Result of FASTA (ccds) for pF1KB8398
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8398, 628 aa
  1>>>pF1KB8398 628 - 628 aa - 628 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9338+/- 0.001; mu= 2.9642+/- 0.059
 mean_var=270.7057+/-58.843, 0's: 0 Z-trim(112.3): 702  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.077952
 statistics sampled from 12301 (13105) to 12301 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.403), width:  16
 Scan time:  3.120

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1          ( 672) 4245 491.4 1.7e-138
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12         ( 661) 1598 193.7 6.8e-49
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19        ( 688)  914 116.8   1e-25
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19        ( 752)  914 116.8 1.1e-25
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14         ( 713)  877 112.6 1.8e-24
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14         ( 729)  864 111.2 5.1e-24
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14         ( 744)  864 111.2 5.2e-24
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14         ( 753)  864 111.2 5.3e-24
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11         ( 719)  861 110.8 6.4e-24
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11         ( 788)  861 110.9 6.9e-24
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11         ( 709)  858 110.5   8e-24
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11          ( 724)  858 110.5 8.2e-24
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11         ( 745)  853 109.9 1.2e-23
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1          ( 780)  850 109.6 1.6e-23
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1          ( 795)  850 109.6 1.6e-23
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1          ( 796)  850 109.6 1.6e-23
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5          ( 559)  814 105.4 2.1e-22
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11         (1261)  820 106.5 2.3e-22
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11          (1321)  820 106.5 2.4e-22
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783)  803 104.3 6.3e-22
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21        ( 783)  803 104.3 6.3e-22
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11          ( 926)  790 102.9 1.9e-21
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1           ( 552)  784 102.0 2.2e-21
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19        ( 778)  745 97.8 5.7e-20
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11         ( 668)  736 96.7   1e-19
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11         ( 674)  736 96.7   1e-19
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11         ( 736)  736 96.8 1.1e-19
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11         ( 766)  706 93.4 1.2e-18
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11         ( 614)  677 90.1 9.8e-18
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9           ( 610)  666 88.8 2.3e-17
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9            ( 651)  666 88.8 2.4e-17
CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1          ( 758)  654 87.6 6.8e-17
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5         ( 436)  649 86.8 6.8e-17
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3          ( 765)  638 85.8 2.4e-16
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9           ( 619)  605 82.0 2.7e-15
CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22        ( 358)  599 81.0 2.9e-15
CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5         ( 367)  592 80.3 5.1e-15
CCDS12116.1 DAPK3 gene_id:1613|Hs108|chr19         ( 454)  592 80.4   6e-15
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10        ( 357)  586 79.6 8.1e-15
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10        ( 385)  586 79.6 8.5e-15
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1          ( 465)  584 79.5 1.1e-14
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1          ( 479)  584 79.5 1.2e-14
CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9          (1430)  589 80.5 1.7e-14
CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5          ( 574)  580 79.1 1.8e-14
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3           ( 370)  575 78.4 1.9e-14
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21         ( 714)  580 79.2 2.1e-14
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19           ( 481)  571 78.0 3.2e-14
CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1           ( 268)  562 76.8 4.3e-14
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX         ( 426)  561 76.8 6.4e-14
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14            ( 480)  562 77.0 6.4e-14


>>CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1               (672 aa)
 initn: 4245 init1: 4245 opt: 4245  Z-score: 2600.0  bits: 491.4 E(32554): 1.7e-138
Smith-Waterman score: 4245; 100.0% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:45-672)

                                             10        20        30
pF1KB8                               MESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RPGAGPVPRASALPAQPTDSPAALAHLLLAMESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKS
           20        30        40        50        60        70    

               40        50        60        70        80        90
pF1KB8 PKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARESSGRLVAIKSIRKDKIKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARESSGRLVAIKSIRKDKIKD
           80        90       100       110       120       130    

              100       110       120       130       140       150
pF1KB8 EQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSER
          140       150       160       170       180       190    

              160       170       180       190       200       210
pF1KB8 EARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFC
          200       210       220       230       240       250    

              220       230       240       250       260       270
pF1KB8 GSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREP
          260       270       280       290       300       310    

              280       290       300       310       320       330
pF1KB8 PKPSDACGLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PKPSDACGLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARA
          320       330       340       350       360       370    

              340       350       360       370       380       390
pF1KB8 SMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSD
          380       390       400       410       420       430    

              400       410       420       430       440       450
pF1KB8 TADDTAHRPGKSNLKLPKGILKKKVSASAEGVQEDPPELSPIPASPGQAAPLLPKKGILK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TADDTAHRPGKSNLKLPKGILKKKVSASAEGVQEDPPELSPIPASPGQAAPLLPKKGILK
          440       450       460       470       480       490    

              460       470       480       490       500       510
pF1KB8 KPRQRESGYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQASGLLLHRKGILKLNGKFSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KPRQRESGYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQASGLLLHRKGILKLNGKFSQ
          500       510       520       530       540       550    

              520       530       540       550       560       570
pF1KB8 TALELAAPTTFGSLDELAPPRPLARASRPSGAVSEDSILSSESFDQLDLPERLPEPPLRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TALELAAPTTFGSLDELAPPRPLARASRPSGAVSEDSILSSESFDQLDLPERLPEPPLRG
          560       570       580       590       600       610    

              580       590       600       610       620        
pF1KB8 CVSVDNLTGLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSLTDCQEVTATYRQALRVCSKLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CVSVDNLTGLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSLTDCQEVTATYRQALRVCSKLT
          620       630       640       650       660       670  

>>CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12              (661 aa)
 initn: 2061 init1: 1389 opt: 1598  Z-score: 991.3  bits: 193.7 E(32554): 6.8e-49
Smith-Waterman score: 2149; 57.4% identity (75.2% similar) in 657 aa overlap (21-627:24-660)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB8    MESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLE
                              :  . :   . .:  : ..::::::::::.::::. :
CCDS31 MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEP-RKPHGVKRHHHKHNLKHRYELQE
               10        20        30         40        50         

        60        70         80        90       100       110      
pF1KB8 TLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIKSIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIH
       :::::::::::.: :  :::.::::::::::::::::..::::::::::::::::::.:.
CCDS31 TLGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHIISIY
      60        70        80        90       100       110         

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB8 EVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDL
       :::::..::::.:::::.:.::::::::..:::::.:::::::::::::::.: ::::::
CCDS31 EVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVVHRDL
     120       130       140       150       160       170         

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB8 KLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSL
       :::::::: : :::::::::::::.. ::::::::::::::::::::.:: :::::::.:
CCDS31 KLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGPEVDSWAL
     180       190       200       210       220       230         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB8 GVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREPPKPSDACGLIRWLLMVNPTRRATLED
       ::::: ::.::::::: ::: :..:::.: :::: .:::: :::::.::::: ::::.::
CCDS31 GVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPSDARGLIRWMLMVNPDRRATIED
     240       250       260       270       280       290         

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB8 VASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARASMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQ
       .:.:::::::: . : . .: :..  :      : . :: .::.    .. ::. .. : 
CCDS31 IANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESP----LLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKGLAK-
     300       310       320           330       340       350     

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB8 HAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSDTADDTAHRPGKSNLKLPKGILKKKVS
         :   ..   ::::.:::::.::::.::: .    : . . :.: . : :::::::. .
CCDS31 --P--TTSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQSGQ----DAVPESPSKLSSKRPKGILKKRSN
              360       370       380           390       400      

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CCDS31 SEHRSHSTGFIEGVVGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPE-AEVPGKLSPKQSATM-PK
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       :: ..:.:  ...  :..:   :. ::.: . : . :.:. ::::...:.::.:::.:::
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CCDS31 TDMDDVTQVYKQALEICSKLN
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CCDS12 PKRSPTSTGEAE-LKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAHNPNKAEIPERRKD
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CCDS12 STSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPRVPPASPSS-HSLAPP
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pF1KB8 SERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYH
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CCDS56 AELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPS
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CCDS56 MMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPRVPPASPSSHSLAPPSGERSRLARGST
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CCDS56 IRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLT
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CCDS56 RRVADEPERIGGPEVTSCHLPWDQTETAPRLLRFPWSVKLTSSRPPEALMAALRQATAAA
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CCDS55 QEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIK
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CCDS55 IIDKTQL-NPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYL
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pF1KB8 SERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYH
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CCDS55 VAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFT
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CCDS55 VGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRER
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pF1KB8 ISNGAYREPPKPSDAC-GLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPH-E
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CCDS55 VLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEE---DELKPFVE
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            ::. : ..   .  :.. . :. .:     . . .   .  .. . :. . ..: 
CCDS55 PELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSEVRPSSDLNNST
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pF1KB8 KKS---RKENDMAQSLHSDTADDTAHRPGKSNLKLPKGILKKKVSASAEGVQED--PPEL
        .:   . . ....: ..   .: :     : .  ::   ....:..   ..::    . 
CCDS55 GQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPK---RSQTSTADSDLKEDGISSRK
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       :   :  :.. ::  :  :  ..: . .      :: ..:. .  ....  .:  ...  
CCDS55 SSGSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKAD-----IPERKKSSTV-PSSNTASGGMTRRNTY
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         .      :..... ::: ..:  .  .:. .  :..  : :    :   : :..:...
CCDS55 VCSERTTADRHSVIQ-NGKENSTIPDQRTPVASTHSISSAATPD---RIRFPRGTASRST
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CCDS55 FHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKD
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                                     :..:.:.:::...::: ::.  .:: ::::
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        : : .. .  .:... ::..::. ::::.:. . ::.:. . . ..::::: :...::.
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         . ...:.:::  ::::::::.::::.:.:::::: ::.::::. ::::::::.:: . 
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>>CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14              (744 aa)
 initn: 773 init1: 741 opt: 864  Z-score: 544.5  bits: 111.2 E(32554): 5.2e-24
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CCDS45 IIDKTQL-NPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYL
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pF1KB8 SERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYH
         . ...:.:::  ::::::::.::::.:.:::::: ::.::::. ::::::::.:: . 
CCDS45 VAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFT
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>>CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14              (753 aa)
 initn: 773 init1: 741 opt: 864  Z-score: 544.5  bits: 111.2 E(32554): 5.3e-24
Smith-Waterman score: 864; 51.4% identity (78.2% similar) in 257 aa overlap (53-307:56-311)

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pF1KB8 SIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYI
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CCDS45 IIDKTQL-NPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYL
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         . ...:.:::  ::::::::.::::.:.:::::: ::.::::. ::::::::.:: . 
CCDS45 VAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFT
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pF1KB8 ISNGAYREPPKPSDAC-GLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEG
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CCDS45 VLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPEL
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>>CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11              (719 aa)
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             ::   :: .  .  .: . : . : ::  :.. .. ..   .  ..     :..
CCDS53    MSSARTPLPTLNERDTEQP-TLGHLDS-KPSSKSNMIRGRNSATSADEQPHIGNYRL
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pF1KB8 LETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIKSIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIA
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CCDS53 LKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQL-NSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVK
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pF1KB8 IHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHR
       . ::.:. . . .:::::: :...::.  . ...:.:::  ::::::::.::::. .:::
CCDS53 LFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHR
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CCDS53 DLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVW
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pF1KB8 SLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREPPKPSDAC-GLIRWLLMVNPTRRAT
       ::::.:: :: :..::::.. : : ...  : :: :   :  : .:.. .:..::..:.:
CCDS53 SLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGT
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pF1KB8 LEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPG-SDSARASMADWLRRSSRPLLEN--GAKV
       ::.. .  :.: :.     ..  :.    :  .:  :. .   .  . . . ..  : . 
CCDS53 LEQIMKDRWMNVGHED---DELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRY
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