Result of FASTA (ccds) for pF1KB7654
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7654, 371 aa
  1>>>pF1KB7654 371 - 371 aa - 371 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5487+/-0.000802; mu= 12.4944+/- 0.049
 mean_var=118.7499+/-23.248, 0's: 0 Z-trim(112.2): 45  B-trim: 104 in 1/52
 Lambda= 0.117695
 statistics sampled from 12957 (13001) to 12957 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.764), E-opt: 0.2 (0.399), width:  16
 Scan time:  3.350

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6588.1 CREB3 gene_id:10488|Hs108|chr9          ( 371) 2453 427.0 1.3e-119
CCDS58029.1 CREB3L4 gene_id:148327|Hs108|chr1      ( 375)  519 98.7 9.1e-21
CCDS1056.1 CREB3L4 gene_id:148327|Hs108|chr1       ( 395)  519 98.7 9.4e-21
CCDS62499.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19      ( 459)  508 96.9 3.9e-20
CCDS62500.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19      ( 460)  508 96.9 3.9e-20
CCDS12121.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19      ( 461)  508 96.9 3.9e-20
CCDS53620.1 CREB3L1 gene_id:90993|Hs108|chr11      ( 519)  387 76.4 6.5e-14
CCDS34760.1 CREB3L2 gene_id:64764|Hs108|chr7       ( 520)  378 74.8 1.9e-13


>>CCDS6588.1 CREB3 gene_id:10488|Hs108|chr9               (371 aa)
 initn: 2453 init1: 2453 opt: 2453  Z-score: 2261.2  bits: 427.0 E(32554): 1.3e-119
Smith-Waterman score: 2453; 100.0% identity (100.0% similar) in 371 aa overlap (1-371:1-371)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MELELDAGDQDLLAFLLEESGDLGTAPDEAVRAPLDWALPLSEVPSDWEVDDLLCSLLSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MELELDAGDQDLLAFLLEESGDLGTAPDEAVRAPLDWALPLSEVPSDWEVDDLLCSLLSP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PASLNILSSSNPCLVHHDHTYSLPRETVSMDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PASLNILSSSNPCLVHHDHTYSLPRETVSMDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 VLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLES
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 RVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQLRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQLRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 LLVPAMYSSDTRGSLPAEHGVLSRQLRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDSTHQWLDGSDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LLVPAMYSSDTRGSLPAEHGVLSRQLRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDSTHQWLDGSDC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 VLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAEPPLEWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAEPPLEWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGS
              310       320       330       340       350       360

              370 
pF1KB7 PSVILQDRYSG
       :::::::::::
CCDS65 PSVILQDRYSG
              370 

>>CCDS58029.1 CREB3L4 gene_id:148327|Hs108|chr1           (375 aa)
 initn: 534 init1: 488 opt: 519  Z-score: 486.3  bits: 98.7 E(32554): 9.1e-21
Smith-Waterman score: 519; 46.6% identity (72.1% similar) in 204 aa overlap (120-319:167-360)

      90       100       110       120       130       140         
pF1KB7 MDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQ
                                     : :::::: :: .::. ::  :::::.::.
CCDS58 ELPFDAHAHILPRAGTVAPVPCTTLLPCQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLTKAEER
        140       150       160       170       180       190      

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB7 ILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQ
       .::.::::::::.:::.:::.:: :. ::::::   .:::.:::.::: ::..:.::. :
CCDS58 VLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKEYIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNISLVAQ
        200       210       220       230       240       250      

     210       220       230       240       250           260     
pF1KB7 LRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCLLLVPAMYSSDTRGSLPAE----HGVLSRQ
       ::.::... . :::....:::.:.:: :. :...:..   ..:    .:    ::: ::.
CCDS58 LRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLILLFSLALIILPSFSPFQSRPEAGSEDYQPHGVTSRN
        260       270       280       290       300       310      

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB7 LRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDSTHQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAEPPL
       .  :  .:  .     :...: ..  ..   ..:    : :.:  ::. :   :      
CCDS58 I--LTHKDVTE----NLETQVVESRLREPPGAKD----ANGSTRTLLEKMGGKPRPSGRI
          320           330       340           350       360      

         330       340       350       360       370 
pF1KB7 EWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGSPSVILQDRYSG
                                                     
CCDS58 RSVLHADEM                                     
        370                                          

>>CCDS1056.1 CREB3L4 gene_id:148327|Hs108|chr1            (395 aa)
 initn: 534 init1: 488 opt: 519  Z-score: 486.0  bits: 98.7 E(32554): 9.4e-21
Smith-Waterman score: 519; 46.6% identity (72.1% similar) in 204 aa overlap (120-319:187-380)

      90       100       110       120       130       140         
pF1KB7 MDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQ
                                     : :::::: :: .::. ::  :::::.::.
CCDS10 ELPFDAHAHILPRAGTVAPVPCTTLLPCQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLTKAEER
        160       170       180       190       200       210      

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB7 ILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQ
       .::.::::::::.:::.:::.:: :. ::::::   .:::.:::.::: ::..:.::. :
CCDS10 VLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKEYIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNISLVAQ
        220       230       240       250       260       270      

     210       220       230       240       250           260     
pF1KB7 LRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCLLLVPAMYSSDTRGSLPAE----HGVLSRQ
       ::.::... . :::....:::.:.:: :. :...:..   ..:    .:    ::: ::.
CCDS10 LRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLILLFSLALIILPSFSPFQSRPEAGSEDYQPHGVTSRN
        280       290       300       310       320       330      

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB7 LRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDSTHQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAEPPL
       .  :  .:  .     :...: ..  ..   ..:    : :.:  ::. :   :      
CCDS10 I--LTHKDVTE----NLETQVVESRLREPPGAKD----ANGSTRTLLEKMGGKPRPSGRI
          340           350       360           370       380      

         330       340       350       360       370 
pF1KB7 EWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGSPSVILQDRYSG
                                                     
CCDS10 RSVLHADEM                                     
        390                                          

>>CCDS62499.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19           (459 aa)
 initn: 561 init1: 503 opt: 508  Z-score: 475.0  bits: 96.9 E(32554): 3.9e-20
Smith-Waterman score: 508; 47.3% identity (74.7% similar) in 186 aa overlap (120-298:211-396)

      90       100       110       120       130       140         
pF1KB7 MDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQ
                                     ::::..::.:: :::. ::  ::::: ::.
CCDS62 KDLLLSGSSGDLHHLGASYLLRPGAGHCQELVLTEDEKKLLAKEGITLPTQLPLTKYEER
              190       200       210       220       230       240

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB7 ILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQ
       .::..:::::::.::::::.::: :. :::.:.   ::::.::: ::  ::.::::::.:
CCDS62 VLKKIRRKIRNKQSAQESRKKKKEYIDGLETRMSACTAQNQELQRKVLHLEKQNLSLLEQ
              250       260       270       280       290       300

     210       220       230       240        250       260        
pF1KB7 LRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCLLLVPAMYS-SDTRGSLPAEHG---VLSRQ
       :.::::.:.. ..:.....::. :::.:: :...:..   . ..   :.. .   :.:: 
CCDS62 LKKLQAIVVQSTSKSAQTGTCVAVLLLSFALIILPSISPFGPNKTESPGDFAPVRVFSRT
              310       320       330       340       350       360

         270       280          290       300       310       320  
pF1KB7 LRALPSEDPYQLELPALQSEVPK---DSTHQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAE
       :.   .       .:. ..  :.   :.:..   ::                        
CCDS62 LHNDAASRVAADAVPGSEAPGPRPEADTTREESPGSPGADWGFQDTANLTNSTEELDNAT
              370       380       390       400       410       420

            330       340       350       360       370 
pF1KB7 PPLEWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGSPSVILQDRYSG
                                                        
CCDS62 LVLRNATEGLGQVALLDWVAPGPSTGSGRAGLEAAGDEL          
              430       440       450                   

>>CCDS62500.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19           (460 aa)
 initn: 561 init1: 503 opt: 508  Z-score: 475.0  bits: 96.9 E(32554): 3.9e-20
Smith-Waterman score: 508; 47.3% identity (74.7% similar) in 186 aa overlap (120-298:212-397)

      90       100       110       120       130       140         
pF1KB7 MDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQ
                                     ::::..::.:: :::. ::  ::::: ::.
CCDS62 LLLSGSSGDLQQHHLGASYLLRPGAGHCQELVLTEDEKKLLAKEGITLPTQLPLTKYEER
             190       200       210       220       230       240 

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB7 ILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQ
       .::..:::::::.::::::.::: :. :::.:.   ::::.::: ::  ::.::::::.:
CCDS62 VLKKIRRKIRNKQSAQESRKKKKEYIDGLETRMSACTAQNQELQRKVLHLEKQNLSLLEQ
             250       260       270       280       290       300 

     210       220       230       240        250       260        
pF1KB7 LRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCLLLVPAMYS-SDTRGSLPAEHG---VLSRQ
       :.::::.:.. ..:.....::. :::.:: :...:..   . ..   :.. .   :.:: 
CCDS62 LKKLQAIVVQSTSKSAQTGTCVAVLLLSFALIILPSISPFGPNKTESPGDFAPVRVFSRT
             310       320       330       340       350       360 

         270       280          290       300       310       320  
pF1KB7 LRALPSEDPYQLELPALQSEVPK---DSTHQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAE
       :.   .       .:. ..  :.   :.:..   ::                        
CCDS62 LHNDAASRVAADAVPGSEAPGPRPEADTTREESPGSPGADWGFQDTANLTNSTEELDNAT
             370       380       390       400       410       420 

            330       340       350       360       370 
pF1KB7 PPLEWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGSPSVILQDRYSG
                                                        
CCDS62 LVLRNATEGLGQVALLDWVAPGPSTGSGRAGLEAAGDEL          
             430       440       450       460          

>>CCDS12121.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19           (461 aa)
 initn: 561 init1: 503 opt: 508  Z-score: 475.0  bits: 96.9 E(32554): 3.9e-20
Smith-Waterman score: 508; 47.3% identity (74.7% similar) in 186 aa overlap (120-298:213-398)

      90       100       110       120       130       140         
pF1KB7 MDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQ
                                     ::::..::.:: :::. ::  ::::: ::.
CCDS12 LLLSGSSGDLQQHHLGASYLLRPGAGHCQELVLTEDEKKLLAKEGITLPTQLPLTKYEER
            190       200       210       220       230       240  

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB7 ILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQ
       .::..:::::::.::::::.::: :. :::.:.   ::::.::: ::  ::.::::::.:
CCDS12 VLKKIRRKIRNKQSAQESRKKKKEYIDGLETRMSACTAQNQELQRKVLHLEKQNLSLLEQ
            250       260       270       280       290       300  

     210       220       230       240        250       260        
pF1KB7 LRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCLLLVPAMYS-SDTRGSLPAEHG---VLSRQ
       :.::::.:.. ..:.....::. :::.:: :...:..   . ..   :.. .   :.:: 
CCDS12 LKKLQAIVVQSTSKSAQTGTCVAVLLLSFALIILPSISPFGPNKTESPGDFAPVRVFSRT
            310       320       330       340       350       360  

         270       280          290       300       310       320  
pF1KB7 LRALPSEDPYQLELPALQSEVPK---DSTHQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAE
       :.   .       .:. ..  :.   :.:..   ::                        
CCDS12 LHNDAASRVAADAVPGSEAPGPRPEADTTREESPGSPGADWGFQDTANLTNSTEELDNAT
            370       380       390       400       410       420  

            330       340       350       360       370 
pF1KB7 PPLEWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGSPSVILQDRYSG
                                                        
CCDS12 LVLRNATEGLGQVALLDWVAPGPSTGSGRAGLEAAGDEL          
            430       440       450       460           

>>CCDS53620.1 CREB3L1 gene_id:90993|Hs108|chr11           (519 aa)
 initn: 341 init1: 341 opt: 387  Z-score: 363.3  bits: 76.4 E(32554): 6.5e-14
Smith-Waterman score: 389; 35.2% identity (58.0% similar) in 307 aa overlap (26-327:173-451)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB7      MELELDAGDQDLLAFLLEESGDLGTAPDEAVRAPLDWALPLSEVPSDWEV--DDL
                                     :: : .. :.  : :: :: .  .:  .::
CCDS53 APSAMAAAAAMATTPLLGLSPLSRLPIPHQAPGEMTQLPVIKAEPL-EVNQFLKVTPEDL
            150       160       170       180        190       200 

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB7 LCSLLSPPASLNILSSSNPCLVHHDHTYSLPRETVSMDLESESCRKEGTQMTPQHMEELA
       .    .::.: .  :.:.     ..   : : .   :   : .        .:....  .
CCDS53 VQMPPTPPSSHG--SDSDGSQSPRSLPPSSPVRP--MARSSTAISTSPLLTAPHKLQGTS
             210         220       230         240       250       

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB7 EQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKV
           . :.::.:::  :  ::  .:  :::::.::. ::::::::.:: :::::::::: 
CCDS53 ----GPLLLTEEEKRTLIAEGYPIPTKLPLTKAEEKALKRVRRKIKNKISAQESRRKKKE
           260       270       280       290       300       310   

           180       190       200       210        220         230
pF1KB7 YVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQLRKLQAMVI-EISN--KTSSSSTC
       ::  ::..:  .:..: :: .::. ::. : .::.::.:::..:  .::   : ....: 
CCDS53 YVECLEKKVETFTSENNELWKKVETLENANRTLLQQLQKLQTLVTNKISRPYKMAATQTG
           320       330       340       350       360       370   

              240       250       260       270       280       290
pF1KB7 ILVLLVSFCLLLVPAMYSSDTRGSLPAEHGVLSRQLRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDS
         ......:..::     ..    :: : .  :. ..    :::   .     :..:. :
CCDS53 TCLMVAALCFVLV----LGSLVPCLP-EFSSGSQTVK----EDPLAADGVYTASQMPSRS
           380           390        400           410       420    

              300       310       320       330       340       350
pF1KB7 THQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAEPPLEWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLT
          . ::.   :   : .. :    :.    :::  :                       
CCDS53 LLFYDDGAG--LWEDGRSTLL----PM----EPPDGWEINPGGPAEQRPRDHLQHDHLDS
          430         440               450       460       470    

              360       370                         
pF1KB7 RKGGWLPTGSPSVILQDRYSG                        
                                                    
CCDS53 THETTKYLSEAWPKDGGNGTSPDFSHSKEWFHDRDLGPNTTIKLS
          480       490       500       510         

>>CCDS34760.1 CREB3L2 gene_id:64764|Hs108|chr7            (520 aa)
 initn: 342 init1: 342 opt: 378  Z-score: 355.0  bits: 74.8 E(32554): 1.9e-13
Smith-Waterman score: 392; 37.1% identity (63.7% similar) in 237 aa overlap (41-261:188-415)

               20        30        40        50        60          
pF1KB7 DLLAFLLEESGDLGTAPDEAVRAPLDWALPLSEVPSDWEVDDLLCSLLSPPASLNILS--
                                     :.  :..  :: :     .::.: .  :  
CCDS34 PPLEMNTGVDSSCQTIIPKIKLEPHEVDQFLNFSPKEAPVDHLHLPP-TPPSSHGSDSEG
       160       170       180       190       200        210      

         70        80        90       100         110       120    
pF1KB7 --SSNPCLVHHDHTYSLPRETVSMDLESESCRKEGTQMT--PQHMEELAEQEIARLVLTD
         : :: :    : .::: .: :    :..  .  . ..  :        :  . ::::.
CCDS34 SLSPNPRL----HPFSLP-QTHS---PSRAAPRAPSALSSSPLLTAPHKLQGSGPLVLTE
        220           230           240       250       260        

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB7 EEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLK
       :::  :  ::  .:  :::.:.::. ::..::::.:: :::::::::: :. .::..: .
CCDS34 EEKRTLIAEGYPIPTKLPLSKSEEKALKKIRRKIKNKISAQESRRKKKEYMDSLEKKVES
      270       280       290       300       310       320        

          190       200       210       220            230         
pF1KB7 YTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQLRKLQAMVIEISNKT-----SSSSTCILVLLVSFC
        ...:.::..::..::. : .::.::.:::..:.   ..:     ....::..:... : 
CCDS34 CSTENLELRKKVEVLENTNRTLLQQLQKLQTLVMGKVSRTCKLAGTQTGTCLMVVVLCFA
      330       340       350       360       370       380        

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pF1KB7 LLLVPAM-----YSSDTRGSLPAEHGVLSRQLRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDSTHQW
       . .   .     : : :. .::..:..                                 
CCDS34 VAFGSFFQGYGPYPSATKMALPSQHSLQEPYTASVVRSRNLLIYEEHSPPEESSSPGSAG
      390       400       410       420       430       440        




371 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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