Result of FASTA (ccds) for pF1KB7289
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7289, 988 aa
  1>>>pF1KB7289 988 - 988 aa - 988 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4819+/-0.000961; mu= 7.7188+/- 0.058
 mean_var=169.0567+/-33.393, 0's: 0 Z-trim(111.8): 25  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.098641
 statistics sampled from 12653 (12676) to 12653 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.389), width:  16
 Scan time:  4.780

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5881.1 CLCN1 gene_id:1180|Hs108|chr7           ( 988) 6636 957.0       0
CCDS3263.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3           ( 898) 2942 431.3 4.2e-120
CCDS54690.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3          ( 854) 2773 407.3  7e-113
CCDS54692.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3          ( 869) 2704 397.4 6.4e-110
CCDS54691.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3          ( 881) 1727 258.4 4.6e-68
CCDS57973.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1         ( 644) 1316 199.8 1.4e-50
CCDS167.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1           ( 687) 1316 199.9 1.5e-50
CCDS41269.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1         ( 686) 1315 199.7 1.7e-50
CCDS168.1 CLCNKB gene_id:1188|Hs108|chr1           ( 687) 1291 196.3 1.8e-49
CCDS57974.1 CLCNKB gene_id:1188|Hs108|chr1         ( 517) 1164 178.2 3.9e-44
CCDS14328.1 CLCN5 gene_id:1184|Hs108|chrX          ( 746)  705 112.9 2.4e-24
CCDS48115.1 CLCN5 gene_id:1184|Hs108|chrX          ( 816)  705 113.0 2.6e-24
CCDS59159.1 CLCN4 gene_id:1183|Hs108|chrX          ( 666)  702 112.5   3e-24
CCDS14137.1 CLCN4 gene_id:1183|Hs108|chrX          ( 760)  702 112.5 3.3e-24
CCDS75208.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4          ( 791)  675 108.7 4.9e-23
CCDS34101.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4          ( 818)  675 108.7 5.1e-23
CCDS34100.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4          ( 866)  675 108.7 5.3e-23
CCDS45378.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16         ( 781)  389 68.0 8.7e-11


>>CCDS5881.1 CLCN1 gene_id:1180|Hs108|chr7                (988 aa)
 initn: 6636 init1: 6636 opt: 6636  Z-score: 5110.2  bits: 957.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6636; 100.0% identity (100.0% similar) in 988 aa overlap (1-988:1-988)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEQSRSQQRGGEQSWWGSDPQYQYMPFEHCTSYGLPSENGGLQHRLRKDAGPRHNVHPTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MEQSRSQQRGGEQSWWGSDPQYQYMPFEHCTSYGLPSENGGLQHRLRKDAGPRHNVHPTQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 IYGHHKEQFSDREQDIGMPKKTGSSSTVDSKDEDHYSKCQDCIHRLGQVVRRKLGEDGIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IYGHHKEQFSDREQDIGMPKKTGSSSTVDSKDEDHYSKCQDCIHRLGQVVRRKLGEDGIF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 LVLLGLLMALVSWSMDYVSAKSLQAYKWSYAQMQPSLPLQFLVWVTFPLVLILFSALFCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LVLLGLLMALVSWSMDYVSAKSLQAYKWSYAQMQPSLPLQFLVWVTFPLVLILFSALFCH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LISPQAVGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LISPQAVGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIAS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 ICAAVLSKFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ICAAVLSKFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 NYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGICCGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGICCGL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 LGAVFVYLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGELMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LGAVFVYLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGELMP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 REAISTLFDNNTWVKHAGDPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 REAISTLFDNNTWVKHAGDPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 CGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 STAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQLSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 STAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQLSK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 YTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQAL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 LQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFAFVDEDEDEDLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFAFVDEDEDEDLS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 GKSELPPSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQSLLHCLLGRAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GKSELPPSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQSLLHCLLGRAR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 PTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHKTHTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHKTHTL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 FSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKSTGAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKSTGAP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 PSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELELVESP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELELVESP
              910       920       930       940       950       960

              970       980        
pF1KB7 GLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL
              970       980        

>>CCDS3263.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3                (898 aa)
 initn: 2883 init1: 1513 opt: 2942  Z-score: 2269.8  bits: 431.3 E(32554): 4.2e-120
Smith-Waterman score: 2942; 55.9% identity (77.8% similar) in 835 aa overlap (97-920:70-888)

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB7 EQFSDREQDIGMPKKTGSSSTVDSKDEDHYSKCQDCIHRLGQVVRRKLGEDGIFLVLLGL
                                     ..:. :  :  . .  ..::: ::::::::
CCDS32 RIRLGGPEPWKGPPSSRAAPELLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGL
      40        50        60        70        80        90         

        130       140       150       160       170       180      
pF1KB7 LMALVSWSMDYVSAKSLQAYKWSYAQMQPSLPLQFLVWVTFPLVLILFSALFCHLISPQA
       ::::::: :::. :  ::: .:    .. :. ::.:.:::.:.::: ::: : ....:::
CCDS32 LMALVSWVMDYAIAACLQAQQWMSRGLNTSILLQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQA
     100       110       120       130       140       150         

        190       200       210       220       230       240      
pF1KB7 VGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIASICAAVL
       ::::::::::::::::::::::.:.:.:::..:: .::::.:.:::::::::::.:::.:
CCDS32 VGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALL
     160       170       180       190       200       210         

        250       260       270       280       290       300      
pF1KB7 SKFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVRNYWRGF
       :::.:.: :.::.    ...:...:::::::::..:.::::::::::::.::::::::::
CCDS32 SKFLSLFGGIYENESRNTEMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGF
     220       230       240       250       260       270         

        310       320       330       340       350       360      
pF1KB7 FAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGICCGLLGAVFV
       ::::::::.::::::::.:  ::::::.: ::.::::::.::::::.:::  :. ::.::
CCDS32 FAATFSAFIFRVLAVWNRDEETITALFKTRFRLDFPFDLQELPAFAVIGIASGFGGALFV
     280       290       300       310       320       330         

        370       380       390       400       410       420      
pF1KB7 YLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGELMPREAIST
       ::.:...  .::.:....:: ..:::.:..::..:...:::::.::::::.:  .:.. :
CCDS32 YLNRKIVQVMRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQKETLVT
     340       350       360       370       380       390         

        430           440       450       460       470       480  
pF1KB7 LFDNNTWVKHAG----DPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIPCG
       :::: :::...     .: : .:.  :  ::.:: . . .:..:::::: .:::.:.:::
CCDS32 LFDNRTWVRQGLVEELEPPSTSQA--WNPPRANVFLTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCG
     400       410       420         430       440       450       

            490       500       510       520       530       540  
pF1KB7 GFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTVST
       .::::::.:::::::::: ::  :::::  :.  :.:.::::::.:::::.:::.:::::
CCDS32 AFMPVFVIGAAFGRLVGESMAAWFPDGIHTDSSTYRIVPGGYAVVGAAALAGAVTHTVST
       460       470       480       490       500       510       

            550       560       570       580       590       600  
pF1KB7 AVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQLSKYT
       ::: ::::::::::::.:.:::::: ::::::::::::::..:::::::.:::.. ..: 
CCDS32 AVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPSLYDSIIRIKKLPYLPELGWGRHQQYR
       520       530       540       550       560       570       

            610       620       630       640       650       660  
pF1KB7 IFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQALLQ
       . :::::::::  :. : :. .::  :. :  . : ::.: .:::::::.:::.. ::: 
CCDS32 VRVEDIMVRDVPHVALSCTFRDLRLALHRTKGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLG
       580       590       600       610       620       630       

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        .: : :: .  ::  :  .  : . .     ::    ::    :  :  . ::  .   
CCDS32 AQLSPARRRQHMQER-RATQTSPLSDQ-----EG----PPTPEASVCFQVNTEDSAFPAA
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pF1KB7 -GKSELP--PSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRP-SIFQSLLHCLL
        :... :  :.:   ::.:  :. : :.:   .     ..   ..  : .  ..:  :  
CCDS32 RGETHKPLKPALKRGPSVTRNLG-ESPTGSAESAGIALRSLFCGSPPPEAASEKLESCEK
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        . . .. . ..:. ::  .::::::  ::..::..:: :..: :: .::::::.:.:::
CCDS32 RKLKRVRISLASDA-DLEGEMSPEEILEWEEQQLDEPVNFSDCKIDPAPFQLVERTSLHK
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pF1KB7 THTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGH-TKSGVQLRPPLASFRNTTSTRK
       :::.:::::.  :::::.:.: :...:.::.:::::  : .::..::::::::..... .
CCDS32 THTIFSLLGVDHAYVTSIGRLIGIVTLKELRKAIEGSVTAQGVKVRPPLASFRDSATSSS
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       .: .    :  :. :..: :    :                                   
CCDS32 DTETTEVHAL-WG-PHSRHGLPREGSPSDSDDKCQ                         
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>>CCDS54690.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3               (854 aa)
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CCDS54 PFVHIASMCAALLSKFLSLFGGIYENESRNTEMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVT
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CCDS54 STFFAVRNYWRGFFAATFSAFIFRVLAVWNRDEETITALFKTRFRLDFPFDLQELPAFAV
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pF1KB7 IGICCGLLGAVFVYLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQF
       :::  :. ::.::::.:...  .::.:....:: ..:::.:..::..:...:::::.:::
CCDS54 IGIASGFGGALFVYLNRKIVQVMRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQF
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       :::.:  .:.. ::::: :::...     .: : .:.  :  ::.:: . . .:..::::
CCDS54 MAGQLSQKETLVTLFDNRTWVRQGLVEELEPPSTSQA--WNPPRANVFLTLVIFILMKFW
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       :: .:::.:.:::.::::::.:::::::::: ::  :::::  :.  :.:.::::::.::
CCDS54 MSALATTIPVPCGAFMPVFVIGAAFGRLVGESMAAWFPDGIHTDSSTYRIVPGGYAVVGA
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CCDS54 AALAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPSLYDSIIRIKKLPY
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CCDS54 LPELGWGRHQQYRVRVEDIMVRDVPHVALSCTFRDLRLALHRTKGRMLALVESPESMILL
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pF1KB7 GSVERSELQALLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFA
       ::.:::.. :::  .: : :: .  ::  :  .  : . .     ::    ::    :  
CCDS54 GSIERSQVVALLGAQLSPARRRQHMQER-RATQTSPLSDQ-----EG----PPTPEASVC
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pF1KB7 FVDEDEDEDLS---GKSELP--PSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQR
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CCDS54 FQVNTEDSAFPAARGETHKPLKPALKRGPSVTRNLG-ESPTGSAESAGIALRSLFCGSPP
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       : .  ..:  :   . . .. . ..:. ::  .::::::  ::..::..:: :..: :: 
CCDS54 PEAASEKLESCEKRKLKRVRISLASDA-DLEGEMSPEEILEWEEQQLDEPVNFSDCKIDP
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pF1KB7 SPFQLVEQTTLHKTHTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGH-TKSGVQLRP
       .::::::.:.::::::.:::::.  :::::.:.: :...:.::.:::::  : .::..::
CCDS54 APFQLVERTSLHKTHTIFSLLGVDHAYVTSIGRLIGIVTLKELRKAIEGSVTAQGVKVRP
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pF1KB7 PLASFRNTTSTRKSTGAPPSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSL
       ::::::..... ..: .    :  :. :..: :    :                      
CCDS54 PLASFRDSATSSSDTETTEVHAL-WG-PHSRHGLPREGSPSDSDDKCQ            
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pF1KB7 APGKVEGELEELELVESPGLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL

>>CCDS54692.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3               (869 aa)
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CCDS54 RIRLGGPEPWKGPPSSRAAPELLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGL
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CCDS54 LMALVSWVMDYAIAACLQAQQWMSRGLNTSILLQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQA
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pF1KB7 VGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIASICAAVL
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CCDS54 VGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALL
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       :::.:.: :.::.    ...:...:::::::::..:.::::::::::::.::::::::::
CCDS54 SKFLSLFGGIYENESRNTEMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGF
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pF1KB7 FAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGICCGLLGAVFV
       ::::::::.::::::::.:  ::::::.: ::.::::::.::::::.:::  :. ::.::
CCDS54 FAATFSAFIFRVLAVWNRDEETITALFKTRFRLDFPFDLQELPAFAVIGIASGFGGALFV
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pF1KB7 YLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGELMPREAIST
       ::.:...  .::.:....:: ..:::.:..::..:...:::::.::::::.:  .:.. :
CCDS54 YLNRKIVQVMRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQKETLVT
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pF1KB7 LFDNNTWVKHAG----DPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIPCG
       :::: :::...     .: : .:.  :  ::.:: . . .:..:::::: .:::.:.:::
CCDS54 LFDNRTWVRQGLVEELEPPSTSQA--WNPPRANVFLTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCG
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pF1KB7 GFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTVST
       .::::::.:::::::::: ::  :::::  :.  :.:.::::::.:::::.:::.:::::
CCDS54 AFMPVFVIGAAFGRLVGESMAAWFPDGIHTDSSTYRIVPGGYAVVGAAALAGAVTHTVST
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CCDS54 AVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPSLYDSIIRIKKLPYLPELGWGRHQQYR
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pF1KB7 IFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQALLQ
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CCDS54 VRVEDIMVRDVPHVALSCTFRDLRLALHRTKGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLG
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CCDS54 AQLSPARRRQHMQER-RATQTSPLSDQ-----EG----PPTPEASVCFQVNTEDSAFPAA
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pF1KB7 -GKSELP--PSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRP-SIFQSLLHCLL
        :... :  :.:   ::.:  :. : :.:   .     ..   ..  : .  ..:  :  
CCDS54 RGETHKPLKPALKRGPSVTRNLG-ESPTGSAESAGIALRSLFCGSPPPEAASEKLESCEK
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pF1KB7 GRARPTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHK
        . . .. . ..:. ::  .::::::  ::..::..:: :..: :: .::::::.:.:::
CCDS54 RKLKRVRISLASDA-DLEGEMSPEEILEWEEQQLDEPVNFSDCKIDPAPFQLVERTSLHK
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pF1KB7 THTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGH-TKSGVQLRPPLASFRNTTSTRK
                                    :.:::::  : .::..::::::::..... .
CCDS54 -----------------------------LRKAIEGSVTAQGVKVRPPLASFRDSATSSS
                                      810       820       830      

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pF1KB7 STGAPPSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELE
       .: .    :  :. :..: :    :                                   
CCDS54 DTETTEVHAL-WG-PHSRHGLPREGSPSDSDDKCQ                         
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CCDS54 RIRLGGPEPWKGPPSSRAAPELLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGL
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       ::::::: :::. :  ::: .:    .. :. ::.:.:::.:.::: ::: : ....:::
CCDS54 LMALVSWVMDYAIAACLQAQQWMSRGLNTSILLQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQA
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pF1KB7 VGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIASICAAVL
       ::::::::::::::::::::::.:.:.:::..:: .::::.:.:::::::::::.:::.:
CCDS54 VGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALL
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pF1KB7 SKFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVRNYWRGF
       :::.:.: :.::.    ...:...:::::::::..:.::::::::::::.::::::::::
CCDS54 SKFLSLFGGIYENESRNTEMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGF
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pF1KB7 FAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGICCGLLGAVFV
       ::::::::.::::::::.:  ::::::.: ::.::::::.::::::.:::  :. ::.::
CCDS54 FAATFSAFIFRVLAVWNRDEETITALFKTRFRLDFPFDLQELPAFAVIGIASGFGGALFV
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pF1KB7 YLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGELMPREAIST
       ::.:...  .::.:....:: ..:::.:..::..:...:::::.::::::.:  .:.. :
CCDS54 YLNRKIVQVMRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQKETLVT
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pF1KB7 LFDNNTWVKHAG----DPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIPCG
       :::: :::...     .: : .:.  :  ::.:: . . .:..:::::: .:::.:.:::
CCDS54 LFDNRTWVRQGLVEELEPPSTSQA--WNPPRANVFLTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCG
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pF1KB7 GFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTVST
       .::::::.                 :::  :.  :.:.::::::.:::::.:::.:::::
CCDS54 AFMPVFVI-----------------DGIHTDSSTYRIVPGGYAVVGAAALAGAVTHTVST
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pF1KB7 AVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQLSKYT
       ::: ::::::::::::.:.:::::: ::::::::::::::..:::::::.:::.. ..: 
CCDS54 AVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPSLYDSIIRIKKLPYLPELGWGRHQQYR
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pF1KB7 IFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQALLQ
       . :::::::::  :. : :. .::  :. :  . : ::.: .:::::::.:::.. ::: 
CCDS54 VRVEDIMVRDVPHVALSCTFRDLRLALHRTKGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLG
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pF1KB7 RHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFAFVDEDEDEDLS--
        .: : :: .  ::  :  .  : . .     ::    ::    :  :  . ::  .   
CCDS54 AQLSPARRRQHMQER-RATQTSPLSDQ-----EG----PPTPEASVCFQVNTEDSAFPAA
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pF1KB7 -GKSELP--PSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRP-SIFQSLLHCLL
        :... :  :.:   ::.:  :. : :.:   .     ..   ..  : .  ..:  :  
CCDS54 RGETHKPLKPALKRGPSVTRNLG-ESPTGSAESAGIALRSLFCGSPPPEAASEKLESCEK
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pF1KB7 GRARPTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHK
        . . .. . ..:. ::  .::::::  ::..::..:: :..: :: .::::::.:.:::
CCDS54 RKLKRVRISLASDA-DLEGEMSPEEILEWEEQQLDEPVNFSDCKIDPAPFQLVERTSLHK
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pF1KB7 THTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGH-TKSGVQLRPPLASFRNTTSTRK
       :::.:::::.  :::::.:.: :...:.::.:::::  : .::..::::::::..... .
CCDS54 THTIFSLLGVDHAYVTSIGRLIGIVTLKELRKAIEGSVTAQGVKVRPPLASFRDSATSSS
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pF1KB7 STGAPPSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELE
       .: .    :  :. :..: :    :                                   
CCDS54 DTETTEVHAL-WG-PHSRHGLPREGSPSDSDDKCQ                         
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CCDS57 ELVGLREGFSGDPVTLQELWGPCPHIRRAIQGGLEWLKQKVFR-LGEDWYFLMTLGVLMA
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pF1KB7 LVSWSMDYVSAKSLQAYKWSYAQMQPSLPLQFLVWVTFPLVLILFSALFCHLISPQAVGS
       :::..:..                                      :. : ..     ::
CCDS57 LVSYAMNF--------------------------------------AIGC-VVR----GS
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pF1KB7 GIPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGL--GSGIPVGKEGPFVHIASICAAVLS
       ::::.::.: ::.:..:: .: : ::::.:.  :  :: . .:: :::::.. . :: :.
CCDS57 GIPELKTMLAGVILEDYLDIKNFGAKVVGLSCTLATGSTLFLGKVGPFVHLSVMIAAYLG
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pF1KB7 KFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVRNYWRGFF
       .  ..  :  :.    ...:... ::::.  :..:..:::::::: :..:.::.::::::
CCDS57 RVRTTTIGEPENKSKQNEMLVAAAAVGVATVFAAPFSGVLFSIEVMSSHFSVRDYWRGFF
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pF1KB7 AATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGICCGLLGAVFVY
       ::: .::.::.:::.:..  :::.:..:.::.: :::: :.  :.:.:  ::.:. ....
CCDS57 AATCGAFIFRLLAVFNSEQETITSLYKTSFRVDVPFDLPEIFFFVALGGICGVLSCAYLF
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pF1KB7 LHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGELMPREAISTL
        .:  .  .. ..  :..::  . .: ...:...::.:.:::.:.:.:..:  .. ...:
CCDS57 CQRTFLSFIKTNRYSSKLLATSKPVYSALATLLLASITYPPGVGHFLASRLSMKQHLDSL
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pF1KB7 FDNNTWVKHAGD-----PESLGQSAVW---IHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPI
       :::..:.  . .     :: :  . .:    ::: ..   . .:.:::::: :.:::.:.
CCDS57 FDNHSWALMTQNSSPPWPEELDPQHLWWEWYHPRFTIFGTLAFFLVMKFWMLILATTIPM
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pF1KB7 PCGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHT
       : : :::.:.::::.:::.:: .:. ::.::.   .   :.:::::. ::::..:::.::
CCDS57 PAGYFMPIFILGAAIGRLLGEALAVAFPEGIVTGGVTNPIMPGGYALAGAAAFSGAVTHT
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pF1KB7 VSTAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQLS
       .:::.. :::::::.: ::...::. :: .::: :::.::. : :::::::: .   ...
CCDS57 ISTALLAFELTGQIVHALPVLMAVLAANAIAQSCQPSFYDGTIIVKKLPYLPRILGRNIG
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pF1KB7 KYTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQA
       .. . :: .: ...  .. .    :.  .. .: :   :::.: .:.::.: :.:..:  
CCDS57 SHHVRVEHFMNHSITTLAKDTPLEEVVKVVTSTDVTEYPLVESTESQILVGIVQRAQLVQ
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pF1KB7 LLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFAFVDEDEDEDL
        :: .  :  :  . :.                                           
CCDS57 ALQAE--PPSRAPGHQQCLQDILARGCPTEPVTLTLFSETTLHQAQNLFKLLNLQSLFVT
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>>CCDS167.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1                (687 aa)
 initn: 1449 init1: 706 opt: 1316  Z-score: 1020.9  bits: 199.9 E(32554): 1.5e-50
Smith-Waterman score: 1641; 43.6% identity (73.9% similar) in 587 aa overlap (100-676:33-616)

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pF1KB7 SDREQDIGMPKKTGSSSTVDSKDEDHYSKCQDCIHRLGQVVRRKLGEDGIFLVLLGLLMA
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CCDS16 ELVGLREGFSGDPVTLQELWGPCPHIRRAIQGGLEWLKQKVFR-LGEDWYFLMTLGVLMA
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CCDS16 VFNSEQETITSLYKTSFRVDVPFDLPEIFFFVALGGLCGILGSAYLFCQR-IFFGFIRNN
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CCDS16 SSPPWPEELDPQHLWWEWYHPRFTIFGTLAFFLVMKFWMLILATTIPMPAGYFMPIFVYG
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CCDS16 AAIGRLFGETLSFIFPEGIVAGGITNPIMPGGYALAGAAAFSGAVTHTISTALLAFEVTG
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