Result of FASTA (omim) for
pF1KB8580
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8580, 482 aa
1>>>pF1KB8580 482 - 482 aa - 482 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1065+/-0.000332; mu= 6.8510+/- 0.021
mean_var=177.4856+/-36.549, 0's: 0 Z-trim(121.0): 174 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.096270
statistics sampled from 36764 (36951) to 36764 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.733), E-opt: 0.2 (0.433), width: 16
Scan time: 9.270
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_079514 (OMIM: 608530) BTB/POZ domain-containing ( 482) 3215 458.5 1.9e-128
NP_060267 (OMIM: 608531) BTB/POZ domain-containing ( 525) 2496 358.7 2.3e-98
NP_001011885 (OMIM: 608530) BTB/POZ domain-contain ( 385) 2345 337.6 3.8e-92
XP_005259650 (OMIM: 608531) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 377) 2158 311.6 2.4e-84
XP_016883218 (OMIM: 615566) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 461) 1244 184.7 4.7e-46
XP_016883217 (OMIM: 615566) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 461) 1244 184.7 4.7e-46
NP_001269480 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-contain ( 461) 1244 184.7 4.7e-46
NP_001269479 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-contain ( 461) 1244 184.7 4.7e-46
NP_055777 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-containing ( 522) 1244 184.8 5.2e-46
NP_852108 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-containing ( 565) 1244 184.8 5.5e-46
XP_011526429 (OMIM: 608531) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 204) 1184 176.1 8e-44
NP_001269483 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-contain ( 371) 1048 157.4 6.2e-38
NP_001269481 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-contain ( 371) 1048 157.4 6.2e-38
XP_016883219 (OMIM: 615566) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 371) 1048 157.4 6.2e-38
XP_016867930 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 303) 367 62.8 1.6e-09
XP_016867929 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 325) 367 62.8 1.7e-09
NP_061334 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-like ( 538) 367 63.0 2.5e-09
XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 564) 367 63.0 2.5e-09
NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 367 63.0 2.6e-09
XP_016865716 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 387) 345 59.8 1.6e-08
XP_011512584 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 387) 345 59.8 1.6e-08
XP_011512583 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 391) 345 59.8 1.6e-08
XP_011512582 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 401) 345 59.8 1.6e-08
XP_011512581 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 612) 345 60.0 2.3e-08
NP_001092742 (OMIM: 611237) BTB/POZ domain-contain ( 612) 345 60.0 2.3e-08
NP_443125 (OMIM: 611237) BTB/POZ domain-containing ( 612) 345 60.0 2.3e-08
NP_689606 (OMIM: 615340,615348) kelch-like protein ( 621) 288 52.0 5.5e-06
NP_006054 (OMIM: 607701,615731) kelch-like protein ( 606) 280 50.9 1.2e-05
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 262 48.4 6.5e-05
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 263 48.6 6.9e-05
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 263 48.6 6.9e-05
XP_006715820 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 338) 250 46.6 0.00013
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 254 47.3 0.00013
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 254 47.3 0.00014
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 251 46.8 0.00014
NP_115894 (OMIM: 616607) kelch repeat and BTB doma ( 601) 253 47.2 0.00016
NP_001165889 (OMIM: 611237) BTB/POZ domain-contain ( 582) 252 47.0 0.00017
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 251 46.9 0.00018
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 251 46.9 0.00019
XP_006715819 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 551) 250 46.7 0.0002
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 251 46.9 0.0002
XP_006715818 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 577) 250 46.7 0.0002
XP_006715817 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 577) 250 46.7 0.0002
XP_006715816 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 599) 250 46.7 0.00021
XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 243 45.8 0.00042
XP_005260230 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 243 45.8 0.00042
XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 243 45.8 0.00042
NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 243 45.8 0.00042
NP_987096 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 243 45.8 0.00042
XP_006710686 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 440) 239 45.1 0.00047
>>NP_079514 (OMIM: 608530) BTB/POZ domain-containing pro (482 aa)
initn: 3215 init1: 3215 opt: 3215 Z-score: 2427.0 bits: 458.5 E(85289): 1.9e-128
Smith-Waterman score: 3215; 100.0% identity (100.0% similar) in 482 aa overlap (1-482:1-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 FLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 FLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 LPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 FMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 FMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 FGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 FGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 VNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 IVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VCYTACATLKGPDSHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 VCYTACATLKGPDSHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIF
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 YT
::
NP_079 YT
>>NP_060267 (OMIM: 608531) BTB/POZ domain-containing pro (525 aa)
initn: 2397 init1: 2156 opt: 2496 Z-score: 1886.8 bits: 358.7 E(85289): 2.3e-98
Smith-Waterman score: 2496; 77.6% identity (89.0% similar) in 491 aa overlap (7-482:42-525)
10 20 30
pF1KB8 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSS---
:::. :..: : :::. :: ::.:..
NP_060 CPPGVGVGPGTGGSPGPSANAAATPAPGNAAAAAAAAAAAAAAPGPT-PPAPPGPGTDAQ
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KB8 ----------LGP-LLPLQREPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRFVLGKGRGAA
:: :::: :::::.: ...::::::::.:.: ::.:..::: ..
NP_060 AAGAERAEEAAGPGAAALQREAAYNWQASKPTVQERFAFLFNNEVLCDVHFLVGKGLSS-
80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 AAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQ
:::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::
NP_060 -----QRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYSDEVQ
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 IGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLDT
::::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::..
NP_060 IGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLEN
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 IDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQRQQLPVTFG
:::.: :::.::::::::.::: ::::::::.::: :::.:::::.::::::::: ::
NP_060 IDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQVTPE
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 NKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPR
:..:::::::.:::::::::::::::::::::: :::::.::::::::::::::.:::::
NP_060 NRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFIDRPR
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 CCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRISIVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQI
:::::::: ::::::::::::::::::::::.::.:: .:::::::::::::::::::::
NP_060 CCLRGKECSINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQI
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 IEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPNVCYTACATLKGPDSHYGTKGLK
:. ... .::::::::::::.:.:::::::::.:.:::: :::::::::::::::::::.
NP_060 IHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPDSHYGTKGLR
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480
pF1KB8 KVVHETPAA-SKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT
::.::.:.. .:: : : . :::::::.:::::::.::::
NP_060 KVTHESPTTGAKTCFTFCYAAGNNNGTSVEDGQIPEVIFYT
490 500 510 520
>>NP_001011885 (OMIM: 608530) BTB/POZ domain-containing (385 aa)
initn: 2340 init1: 2340 opt: 2345 Z-score: 1775.4 bits: 337.6 E(85289): 3.8e-92
Smith-Waterman score: 2345; 98.6% identity (99.2% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 FLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 FMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 FGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRIS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..: : :
NP_001 VNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIR-SLNMRKS
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPN
NP_001 KPWDRMIPALVVMGQLTHSGSCSRNP
360 370 380
>>XP_005259650 (OMIM: 608531) PREDICTED: BTB/POZ domain- (377 aa)
initn: 2038 init1: 2038 opt: 2158 Z-score: 1635.1 bits: 311.6 E(85289): 2.4e-84
Smith-Waterman score: 2158; 85.1% identity (95.0% similar) in 377 aa overlap (107-482:1-377)
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 KGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALLRFL
::::::::::.::::::::::::::::.::
XP_005 MFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFL
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 YSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEPQLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::::
XP_005 YSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLA
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 SLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQRQQ
::::..:::.: :::.::::::::.::: ::::::::.::: :::.:::::.::::::::
XP_005 SLCLENIDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQ
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 LPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKPRVE
: :: :..:::::::.:::::::::::::::::::::: :::::.::::::::::::::
XP_005 LQVTPENRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVE
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 YIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRISIVGFGLYGSIHGPTDY
.::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.::.:: .:::::::::::::::
XP_005 FIDRPRCCLRGKECSINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTDY
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 QVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPNVCYTACATLKGPDSHY
:::::::. ... .::::::::::::.:.:::::::::.:.:::: ::::::::::::::
XP_005 QVNIQIIHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPDSHY
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480
pF1KB8 GTKGLKKVVHETPAA-SKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT
:::::.::.::.:.. .:: : : . :::::::.:::::::.::::
XP_005 GTKGLRKVTHESPTTGAKTCFTFCYAAGNNNGTSVEDGQIPEVIFYT
340 350 360 370
>>XP_016883218 (OMIM: 615566) PREDICTED: BTB/POZ domain- (461 aa)
initn: 1228 init1: 814 opt: 1244 Z-score: 947.8 bits: 184.7 E(85289): 4.7e-46
Smith-Waterman score: 1244; 44.6% identity (73.6% similar) in 444 aa overlap (44-481:34-460)
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pF1KB8 SGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRF
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NP_852 CGSAEYSAKIEL----KRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEYPVQIEPDTFYTASVI
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pF1KB8 LKGPD-SHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT
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NP_852 LDGNELSYFGQEGMTEV-----QCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
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482 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 13:30:42 2016 done: Fri Nov 4 13:30:44 2016
Total Scan time: 9.270 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]