Result of FASTA (omim) for pF1KB7400
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7400, 305 aa
  1>>>pF1KB7400 305 - 305 aa - 305 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8739+/-0.000467; mu= 17.8512+/- 0.029
 mean_var=96.5962+/-27.294, 0's: 0 Z-trim(106.8): 246  B-trim: 909 in 1/51
 Lambda= 0.130495
 statistics sampled from 14472 (14838) to 14472 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.507), E-opt: 0.2 (0.174), width:  16
 Scan time:  6.560

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314)  952 190.5 3.7e-48
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314)  898 180.3 4.2e-45
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312)  837 168.8 1.2e-41
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312)  837 168.8 1.2e-41
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322)  837 168.9 1.2e-41
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  834 168.3 1.8e-41
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317)  834 168.3 1.8e-41
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  834 168.3 1.8e-41
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311)  825 166.6 5.8e-41
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327)  813 164.3 2.9e-40
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317)  808 163.4 5.4e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312)  804 162.6   9e-40
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314)  799 161.7 1.7e-39
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311)  789 159.8 6.3e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300)  781 158.3 1.8e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308)  770 156.2 7.5e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307)  759 154.1 3.2e-37
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312)  758 154.0 3.6e-37
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312)  743 151.1 2.6e-36
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309)  731 148.9 1.2e-35
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318)  452 96.4 8.1e-20
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320)  432 92.6 1.1e-18
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325)  216 52.0 1.9e-06
XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373)  189 46.9 7.2e-05
NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373)  189 46.9 7.2e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345)  186 46.3  0.0001
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323)  184 45.9 0.00013
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351)  174 44.1 0.00049
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332)  173 43.9 0.00054
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370)  172 43.7 0.00066
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478)  170 43.5   0.001
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin  ( 528)  170 43.5  0.0011
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306)  163 41.9  0.0019
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348)  163 42.0   0.002
XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349)  162 41.8  0.0023
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349)  162 41.8  0.0023
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332)  161 41.6  0.0026
NP_005675 (OMIM: 604106) probable G-protein couple ( 361)  157 40.9  0.0046
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318)  155 40.5  0.0055
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  155 40.6  0.0065
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  155 40.6  0.0065
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  155 40.6  0.0065
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  155 40.6  0.0065
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412)  155 40.6  0.0065
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465)  155 40.7   0.007
NP_000855 (OMIM: 182133) 5-hydroxytryptamine recep ( 377)  152 40.0   0.009
NP_056542 (OMIM: 162323) substance-P receptor isof ( 311)  151 39.7  0.0091
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339)  151 39.7  0.0096
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor  ( 428)  152 40.0  0.0098
XP_011543934 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359)  151 39.8    0.01


>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo   (314 aa)
 initn: 944 init1: 944 opt: 952  Z-score: 985.6  bits: 190.5 E(85289): 3.7e-48
Smith-Waterman score: 952; 49.8% identity (75.9% similar) in 303 aa overlap (3-304:6-307)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB7    MQRSNHTVTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTP
            :.   ::::::::: : : .:. ::..:: .:.. ..::  :..::  :  :.::
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB7 MYFFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAV
       :::: .::::.:: : :  .::.::. .::.::::. ::  ::.:   .: .: ..:::.
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB7 AYDRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFF
       :::::::: .::::. .::  .:  :...:: :: ..: . :. .: ...: .:.:. ::
NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200        210       220       230      
pF1KB7 CDLLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLAS-NVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKA
       ::: ::..:.: .    . ..    .: ..::  ..:. ::.::. :::.: : .:  :.
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIIC-FIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
              190       200       210        220       230         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB7 FSTCSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDV
       ::::.:::::::.: :..:.::. :   :: . :::.:.:::. .:.:: .:::::::::
NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
     240       250       260       270       280       290         

        300           
pF1KB7 KEALKKLLP      
       :.: .:.:       
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
     300       310    

>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo   (314 aa)
 initn: 906 init1: 882 opt: 898  Z-score: 930.6  bits: 180.3 E(85289): 4.2e-45
Smith-Waterman score: 898; 45.6% identity (75.7% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-305)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7 MQRSNHT-VTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMY
       : :.:.: .:::.:::..    .:. ::. :: .:.:::.::  .:.::  :: ::::::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 FFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAY
       :: .::::.:.  :.. :::.:.  .:: :.::::::. :..:  .:: .:: :.. .::
NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 DRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFCD
       :::.:: .::::.  ::  .   ..: .. .:..:  . :... :..::  :.:  ::::
NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 LLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFST
         :: .:.:..    . .  .: . :..   ..::.:: ... :.. . :..:  .::::
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB7 CSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEA
       :.::::.. :.:.. .: :  : ::::...::..:.:::::.:::: .:::::.:.::.:
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
              250       260       270       280       290       300

     300             
pF1KB7 LKKLLP        
       : ...         
NP_003 LANVISRKRTSSFL
              310    

>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo   (312 aa)
 initn: 846 init1: 826 opt: 837  Z-score: 868.6  bits: 168.8 E(85289): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 837; 44.6% identity (72.5% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-305)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7 MQRSNHT-VTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMY
       :. .:.. :.::.:::.. .: .:  ::: ::..:  ::.::  .:. .  :::::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 FFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAY
       :: .::::.:. .: . .::.:.. : : ..::: ::: :..:   ..  . .:::..::
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 DRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFCD
       :..::. .:: :.  :. .:::::::  .  . .:  . :     ..:: .: :  ::::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 LLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFST
       . ::..:.:..    ....    :  .: : . :::::. :  .::.. :.::  :::::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB7 CSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEA
       :.:::. : :.:..:. .:  : ::.: . : .....:::: :::: .::::::. .: :
NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
              250       260       270       280       290       300

     300           
pF1KB7 LKKLLP      
       :::..       
NP_036 LKKVVGRVVFSV
              310  

>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (312 aa)
 initn: 846 init1: 826 opt: 837  Z-score: 868.6  bits: 168.8 E(85289): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 837; 44.6% identity (72.5% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-305)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7 MQRSNHT-VTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMY
       :. .:.. :.::.:::.. .: .:  ::: ::..:  ::.::  .:. .  :::::::::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 FFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAY
       :: .::::.:. .: . .::.:.. : : ..::: ::: :..:   ..  . .:::..::
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 DRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFCD
       :..::. .:: :.  :. .:::::::  .  . .:  . :     ..:: .: :  ::::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 LLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFST
       . ::..:.:..    ....    :  .: : . :::::. :  .::.. :.::  :::::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB7 CSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEA
       :.:::. : :.:..:. .:  : ::.: . : .....:::: :::: .::::::. .: :
XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
              250       260       270       280       290       300

     300           
pF1KB7 LKKLLP      
       :::..       
XP_011 LKKVVGRVVFSV
              310  

>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (322 aa)
 initn: 846 init1: 826 opt: 837  Z-score: 868.5  bits: 168.9 E(85289): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 837; 44.6% identity (72.5% similar) in 305 aa overlap (1-304:11-315)

                          10        20        30        40         
pF1KB7           MQRSNHT-VTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLIC
                 :. .:.. :.::.:::.. .: .:  ::: ::..:  ::.::  .:. . 
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB7 NDSCLHTPMYFFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYS
        ::::::::::: .::::.:. .: . .::.:.. : : ..::: ::: :..:   ..  
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB7 ECYLLAAVAYDRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCR
       . .:::..:::..::. .:: :.  :. .:::::::  .  . .:  . :     ..:: 
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB7 ENIIDDFFCDLLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISS
       .: :  ::::. ::..:.:..    ....    :  .: : . :::::. :  .::.. :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
              190       200       210       220       230       240

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB7 SKGYLKAFSTCSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIY
       .::  ::::::.:::. : :.:..:. .:  : ::.: . : .....:::: :::: .::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
              250       260       270       280       290       300

     290       300           
pF1KB7 SLRNKDVKEALKKLLP      
       ::::. .: ::::..       
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
              310       320  

>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep  (317 aa)
 initn: 829 init1: 829 opt: 834  Z-score: 865.5  bits: 168.3 E(85289): 1.8e-41
Smith-Waterman score: 834; 45.2% identity (72.5% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-305)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7 MQRSNHT-VTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMY
       :  .:.: :.::::::...:   ...:::.:: .: .::.::  ...::  :: ::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 FFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAY
       ::  :::..:. :..  .:..:.  ..: :.: : .:  :.::: .:.  :  :::..::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 DRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFCD
       :::::.   : :.  :   ::: :. .:. .:::.: . :  ::.. .::...:: . :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 LLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFST
       :: .:.::: . .. .. ..      .. :  :.: ::. ::...:.:.: .:  ::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB7 CSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEA
       :.:::: :.: ::  .. :  :.:: :  ..:. :.::... :::: ::::::::.:: :
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
              250       260       270       280       290       300

     300                
pF1KB7 LKKLLP           
        .:::            
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
              310       

>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo   (317 aa)
 initn: 829 init1: 829 opt: 834  Z-score: 865.5  bits: 168.3 E(85289): 1.8e-41
Smith-Waterman score: 834; 45.2% identity (72.5% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-305)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7 MQRSNHT-VTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMY
       :  .:.: :.::::::...:   ...:::.:: .: .::.::  ...::  :: ::::::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 FFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAY
       ::  :::..:. :..  .:..:.  ..: :.: : .:  :.::: .:.  :  :::..::
NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 DRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFCD
       :::::.   : :.  :   ::: :. .:. .:::.: . :  ::.. .::...:: . :.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 LLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFST
       :: .:.::: . .. .. ..      .. :  :.: ::. ::...:.:.: .:  ::: :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB7 CSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEA
       :.:::: :.: ::  .. :  :.:: :  ..:. :.::... :::: ::::::::.:: :
NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
              250       260       270       280       290       300

     300                
pF1KB7 LKKLLP           
        .:::            
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
              310       

>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep  (317 aa)
 initn: 829 init1: 829 opt: 834  Z-score: 865.5  bits: 168.3 E(85289): 1.8e-41
Smith-Waterman score: 834; 45.2% identity (72.5% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-305)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7 MQRSNHT-VTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMY
       :  .:.: :.::::::...:   ...:::.:: .: .::.::  ...::  :: ::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 FFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAY
       ::  :::..:. :..  .:..:.  ..: :.: : .:  :.::: .:.  :  :::..::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 DRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFCD
       :::::.   : :.  :   ::: :. .:. .:::.: . :  ::.. .::...:: . :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 LLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFST
       :: .:.::: . .. .. ..      .. :  :.: ::. ::...:.:.: .:  ::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB7 CSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEA
       :.:::: :.: ::  .. :  :.:: :  ..:. :.::... :::: ::::::::.:: :
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
              250       260       270       280       290       300

     300                
pF1KB7 LKKLLP           
        .:::            
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
              310       

>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H  (311 aa)
 initn: 842 init1: 818 opt: 825  Z-score: 856.4  bits: 166.6 E(85289): 5.8e-41
Smith-Waterman score: 825; 44.6% identity (72.6% similar) in 296 aa overlap (8-303:10-305)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB7   MQRSNHTVTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPM
                .: ::::::.  : .   ::..:: .:  ... : .:::::  :: :::::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB7 YFFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVA
       ::: .::::.:. : :  .::.: . ..:...:.:.::. :.:. . .. ::  :..:.:
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB7 YDRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFC
       ::::.:: .::::.. ::  ::. .:  .:  :.  : .     ....::  :.:  :::
NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB7 DLLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFS
       :.  :. :.: .    ..:  .:     :  :..:. :: .:  :...:.:.::  :::.
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB7 TCSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKE
       ::.::::.:.:.: : ...:    :. : ..:...:.:::::.:::: .:::::::..:.
NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
              250       260       270       280       290       300

      300         
pF1KB7 ALKKLLP    
       :::.:      
NP_001 ALKRLQKRKCC
              310 

>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo   (327 aa)
 initn: 800 init1: 584 opt: 813  Z-score: 844.0  bits: 164.3 E(85289): 2.9e-40
Smith-Waterman score: 813; 41.8% identity (70.6% similar) in 306 aa overlap (1-300:1-306)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB7 MQRSNHT--VTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPM
       :.  ::.  :.::.:::: .   .:. ::...: .: :... :. .:. : : : :: ::
NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90           100       110    
pF1KB7 YFFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKS----ISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLL
       ::: .:.:::..:: .:  ::.:.  ..  ..    ::: ::. :..:  ::. .:: ::
NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB7 AAVAYDRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIID
       :..:::::.::  :: :   .: .::. ..: :. :::  : . .    ....:  :::.
NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB7 DFFCDLLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYL
        ::::. ::..:.: . .  ..  ..:    .. :  .  :::. :  .:..: :. :  
NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
              190       200       210       220       230       240

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB7 KAFSTCSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNK
       ::::::.:::: : ..:.. ..::: :..  .:: .:.::..:.:. :.:: .:: :::.
NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
              250       260       270       280       290       300

          300                     
pF1KB7 DVKEALKKLLP                
       .::.::                     
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
              310       320       




305 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 07:25:53 2016 done: Fri Nov  4 07:25:54 2016
 Total Scan time:  6.560 Total Display time:  0.030

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com