Result of SIM4 for pF1KB8390

seq1 = pF1KB8390.tfa, 1194 bp
seq2 = pF1KB8390/gi568815596f_170615513.tfa (gi568815596f:170615513_170817401), 201889 bp

>pF1KB8390 1194
>gi568815596f:170615513_170817401 (Chr2)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-1194  (100747-101889)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCGGTGGCCGTCCTCCGGAACGACTCGCTGCAGGCCTTTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCGGTGGCCGTCCTCCGGAACGACTCGCTGCAGGCCTTTCTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         GACCGCACCCCCAGCGCCTCCCCGGACCTGGGCAAGCACT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTC...CAGGACCGCACCCCCAGCGCCTCCCCGGACCTGGGCAAGCACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGCCCCTGGCATTGCTGGCCGCCACCTGTAGCCGCATCGGCCAGCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100787 CGCCCCTGGCATTGCTGGCCGCCACCTGTAGCCGCATCGGCCAGCCGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGGCGGCGCCCCCGGACTTCCTGCAGGTGCCCTACGACCCCGCGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100837 GCGGCGGCGCCCCCGGACTTCCTGCAGGTGCCCTACGACCCCGCGCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCACCCTCCAGGCTCTTCCACCCGTGGACCGCCGACATGCCGGCGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100887 CTCACCCTCCAGGCTCTTCCACCCGTGGACCGCCGACATGCCGGCGCACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGCCAGGCGCACTGCCGCCCCCGCATCCCAGCTTGGGGCTGACGCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100937 CGCCAGGCGCACTGCCGCCCCCGCATCCCAGCTTGGGGCTGACGCCGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGACGCACCTGCAGCCGTCCTTCGGGGCTGCGCACGAGCTTCCCCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100987 AAGACGCACCTGCAGCCGTCCTTCGGGGCTGCGCACGAGCTTCCCCTTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ACCCCCCGCCGACCCCTCGTACCCCTACGAGTTCTCGCCGGTCAAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101037 ACCCCCCGCCGACCCCTCGTACCCCTACGAGTTCTCGCCGGTCAAGATGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGCCCTCGAGCATGGCGGCTCTGCCCGCCAGCTGCGCGCCCGCCTACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101087 TGCCCTCGAGCATGGCGGCTCTGCCCGCCAGCTGCGCGCCCGCCTACGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCCTACGCGGCGCAGGCCGCGCTGCCGCCAGGCTACTCCAACCTGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101137 CCCTACGCGGCGCAGGCCGCGCTGCCGCCAGGCTACTCCAACCTGCTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TCCGCCGCCGCCACCGCCCCCGCCGCCCACCTGCCGCCAGTTGTCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101187 TCCGCCGCCGCCACCGCCCCCGCCGCCCACCTGCCGCCAGTTGTCACCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACCCGGCCCCCGACGACCTCCCGTGGTGGAGCATCCCGCAGGCGGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101237 ACCCGGCCCCCGACGACCTCCCGTGGTGGAGCATCCCGCAGGCGGGCGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGGCCGGGGGCCTCCGGGGTTCCGGGAAGCGGCCTCTCCGGCGCCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101287 GGGCCGGGGGCCTCCGGGGTTCCGGGAAGCGGCCTCTCCGGCGCCTGTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CGGGGCCCCCCACGCGCCCCGCTTCCCCGCCTCTGCGGCCGCTGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101337 CGGGGCCCCCCACGCGCCCCGCTTCCCCGCCTCTGCGGCCGCTGCTGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CGGCCGCCGCCGCCCTACAAAGAGGCCTGGTGTTGGGCCCGTCGGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101387 CGGCCGCCGCCGCCCTACAAAGAGGCCTGGTGTTGGGCCCGTCGGACTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCGCAGTACCAGAGCCAGATCGCCGCGCTGCTGCAGACCAAGGCCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101437 GCGCAGTACCAGAGCCAGATCGCCGCGCTGCTGCAGACCAAGGCCCCCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGCGGCCACGGCCAGGAGGTGCCGCCGCTGCCGCTGTCCCAACTGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101487 GGCGGCCACGGCCAGGAGGTGCCGCCGCTGCCGCTGTCCCAACTGCCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CGGCGGGCGGCGCCCCCGAGGCGGAGCCGGGGAAGAAGAAGCAGCACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101537 CGGCGGGCGGCGCCCCCGAGGCGGAGCCGGGGAAGAAGAAGCAGCACGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TGCCACGTGCCGGGCTGCGGCAAGGTGTACGGGAAGACGTCGCACCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101587 TGCCACGTGCCGGGCTGCGGCAAGGTGTACGGGAAGACGTCGCACCTGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GGCGCACCTGCGCTGGCACACGGGCGAGCGACCCTTCGTGTGCAACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101637 GGCGCACCTGCGCTGGCACACGGGCGAGCGACCCTTCGTGTGCAACTGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TCTTCTGCGGGAAGAGCTTCACGCGCTCGGACGAGCTGCAGCGGCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101687 TCTTCTGCGGGAAGAGCTTCACGCGCTCGGACGAGCTGCAGCGGCACCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CGGACTCACACGGGCGAGAAGCGCTTTGCCTGTCCCGAGTGCGGCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101737 CGGACTCACACGGGCGAGAAGCGCTTTGCCTGTCCCGAGTGCGGCAAGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CTTCATGCGCAGCGACCACCTCGCGAAGCACGTCAAGACTCACCAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101787 CTTCATGCGCAGCGACCACCTCGCGAAGCACGTCAAGACTCACCAGAATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 AGAAGCTCAAAGTCGCTGAGGCCGGGGTTAAGCGGGAGGACGCGCGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101837 AGAAGCTCAAAGTCGCTGAGGCCGGGGTTAAGCGGGAGGACGCGCGGGAC

   1200 
   1192 CTG
        |||
 101887 CTG

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