Result of FASTA (ccds) for pF1KB7745
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7745, 437 aa
  1>>>pF1KB7745 437 - 437 aa - 437 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5926+/-0.000907; mu= -4.4952+/- 0.055
 mean_var=290.4599+/-58.010, 0's: 0 Z-trim(116.2): 16  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.075254
 statistics sampled from 16743 (16757) to 16743 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.808), E-opt: 0.2 (0.515), width:  16
 Scan time:  3.440

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS236.1 E2F2 gene_id:1870|Hs108|chr1             ( 437) 2954 333.5 2.4e-91
CCDS4545.1 E2F3 gene_id:1871|Hs108|chr6            ( 465)  961 117.2 3.5e-26
CCDS58999.1 E2F3 gene_id:1871|Hs108|chr6           ( 334)  914 112.0 9.3e-25
CCDS13224.1 E2F1 gene_id:1869|Hs108|chr20          ( 437)  908 111.4 1.8e-24
CCDS62859.1 E2F6 gene_id:1876|Hs108|chr2           ( 249)  619 79.9 3.2e-15
CCDS1680.2 E2F6 gene_id:1876|Hs108|chr2            ( 281)  619 79.9 3.5e-15
CCDS62858.1 E2F6 gene_id:1876|Hs108|chr2           ( 206)  566 74.1 1.5e-13
CCDS32464.1 E2F4 gene_id:1874|Hs108|chr16          ( 413)  563 73.9 3.2e-13
CCDS47885.1 E2F5 gene_id:1875|Hs108|chr8           ( 346)  518 69.0 8.3e-12
CCDS47886.1 E2F5 gene_id:1875|Hs108|chr8           ( 345)  517 68.9   9e-12


>>CCDS236.1 E2F2 gene_id:1870|Hs108|chr1                  (437 aa)
 initn: 2954 init1: 2954 opt: 2954  Z-score: 1753.3  bits: 333.5 E(32554): 2.4e-91
Smith-Waterman score: 2954; 100.0% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-437)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MLQGPRALASAAGQTPKVVPAMSPTELWPSGLSSPQLCPATATYYTPLYPQTAPPAAAPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MLQGPRALASAAGQTPKVVPAMSPTELWPSGLSSPQLCPATATYYTPLYPQTAPPAAAPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 TCLDATPHGPEGQVVRCLPAGRLPAKRKLDLEGIGRPVVPEFPTPKGKCIRVDGLPSPKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 TCLDATPHGPEGQVVRCLPAGRLPAKRKLDLEGIGRPVVPEFPTPKGKCIRVDGLPSPKT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 PKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSESEDGVLDLNWAAEVLDVQKRRIYDITNVLEGIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSESEDGVLDLNWAAEVLDVQKRRIYDITNVLEGIQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LIRKKAKNNIQWVGRGMFEDPTRPGKQQQLGQELKELMNTEQALDQLIQSCSLSFKHLTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 LIRKKAKNNIQWVGRGMFEDPTRPGKQQQLGQELKELMNTEQALDQLIQSCSLSFKHLTE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 DKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQTVIAVKAPPQTRLEVPDRTEDNLQIYLKSTQGPIEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 DKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQTVIAVKAPPQTRLEVPDRTEDNLQIYLKSTQGPIEV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 YLCPEEVQEPDSPSEEPLPSTSTLCPSPDSAQPSSSTDPSIMEPTASSVPAPAPTPQQAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 YLCPEEVQEPDSPSEEPLPSTSTLCPSPDSAQPSSSTDPSIMEPTASSVPAPAPTPQQAP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 PPPSLVPLEATDSLLELPHPLLQQTEDQFLSPTLACSSPLISFSPSLDQDDYLWGLEAGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PPPSLVPLEATDSLLELPHPLLQQTEDQFLSPTLACSSPLISFSPSLDQDDYLWGLEAGE
              370       380       390       400       410       420

              430       
pF1KB7 GISDLFDSYDLGDLLIN
       :::::::::::::::::
CCDS23 GISDLFDSYDLGDLLIN
              430       

>>CCDS4545.1 E2F3 gene_id:1871|Hs108|chr6                 (465 aa)
 initn: 994 init1: 746 opt: 961  Z-score: 583.5  bits: 117.2 E(32554): 3.5e-26
Smith-Waterman score: 1084; 49.0% identity (67.3% similar) in 449 aa overlap (1-434:38-456)

                                              10        20         
pF1KB7                               MLQGPR-ALASAAGQTPKVVPAMSPTELWP
                                     .: .:  : :.::. .: .   .  :.   
CCDS45 ALEQYLVTAGGGEGAAVVAAAAAASMDKRALLASPGFAAAAAAAAAPGAYIQILTTNTST
        10        20        30        40        50        60       

      30        40        50         60        70          80      
pF1KB7 SGLSSPQLCPATATYYTPLYPQTAPPAA-APGTCLDATPHGPEGQ--VVRCLPA-GRL--
       .. ::     :.:.   :: : .:: :  . :. : .::::: ..  ...  :: ::   
CCDS45 TSCSSSLQSGAVAA--GPLLP-SAPGAEQTAGSLLYTTPHGPSSRAGLLQQPPALGRGGS
        70        80           90       100       110       120    

                  90       100        110        120       130     
pF1KB7 ------PAKRKLDLEGIGRPVVPE-FPTPKGKCIRVDGLP-SPKTPKSPGEKTRYDTSLG
             ::::.:.:   :.  . . . :::::   .   : ::::::::.::::::::::
CCDS45 GGGGGPPAKRRLELGESGHQYLSDGLKTPKGKGRAALRSPDSPKTPKSPSEKTRYDTSLG
          130       140       150       160       170       180    

         140       150       160       170       180       190     
pF1KB7 LLTKKFIYLLSESEDGVLDLNWAAEVLDVQKRRIYDITNVLEGIQLIRKKAKNNIQWVGR
       ::::::: :::.: ::::::: ::::: ::::::::::::::::.::.::.:::.::.: 
CCDS45 LLTKKFIQLLSQSPDGVLDLNKAAEVLKVQKRRIYDITNVLEGIHLIKKKSKNNVQWMGC
          190       200       210       220       230       240    

         200       210       220       230       240       250     
pF1KB7 GMFEDPTRPGKQQQLGQELKELMNTEQALDQLIQSCSLSFKHLTEDKANKRLAYVTYQDI
       .. ::    .. : :..:. :: . :. ::.:::::.:..: ::::. :.::::::::::
CCDS45 SLSEDGGMLAQCQGLSKEVTELSQEEKKLDELIQSCTLDLKLLTEDSENQRLAYVTYQDI
          250       260       270       280       290       300    

         260       270       280       290       300       310     
pF1KB7 RAVGNFKEQTVIAVKAPPQTRLEVPDRTEDNLQIYLKSTQGPIEVYLCPEEVQEPDSPSE
       : ....:.::::.:::::.:::::::  : .:::.: ::::::::::::::. :  :: .
CCDS45 RKISGLKDQTVIVVKAPPETRLEVPDSIE-SLQIHLASTQGPIEVYLCPEET-ETHSPMK
          310       320       330        340       350        360  

         320       330       340       350       360       370     
pF1KB7 EPLPSTSTLCPSPDSAQPSSSTDPSIMEPTASSVPAPAPTPQQAPPPPSLVPLEATDSLL
           . .   :.: : . .:...      .  ::              .: :: .     
CCDS45 TNNQDHNGNIPKPASKDLASTNSGH----SDCSVSMG-----------NLSPLAS-----
            370       380           390                  400       

         380       390       400       410       420       430     
pF1KB7 ELPHPLLQQTEDQFLSPTLACSSPLISFSPSLDQDDYLWGLEAGEGISDLFDSYDLGDLL
         :  ::::::::.  :.    .:.... : : :.::: .:   ::::::::.:::  : 
CCDS45 --PANLLQQTEDQI--PS-NLEGPFVNLLPPLLQEDYLLSLGEEEGISDLFDAYDLEKLP
              410          420       430       440       450       

               
pF1KB7 IN      
               
CCDS45 LVEDFMCS
       460     

>>CCDS58999.1 E2F3 gene_id:1871|Hs108|chr6                (334 aa)
 initn: 903 init1: 711 opt: 914  Z-score: 558.0  bits: 112.0 E(32554): 9.3e-25
Smith-Waterman score: 984; 52.4% identity (70.4% similar) in 351 aa overlap (85-434:7-325)

           60        70        80        90       100        110   
pF1KB7 PAAAPGTCLDATPHGPEGQVVRCLPAGRLPAKRKLDLEGIGRPVVPE-FPTPKGKCIRVD
                                     :::.:.:   :.  . . . :::::     
CCDS58                         MPLQQQAKRRLELGESGHQYLSDGLKTPKGK-----
                                       10        20        30      

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB7 GLPSPKTPKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSESEDGVLDLNWAAEVLDVQKRRIYDIT
       :  . ..: :: .:::::::::::::::: :::.: ::::::: ::::: ::::::::::
CCDS58 GRAALRSPDSPKKKTRYDTSLGLLTKKFIQLLSQSPDGVLDLNKAAEVLKVQKRRIYDIT
              40        50        60        70        80        90 

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB7 NVLEGIQLIRKKAKNNIQWVGRGMFEDPTRPGKQQQLGQELKELMNTEQALDQLIQSCSL
       ::::::.::.::.:::.::.: .. ::    .. : :..:. :: . :. ::.:::::.:
CCDS58 NVLEGIHLIKKKSKNNVQWMGCSLSEDGGMLAQCQGLSKEVTELSQEEKKLDELIQSCTL
             100       110       120       130       140       150 

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB7 SFKHLTEDKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQTVIAVKAPPQTRLEVPDRTEDNLQIYLKS
       ..: ::::. :.::::::::::: ....:.::::.:::::.:::::::  : .:::.: :
CCDS58 DLKLLTEDSENQRLAYVTYQDIRKISGLKDQTVIVVKAPPETRLEVPDSIE-SLQIHLAS
             160       170       180       190       200        210

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB7 TQGPIEVYLCPEEVQEPDSPSEEPLPSTSTLCPSPDSAQPSSSTDPSIMEPTASSVPAPA
       :::::::::::::. :  :: .    . .   :.: : . .:...      .  ::    
CCDS58 TQGPIEVYLCPEET-ETHSPMKTNNQDHNGNIPKPASKDLASTNSGH----SDCSVSMG-
              220        230       240       250           260     

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB7 PTPQQAPPPPSLVPLEATDSLLELPHPLLQQTEDQFLSPTLACSSPLISFSPSLDQDDYL
                 .: :: .       :  ::::::::.  :.    .:.... : : :.:::
CCDS58 ----------NLSPLAS-------PANLLQQTEDQI--PS-NLEGPFVNLLPPLLQEDYL
                    270              280          290       300    

           420       430             
pF1KB7 WGLEAGEGISDLFDSYDLGDLLIN      
        .:   ::::::::.:::  :         
CCDS58 LSLGEEEGISDLFDAYDLEKLPLVEDFMCS
          310       320       330    

>>CCDS13224.1 E2F1 gene_id:1869|Hs108|chr20               (437 aa)
 initn: 819 init1: 379 opt: 908  Z-score: 552.8  bits: 111.4 E(32554): 1.8e-24
Smith-Waterman score: 936; 44.1% identity (62.4% similar) in 458 aa overlap (7-434:2-432)

               10        20        30            40        50      
pF1KB7 MLQGPRALASAAGQTPKVVPAMSPTELWPSG----LSSPQLCPATATYYTPLYPQ-TAPP
             :::.: .  :  .::.    :  .:    :.: :.   .:.  .   :  :.: 
CCDS13      MALAGAPAGGP-CAPALE--ALLGAGALRLLDSSQIVIISAAQDASAPPAPTGPA
                    10           20        30        40        50  

          60             70        80         90       100         
pF1KB7 AAAPGTC-----LDATPHGPEGQVVRCLPA-GRLPAKRKLDLEGIGRPVVPEFPTPKGKC
       : : : :     : :::..:.       :: :: :.::.::::   .  . :   :    
CCDS13 APAAGPCDPDLLLFATPQAPRPTPSAPRPALGRPPVKRRLDLE-TDHQYLAESSGPA---
             60        70        80        90        100           

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB7 IRVDGLPSPKTPKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSESEDGVLDLNWAAEVLDVQKRRI
        :  :    :  ::::::.::.:::.: ::.:. :::.: :::.::::::::: ::::::
CCDS13 -RGRGRHPGKGVKSPGEKSRYETSLNLTTKRFLELLSHSADGVVDLNWAAEVLKVQKRRI
       110       120       130       140       150       160       

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB7 YDITNVLEGIQLIRKKAKNNIQWVGRGMFEDPTRPGKQQQLGQELKELMNTEQALDQLIQ
       ::::::::::::: ::.::.:::.:          :. . : :.:..:...:: ::.:..
CCDS13 YDITNVLEGIQLIAKKSKNHIQWLGS--HTTVGVGGRLEGLTQDLRQLQESEQQLDHLMN
       170       180       190         200       210       220     

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB7 SCSLSFKHLTEDKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQTVIAVKAPPQTRLEVPDRTEDNLQI
        :. ... :.::  ..:::::: ::.:....  :: :...::::.:.:.. : .: :.::
CCDS13 ICTTQLRLLSEDTDSQRLAYVTCQDLRSIADPAEQMVMVIKAPPETQLQAVDSSE-NFQI
         230       240       250       260       270       280     

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pF1KB7 YLKSTQGPIEVYLCPEEV-----------QEPDSPSEEPLPSTSTLCPSPDSAQPSS-ST
        ::: ::::.:.:::::.           ::  :  :.   ...:.   : :. ::: .:
CCDS13 SLKSKQGPIDVFLCPEETVGGISPGKTPSQEVTSEEENRATDSATIVSPPPSSPPSSLTT
          290       300       310       320       330       340    

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pF1KB7 DPSI------MEPTASSVPA-PAPTPQQAPPPPSLVPLEATDSLLELPHPLLQQTEDQFL
       :::       .::  : . .  ::. ..      : :: :.:::::      .  ::  .
CCDS13 DPSQSLLSLEQEPLLSRMGSLRAPVDED-----RLSPLVAADSLLE------HVRED--F
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pF1KB7 SPTLACSSPLISFSPSLDQDDYLWGLEAGEGISDLFDSYDLGDLLIN  
       :  :     .::.::  .  :: .::: :::: ::::  :.:::     
CCDS13 SGLLP--EEFISLSPPHEALDYHFGLEEGEGIRDLFDC-DFGDLTPLDF
               400       410       420        430       

>>CCDS62859.1 E2F6 gene_id:1876|Hs108|chr2                (249 aa)
 initn: 584 init1: 344 opt: 619  Z-score: 386.7  bits: 79.9 E(32554): 3.2e-15
Smith-Waterman score: 619; 45.0% identity (74.3% similar) in 218 aa overlap (126-343:28-242)

         100       110       120       130       140       150     
pF1KB7 RPVVPEFPTPKGKCIRVDGLPSPKTPKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSESEDGVLDL
                                     .. :.:.::  ::.::. :.  .  :.:::
CCDS62    MNPSPSKIRINLEDNVQYVSMRKALKVKRPRFDVSLVYLTRKFMDLVRSAPGGILDL
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pF1KB7 NWAAEVLDVQKRRIYDITNVLEGIQLIRKKAKNNIQWVGRGMFEDPTRPGKQQQLGQELK
       : .:  : :.:::.:::::::.::.:..::.::.:.:.:  . .  . : .:..: .::.
CCDS62 NKVATKLGVRKRRVYDITNVLDGIDLVEKKSKNHIRWIGSDLSNFGAVP-QQKKLQEELS
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pF1KB7 ELMNTEQALDQLIQSCSLSFKHLTEDKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQTVIAVKAPPQT
       .:   :.:::.::..:. .. .::.:: :.::::::::::...  :.:: ::::::: .:
CCDS62 DLSAMEDALDELIKDCAQQLFELTDDKENERLAYVTYQDIHSIQAFHEQIVIAVKAPAET
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pF1KB7 RLEVPDRTEDNLQIYLKSTQGPIEVYLCPEEVQEPDSPSEEPLPSTSTLCPSPDSAQPSS
       ::.::   ::.. ....::.:::.::::  :  . ..   : . ..:.    :..  :  
CCDS62 RLDVPAPREDSITVHIRSTNGPIDVYLCEVEQGQTSNKRSEGVGTSSSESTHPEG--PEE
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pF1KB7 STDPSIMEPTASSVPAPAPTPQQAPPPPSLVPLEATDSLLELPHPLLQQTEDQFLSPTLA
         .:.  :                                                    
CCDS62 EENPQQSEELLEVSN                                             
          240                                                      

>>CCDS1680.2 E2F6 gene_id:1876|Hs108|chr2                 (281 aa)
 initn: 584 init1: 344 opt: 619  Z-score: 386.0  bits: 79.9 E(32554): 3.5e-15
Smith-Waterman score: 619; 45.0% identity (74.3% similar) in 218 aa overlap (126-343:60-274)

         100       110       120       130       140       150     
pF1KB7 RPVVPEFPTPKGKCIRVDGLPSPKTPKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSESEDGVLDL
                                     .. :.:.::  ::.::. :.  .  :.:::
CCDS16 INVEGLLPSKIRINLEDNVQYVSMRKALKVKRPRFDVSLVYLTRKFMDLVRSAPGGILDL
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pF1KB7 NWAAEVLDVQKRRIYDITNVLEGIQLIRKKAKNNIQWVGRGMFEDPTRPGKQQQLGQELK
       : .:  : :.:::.:::::::.::.:..::.::.:.:.:  . .  . : .:..: .::.
CCDS16 NKVATKLGVRKRRVYDITNVLDGIDLVEKKSKNHIRWIGSDLSNFGAVP-QQKKLQEELS
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pF1KB7 ELMNTEQALDQLIQSCSLSFKHLTEDKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQTVIAVKAPPQT
       .:   :.:::.::..:. .. .::.:: :.::::::::::...  :.:: ::::::: .:
CCDS16 DLSAMEDALDELIKDCAQQLFELTDDKENERLAYVTYQDIHSIQAFHEQIVIAVKAPAET
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pF1KB7 RLEVPDRTEDNLQIYLKSTQGPIEVYLCPEEVQEPDSPSEEPLPSTSTLCPSPDSAQPSS
       ::.::   ::.. ....::.:::.::::  :  . ..   : . ..:.    :..  :  
CCDS16 RLDVPAPREDSITVHIRSTNGPIDVYLCEVEQGQTSNKRSEGVGTSSSESTHPEG--PEE
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pF1KB7 STDPSIMEPTASSVPAPAPTPQQAPPPPSLVPLEATDSLLELPHPLLQQTEDQFLSPTLA
         .:.  :                                                    
CCDS16 EENPQQSEELLEVSN                                             
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>>CCDS62858.1 E2F6 gene_id:1876|Hs108|chr2                (206 aa)
 initn: 531 init1: 344 opt: 566  Z-score: 356.8  bits: 74.1 E(32554): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 566; 45.0% identity (74.0% similar) in 200 aa overlap (144-343:3-199)

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pF1KB7 GLPSPKTPKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSESEDGVLDLNWAAEVLDVQKRRIYDIT
                                     :.  .  :.:::: .:  : :.:::.::::
CCDS62                             MDLVRSAPGGILDLNKVATKLGVRKRRVYDIT
                                           10        20        30  

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pF1KB7 NVLEGIQLIRKKAKNNIQWVGRGMFEDPTRPGKQQQLGQELKELMNTEQALDQLIQSCSL
       :::.::.:..::.::.:.:.:  . .  . : .:..: .::..:   :.:::.::..:. 
CCDS62 NVLDGIDLVEKKSKNHIRWIGSDLSNFGAVP-QQKKLQEELSDLSAMEDALDELIKDCAQ
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pF1KB7 SFKHLTEDKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQTVIAVKAPPQTRLEVPDRTEDNLQIYLKS
       .. .::.:: :.::::::::::...  :.:: ::::::: .:::.::   ::.. ....:
CCDS62 QLFELTDDKENERLAYVTYQDIHSIQAFHEQIVIAVKAPAETRLDVPAPREDSITVHIRS
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pF1KB7 TQGPIEVYLCPEEVQEPDSPSEEPLPSTSTLCPSPDSAQPSSSTDPSIMEPTASSVPAPA
       :.:::.::::  :  . ..   : . ..:.    :..  :    .:.  :          
CCDS62 TNGPIDVYLCEVEQGQTSNKRSEGVGTSSSESTHPEG--PEEEENPQQSEELLEVSN   
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pF1KB7 PTPQQAPPPPSLVPLEATDSLLELPHPLLQQTEDQFLSPTLACSSPLISFSPSLDQDDYL

>>CCDS32464.1 E2F4 gene_id:1874|Hs108|chr16               (413 aa)
 initn: 460 init1: 184 opt: 563  Z-score: 350.7  bits: 73.9 E(32554): 3.2e-13
Smith-Waterman score: 563; 44.4% identity (65.5% similar) in 252 aa overlap (118-360:6-253)

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pF1KB7 KLDLEGIGRPVVPEFPTPKGKCIRVDGLPSPKTPKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSE
                                     :..:  ::  .:.. :::::: ::. ::.:
CCDS32                          MAEAGPQAPPPPGTPSRHEKSLGLLTTKFVSLLQE
                                        10        20        30     

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pF1KB7 SEDGVLDLNWAAEVLDV-QKRRIYDITNVLEGIQLIRKKAKNNIQWVGRGMFEDPTRP--
       ..::::::. ::..: : ::::::::::::::: ::.::.::.::: : :   . ::   
CCDS32 AKDGVLDLKLAADTLAVRQKRRIYDITNVLEGIGLIEKKSKNSIQWKGVGPGCN-TREIA
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pF1KB7 GKQQQLGQELKELMNTEQALDQLIQSCSLSFKHLTEDKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQ
        :  .:  :..::.. :: :::     . :....:::  :. :::::..::     :  .
CCDS32 DKLIELKAEIEELQQREQELDQHKVWVQQSIRNVTEDVQNSCLAYVTHEDI--CRCFAGD
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pF1KB7 TVIAVKAPPQTRLEVPD----RTEDNLQIYLKSTQGPIEVYLCPEEVQEPDSPSEEPLPS
       :..:..::  : ::::       . . ::.:::..::::: :  .:.   . :   :.: 
CCDS32 TLLAIRAPSGTSLEVPIPEGLNGQKKYQIHLKSVSGPIEVLLVNKEAWS-SPPVAVPVPP
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pF1KB7 TSTLCPSPDSAQ-PSSSTDPSIMEPTASSVP-APAPTPQQAPPPPSLVPLEATDSLLELP
          :  ::.... :     :.. .   .: : .:  ::  .:                  
CCDS32 PEDLLQSPSAVSTPPPLPKPALAQSQEASRPNSPQLTPTAVPGSAEVQGMAGPAAEITVS
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pF1KB7 HPLLQQTEDQFLSPTLACSSPLISFSPSLDQDDYLWGLEAGEGISDLFDSYDLGDLLIN 
                                                                   
CCDS32 GGPGTDSKDSGELSSLPLGPTTLDTRPLQSSALLDSSSSSSSSSSSSSNSNSSSSSGPNP
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>>CCDS47885.1 E2F5 gene_id:1875|Hs108|chr8                (346 aa)
 initn: 271 init1: 168 opt: 518  Z-score: 325.4  bits: 69.0 E(32554): 8.3e-12
Smith-Waterman score: 574; 37.2% identity (61.9% similar) in 344 aa overlap (92-427:17-340)

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pF1KB7 CLDATPHGPEGQVVRCLPAGRLPAKRKLDLEGIG-RPVVPEFPTPKGKCIRVDGLPSPKT
                                     .: : ::  :  : :...  .    : :. 
CCDS47               MAAAEPASSGQQAPAGQGQGQRP--PPQP-PQAQAPQPP--PPPQL
                             10        20           30          40 

              130       140       150       160        170         
pF1KB7 PKSPGEKTRYDTSLGLLTKKFIYLLSESEDGVLDLNWAAEVLDV-QKRRIYDITNVLEGI
         . : ..:.. :::::: ::. ::.:..::::::. ::..: : :::::::::::::::
CCDS47 GGAGGGSSRHEKSLGLLTTKFVSLLQEAKDGVLDLKAAADTLAVRQKRRIYDITNVLEGI
              50        60        70        80        90       100 

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pF1KB7 QLIRKKAKNNIQWVGRGMFEDPTRP-GKQQQLGQELKELMNTEQALDQLIQSCSLSFKHL
       .::.::.::.::: : :   .  .   . . :  :...:   :. :::     . :.:..
CCDS47 DLIEKKSKNSIQWKGVGAGCNTKEVIDRLRYLKAEIEDLELKERELDQQKLWLQQSIKNV
             110       120       130       140       150       160 

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pF1KB7 TEDKANKRLAYVTYQDIRAVGNFKEQTVIAVKAPPQTRLEVP-----DRTEDNLQIYLKS
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