Result of SIM4 for pF1KB8339

seq1 = pF1KB8339.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KB8339/gi568815597r_160939923.tfa (gi568815597r:160939923_161142883), 202961 bp

>pF1KB8339 930
>gi568815597r:160939923_161142883 (Chr1)

(complement)

1-58  (99994-100051)   93% ->
59-174  (100214-100329)   100% ->
175-276  (100667-100768)   100% ->
277-472  (101038-101233)   100% ->
473-560  (101473-101560)   100% ->
561-619  (102012-102070)   100% ->
620-714  (102214-102308)   100% ->
715-843  (102554-102682)   100% ->
844-930  (102875-102961)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGGGCAGCAGAAAACAGCTGAAACGGAAGAGGGGACAGTGCAGAT
        |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99994 ACAAACAGGCAGCAGAAAACAGCTGAAACGGAAGAGGGGACAGTGCAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCAGGAAG         GTGCAGTGGCTACTGGGGAAGACCCAACCAGTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100044 TCAGGAAGGTG...CAGGTGCAGTGGCTACTGGGGAAGACCCAACCAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGCTATTGCCAGCATCCAGTCAGCTGCCACCTTCCCTGACCCCAACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100247 TGGCTATTGCCAGCATCCAGTCAGCTGCCACCTTCCCTGACCCCAACGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGTACGTCTTCCGAACTGAGAATGGGGGCCAG         GTGATGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100297 AAGTACGTCTTCCGAACTGAGAATGGGGGCCAGGTA...TAGGTGATGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAGGGTGATCCAGGTGTCTGAGGGGCAGCTGGATGGCCAAACTGAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100675 CAGGGTGATCCAGGTGTCTGAGGGGCAGCTGGATGGCCAAACTGAGGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGGCGCCATCAGTGGCTACCCTGCCACTCAATCCATGACCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100725 CTGGCGCCATCAGTGGCTACCCTGCCACTCAATCCATGACCCAGGTA...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    277    GCGGTGATCCAGGGTGCTTTCACCAGTGATGATGCAGTTGACACGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101035 CAGGCGGTGATCCAGGGTGCTTTCACCAGTGATGATGCAGTTGACACGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGGGACAGCTGCTGAGACGCACTATACTTACTTCCCCAGCACGGCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101085 GGGGACAGCTGCTGAGACGCACTATACTTACTTCCCCAGCACGGCAGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAGATGGGGCAGGGGGTACCACATCGGGGAGTACAGCTGCTGTTGTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101135 GAGATGGGGCAGGGGGTACCACATCGGGGAGTACAGCTGCTGTTGTTACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACCCAGGGCTCAGAGGCACTGCTGGGGCAGGCGACCCCTCCTGGCACTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101185 ACCCAGGGCTCAGAGGCACTGCTGGGGCAGGCGACCCCTCCTGGCACTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    473         GTCAATTCTTTGTGATGATGTCACCACAAGAAGTACTGCAGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101235 TG...CAGGTCAATTCTTTGTGATGATGTCACCACAAGAAGTACTGCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GAGGAAGCCAGCGCTCAATTGCCCCTAGGACTCACCCTTATTCCCC    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 101515 GAGGAAGCCAGCGCTCAATTGCCCCTAGGACTCACCCTTATTCCCCGTG.

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    561      GAAGTCAGAAGCTCCCCGGACGACTCGGGATGAGAAACGCAGGGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101565 ..CAGGAAGTCAGAAGCTCCCCGGACGACTCGGGATGAGAAACGCAGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCAGCATAATGAAG         TGGAGCGTCGCCGCCGAGACAAGATCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102057 TCAGCATAATGAAGGTA...CAGTGGAGCGTCGCCGCCGAGACAAGATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACAACTGGATCGTGCAGCTCTCCAAGATAATCCCAGACTGCTCTATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102241 ACAACTGGATCGTGCAGCTCTCCAAGATAATCCCAGACTGCTCTATGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AGCACCAAGTCTGGCCAG         AGTAAAGGTGGGATTCTATCCAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102291 AGCACCAAGTCTGGCCAGGTC...CAGAGTAAAGGTGGGATTCTATCCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGCTTGTGATTATATCCAGGAGCTTCGGCAGAGTAACCACCGCTTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102577 AGCTTGTGATTATATCCAGGAGCTTCGGCAGAGTAACCACCGCTTGTCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AAGAACTGCAGGGACTTGACCAACTGCAGCTGGACAATGACGTGCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102627 AAGAACTGCAGGGACTTGACCAACTGCAGCTGGACAATGACGTGCTTCGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CAACAG         GTGGAAGATCTTAAAAACAAGAATCTGCTGCTTCG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102677 CAACAGGTC...CAGGTGGAAGATCTTAAAAACAAGAATCTGCTGCTTCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGCTCAGTTGCGGCACCACGGATTAGAGGTCGTCATCAAGAATGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102910 AGCTCAGTTGCGGCACCACGGATTAGAGGTCGTCATCAAGAATGACAGCA

   1000 
    929 AC
        ||
 102960 AC

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