Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7448
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7448, 324 aa
1>>>pF1KB7448 324 - 324 aa - 324 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4996+/-0.0013; mu= 14.9720+/- 0.077
mean_var=126.4282+/-40.147, 0's: 0 Z-trim(102.2): 378 B-trim: 841 in 2/48
Lambda= 0.114065
statistics sampled from 6358 (6844) to 6358 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 2133 363.1 1.7e-100
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 2041 348.0 6.5e-96
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 961 170.2 2e-42
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 953 168.9 4.8e-42
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 942 167.1 1.7e-41
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 918 163.1 2.6e-40
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 916 162.8 3.3e-40
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 913 162.3 4.6e-40
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 902 160.5 1.7e-39
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 901 160.4 1.9e-39
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 893 159.0 4.5e-39
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 889 158.4 7.3e-39
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 887 158.0 9.1e-39
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 878 156.5 2.5e-38
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 875 156.0 3.5e-38
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 867 154.7 8.8e-38
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 859 153.4 2.2e-37
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 850 151.9 6.2e-37
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 842 150.6 1.5e-36
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CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 833 149.1 4.3e-36
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 820 147.0 1.9e-35
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 817 146.5 2.6e-35
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 813 145.8 4.2e-35
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 809 145.2 6.6e-35
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 788 141.7 7.2e-34
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 787 141.6 8.2e-34
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 785 141.2 1e-33
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 768 138.4 7e-33
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 759 137.0 2.1e-32
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 747 135.0 8.3e-32
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 734 132.9 3.5e-31
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 730 132.2 5.3e-31
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 728 131.9 6.8e-31
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 725 131.4 9.5e-31
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 703 127.7 1.2e-29
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 699 127.2 2e-29
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 696 126.6 2.6e-29
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 695 126.4 3e-29
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 675 123.1 2.8e-28
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 674 123.0 3.2e-28
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 671 122.5 4.5e-28
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 662 121.0 1.2e-27
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 662 121.0 1.3e-27
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 658 120.3 2e-27
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 652 119.4 4e-27
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 638 117.0 1.9e-26
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 634 116.4 3.1e-26
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 611 112.6 4.2e-25
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 607 111.9 6.7e-25
>>CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 2133 init1: 2133 opt: 2133 Z-score: 1917.6 bits: 363.1 E(32554): 1.7e-100
Smith-Waterman score: 2133; 100.0% identity (100.0% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAISLSAMYITALLGNTLIVTAIWMDSTRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAISLSAMYITALLGNTLIVTAIWMDSTRH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDSSISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDSSISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAVTIRAVTFMTPLSWMMNHLPFCGSNVVVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAVTIRAVTFMTPLSWMMNHLPFCGSNVVVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SYCKHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSDVAFIAASYILILRAVFDLSSKTAQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SYCKHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSDVAFIAASYILILRAVFDLSSKTAQLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDIVPLHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDIVPLHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMR
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 TKQLLEGIWSYLMHFLFDHSNLGS
::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TKQLLEGIWSYLMHFLFDHSNLGS
310 320
>>CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 (350 aa)
initn: 2041 init1: 2041 opt: 2041 Z-score: 1835.4 bits: 348.0 E(32554): 6.5e-96
Smith-Waterman score: 2041; 95.1% identity (97.8% similar) in 324 aa overlap (1-324:27-350)
10 20 30
pF1KB7 MLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MCQQILRDCILLIHHLCINRKKVSLVMLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAIS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LSAMYITALLGNTLIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDS
:::::: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSAMYIIALLGNTIIVTAIWMDSTRHEPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDS
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 SISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAVTI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS31 SISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLLTMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAITI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 RAVTFMTPLSWMMNHLPFCGSNVVVHSYCKHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSD
::. .::::::..:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RAIIAITPLSWMVSHLPFCGSNVVVHSYCEHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSD
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 VAFIAASYILILRAVFDLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDIVP
::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS31 VAFIAASYILILKAVFGLSSKTAQLKALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDVVP
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KB7 LHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLLEGIWSYLMHFLFDHSNLGS
:::::::::::::::::::::::::::::: : ::::::: :::::::::
CCDS31 LHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMRTKQLRERIWSYLMHVLFDHSNLGS
310 320 330 340 350
>>CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 (323 aa)
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Smith-Waterman score: 961; 47.1% identity (76.0% similar) in 312 aa overlap (7-318:5-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAISLSAMYITALLGNTLIVTAIWMDSTRH
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CCDS53 MSHTNVTIFHPAVFVLPGIPGLEAYHIWLSIPLCLIYITAVLGNSILIVVIVMERNLH
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pF1KB7 EPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDSSISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLL
::: :: .::..::......::: ..:: .:.:.:: :: ::::. . :...::
CCDS53 VPMYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVHMMFVGESAILL
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAVTIRAVTFMTPLSWMMNHLPFCGSNVVVH
.:::::.:::: ::.: .:: :. ...:: :. .. :. .....:::: .:.: :
CCDS53 AMAFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLLKRLPFCLTNIVPH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SYCKHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSDVAFIAASYILILRAVFDLSSKTAQLK
:::.::..::::::: . . :.. .:: :: .::.:: ::::::: : :. :. :
CCDS53 SYCEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAVFRLPSQDARHK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDIVPLHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMR
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CCDS53 ALSTCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFGRNI-PQHVHILLANLYVAVPPMLNPIVYGVK
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KB7 TKQLLEGIWSYLMHFLFDHSNLGS
:::. ::. : .::
CCDS53 TKQIREGV----AHRFFDIKTWCCTSPLGS
300 310 320
>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 879 init1: 594 opt: 953 Z-score: 868.3 bits: 168.9 E(32554): 4.8e-42
Smith-Waterman score: 953; 44.2% identity (80.9% similar) in 303 aa overlap (6-308:4-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAISLSAMYITALLGNTLIVTAIWMDSTRH
.:... :..:.:.:::::.. :.:.. . ..:..:::::. :. .: ...: .
CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDSSISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLL
:::. :: .:...:...... ::.:..:: :...:: .:::..: :..:. .::
CCDS31 EPMFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAVTIRAVTFMTPLSWMMNHLPFCGSNVVVH
.::::::::.: :::: ::: ::..:.:: ..:: : . :. ... .:::: .....:
CCDS31 AMAFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SYCKHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSDVAFIAASYILILRAVFDLSSKTAQLK
:::.:...:.:.:.. ...:.:. :..: ....:. ::. :::::: : :. ::::
CCDS31 SYCEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFV-LNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDIVPLHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMR
::::::.::::. ..:.:.. :. . .:..: : . ..:.:.::.::: .:::::::.:
CCDS31 ALSTCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQI-PGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVR
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KB7 TKQLLEGIWSYLMHFLFDHSNLGS
:::. : .
CCDS31 TKQIRERVLYVFTKK
300 310
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 972 init1: 918 opt: 942 Z-score: 858.4 bits: 167.1 E(32554): 1.7e-41
Smith-Waterman score: 942; 45.9% identity (80.5% similar) in 292 aa overlap (13-304:12-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAISLSAMYITALLGNTLIVTAIWMDSTRH
: .:.:.:::::...:.:.:: . :::..::.::. .. .: ::.. :
CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDNALH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EPMYCFLCVLAAVDIVMASSVVPKMVSIFCSGDSSISFSACFTQMFFVHLATAVETGLLL
::: :::.:. .:....:..::::..:. . :::..:..::: :: :.:...::
CCDS31 APMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSILL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TMAFDRYVAICKPLHYKRILTPQVMLGMSMAVTIRAVTFMTPLSWMMNHLPFCGSNVVVH
.::::::::::.::.: ::. :. .... .:.:....:. ... .::.:: :..:
CCDS31 AMAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLRRLPYCGHRVMTH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SYCKHIALARLACADPVPSSLYSLIGSSLMVGSDVAFIAASYILILRAVFDLSSKTAQLK
.::.:...::::::. . . .:.: . : .: : .:: :: .::.::: : :. :: :
CCDS31 TYCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSHDAQHK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ALSTCGSHVGVMALYYLPGMASIYAAWLGQDIVPLHTQVLLADLYVIIPATLNPIIYGMR
::::::::.:.. ..:.:.. :. . .:. :: :....::.:::..: .::::.:: :
CCDS31 ALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGAR
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KB7 TKQLLEGIWSYLMHFLFDHSNLGS
::..
CCDS31 TKEIRSRLLKLLHLGKTSI
300 310
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 906 init1: 630 opt: 918 Z-score: 837.1 bits: 163.1 E(32554): 2.6e-40
Smith-Waterman score: 918; 43.7% identity (78.5% similar) in 302 aa overlap (7-308:9-308)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MLGPAYNHTMETPASFLLVGIPGLQSSHLWLAISLSAMYITALLGNTLIVTAIWMDST
:::. :.::::.:::::.. :.:... . .:..:::::: .. .: ...
CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
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