Result of FASTA (ccds) for pF1KB8310
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8310, 403 aa
  1>>>pF1KB8310 403 - 403 aa - 403 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1233+/-0.0011; mu= -1.3886+/- 0.064
 mean_var=253.5153+/-55.788, 0's: 0 Z-trim(110.5): 708  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.080551
 statistics sampled from 10864 (11676) to 10864 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.359), width:  16
 Scan time:  2.480

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13451.1 AURKA gene_id:6790|Hs108|chr20         ( 403) 2700 327.2 1.7e-89
CCDS67162.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17         ( 345) 1351 170.4 2.4e-42
CCDS58514.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17         ( 303) 1348 170.0 2.7e-42
CCDS11134.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17         ( 344) 1348 170.0   3e-42
CCDS33128.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19         ( 309) 1316 166.3 3.6e-41
CCDS46205.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19         ( 290) 1311 165.6 5.2e-41
CCDS46206.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19         ( 275) 1309 165.4 5.9e-41
CCDS82065.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17         ( 312) 1004 130.0   3e-30
CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4           ( 970)  663 90.8 5.9e-18
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3          ( 765)  593 82.6 1.4e-15
CCDS76779.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15         ( 470)  580 80.9 2.8e-15
CCDS45305.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15         ( 472)  580 80.9 2.8e-15
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11       ( 482)  576 80.4 3.9e-15
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11         ( 709)  579 80.9 4.1e-15
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11         ( 719)  579 80.9 4.1e-15
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11          ( 724)  579 80.9 4.1e-15
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11         ( 788)  579 81.0 4.4e-15
CCDS58411.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16         ( 454)  572 79.9 5.1e-15
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19        ( 688)  575 80.4 5.5e-15
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14         ( 713)  575 80.5 5.6e-15
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14         ( 729)  575 80.5 5.7e-15
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14         ( 744)  575 80.5 5.8e-15
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19        ( 752)  575 80.5 5.8e-15
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14         ( 753)  575 80.5 5.8e-15
CCDS10472.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16         ( 556)  572 80.0   6e-15
CCDS54804.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4          ( 929)  575 80.6 6.8e-15
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11         (1261)  569 80.0 1.4e-14
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11          (1321)  569 80.0 1.4e-14
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1          ( 780)  562 79.0 1.7e-14
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1          ( 795)  562 79.0 1.7e-14
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1          ( 796)  562 79.0 1.7e-14
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11          ( 926)  563 79.2 1.8e-14
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11         ( 745)  561 78.9 1.8e-14
CCDS10616.1 PLK1 gene_id:5347|Hs108|chr16          ( 603)  558 78.4   2e-14
CCDS72816.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1         ( 338)  551 77.4 2.2e-14
CCDS14125.1 PRKX gene_id:5613|Hs108|chrX           ( 358)  550 77.3 2.5e-14
CCDS72813.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1         ( 339)  549 77.2 2.6e-14
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX        ( 740)  556 78.3 2.7e-14
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1          ( 672)  555 78.1 2.7e-14
CCDS691.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1           ( 351)  549 77.2 2.7e-14
CCDS55610.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1         ( 355)  549 77.2 2.7e-14
CCDS72815.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1         ( 357)  549 77.2 2.7e-14
CCDS55609.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1         ( 358)  549 77.2 2.7e-14
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17       ( 451)  551 77.5 2.8e-14
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17       ( 472)  551 77.5 2.9e-14
CCDS693.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1           ( 398)  549 77.2   3e-14
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17       ( 525)  551 77.6 3.1e-14
CCDS6625.1 PRKACG gene_id:5568|Hs108|chr9          ( 351)  547 76.9 3.2e-14
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2           ( 737)  550 77.6 4.3e-14
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19           ( 481)  545 76.8 4.7e-14


>>CCDS13451.1 AURKA gene_id:6790|Hs108|chr20              (403 aa)
 initn: 2700 init1: 2700 opt: 2700  Z-score: 1720.2  bits: 327.2 E(32554): 1.7e-89
Smith-Waterman score: 2700; 99.8% identity (100.0% similar) in 403 aa overlap (1-403:1-403)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MDRSKENCISGPVKATAPVGGPKRVLVTQQFPCQNPLPVNSGQAQRVLCPSNSSQRVPLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS13 MDRSKENCISGPVKATAPVGGPKRVLVTQQFPCQNPLPVNSGQAQRVLCPSNSSQRIPLQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 AQKLVSSHKPVQNQKQKQLQATSVPHPVSRPLNNTQKSKQPLPSAPENNPEEELASKQKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AQKLVSSHKPVQNQKQKQLQATSVPHPVSRPLNNTQKSKQPLPSAPENNPEEELASKQKN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 EESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 EVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITEL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 ANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 IEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400   
pF1KB8 SRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSKPSNCQNKESASKQS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSKPSNCQNKESASKQS
              370       380       390       400   

>>CCDS67162.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17              (345 aa)
 initn: 1358 init1: 1331 opt: 1351  Z-score: 873.9  bits: 170.4 E(32554): 2.4e-42
Smith-Waterman score: 1353; 65.5% identity (81.8% similar) in 313 aa overlap (99-395:31-343)

       70        80        90       100            110       120   
pF1KB8 KPVQNQKQKQLQATSVPHPVSRPLNNTQKSKQPL-PSA----PENNPEEELASKQKNEES
                                     :.:. :::     ..: .   :  ::  :.
CCDS67 MAQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMEN
               10        20        30        40        50        60

                   130       140       150       160       170     
pF1KB8 K--------KRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVE
       .        .:.....::::::::::::::::::::::.:.::.:::::::.:.:: :::
CCDS67 SSGTPDILTRRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVE
               70        80        90       100       110       120

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB8 HQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTAT
       ::::::.:::.::.::::::::.::.:  :.:::::::: : .:.::::   ::::::::
CCDS67 HQLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTAT
              130       140       150       160       170       180

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB8 YITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDY
        . :::.:: :::.:.::::::::::::::  :::::::::::::::: :: :.::::::
CCDS67 IMEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDY
              190       200       210       220       230       240

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB8 LPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEG
       :::::::::::.:::::: .::::::.:::.::::. ...:::.:: .:.. ::  :  :
CCDS67 LPPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPMG
              250       260       270       280       290       300

         360       370       380          390       400   
pF1KB8 ARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSK---PSNCQNKESASKQS
       :.::::.::.::::.:  : .:  :::. ::: .   ::  :.        
CCDS67 AQDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA      
              310       320       330       340           

>>CCDS58514.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17              (303 aa)
 initn: 1358 init1: 1331 opt: 1348  Z-score: 872.7  bits: 170.0 E(32554): 2.7e-42
Smith-Waterman score: 1348; 71.4% identity (87.2% similar) in 273 aa overlap (126-395:29-301)

         100       110       120       130       140       150     
pF1KB8 QKSKQPLPSAPENNPEEELASKQKNEESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQS
                                     :.....::::::::::::::::::::::.:
CCDS58   MSRSNVQPTAAPGQKVMENSSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKS
                 10        20        30        40        50        

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB8 KFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPL
       .::.:::::::.:.:: :::::::::.:::.::.::::::::.::.:  :.:::::::: 
CCDS58 HFIVALKVLFKSQIEKEGVEHQLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPR
       60        70        80        90       100       110        

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB8 GTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADF
       : .:.::::   :::::::: . :::.:: :::.:.::::::::::::::  ::::::::
CCDS58 GELYKELQKSCTFDEQRTATIMEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADF
      120       130       140       150       160       170        

         280       290       300       310       320       330     
pF1KB8 GWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQ
       :::::::: :: :.:::::::::::::::::.:::::: .::::::.:::.::::. ...
CCDS58 GWSVHAPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHN
      180       190       200       210       220       230        

         340       350       360       370       380          390  
pF1KB8 ETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSK---PSN
       :::.:: .:.. ::  :  ::.::::.::.::::.:  : .:  :::. ::: .   :: 
CCDS58 ETYRRIVKVDLKFPASVPMGAQDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSA
      240       250       260       270       280       290        

            400   
pF1KB8 CQNKESASKQS
        :.        
CCDS58 LQSVA      
      300         

>>CCDS11134.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17              (344 aa)
 initn: 1358 init1: 1331 opt: 1348  Z-score: 872.0  bits: 170.0 E(32554): 3e-42
Smith-Waterman score: 1352; 65.7% identity (82.1% similar) in 312 aa overlap (99-395:31-342)

       70        80        90       100            110       120   
pF1KB8 KPVQNQKQKQLQATSVPHPVSRPLNNTQKSKQPL-PSA----PENNPEEELASKQKNEES
                                     :.:. :::     ..: .   :  ::  :.
CCDS11 MAQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMEN
               10        20        30        40        50        60

                  130       140       150       160       170      
pF1KB8 KK-------RQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEH
       ..       :.....::::::::::::::::::::::.:.::.:::::::.:.:: ::::
CCDS11 SSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVEH
               70        80        90       100       110       120

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB8 QLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATY
       :::::.:::.::.::::::::.::.:  :.:::::::: : .:.::::   :::::::: 
CCDS11 QLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATI
              130       140       150       160       170       180

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB8 ITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYL
       . :::.:: :::.:.::::::::::::::  :::::::::::::::: :: :.:::::::
CCDS11 MEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYL
              190       200       210       220       230       240

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB8 PPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGA
       ::::::::::.:::::: .::::::.:::.::::. ...:::.:: .:.. ::  :  ::
CCDS11 PPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPMGA
              250       260       270       280       290       300

        360       370       380          390       400   
pF1KB8 RDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSK---PSNCQNKESASKQS
       .::::.::.::::.:  : .:  :::. ::: .   ::  :.        
CCDS11 QDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA      
              310       320       330       340          

>>CCDS33128.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19              (309 aa)
 initn: 1300 init1: 1300 opt: 1316  Z-score: 852.5  bits: 166.3 E(32554): 3.6e-41
Smith-Waterman score: 1316; 68.1% identity (86.5% similar) in 282 aa overlap (112-389:18-299)

              90       100       110       120           130       
pF1KB8 TSVPHPVSRPLNNTQKSKQPLPSAPENNPEEELASKQKNEESKK----RQWALEDFEIGR
                                     ::::. ... .. .    :. ...::::::
CCDS33              MSSPRAVVQLGKAQPAGEELATANQTAQQPSSPAMRRLTVDDFEIGR
                            10        20        30        40       

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB8 PLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLY
       :::::::::::::: :.:.::.:::::::.:.:: :.:::::::.:::.::.::::::::
CCDS33 PLGKGKFGNVYLARLKESHFIVALKVLFKSQIEKEGLEHQLRREIEIQAHLQHPNILRLY
        50        60        70        80        90       100       

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB8 GYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDI
       .::::: :::::::::: : .:.::::  :.::::::: : :::.::.:::.:.::::::
CCDS33 NYFHDARRVYLILEYAPRGELYKELQKSEKLDEQRTATIIEELADALTYCHDKKVIHRDI
       110       120       130       140       150       160       

       260       270       280       290       300       310       
pF1KB8 KPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGV
       ::::::::  ::.::::::::::.:: :: :.::::::::::::::: .::::::: .::
CCDS33 KPENLLLGFRGEVKIADFGWSVHTPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRTYDEKVDLWCIGV
       170       180       190       200       210       220       

       320       330       340       350       360       370       
pF1KB8 LCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREV
       ::::.::: ::::. ...:::.:: .:.  ::  .  ::::::::::...: .:  : ..
CCDS33 LCYELLVGYPPFESASHSETYRRILKVDVRFPLSMPLGARDLISRLLRYQPLERLPLAQI
       230       240       250       260       270       280       

       380       390       400   
pF1KB8 LEHPWITANSSKPSNCQNKESASKQS
       :.:::. :.: .              
CCDS33 LKHPWVQAHSRRVLPPCAQMAS    
       290       300             

>>CCDS46205.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19              (290 aa)
 initn: 1300 init1: 1300 opt: 1311  Z-score: 849.8  bits: 165.6 E(32554): 5.2e-41
Smith-Waterman score: 1311; 69.0% identity (86.1% similar) in 274 aa overlap (116-389:7-280)

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB8 HPVSRPLNNTQKSKQPLPSAPENNPEEELASKQKNEESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFG
                                     . :.      :. ...::::::::::::::
CCDS46                         MATANQTAQQPSSPAMRRLTVDDFEIGRPLGKGKFG
                                       10        20        30      

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB8 NVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATR
       :::::: :.:.::.:::::::.:.:: :.:::::::.:::.::.::::::::.::::: :
CCDS46 NVYLARLKESHFIVALKVLFKSQIEKEGLEHQLRREIEIQAHLQHPNILRLYNYFHDARR
         40        50        60        70        80        90      

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB8 VYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLG
       ::::::::: : .:.::::  :.::::::: : :::.::.:::.:.::::::::::::::
CCDS46 VYLILEYAPRGELYKELQKSEKLDEQRTATIIEELADALTYCHDKKVIHRDIKPENLLLG
        100       110       120       130       140       150      

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB8 SAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVG
         ::.::::::::::.:: :: :.::::::::::::::: .::::::: .::::::.:::
CCDS46 FRGEVKIADFGWSVHTPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRTYDEKVDLWCIGVLCYELLVG
        160       170       180       190       200       210      

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB8 KPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITA
        ::::. ...:::.:: .:.  ::  .  ::::::::::...: .:  : ..:.:::. :
CCDS46 YPPFESASHSETYRRILKVDVRFPLSMPLGARDLISRLLRYQPLERLPLAQILKHPWVQA
        220       230       240       250       260       270      

         390       400   
pF1KB8 NSSKPSNCQNKESASKQS
       .: .              
CCDS46 HSRRVLPPCAQMAS    
        280       290    

>>CCDS46206.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19              (275 aa)
 initn: 1300 init1: 1300 opt: 1309  Z-score: 848.8  bits: 165.4 E(32554): 5.9e-41
Smith-Waterman score: 1309; 71.2% identity (88.3% similar) in 264 aa overlap (126-389:2-265)

         100       110       120       130       140       150     
pF1KB8 QKSKQPLPSAPENNPEEELASKQKNEESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQS
                                     :. ...:::::::::::::::::::: :.:
CCDS46                              MRRLTVDDFEIGRPLGKGKFGNVYLARLKES
                                            10        20        30 

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB8 KFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPL
       .::.:::::::.:.:: :.:::::::.:::.::.::::::::.::::: :::::::::: 
CCDS46 HFIVALKVLFKSQIEKEGLEHQLRREIEIQAHLQHPNILRLYNYFHDARRVYLILEYAPR
              40        50        60        70        80        90 

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB8 GTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADF
       : .:.::::  :.::::::: : :::.::.:::.:.::::::::::::::  ::.:::::
CCDS46 GELYKELQKSEKLDEQRTATIIEELADALTYCHDKKVIHRDIKPENLLLGFRGEVKIADF
             100       110       120       130       140       150 

         280       290       300       310       320       330     
pF1KB8 GWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQ
       :::::.:: :: :.::::::::::::::: .::::::: .::::::.::: ::::. ...
CCDS46 GWSVHTPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRTYDEKVDLWCIGVLCYELLVGYPPFESASHS
             160       170       180       190       200       210 

         340       350       360       370       380       390     
pF1KB8 ETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSKPSNCQN
       :::.:: .:.  ::  .  ::::::::::...: .:  : ..:.:::. :.: .      
CCDS46 ETYRRILKVDVRFPLSMPLGARDLISRLLRYQPLERLPLAQILKHPWVQAHSRRVLPPCA
             220       230       240       250       260       270 

         400   
pF1KB8 KESASKQS
               
CCDS46 QMAS    
               

>>CCDS82065.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17              (312 aa)
 initn: 1070 init1: 1000 opt: 1004  Z-score: 656.5  bits: 130.0 E(32554): 3e-30
Smith-Waterman score: 1019; 55.1% identity (69.9% similar) in 312 aa overlap (99-395:31-310)

       70        80        90       100            110       120   
pF1KB8 KPVQNQKQKQLQATSVPHPVSRPLNNTQKSKQPL-PSA----PENNPEEELASKQKNEES
                                     :.:. :::     ..: .   :  ::  :.
CCDS82 MAQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMEN
               10        20        30        40        50        60

                  130       140       150       160       170      
pF1KB8 KK-------RQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEH
       ..       :.....::::::::::                  ::  :.    : ..:  
CCDS82 SSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGK------------------ALLCLWP---EASSV--
               70        80                          90            

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB8 QLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATY
                :   ::::::::.::.:  :.:::::::: : .:.::::   :::::::: 
CCDS82 ---------SSPSHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATI
                100       110       120       130       140        

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB8 ITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYL
       . :::.:: :::.:.::::::::::::::  :::::::::::::::: :: :.:::::::
CCDS82 MEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYL
      150       160       170       180       190       200        

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB8 PPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGA
       ::::::::::.:::::: .::::::.:::.::::. ...:::.:: .:.. ::  :  ::
CCDS82 PPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPMGA
      210       220       230       240       250       260        

        360       370       380          390       400   
pF1KB8 RDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSK---PSNCQNKESASKQS
       .::::.::.::::.:  : .:  :::. ::: .   ::  :.        
CCDS82 QDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA      
      270       280       290       300       310        

>>CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4                (970 aa)
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                                     .:::..:  ::::.:..:: :.  .. . .
CCDS37                       MATCIGEKIEDFKVGNLLGKGSFAGVYRAESIHTGLEV
                                     10        20        30        

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pF1KB8 ALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVY
       :.:.. :  . :::. .... ::.:. .:.::.::.::.::.:.. :::.::.   : . 
CCDS37 AIKMIDKKAMYKAGMVQRVQNEVKIHCQLKHPSILELYNYFEDSNYVYLVLEMCHNGEMN
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pF1KB8 RELQ-KLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWS
       : :. ... :.:...  .. .. ... : ::. ..:::.   ::::    ..:::::: .
CCDS37 RYLKNRVKPFSENEARHFMHQIITGMLYLHSHGILHRDLTLSNLLLTRNMNIKIADFGLA
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       ..   :  .. ::::: .:. ::.     :  . :.:::: . : .:.:.:::...: ..
CCDS37 TQLKMPHEKHYTLCGTPNYISPEIATRSAHGLESDVWSLGCMFYTLLIGRPPFDTDTVKN
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       : ...  ... .:.:..  :.::: .::..::..:  :  ::.::... :::  :     
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>>CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3               (765 aa)
 initn: 511 init1: 226 opt: 593  Z-score: 393.3  bits: 82.6 E(32554): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 593; 35.6% identity (71.2% similar) in 267 aa overlap (133-395:16-281)

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pF1KB8 PSAPENNPEEELASKQKNEESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALK
                                     ... . ::.:.:. : :::.  .   .:.:
CCDS43                MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVK
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pF1KB8 VLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYREL
       :. :..:.  .. : : .::. .. ..::::.:::  .   :..::::: .  : ..  .
CCDS43 VIDKTKLDTLATGH-LFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYI
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       .:  . ..:. .  :......:.::::. .:.:::.::::...  . : .:..:::.: .
CCDS43 MKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNK
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pF1KB8 -APSSRRTTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEK-VDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETY
         :... :: ::.: :  ::.. :  .:   ::.:::::. . .. :.:::.  . .:: 
CCDS43 FQPGKKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETL
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CCDS43 TMIMDCKYTVPSHVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPL
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CCDS43 VSYKNLSEEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKE
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403 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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