>>CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6               (648 aa)
 initn: 631 init1: 290 opt: 749  Z-score: 786.4  bits: 155.7 E(32554): 1.8e-37
Smith-Waterman score: 752; 32.9% identity (65.4% similar) in 477 aa overlap (142-596:177-641)

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pF1KB8 GRYGEYICDKTDEDVCSLECKAKHLLQVKEKEEKSKLSNPQKADSEPESPLNASYVYKEH
                                     .::  : .. . ::  :  :.. .. ::: 
CCDS49 TAFQPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIREEGLKWQKTKWADL-P--PIKKNF-YKES
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pF1KB8 PFILNLQEDQIENL-KQQLGI----LVQGQE--VTRPIIDFE---HCSLPEVLNHNLKKS
            ... . ..  :....:    : .:..  .  :   :.   .:  :::.. :.::.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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