Result of SIM4 for pF1KB8342

seq1 = pF1KB8342.tfa, 1044 bp
seq2 = pF1KB8342/gi568815595f_129428734.tfa (gi568815595f:129428734_129633715), 204982 bp

>pF1KB8342 1044
>gi568815595f:129428734_129633715 (Chr3)

1-361  (100001-100361)   100% ->
362-530  (102143-102311)   100% ->
531-696  (103518-103683)   100% ->
697-936  (103800-104039)   100% ->
937-1044  (104875-104982)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATGGCACAGAAGGCCCTAACTTCTACGTGCCCTTCTCCAATGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATGGCACAGAAGGCCCTAACTTCTACGTGCCCTTCTCCAATGCGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGTGTGGTACGCAGCCCCTTCGAGTACCCACAGTACTACCTGGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGTGTGGTACGCAGCCCCTTCGAGTACCCACAGTACTACCTGGCTGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATGGCAGTTCTCCATGCTGGCCGCCTACATGTTTCTGCTGATCGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CATGGCAGTTCTCCATGCTGGCCGCCTACATGTTTCTGCTGATCGTGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCTTCCCCATCAACTTCCTCACGCTCTACGTCACCGTCCAGCACAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCTTCCCCATCAACTTCCTCACGCTCTACGTCACCGTCCAGCACAAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGCGCACGCCTCTCAACTACATCCTGCTCAACCTAGCCGTGGCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGCGCACGCCTCTCAACTACATCCTGCTCAACCTAGCCGTGGCTGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTTCATGGTCCTAGGTGGCTTCACCAGCACCCTCTACACCTCTCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTTCATGGTCCTAGGTGGCTTCACCAGCACCCTCTACACCTCTCTGCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGATACTTCGTCTTCGGGCCCACAGGATGCAATTTGGAGGGCTTCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGATACTTCGTCTTCGGGCCCACAGGATGCAATTTGGAGGGCTTCTTTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACCCTGGGCG         GTGAAATTGCCCTGTGGTCCTTGGTGGTCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACCCTGGGCGGTA...CAGGTGAAATTGCCCTGTGGTCCTTGGTGGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGCCATCGAGCGGTACGTGGTGGTGTGTAAGCCCATGAGCAACTTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102173 TGGCCATCGAGCGGTACGTGGTGGTGTGTAAGCCCATGAGCAACTTCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTCGGGGAGAACCATGCCATCATGGGCGTTGCCTTCACCTGGGTCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102223 TTCGGGGAGAACCATGCCATCATGGGCGTTGCCTTCACCTGGGTCATGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCTGGCCTGCGCCGCACCCCCACTCGCCGGCTGGTCCAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102273 GCTGGCCTGCGCCGCACCCCCACTCGCCGGCTGGTCCAGGTA...CAGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACATCCCCGAGGGCCTGCAGTGCTCGTGTGGAATCGACTACTACACGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103520 ACATCCCCGAGGGCCTGCAGTGCTCGTGTGGAATCGACTACTACACGCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAGCCGGAGGTCAACAACGAGTCTTTTGTCATCTACATGTTCGTGGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103570 AAGCCGGAGGTCAACAACGAGTCTTTTGTCATCTACATGTTCGTGGTCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CTTCACCATCCCCATGATTATCATCTTTTTCTGCTATGGGCAGCTCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103620 CTTCACCATCCCCATGATTATCATCTTTTTCTGCTATGGGCAGCTCGTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCACCGTCAAGGAG         GCCGCTGCCCAGCAGCAGGAGTCAGCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103670 TCACCGTCAAGGAGGTA...CAGGCCGCTGCCCAGCAGCAGGAGTCAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACCACACAGAAGGCAGAGAAGGAGGTCACCCGCATGGTCATCATCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103827 ACCACACAGAAGGCAGAGAAGGAGGTCACCCGCATGGTCATCATCATGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CATCGCTTTCCTGATCTGCTGGGTGCCCTACGCCAGCGTGGCATTCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103877 CATCGCTTTCCTGATCTGCTGGGTGCCCTACGCCAGCGTGGCATTCTACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TCTTCACCCACCAGGGCTCCAACTTCGGTCCCATCTTCATGACCATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103927 TCTTCACCCACCAGGGCTCCAACTTCGGTCCCATCTTCATGACCATCCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GCGTTCTTTGCCAAGAGCGCCGCCATCTACAACCCTGTCATCTATATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103977 GCGTTCTTTGCCAAGAGCGCCGCCATCTACAACCCTGTCATCTATATCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GATGAACAAGCAG         TTCCGGAACTGCATGCTCACCACCATCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104027 GATGAACAAGCAGGTG...CAGTTCCGGAACTGCATGCTCACCACCATCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GCTGCGGCAAGAACCCACTGGGTGACGATGAGGCCTCTGCTACCGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104903 GCTGCGGCAAGAACCCACTGGGTGACGATGAGGCCTCTGCTACCGTGTCC

   1050     .    :    .    :    .    :
   1015 AAGACGGAGACGAGCCAGGTGGCCCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 104953 AAGACGGAGACGAGCCAGGTGGCCCCGGCC

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