Result of FASTA (omim) for pF1KB7382
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7382, 313 aa
  1>>>pF1KB7382 313 - 313 aa - 313 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4268+/-0.00058; mu= 21.1540+/- 0.036
 mean_var=106.8738+/-30.449, 0's: 0 Z-trim(106.4): 338  B-trim: 840 in 1/49
 Lambda= 0.124062
 statistics sampled from 13995 (14472) to 13995 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.497), E-opt: 0.2 (0.17), width:  16
 Scan time:  5.710

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1036 197.1   4e-50
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312)  918 175.9 9.1e-44
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312)  918 175.9 9.1e-44
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322)  918 176.0 9.2e-44
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314)  900 172.7 8.5e-43
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308)  882 169.5 7.8e-42
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314)  870 167.4 3.5e-41
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311)  860 165.6 1.2e-40
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317)  848 163.4 5.4e-40
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307)  847 163.2   6e-40
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327)  841 162.2 1.3e-39
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312)  832 160.5 3.9e-39
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311)  830 160.2   5e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314)  823 158.9 1.2e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317)  821 158.6 1.5e-38
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  821 158.6 1.5e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  821 158.6 1.5e-38
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312)  810 156.6   6e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300)  808 156.2 7.5e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312)  790 153.0 7.2e-37
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318)  531 106.7 6.5e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320)  508 102.6 1.1e-21
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337)  263 58.8 1.9e-08
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323)  210 49.2 1.3e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318)  208 48.9 1.6e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332)  203 48.0 3.1e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339)  202 47.8 3.6e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306)  197 46.9 6.3e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351)  197 47.0 6.8e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332)  195 46.6 8.5e-05
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432)  194 46.6 0.00011
NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445)  194 46.6 0.00011
NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479)  194 46.6 0.00012
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364)  189 45.6 0.00019
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345)  186 45.0 0.00026
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471)  186 45.2 0.00031
NP_473362 (OMIM: 300393,300943) probable G-protein ( 508)  186 45.2 0.00033
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325)  184 44.6 0.00033
XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328)  181 44.1 0.00048
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370)  181 44.1 0.00051
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297)  180 43.8 0.00051
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297)  180 43.8 0.00051
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297)  180 43.8 0.00051
NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617)  183 44.8 0.00053
XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331)  179 43.7 0.00062
XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366)  179 43.8 0.00065
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308)  178 43.5 0.00067
XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389)  179 43.8 0.00067
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317)  178 43.5 0.00068
XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402)  179 43.8 0.00068


>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H  (309 aa)
 initn: 1059 init1: 1028 opt: 1036  Z-score: 1020.9  bits: 197.1 E(85289): 4e-50
Smith-Waterman score: 1036; 48.5% identity (80.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:3-303)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
           :.. .::::.::::.:  .. ..:..: .::..:. : .::... . .::: .:::
NP_001   MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIVAY
       . :. ::::: :.:::..:...   :  .:.: :..:.::.:  :.:. :: .:: ..::
NP_001 LSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAY
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFCD
       :.::::: :::: ..::. ::  :. ..:.:: .:.  : .. ..::.::::.:: ..::
NP_001 DHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCD
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 VPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVSLRKHSAEGRQKALSTC
       .  ...::::::..  ..:..::: : :  :  ...::.::: ::: :: :.:.::::::
NP_001 LNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTC
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 SAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKSAMKQ
        .:. :: ::: ::::.: :: ... :::.:..:::..::.:::.::::.: ..:.:...
NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRK
      240       250       260       270       280       290        

              310   
pF1KB7 LRQRQVFFTKSYT
       : .:.        
NP_001 LCSRKDISGDK  
      300           

>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (312 aa)
 initn: 936 init1: 668 opt: 918  Z-score: 906.8  bits: 175.9 E(85289): 9.1e-44
Smith-Waterman score: 918; 44.8% identity (75.8% similar) in 310 aa overlap (1-307:1-310)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
       :.. ::. :.::..:::. .   . :.:. : ..:. :. ::.:::... .   ::::::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIVAY
       ::::::::.::: : .:::::: . .:: .:::: .:.::..:. .:.  . ::: ..::
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFCD
       :..::.: ::::   :. ..:  :: .::. .... : .:.:   : .:. : :  .:::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220        230         
pF1KB7 VPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVS-LRKHSAEGRQKALST
       :  ..::.:.::.:. ..:..... . .. :: ...::: :  . :.  :..:: ::.::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260         270       280       290       
pF1KB7 CSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDK--VVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKSA
       :..:. :: ::..  : .:  : .: : .:  ...:.::::::.::::::.:::. .:.:
XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
              250       260       270       280       290       300

       300       310   
pF1KB7 MKQLRQRQVFFTKSYT
       .:..  : ::      
XP_011 LKKVVGRVVFSV    
              310      

>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo   (312 aa)
 initn: 936 init1: 668 opt: 918  Z-score: 906.8  bits: 175.9 E(85289): 9.1e-44
Smith-Waterman score: 918; 44.8% identity (75.8% similar) in 310 aa overlap (1-307:1-310)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
       :.. ::. :.::..:::. .   . :.:. : ..:. :. ::.:::... .   ::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIVAY
       ::::::::.::: : .:::::: . .:: .:::: .:.::..:. .:.  . ::: ..::
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFCD
       :..::.: ::::   :. ..:  :: .::. .... : .:.:   : .:. : :  .:::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220        230         
pF1KB7 VPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVS-LRKHSAEGRQKALST
       :  ..::.:.::.:. ..:..... . .. :: ...::: :  . :.  :..:: ::.::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260         270       280       290       
pF1KB7 CSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDK--VVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKSA
       :..:. :: ::..  : .:  : .: : .:  ...:.::::::.::::::.:::. .:.:
NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
              250       260       270       280       290       300

       300       310   
pF1KB7 MKQLRQRQVFFTKSYT
       .:..  : ::      
NP_036 LKKVVGRVVFSV    
              310      

>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (322 aa)
 initn: 936 init1: 668 opt: 918  Z-score: 906.6  bits: 176.0 E(85289): 9.2e-44
Smith-Waterman score: 918; 44.8% identity (75.8% similar) in 310 aa overlap (1-307:11-320)

                         10        20        30        40        50
pF1KB7           MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATV
                 :.. ::. :.::..:::. .   . :.:. : ..:. :. ::.:::... 
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KB7 FTPSLHTPMYFFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACA
       .   ::::::::::::::.::: : .:::::: . .:: .:::: .:.::..:. .:.  
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KB7 EIFLLIIVAYDRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCG
       . ::: ..:::..::.: ::::   :. ..:  :: .::. .... : .:.:   : .:.
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
              130       140       150       160       170       180

              180       190       200       210       220          
pF1KB7 PNIIDSYFCDVPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVS-LRKHS
        : :  .::::  ..::.:.::.:. ..:..... . .. :: ...::: :  . :.  :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
              190       200       210       220       230       240

     230       240       250       260         270       280       
pF1KB7 AEGRQKALSTCSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDK--VVSVFYTVVTPLLNPFIY
       ..:: ::.:::..:. :: ::..  : .:  : .: : .:  ...:.::::::.::::::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
              250       260       270       280       290       300

       290       300       310   
pF1KB7 TLRNEEVKSAMKQLRQRQVFFTKSYT
       .:::. .:.:.:..  : ::      
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV    
              310       320      

>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo   (314 aa)
 initn: 788 init1: 653 opt: 900  Z-score: 889.3  bits: 172.7 E(85289): 8.5e-43
Smith-Waterman score: 900; 43.9% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (5-306:7-311)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB7   MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTP
             : : ::::..::.     :....:. : ..: . : ::: ...   . : :.::
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB7 MYFFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIV
       ::::::::::.:.:. :  ::::: ..: : :.::. .:  :..:.  :: .: :.:  .
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB7 AYDRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYF
       :::::::::.:: :  ::.  .:..:.   .:::.. :: .: ... : ::  :.:. .:
NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220        230       
pF1KB7 CDVPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVS-LRKHSAEGRQKAL
       ::.: ..::.:::: ..  :. : .... . ::. .. ::. ::.: :. .:  ::.:..
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260         270       280       290     
pF1KB7 STCSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFS--IDKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVK
       :::..:.  :... :  .:::.::.  .:   ::..:::::.  :.:::.::.:::..::
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
              250       260       270       280       290       300

         300       310   
pF1KB7 SAMKQLRQRQVFFTKSYT
       .: ... . .:       
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS    
              310        

>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo   (308 aa)
 initn: 891 init1: 616 opt: 882  Z-score: 872.0  bits: 169.5 E(85289): 7.8e-42
Smith-Waterman score: 882; 44.3% identity (75.1% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
       : ..:::.::::..:::.:.   :.:.:... ..:..:. ::.:.:  .    .::::::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIVAY
       ::: :::. :.: :.  ::. :  :: ..:.:.:  : ..:.:. .:.:..  :: ...:
NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFCD
       :::::::.::.:::.:. .::.::. . : .: . :. .: . .:::: : : :  .::.
NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220        230         
pF1KB7 VPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVSLRK-HSAEGRQKALST
       .: .. :: :::. . . :   . .: :   . ...::  :.:.. : .:. :  ::.::
NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB7 CSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKSAMK
       :..:.::: ::.:  :. :  : .: . .: :::::..:::.:::.::.:::..::.:..
NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAALR
              250       260       270       280       290       300

     300       310   
pF1KB7 QLRQRQVFFTKSYT
       ..  :         
NP_003 KVATRNFP      
                     

>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo   (314 aa)
 initn: 922 init1: 569 opt: 870  Z-score: 860.3  bits: 167.4 E(85289): 3.5e-41
Smith-Waterman score: 870; 42.9% identity (74.7% similar) in 308 aa overlap (1-305:1-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
       :   : : .::::.:::.:.  :....:. : .:: ::. ::. .:.   .  .::::::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIVAY
       :::.::::.:.:.:.. .::::  :: :.::::: .:. :..:.  .: .: .:. ..::
NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFCD
       :::.::: :: :  .:.  : .... . . .: .. . .:  .  : .:  :.:  .:::
NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220        230         
pF1KB7 VPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVSLRK-HSAEGRQKALST
        : ..::.:.:: :   .    .:.  .. .:....::  .: :. . ::.:::..:.::
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260         270       280       290       
pF1KB7 CSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSI--DKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKSA
       :..:. .. ::.. ::. : ::..:.:.  :::.::::::: :.:::.::.::..:::.:
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
              250       260       270       280       290       300

       300       310   
pF1KB7 MKQLRQRQVFFTKSYT
       . .. .:.        
NP_003 LANVISRKRTSSFL  
              310      

>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H  (311 aa)
 initn: 807 init1: 565 opt: 860  Z-score: 850.7  bits: 165.6 E(85289): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 860; 42.6% identity (74.8% similar) in 305 aa overlap (5-305:6-309)

                10         20        30        40        50        
pF1KB7  MDSLNQTRVTEFVFLGLTD-NRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTP
            : :..: :..::..:  :....:: . : .::. .:. :. .:.   .   ::::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTI-FLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTP
               10        20        30         40        50         

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB7 MYFFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIV
       ::::::::::::.:. : :::::: .:: :..::.: .:: : :..  .. .:  :.  .
NP_001 MYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAM
      60        70        80        90       100       110         

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB7 AYDRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYF
       :::::.:::.:: : ..:.  .:. .:.. .. : . :: :    ..: .:: :.:  .:
NP_001 AYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFF
     120       130       140       150       160       170         

      180       190       200       210       220        230       
pF1KB7 CDVPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVSLRK-HSAEGRQKAL
       ::.: .. :.::::... .. .  .  ....  :... ::  : .:. :  ::.::.::.
NP_001 CDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260         270       280       290     
pF1KB7 STCSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDT--SFSIDKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVK
       .::..:. .:.::.   ::.:   ..  : :.:. .::::::: :.:::.::.:::.:.:
NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
     240       250       260       270       280       290         

         300       310   
pF1KB7 SAMKQLRQRQVFFTKSYT
       .:.:.:..:.        
NP_001 DALKRLQKRKCC      
     300       310       

>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo  (317 aa)
 initn: 783 init1: 582 opt: 848  Z-score: 839.0  bits: 163.4 E(85289): 5.4e-40
Smith-Waterman score: 848; 44.7% identity (73.0% similar) in 300 aa overlap (5-300:5-304)

               10         20        30        40        50         
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTD-NRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPM
           : :...::.......    .. :.:..: .::..::.:: :::..:.  : ::.::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 YFFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIVA
       :::: ::::..:  . : :::::  :: .  :::: .: ::..:. .:. :: :::  .:
NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 YDRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFC
       ::::::::.::::: .::.:.  .:. : :. :   .  ::   . .:.:: : .. .::
NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220        230        
pF1KB7 DVPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVSLRK-HSAEGRQKALS
       : : :.::.:.:: :  :  ....  . .   : .. ::  : ... :  ::.:..::.:
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260         270       280       290      
pF1KB7 TCSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSID--KVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKS
       :::.:..::.::.    . :  : .. : .  :..:. ::::::.:::.::.::: :::.
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
              250       260       270       280       290       300

        300       310   
pF1KB7 AMKQLRQRQVFFTKSYT
       :...             
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
              310       

>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H  (307 aa)
 initn: 840 init1: 586 opt: 847  Z-score: 838.2  bits: 163.2 E(85289): 6e-40
Smith-Waterman score: 847; 40.4% identity (76.8% similar) in 302 aa overlap (4-301:1-301)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
          .:.. ::::..:::: .  :. ..:. :  .:.... ::.::::: ... .::::::
NP_001    MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
                  10        20        30        40        50       

               70         80        90       100       110         
pF1KB7 FFLSNLSFIDI-CHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIVA
        :: .:. .:: : .:. .::::  .:  ..:::. .:..:::..     ::. :.  .:
NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSI-IPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMA
        60        70         80        90       100       110      

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 YDRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFC
       :::::::: :::: ..:: ..:. :.  .   ....:  .: : .:: .:::: :: .::
NP_001 YDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFC
        120       130       140       150       160       170      

     180       190       200       210       220        230        
pF1KB7 DVPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVS-LRKHSAEGRQKALS
       ..: .. :.:. . .. ... . . :.... :. .  ::  :.:. :: ...::..::.:
NP_001 EIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFS
        180       190       200       210       220       230      

      240       250       260         270       280       290      
pF1KB7 TCSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSI--DKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKS
       :::.:. ::.:...: :. : :: .:...  ::::...::.::: :::..:...:.:...
NP_001 TCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQA
        240       250       260       270       280       290      

        300       310   
pF1KB7 AMKQLRQRQVFFTKSYT
       .....            
NP_001 GIRKVFAFLKH      
        300             




313 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 07:04:36 2016 done: Fri Nov  4 07:04:37 2016
 Total Scan time:  5.710 Total Display time:  0.010

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com