Result of SIM4 for pF1KB7726

seq1 = pF1KB7726.tfa, 1440 bp
seq2 = pF1KB7726/gi568815581f_6923672.tfa (gi568815581f:6923672_7127616), 203945 bp

>pF1KB7726 1440
>gi568815581f:6923672_7127616 (Chr17)

1-179  (100001-100179)   100% ->
180-401  (100412-100633)   100% ->
402-767  (100730-101092)   99% ->
768-892  (101405-101529)   100% ->
893-1057  (102786-102950)   99% ->
1058-1188  (103034-103164)   100% ->
1189-1326  (103279-103416)   100% ->
1327-1440  (103832-103945)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTTCCCCCGCCGCCCCGGAGGGAGCGCTGGGCTACGTCCGCGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTTCCCCCGCCGCCCCGGAGGGAGCGCTGGGCTACGTCCGCGAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTCGCCACTCCTCCGACGTGCTGGGCAACCTCAACGAGCTGCGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACTCGCCACTCCTCCGACGTGCTGGGCAACCTCAACGAGCTGCGCCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGGATCCTCACTGACGTCACGCTGCTGGTTGGCGGGCAACCCCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGGATCCTCACTGACGTCACGCTGCTGGTTGGCGGGCAACCCCTCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCACACAAGGCAGTTCTCATCGCCTGCAG         TGGCTTCTTCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100151 GCACACAAGGCAGTTCTCATCGCCTGCAGGTT...TAGTGGCTTCTTCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCAATTTTCCGGGGCCGTGCGGGAGTCGGGGTGGACGTGCTCTCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100424 TTCAATTTTCCGGGGCCGTGCGGGAGTCGGGGTGGACGTGCTCTCTCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCGGGGGTCCCGAAGCGAGAGGCTTCGCCCCTCTATTGGACTTCATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100474 CCGGGGGTCCCGAAGCGAGAGGCTTCGCCCCTCTATTGGACTTCATGTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACTTCGCGCCTGCGCCTCTCTCCAGCCACTGCACCAGCAGTCCTAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100524 ACTTCGCGCCTGCGCCTCTCTCCAGCCACTGCACCAGCAGTCCTAGCGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGCCACCTATTTGCAGATGGAGCACGTGGTCCAGGCATGCCACCGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100574 CGCCACCTATTTGCAGATGGAGCACGTGGTCCAGGCATGCCACCGCTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCCAGGCCAG         CTATGAACCTCTGGGCATCTCCCTGCGCCCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100624 TCCAGGCCAGGTG...CAGCTATGAACCTCTGGGCATCTCCCTGCGCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGGAAGCAGAACCCCCAACACCCCCAACGGCCCCTCCACCAGGTAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100761 CTGGAAGCAGAACCCCCAACACCCCCAACGGCCCCTCCACCAGGTAGTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAGGCGCTCCGAAGGACACCCAGACCCACCTACTGAATCTCGAAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100811 CAGGCGCTCCGAAGGACACCCAGACCCACCTACTGAATCTCGAAGCTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GTCAAGGCCCCCCCAGTCCAGCCAGCCCTGACCCCAAGGCCTGCAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100861 GTCAAGGCCCCCCCAGTCCAGCCAGCCCTGACCCCAAGGCCTGCAACTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAAAAGTACAAGTACATCGTGCTAAACTCTCAGGCCTCCCAAGCAGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100911 AAAAAGTACAAGTACATCGTGCTAAACTCTCAGGCCTCCCAAGCAGGGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCTGGTCGGGGAGAGAAGTTCTGGTCAACCTTGCCCCCAAGCCAGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100961 CCTGGTCGGGGAGAGAAGTTCTGGTCAACCTTGCCCCCAAGCCAGGCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CCAGTGGAGACGAGGCCTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-
 101011 CCAGTGGAGACGAGGCCTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG 

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AGTGAAGAAGGACCCATTCCTGGTCCCCAGAGCAG         GCTCTC
        --|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101060   TGAAGAAGGACCCATTCCTGGTCCCCAGAGCAGGTA...TAGGCTCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TCCAACTGCTGCCACTGTGCAGTTCAAATGTGGGGCTCCAGCCAGTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101411 TCCAACTGCTGCCACTGTGCAGTTCAAATGTGGGGCTCCAGCCAGTACCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCTACCTCCTCACATCCCAGGCTCAAGACACCTCTGGATCACCCTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101461 CCTACCTCCTCACATCCCAGGCTCAAGACACCTCTGGATCACCCTCTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CGGGCTCGTCCACTACCGG         GAAGTGAATTTTTCAGCTGCCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101511 CGGGCTCGTCCACTACCGGGTA...CAGGAAGTGAATTTTTCAGCTGCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GAACTGTGAGGCTGTGGCAGGGTGCTCATCGGGGCTGGACTCCTTGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102808 GAACTGTGAGGCTGTGGCAGGGTGCTCATCGGGGCTGGACTCCTTGGTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CTGGGGACGAAGACAAACCCTATAAGTGTCAGCTGTGCCGGTCTTCGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102858 CTGGGGACGAAGACAAACCCTATAAGTGTCAGCTGTGCCGGTCTTCGTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CGCTACAAGGGCAACCTTGCCAGTCACCGTACAGTGCACACAG       
        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||>>>...>
 102908 CGCTACAAGGGCAACCTTGCCAGTCATCGTACAGTGCACACAGGTA...C

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1058   GGGAAAAGCCTTACCACTGCTCAATCTGCGGAGCCCGTTTTAACCGGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103032 AGGGGAAAAGCCTTACCACTGCTCAATCTGCGGAGCCCGTTTTAACCGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CAGCAAACCTGAAAACGCACAGCCGCATCCATTCGGGAGAGAAGCCGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103082 CAGCAAACCTGAAAACGCACAGCCGCATCCATTCGGGAGAGAAGCCGTAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 AAGTGTGAGACGTGCGGCTCGCGCTTTGTACAG         GTGGCACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 103132 AAGTGTGAGACGTGCGGCTCGCGCTTTGTACAGGTA...CAGGTGGCACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TCTGCGGGCGCACGTGCTGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACCCTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103287 TCTGCGGGCGCACGTGCTGATCCACACCGGGGAGAAGCCCTACCCTTGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CTACCTGCGGAACCCGCTTCCGCCACCTGCAGACCCTCAAGAGCCACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103337 CTACCTGCGGAACCCGCTTCCGCCACCTGCAGACCCTCAAGAGCCACGTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CGCATCCACACCGGAGAGAAGCCTTACCAC         TGCGACCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103387 CGCATCCACACCGGAGAGAAGCCTTACCACGTG...CAGTGCGACCCCTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TGGCCTGCATTTCCGGCACAAGAGTCAACTGCGGCTGCATCTGCGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103843 TGGCCTGCATTTCCGGCACAAGAGTCAACTGCGGCTGCATCTGCGCCAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 AACACGGAGCTGCTACCAACACCAAAGTGCACTACCACATTCTCGGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103893 AACACGGAGCTGCTACCAACACCAAAGTGCACTACCACATTCTCGGGGGG

   1500 
   1438 CCC
        |||
 103943 CCC

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